Yüksek Verimli Sonikasyon ile Kolaylaştırılan Metabolomik
Metabolomik, idrar, serum, plazma, dışkı ve tükürük gibi çeşitli biyosıvılardaki küçük molekülleri karakterize etmek ve miktarını belirlemek için yüksek verimli teknikler kullanan ve benzersiz metabolik imzaları ortaya çıkaran araştırma alanıdır. Çok kuyucuklu plakalar için tasarlanmış yüksek verimli sonikatör UIP400MTP, bu numunelerdeki hücreleri parçalamak için güçlü bir araçtır ve aşağı akış analizi için metabolitlerin salınmasını kolaylaştırır. Bu kesin ve güvenilir yaklaşım, doğru çalışma tasarımı, titiz numune hazırlama, optimize edilmiş platform kurulumu, kapsamlı veri analizi ve anlamlı biyolojik yorumlamanın çok önemli olduğu metabolomikler için çok önemlidir. Metabolomik, karbonhidratlar, lipitler ve amino asitler gibi belirli molekül sınıflarına odaklanan hedefli yaklaşımları ve bir numune içindeki metabolik profillere geniş bir genel bakış sağlayan ve metabolik sinyallemenin karmaşık karmaşıklığını ortaya çıkaran hedefli olmayan teknikleri kullanır.
96 Kuyulu Plakalı Sonikatör ile Yüksek Verimli Numune Hazırlama UIP400MTP
Temassız sonikatör UIP400MTP 96 oyuklu plakalarla birlikte kullanılması, yüksek verimli homojenizasyon ve metabolit ekstraksiyonu için etkili bir yöntemdir. Bu kurulum, numuneyle doğrudan teması önleyerek aynı anda birden fazla numuneyi işlerken çapraz kontaminasyon riskini azaltır.
96 Kuyulu Sonikatör ile Homojenizasyon için Adım Adım Protokol UIP400MTP
- Metabolomik Örneklerin Hazırlanması
Örnek Yerleştirme: Her numuneyi (ör., dışkı, bağırsak dokusu veya lümen içeriği) 96 oyuklu bir plakanın veya mikroplakanın ayrı kuyucuklarına dağıtın.
Çözücü: Metanol, etanol, asetonitril, kloroform ve bunların (sulu) karışımları gibi organik çözücüler, metabolit ekstraksiyonu için gereklidir ve hücre içi metabolitlerin hücresel matristen salınmasına yardımcı olur. Oyuk başına 100-300 μL çözücü kullanın ve numuneyi tamamen daldırmak için yeterli hacim sağlayın.
İç Standartlar: İsteğe bağlı olarak, aşağı akış metabolomik analizi sırasında normalleştirme için her kuyucuğa dahili standartlar ekleyin. - Kaplin Ortamı Kurulumu
Su seviyesi: 96 kuyulu plakayı, kılavuzda açıklandığı gibi bir su (bağlantı ortamı) ile doldurulmuş sonikasyon platformuna yerleştirin. - UIP400MTP Parametre Yapılandırması
Güç Ayarları: Verimli homojenizasyon için ultrasonik genliği maksimum gücün P-80'ine ayarlayın.
Darbe modu: Soğutmaya izin vermek ve numunenin aşırı ısınmasını önlemek için sonikasyon döngüsünü alternatif darbelere (örneğin, 30 saniye AÇIK, 30 saniye KAPALI) ayarlayın.
Toplam zaman: Numune karmaşıklığına ve tokluğuna bağlı olarak 4-10 dakika.
Sıcaklık kontrolü: Isıya duyarlı metabolitleri korumak için sonikasyon sırasında suyu 4-8 ° C'de tutmak için bir laboratuvar soğutucu kullanın. - Sonikasyon işlemi
Sonikasyon döngüleri için UIP400MTP başlatın.
Süreci UIP400MTP arayüzü üzerinden izleyin.
Kavitasyon etkisi, kuyucuklar içindeki numuneleri ve lizen hücrelerini homojenize edecek ve hücre içi metabolitleri çözücüye bırakacaktır. - PostSonikasyon
Santrifüjleme: Sonikasyondan sonra, gerekirse plaka içeriğini toplama tüplerine aktarın. Çözünmeyen kalıntıları ve hücresel materyali peletlemek için 10 dakika boyunca 4.000–6.000 × g'da santrifüjleyin.
Süpernatant Koleksiyonu: Süpernatanı her bir kuyucuktan analiz için yeni tüplere veya plakalara dikkatlice aktarın.
Opsiyonel Kurutma: Konsantrasyon gerekiyorsa bir vakum yoğunlaştırıcı (örneğin, SpeedVac) kullanarak süpernatanları kurutun, ardından uygun çözücünün küçük bir hacminde yeniden oluşturun.
UIP400MTP çok kuyulu plaka sonikatörünün yüksek verimli işleme kapasitesinden yararlanın ve metabolomik araştırma ve analizinizi kolaylaştırın!
UIP400MTP yüksek verimli sonikatör çok kuyucuklu plakalarda, 96 oyuklu plakalarda, tüplerde ve Petri kaplarında metabolomik araştırmalar için.
UIP400MTP ile Temassız Sonikasyon Prensibi
UIP400MTP, ultrasonik dalgaları 96 oyuklu bir plakanın kuyucuklarına dolaylı olarak bir birleştirme ortamı (örneğin su) aracılığıyla uygular. Bu dalgalar, hücreleri bozan ve sonikatör probu ile numune arasında fiziksel temas olmadan metabolitleri serbest bırakan kavitasyon oluşturur.
“Fekal mikrobiyom örneklerinin düzgün ve tutarlı bakteriyel lizisi için UIP400MTP sonikatörünüzü kullanma konusundaki harika deneyimimiz için teşekkür etmek için yazıyorum. Yüksek verimli lizis teknolojisi için sınırları zorluyoruz ve cihazınız bu görev için çok uygun. Öne çıkan önemli noktalardan bazıları şunlardır:
- Kullanım kolaylığı – Enstrümanın kullanımı kolaydır ve menü seçeneklerini kullanarak özelleştirme basittir
- Yüksek verim – Bir seferde 96 numune ile plakaları işlemek için mükemmel
- Tüm gemilerin bile sonikasyonu – Cihaz, uygulamamız için çok önemli olan tüm kuyulara aynı miktarda sonikasyon sağlayabildi
- Hielscher ekibinden destek – Destek mükemmeldi, hedefimize ulaşmamıza yardımcı olan önerilerle sorularımızı yanıtlamak ve sorunları çözmek için eğitimde her zaman yanımızdaydınız.
Protokollerimizi optimize etmek için çalışırken yardımlarınız ve desteğiniz için tekrar teşekkür ederiz.”
Mark D. Driscoll, Doktora – Baş Bilim Görevlisi – Intus Biyolojik Bilimler
Çok kuyulu plakalı sonikatör UIP400MTP, örneğin metabolit araştırma ve analizinde yüksek verimli numune hazırlamayı kolaylaştırır.
UIP400MTP Çok Kuyulu Plaka Sonikatörünün Temel Özellikleri
| Yüksek Verimli Sonikasyon | 96 kuyulu ve diğer çok kuyulu plakalar için mükemmel şekilde uygun olan UIP400MTP, birden fazla numunenin eşzamanlı, aynı sonikasyonuna izin verir, numune hazırlama süresini önemli ölçüde kısaltır ve yüksek numune sayısı testinin verimini artırır. |
| Seçtiğiniz çok kuyulu plakayı kullanın | UIP400MTP, herhangi bir standart çok kuyulu plakayı, PCR plakasını veya mikrotitre plakasını sonikasyon yapmak için tasarlanmıştır. Deneyleriniz için en uygun plakayı seçersiniz. UIP400MTP özel sarf malzemeleri gerektirmediğinden, bu size çok para tasarrufu sağlar! |
| Temassız Ultrasonikasyon | Multiwell Plaka Sonikatör UIP400MTP, numuneye herhangi bir şey sokmadan yoğun ultrason uygular. Saçaklı çok kuyulu plakaları, kapalı kapları ve şişeleri sonikleştirebilirsiniz. Hielscher, standart olmayan şişeler veya kaplar için size özelleştirilmiş numune tutucular sağlar. |
| Hassasiyet ve Kontrol | Hassas kontrol ve akıllı yazılım, ultrasonik parametreleri özel işleme ihtiyaçlarınıza en uygun şekilde ayarlamanıza olanak tanır. Her deney için maksimum sonikasyon verimliliği ve etkinliği elde edersiniz. |
| Sıcaklık kontrolü | Sonikasyonunuz için belirli bir sıcaklık ayarlayın. UIP400MTP plakalı sonikatörü, numune sıcaklığını izleyebilir ve sonikasyonu buna göre ayarlayabilir. Devridaim yapan bir soğutma sıvısı, hassas sıcaklık kontrolü için plakadaki her bir kuyuyu soğutur. |
| Protokol ve Uzaktan Kontrol | Her sonikasyon çalışması bir bilgisayardan kontrol edilebilir. Herhangi bir yazılım yüklemesine gerek yoktur. UIP400MTP uzaktan kontrol etmek ve izlemek için standart tarayıcınızı (ör. Chrome, Firefox, Edge veya Safari) herhangi bir işletim sisteminde (ör. MacOS, Windows, Android, iOS veya Linux) kullanabilirsiniz. Her sonikasyon çalışması, değerlendirme ve dokümantasyon için ayrıntılı bir sonikasyon protokolü üretir. Protokol dosyası, Microsoft Excel, Apple Numbers veya OpenOffice Calc gibi tercih ettiğiniz programla açabileceğiniz, tescilli olmayan bir CSV biçimindedir. |
| Sağlam ve Güvenilir | Almanya'da en yüksek kalite standartlarına göre tasarlanan ve üretilen UIP400MTP sadece güçlü değil, aynı zamanda son derece dayanıklıdır. Tasarımı endüstriyel standartları karşılar ve zorlu bir laboratuvar ortamında günlük kullanımın zorluklarına kolayca dayanır. Yüksek aktarım hızına sahip işlemlerde UIP400MTP haftanın 7 günü, 24 saat sürekli olarak kullanabilirsiniz. |
- yüksek verim
- En son teknoloji
- güvenilirlik & sağlamlık
- Ayarlanabilir, hassas proses kontrolü
- Akıllı Yazılım
- Akıllı özellikler (örn. programlanabilir, veri protokolü, uzaktan kumanda)
- Kullanımı kolay ve güvenli
- Az bakım gerektirir
- CIP (yerinde temizlik)
Tasarım, İmalat ve Danışmanlık – Almanya'da Üretilen Kalite
Hielscher ultrasonicators en yüksek kalite ve tasarım standartları için iyi bilinir. Sağlamlık ve kolay kullanım, ultrasonicators'ımızın endüstriyel tesislere sorunsuz bir şekilde entegre edilmesini sağlar. Zorlu koşullar ve zorlu ortamlar Hielscher ultrasonicators tarafından kolayca ele alınır.
Hielscher Ultrasonics, ISO sertifikalı bir şirkettir ve en son teknoloji ve kullanıcı dostu özelliklere sahip yüksek performanslı ultrasonicators'a özel önem vermektedir. Tabii ki, Hielscher ultrasonicators CE uyumludur ve UL, CSA ve RoHs gereksinimlerini karşılar.
Temassız sonikatör UIP400MTP Mikroplakalarda metabolomik numune hazırlama için.
Literatür / Referanslar
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Metabolomik Araştırmalar Hakkında Sıkça Sorulan Sorular
Mikrobiyom Nedir?
Mikrobiyom, insan vücudu gibi belirli bir ortamda yaşayan bakteriler, virüsler, mantarlar ve arkeler ile bunların genetik materyalleri dahil olmak üzere kolektif mikroorganizma topluluğunu ifade eder. Diyet, yaşam tarzı ve çevre gibi faktörler tarafından şekillendirilirken metabolizmayı, bağışıklık fonksiyonunu ve patojenlere karşı korumayı etkileyerek konak sağlığında kritik roller oynar.
Metabolomik Nedir?
Metabolomik, biyolojik bir sistem içindeki metabolik süreçler sırasında üretilen küçük moleküller olan metabolitlerin kapsamlı bir çalışmasıdır. Hücresel fonksiyonları, metabolik yolları ve genetik, çevresel veya patolojik değişikliklere nasıl tepki verdiklerini anlamak için bu moleküllerin tanımlanmasını, ölçülmesini ve analizini içerir.
Metabolom Nedir?
Metabolom, belirli bir zamanda bir hücre, doku veya organizma gibi biyolojik bir sistem içinde bulunan küçük moleküllerin veya metabolitlerin tamamıdır. Sistemin biyokimyasal aktivitesini ve fizyolojik durumunu yansıtır, metabolizma ve çevre ile etkileşimleri hakkında bilgi sağlar.
Hielscher Ultrasonics, yüksek performanslı ultrasonik homojenizatörler üretmektedir. laboratuvar Hedef endüstriyel boyut.



