Liza celic kvasovk v mikroploščah s sonikacijo visoke intenzivnosti
Mikrobiologi in raziskovalci na področju ved o življenju, ki delajo s kvasovkami Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris / Komagataella phaffii in drugimi sistemi kvasovk, poznajo ta izziv: celice kvasovk so odporne, ponovljivo lizo je lahko težko doseči, ročna razgradnja vzorcev pa hitro postane ozko grlo, kadar je treba presejati številne seve, klone, pogoje gojenja ali ekspresijske konstrukte.
Liza kvasovk z visoko zmogljivostjo obdelave za mikrobiologijo, molekularno biologijo in analitiko beljakovin
Sonikatorji za mikroplošče Hielscher, kot sta UIP400MTP (400 W) in UIP550MTP (550 W), zagotavljajo rešitev z visoko zmogljivostjo obdelave za mehansko lizo celic kvasovk neposredno v mikroploščah. Namesto obdelave vzorcev enega za drugim s sondo je mogoče pod enakomernimi pogoji sonicirati celotne mikroplošče. Tako je ultrazvočna liza kvasovk hitrejša, bolj ponovljiva in jo je lažje vključiti v sodobne delovne postopke v mikrobiologiji, pri izražanju beljakovin, presejanju encimov in omikah.
Ne glede na to, ali morate sprostiti rekombinantne beljakovine iz P. pastoris, pripraviti lizate kvasovk za encimske teste, razgraditi S. cerevisiae za analizo beljakovin ali vzporedno presejati več deset klonov kvasovk, sonikatorji za mikroplošče Hielscher zagotavljajo učinkovito razgradnjo celic na osnovi kavitacije z natančnim nadzorom procesa.
Potrebujete ponovljivo lizo kvasovk S. cerevisiae, P. pastoris ali drugih sevov kvasovk v mikroploščah? Sporočite nam format plošče, prostornino vzorca, gostoto celic in ciljni analit. Pomagali vam bomo določiti ustrezne parametre sonikacije za vaš delovni postopek z UIP400MTP ali UIP550MTP.
Sonikator za plošče z več vdolbinicami Hielscher za lizo kvasovk – priprava vzorcev z visoko zmogljivostjo obdelave
Zakaj celice kvasovk potrebujejo učinkovito mehansko lizo
Celice kvasovk je težje lizirati kot številne bakterijske celice ali celice sesalcev, ker jih ščiti toga celična stena, sestavljena predvsem iz polisaharidov, glukanov, manoproteinov in hitina. Ta celična stena zagotavlja mehansko stabilnost, vendar tudi omejuje sproščanje znotrajceličnih beljakovin, nukleinskih kislin, metabolitov in encimov.
Običajne metode lize kvasovk vključujejo mehansko razgradnjo s kroglicami, encimsko razgradnjo, cikle zamrzovanja in odtajanja, kemično lizo ter sonikacijo s sondo. Te metode so lahko učinkovite, vendar imajo tudi omejitve. Mehanska razgradnja s kroglicami lahko vnaša drobce in povzroča segrevanje, encimska razgradnja lahko poveča stroške in variabilnost, sonikacija posameznih vzorcev s sondo pa je zamudna, kadar je treba obdelati veliko vzorcev.
Usmerjena ultrazvočna kavitacija visoke intenzivnosti premaguje te omejitve tako, da na suspenzijo kvasovk deluje z močnimi mehanskimi strižnimi silami, nihanji tlaka in mikrotokovi. Rezultat so hitra razgradnja celičnih sten in membran, izboljšano sproščanje znotrajceličnih sestavin ter zelo ponovljiva priprava vzorcev v ploščah.
Sonikacija mikroplošč za vzporedno pripravo vzorcev kvasovk
Hielscher UIP400MTP in UIP550MTP sta zasnovana za enakomerno sonikacijo mikroplošč, plošč z več vdolbinicami, plošč PCR in ustreznih stojal za vzorce. V nasprotju s sonikacijo s sondo vzorcev ni treba obdelovati posamično. Celotna plošča je izpostavljena nadzorovani ultrazvočni energiji, zato je ta delovni postopek zelo primeren za vzporedno obdelavo vzorcev.
To je še posebej uporabno za:
- Presejanje mutantov ali ekspresijskih sevov S. cerevisiae
- Lizo klonov P. pastoris / K. phaffii po izražanju rekombinantnih beljakovin
- Pripravo lizatov kvasovk za encimske teste
- Ekstrakcijo beljakovin za SDS-PAGE, prenos western, ELISA, LC-MS/MS ali preverjanje aktivnosti
- Sproščanje znotrajceličnih metabolitov za metabolomiko
- Pripravo vzorcev DNA in RNA po ustreznem nadaljnjem čiščenju
- Optimizacijo pufrov za lizo, dodatkov in pogojev ekstrakcije z visoko zmogljivostjo obdelave
Kako ultrazvočna kavitacija razgrajuje celice kvasovk
Med sonikacijo usmerjeni ultrazvok visoke moči v tekočem vzorcu ustvarja izmenjujoče se cikle stiskanja in redčenja. Pri zadostni intenzivnosti ta nihanja tlaka povzročijo akustično kavitacijo. Kavitacijski mehurčki nastajajo, nihajo in se sesedajo, pri čemer ustvarjajo lokalizirane strižne sile, mikroc urke, turbulenco in močne gradiente tlaka.
V suspenzijah kvasovk ti mehanski učinki oslabijo in pretrgajo celično steno ter celično membrano. Znotrajcelične beljakovine, encimi, nukleinske kisline in metaboliti se sprostijo v pufer za lizo. Ker je proces mehanski, ga je mogoče uporabljati s številnimi različnimi pufrskimi sistemi ter kombinirati z zaviralci proteaz, reducenti, detergenti, solmi ali blago encimsko predobdelavo.
Splošni protokol: liza celic kvasovk v mikroploščah
Naslednji protokol predstavlja praktično izhodišče za lizo kvasovk s sonikatorjem za mikroplošče Hielscher UIP400MTP ali UIP550MTP. Parametre je treba optimizirati glede na sev kvasovk, gostoto celic, ciljno molekulo, sestavo pufra, vrsto plošče in nadaljnji test.
1. Zberite in sperite celice kvasovk
Gojite Saccharomyces, Pichia, Hansenula, Debaryomyces ali drug sev kvasovk v želenih pogojih gojenja. Celice zberite s centrifugiranjem in odstranite gojišče. Usedlino sperite s hladno destilirano vodo, PBS ali izbranim pufrom za lizo, da odstranite preostale sestavine gojišča, ki bi lahko motile nadaljnjo analizo.
Pri ekstrakciji beljakovin ohranjajte vzorce hladne in delajte hitro. Če vas skrbi delovanje proteaz, predhodno ohladite vse pufre in potrošni material.
2. Resuspendirajte celično usedlino
Usedlino kvasovk resuspendirajte v ustreznem hladnem pufru za lizo. Za učinkovito sproščanje beljakovin je pogosto ugodna visoka gostota celic. Kot izhodišče uporabite približno 10–20% w/v mokre celične usedline ali gosto suspenzijo, ki ustreza OD600 > 10, odvisno od testa.
Značilen pufer za lizo kvasovk za pridobivanje beljakovin lahko vsebuje:
- pufrski sistem, kot je Tris-HCl, fosfatni pufer ali HEPES
- sol, kot je NaCl ali KCl
- mešanico zaviralcev proteaz
- po izbiri reducent, kot je DTT ali β-merkaptoetanol
- po izbiri detergent, kot je Triton X-100, NP-40, SDS ali CHAPS, odvisno od združljivosti z nadaljnjimi postopki
- po izbiri zaviralce fosfataz za raziskave fosforilacije
Pri težavnih sevih kvasovk ali za zelo nežno ekstrakcijo beljakovin je mogoče pred sonikacijo uporabiti kratko predobdelavo z Zymolyase, Lyticase ali drugim encimom, ki razgrajuje celično steno. Ta encimska predobdelava je izbirna, vendar lahko izboljša učinkovitost lize ali zmanjša potrebno ultrazvočno intenzivnost.
3. Prenesite vzorce v ustrezno mikroploščo
Suspenzijo kvasovk odmerite v mikroploščo, združljivo s sonikacijo. Pogosto imajo prednost plošče z zaobljenim dnom, ker izboljšajo zbiranje vzorcev in zmanjšajo mrtve cone. Za boljšo ponovljivost uporabite enake prostornine vzorcev v vseh vdolbinicah.
Ploščo zatesnite z ustrezno tesnilno podlogo ali folijo, da preprečite izhlapevanje, nastajanje aerosolov in navzkrižno kontaminacijo. Prepričajte se, da je tesnilo združljivo z izbrano temperaturo in pogoji sonikacije.
Značilne delovne prostornine so odvisne od formata plošče in uporabe. Pogosti formati vključujejo plošče s 96 vdolbinicami, plošče z globokimi vdolbinicami, plošče PCR ali ustrezna stojala za epruvete.
4. Pripravite hlajenje
Liza kvasovk zahteva visoko ultrazvočno intenzivnost, mehanska razgradnja pa ustvarja toploto. Nadzor temperature je zato ključen, zlasti pri analizi beljakovin, encimov, RNA ali fosforilacije.
Uporabite ustrezen način hlajenja, kot so:
- predhodno ohlajen pufer za lizo
- predhodno ohlajene mikroplošče
- premori za hlajenje med intervali sonikacije
- zunanje hlajenje platforme za sonikacijo, kjer je to mogoče
Cilj je ohranjati vzorec dovolj hladen, da preprečite denaturacijo beljakovin, inaktivacijo encimov, razgradnjo RNA in variabilnost vzorcev zaradi segrevanja.
5. Sonicirajte suspenzijo kvasovk
Zatesnjeno ploščo namestite v sonikator za mikroplošče Hielscher UIP400MTP ali UIP550MTP in izberite program pulzne sonikacije. Pulzno delovanje je priporočljivo, ker omogoča mehansko razgradnjo med fazami vklopa in odvajanje toplote med fazami izklopa.
Kot izhodišče za lizo celic kvasovk:
| Parameter | Priporočeno začetno območje | Namen |
|---|---|---|
| Amplituda | 60–100% | Visoka intenzivnost kavitacije za odporne celice kvasovk |
| Pulzni način | 10–30 sec VKLOP / 30–60 sec IZKLOP | Učinkovita liza z nadzorovanim kopičenjem toplote |
| Skupni čas vklopa | 5–15 min | Prilagodite glede na sev, gostoto in ciljno molekulo |
| Temperatura | Ohranjajte vzorce hladne | Zaščitite beljakovine, encime, RNA in metabolite |
| Tesnjenje plošče | Priporočeno | Preprečuje izhlapevanje, nastajanje aerosolov in navzkrižno kontaminacijo |
Pri zelo odpornih suspenzijah kvasovk, gosti biomasi P. pastoris ali težavni ekstrakciji rekombinantnih beljakovin postopoma povečujte skupni čas vklopa. Pri beljakovinah, občutljivih na toploto, ali encimskih testih uporabite krajše pulze, daljše premore za hlajenje in nižjo začetno amplitudo.
Liza kvasovk z visoko zmogljivostjo obdelave v ploščah z več vdolbinicami z UIP400MTP
6. Zbistrite lizat
Po sonikaciji centrifugirajte mikroploščo ali prenesite vzorce v epruvete za centrifugiranje. Celične ostanke odstranite s centrifugiranjem pri ustrezni hitrosti in temperaturi. Zberite supernatant za nadaljnjo analizo.
Odvisno od uporabe se lahko lizat uporablja za:
- kvantifikacijo beljakovin
- teste encimske aktivnosti
- SDS-PAGE in prenos western
- ELISA in imunološke teste
- proteomiko z LC-MS/MS
- analizo metabolitov
- čiščenje DNA ali RNA
7. Optimizirajte in dokumentirajte metodo
Za ponovljivo lizo kvasovk dokumentirajte vse pomembne parametre, vključno s sevom, pogoji gojenja, OD600, mokro celično maso, sestavo pufra, vrsto plošče, prostornino vzorca, amplitudo, pulznim ciklom, skupnim časom vklopa, načinom hlajenja in končno temperaturo vzorca.
Če je sonikator Hielscher opremljen s samodejnim beleženjem podatkov, se lahko podatki o procesu uporabljajo za dokumentiranje, razvoj metode, povečanje merila in nadzor kakovosti.
Nasveti za optimizacijo lize kvasovk
Za največje sproščanje beljakovin uporabite goste suspenzije kvasovk, visoko ultrazvočno intenzivnost in zadosten skupni čas vklopa. Pri občutljivih beljakovinah zmanjšajte amplitudo, podaljšajte premore za hlajenje in ohranjajte ploščo hladno ves čas postopka.
Če liza ni popolna, postopoma podaljšujte čas sonikacije, preizkusite encimsko predobdelavo, zmanjšajte viskoznost vzorca ali optimizirajte pufer. Če se beljakovine razgrajujejo ali izgubljajo aktivnost, izboljšajte hlajenje, skrajšajte intervale vklopa, dodajte zaviralce in preverite, ali je detergentni sistem združljiv s ciljno beljakovino.
Ker se sevi kvasovk bistveno razlikujejo po zgradbi celične stene, fazi rasti, ekspresijskem sistemu in gostoti biomase, je priporočljiva manjša optimizacijska matrika. Preizkusite na primer tri amplitude, dva pulzna cikla in dva skupna časa vklopa, nato pa ocenite učinkovitost lize in celovitost beljakovin.
Ne glede na to, ali obdelujete nekaj plošč za teste ali izvajate presejanje kvasovk z visoko zmogljivostjo obdelave, vam lahko Hielscher pomaga izbrati pravi sonikator za mikroplošče in razviti zanesljiv protokol lize. Obrnite se na nas s podatki o svojem sevu kvasovk, delovnem postopku in zahtevah glede zmogljivosti obdelave vzorcev!
Prednosti sonikatorjev za mikroplošče Hielscher pri lizi kvasovk
Sonikatorji za mikroplošče Hielscher so idealni za laboratorije, ki potrebujejo ponovljivo lizo številnih vzorcev. Odpravljajo počasno obdelavo vzorcev enega za drugim pri sonikaciji s sondo ter zmanjšujejo variabilnost, ki jo povzročajo ročno nameščanje sonde, globina potopitve in razlike pri ravnanju s posameznimi vzorci.
Ključne prednosti vključujejo:
- Visoka zmogljivost obdelave: Vzporedno sonicirajte številne vzorce kvasovk v mikroploščah ali združljivih stojalih za vzorce.
- Ponovljivi pogoji: Enaki pogoji sonikacije v vseh vdolbinicah za enakomerne in primerljive rezultate lize.
- Brez navzkrižne kontaminacije s sondo: Vzorci med sonikacijo ostanejo zatesnjeni, kar zmanjšuje prenos snovi med vzorci in število korakov čiščenja.
- Primerno za odporne celice: Ultrazvok visoke intenzivnosti podpira razgradnjo celičnih sten kvasovk.
- Učinkovit delovni postopek: Idealno za presejanje sevov, klonov, pogojev izražanja in pufrov za lizo.
- Učinkovit delovni postopek: Programirljive nastavitve, samodejno beleženje podatkov in primernost za laboratorijsko avtomatizacijo.
Uporaba v biotehnologiji kvasovk in raziskavah na področju ved o življenju
Ultrazvočna liza kvasovk v mikroploščah podpira številne raziskovalne in presejalne delovne postopke. Pri izražanju rekombinantnih beljakovin je mogoče vzporedno lizirati klone P. pastoris in S. cerevisiae za primerjavo ravni izražanja ali encimske aktivnosti. V sistemski biologiji in omikah standardizirana liza izboljša primerljivost med različnimi pogoji. V mikrobiologiji sonikacija podpira hitro pripravo lizatov iz več sevov, pri različnih pogojih gojišča ali po različnih stresnih obdelavah.
Značilna področja uporabe vključujejo:
- ekstrakcijo beljakovin iz kvasovk
- presejanje rekombinantnih beljakovin
- presejanje encimske aktivnosti
- izbor klonov po transformaciji
- optimizacijo fermentacije
- pripravo vzorcev za proteomiko
- pripravo vzorcev za metabolomiko
- raziskave razgradnje celične stene
- mikrobiološke teste z visoko zmogljivostjo obdelave
Zanesljiva liza kvasovk se začne z nadzorovano sonikacijo
Liza kvasovk je lahko težavna, ko se število vzorcev poveča, vendar sonikatorji za mikroplošče Hielscher omogočajo hitrejši, čistejši in bolj ponovljiv proces. UIP400MTP in UIP550MTP raziskovalcem omogočata obdelavo celotnih plošč pod določenimi ultrazvočnimi pogoji, s čimer povečujeta zmogljivost obdelave vzorcev in hkrati zmanjšujeta ročno ravnanje.
Za mikrobiologe, molekularne biologe, raziskovalce beljakovin in biotehnološke laboratorije je sonikacija mikroplošč zmogljivo orodje za učinkovito in ponovljivo sproščanje znotrajceličnih sestavin kvasovk.
Pogosta vprašanja o lizi celic kvasovk s sonikacijo mikroplošč
Ali je mogoče celice kvasovk lizirati s sonikacijo?
Da. Celice kvasovk, kot sta Saccharomyces cerevisiae in Pichia pastoris, je mogoče lizirati s sonikacijo visoke intenzivnosti. Ultrazvočna kavitacija ustvarja močne mehanske strižne sile, ki razgradijo celično steno in membrano kvasovk ter sprostijo beljakovine, encime, nukleinske kisline in metabolite.
Zakaj je celice kvasovk težje lizirati kot bakterijske celice?
Celice kvasovk imajo debelo in mehansko odporno celično steno, sestavljeno predvsem iz glukanov, manoproteinov in hitina. Zaradi te toge zgradbe je kvasovke težje razgraditi kot številne bakterijske celice ali celice sesalcev. Zato liza kvasovk običajno zahteva višjo intenzivnost, daljšo obdelavo ali izbirno encimsko predobdelavo.
Kateri sonikatorji Hielscher so primerni za lizo kvasovk v mikroploščah?
Hielscher UIP400MTP in UIP550MTP sta primerna za lizo kvasovk v mikroploščah z visoko zmogljivostjo obdelave. UIP400MTP je idealen za rutinsko vzporedno pripravo vzorcev, UIP550MTP pa zagotavlja večjo ultrazvočno moč za zahtevne naloge lize, goste suspenzije in odporne seve kvasovk.
Ali je mogoče Pichia pastoris lizirati v sonikatorju za mikroplošče?
Da. Pichia pastoris, znano tudi kot Komagataella phaffii, je mogoče lizirati s sonikacijo mikroplošč visoke intenzivnosti. Ker lahko P. pastoris tvori gosto biomaso in ima odporno celično steno, je priporočljiva optimizacija amplitude, pulznega cikla, hlajenja in skupnega časa sonikacije.
Kateri so značilni parametri sonikacije za lizo kvasovk?
Uporabno začetno območje je amplituda 50–80%, pulzno delovanje, na primer 10–30 sekund vklopa in 30–60 sekund izklopa, ter skupni čas vklopa 5–15 minut. Natančni parametri so odvisni od seva kvasovk, gostote celic, prostornine vzorca, vrste plošče, pufra in ciljne molekule.
Zakaj je treba lizo kvasovk izvajati v pulznem načinu?
Pulzni način zmanjšuje kopičenje toplote med sonikacijo. Med fazo vklopa ultrazvočna kavitacija razgrajuje celice. Med fazo izklopa se vzorec lahko ohladi. To je pomembno, ker lahko prekomerna toplota denaturira beljakovine, zmanjša encimsko aktivnost, razgradi RNA in ogrozi ponovljivost.
Ali je pred sonikacijo celic kvasovk potrebna encimska predobdelava?
Encimska predobdelava ni vedno potrebna, vendar lahko izboljša učinkovitost lize. Encimi, kot sta Zymolyase ali Lyticase, delno razgradijo celično steno kvasovk in lahko zmanjšajo ultrazvočno intenzivnost ali čas, potreben za popolno lizo. To je lahko uporabno pri občutljivih beljakovinah ali težavnih sevih.
Kako je mogoče preprečiti pregrevanje med sonikacijo kvasovk?
Uporabite predhodno ohlajene pufre, pulzni način, premore za hlajenje in hlajeno postavitev plošče. Mikroploščo ohranjajte zatesnjeno in spremljajte temperaturo, kjer je to mogoče. Pri občutljivih beljakovinah uporabite krajše intervale vklopa in daljše intervale izklopa ter vzorce obdelujte v hladnih pogojih.
Ali lahko sonikacija mikroplošč nadomesti mehansko razgradnjo s kroglicami pri lizi kvasovk?
V številnih delovnih postopkih da. Sonikacija mikroplošč lahko nadomesti mehansko razgradnjo s kroglicami, kadar je potrebna čista, ponovljiva in vzporedna liza. Odpravlja ravnanje s kroglicami, zmanjšuje zapletenost uporabe potrošnega materiala in poenostavlja avtomatizacijo. Vendar je treba vsako uporabo validirati s primerjavo izplena lize, celovitosti beljakovin in učinkovitosti testa.
Ali je sonikacija mikroplošč primerna za ekstrakcijo beljakovin iz kvasovk?
Da. Sonikacija mikroplošč je zelo primerna za ekstrakcijo beljakovin iz kvasovk, zlasti kadar je treba primerjati številne klone ali pogoje gojenja. Zaviralci proteaz, hladni pufri in nadzorovane pulzne nastavitve pomagajo ohranjati kakovost beljakovin.
Ali je mogoče isto metodo uporabiti za ekstrakcijo DNA, RNA in beljakovin?
Uporabiti je mogoče isto osnovno načelo sonikacije, vendar je treba pufer in pogoje procesa prilagoditi ciljni molekuli. Delovni postopki za beljakovine zahtevajo zaviranje proteaz in nadzor temperature. Delovni postopki za RNA zahtevajo ravnanje brez RNaz in intenzivno hlajenje. Delovni postopki za DNA lahko zahtevajo različne pogoje lize in čiščenja, odvisno od tega, ali želite nepoškodovano genomsko DNA ali fragmentirano DNA.
Katero vrsto plošče je treba uporabiti za lizo kvasovk?
Uporabite mikroploščo ali ploščo z globokimi vdolbinicami, združljivo s sonikacijo, z ustreznim tesnjenjem. Plošče z zaobljenim dnom so pogosto uporabne za ravnanje s suspenzijami. Plošča mora prenesti izbrane pogoje sonikacije, temperaturo vzorca in korake centrifugiranja.
Kako vem, ali je liza kvasovk popolna?
Učinkovitost lize je mogoče preveriti z mikroskopijo, izplenom beljakovin, encimsko aktivnostjo, zmanjšanjem viskoznosti, analizo SDS-PAGE, izplenom DNA/RNA ali primerjavo z znano metodo lize. Pri razvoju metode ocenite tako izplen kot kakovost sproščene ciljne molekule.
UIP400MTP ali UIP550MTP: kateri sonikator za mikroplošče izbrati?
UIP400MTP je zmogljiv sonikator za mikroplošče za rutinsko pripravo vzorcev z visoko zmogljivostjo obdelave, vključno z lizo kvasovk, ekstrakcijo beljakovin, strižnim fragmentiranjem DNA, odstranjevanjem biofilma in pripravo testov. Primeren je za laboratorije, ki potrebujejo ponovljivo sonikacijo v standardnih formatih plošč.
UIP550MTP zagotavlja večjo ultrazvočno moč in je priporočljiv, kadar zahtevnejše aplikacije potrebujejo večjo akustično intenzivnost, krajše čase obdelave, večje obremenitve z vzorci ali pogoje za razgradnjo odpornejših vzorcev. Pri lizi kvasovk je UIP550MTP posebej uporaben za gosto biomaso, težavne seve, večje delovne prostornine in presejanje izražanja z visoko zmogljivostjo obdelave.
Ali je mogoče lizo kvasovk s sonikacijo mikroplošč avtomatizirati?
Da. Sonikacija v mikroploščah je zelo primerna za avtomatizirane laboratorijske delovne postopke, ker vzorci ostanejo v ploščah. To podpira povezovanje s sistemi za pipetiranje, ravnanjem s ploščami, centrifugiranjem, pripravo testov in delovnimi postopki presejanja z visoko zmogljivostjo obdelave.
Literatura / viri
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP550MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics 2024.
