Preskus ultrazvočnega razbijanja – Sonikator Assay-At-Once UIP400MTP
Sonication je bistvena tehnika v laboratorijskih protokolih, zlasti za aplikacije, kot so testi kromatinske imunoprecipitacije (ChIP). Z uporabo ultrazvočne energije za razgradnjo celic, strižno DNK in raztapljanje kromatina ultrazvočna obdelava omogoča raziskovalcem, da pripravijo vzorce učinkoviteje in ponovljivo. Hielscher sonicatorji z več vdolbinicami so med najnaprednejšimi in najučinkovitejšimi orodji, ki so na voljo v ta namen, saj racionalizirajo visoko zmogljive delovne tokove z namestitvijo do 96-jamičnih plošč.
Ključne prednosti zvočnih plošč z več vdolbinicami za teste
Hielscher brezkontaktni 96-jamični sonikatorji, kot je UIP400MTP, ponujajo zelo zanesljiv in nadzorovan pristop k lizi celic in striženju kromatina. Ta brezkontaktna zasnova zagotavlja, da je vsaka vdolbinica enakomerno obdelana, kar zagotavlja dosledne rezultate pri velikem številu vzorcev. S tem sonikatorjem lahko raziskovalci izvajajo več procesov, vključno z:
- Liza celic: Učinkovita ultrazvočna razbijanje razbije odprte celične membrane in sprosti celično vsebino.
- Striženje DNK in RNA: Ultrazvočni valovi visoke intenzivnosti fragmentirajo DNK in RNA na želene velikosti, ki so bistvenega pomena za nadaljnje teste.
- Fragmentacija kromatina: Striženje kromatina na manjše koščke za nadaljnje analize, kot so kromatinska imunoprecipitacija (ChIP), zaporedje DNK ali druge epigenetske študije. Preberite več o fragmentaciji kromatina z uporabo UIP400MTP!
- Raztapljanje: Izboljša topnost vzorčnih komponent in pomaga pri pripravi enotnih, ponovljivih preskusnih vzorcev.
Te funkcije so bistvenega pomena za visoko zmogljivo pripravo vzorcev in miniaturizacijo vzorcev, saj raziskovalcem omogočajo obdelavo več vzorcev z minimalnim tveganjem navzkrižne kontaminacije.
Pomen ultrazvočnega razbijanja v testih ChIP
Preskusi kromatinske imunoprecipitacije (ChIP) so odvisni od natančnega striženja kromatina, da se dobijo fragmenti DNK optimalne velikosti, običajno med 200-600 baznimi pari (bp). Ti fragmenti so potrebni za učinkovito imunoprecipitacijo, natančno ločljivost vrhov in zanesljive rezultate v testih ChIP-Seq. Hielscher UIP400MTP Assay-At-Once sonicator je še posebej primeren za protokole ChIP, ki zagotavljajo enakomerno fragmentacijo kromatina v več vdolbinah. Prednosti te natančnosti v delovnih tokovih ChIP vključujejo:
- Visok donos kromatina: Učinkovita ultrazvočna razbijanje sprosti večjo količino kromatina iz vsakega vzorca.
- Doslednost med vzorci: Sonikator z več vdolbinicami ohranja dosledne velikosti fragmentov v vseh vrtinah, kar zmanjšuje variabilnost testov ChIP.
- Izboljšana občutljivost in ločljivost v ChIP-Seq: Pravilno fragmentirana DNK zagotavlja jasnejšo ločljivost vrha, kar je kritičen dejavnik pri odkrivanju natančnih interakcij protein-DNA.
Vloga zanesljive ultrazvočne razbijanje v uspešnih testih
Za teste, ki vključujejo veliko število vzorcev, na primer pri klinični diagnostiki ali odkrivanju zdravil, sta ponovljivost in prepustnost bistvenega pomena. Hielscher sonicatorji z več vdolbicami zagotavljajo rešitev z olajšanjem enakomerne priprave vzorcev v velikem številu vdolbinic. Ta doslednost ne le izboljša robustnost testa, temveč tudi izboljša splošno učinkovitost delovnega toka, prihrani čas in vire v laboratoriju.
Hielscher sonikatorji z več vdolbicami so neprecenljivi v testnih protokolih, zlasti tistih, ki zahtevajo visoko zmogljivo obdelavo. Z zagotavljanjem zanesljive lize celic, striženja DNK in raztapljanja ti sonikatorji optimizirajo pripravo vzorca za natančne in ponovljive rezultate. Za raziskovalce, ki delajo z testi ChIP, sonikator UIP400MTP ponuja robustno orodje, ki povečuje donos kromatina, konsistenco fragmentov in občutljivost testa, kar na koncu vodi do uspešnejših poskusov in jasnejših vpogledov.
Ključne lastnosti UIP400MTP Multiwell Sonicator
Visoko zmogljiva ultrazvočna razbijanje | Popolnoma primeren za 96-vdolbinice in druge plošče z več vdolbinicami, UIP400MTP omogoča hkratno, enako ultrazvočno razbijanje več vzorcev, kar znatno skrajša trajanje priprave vzorca in poveča prepustnost testiranja z visokim številom vzorcev. |
Uporabite ploščo z več jamicami po vaši izbiri | UIP400MTP je zasnovan tako, da sonikira vse standardne plošče z več vdolbicami, plošče PCR ali mikrotitrijske plošče. Izberete ploščo, ki je najprimernejša za vaše poskuse. Ker UIP400MTP ne zahteva lastniškega potrošnega materiala, vam to prihrani veliko denarja! |
Brezkontaktna ultrazvočna obdelava | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP uporablja intenziven ultrazvok, ne da bi karkoli vstavil v vzorec. Lahko sonicirate plošče z več jamicami, zaprte posode in viale. Hielscher vam dobavi prilagojena držala za vzorce za vse nestandardne viale ali posode. |
Natančnost in nadzor | Natančno krmiljenje in pametna programska oprema vam omogočata, da nastavite ultrazvočne parametre, ki optimalno ustrezajo vašim specifičnim potrebam obdelave. Za vsak poskus dobite največjo učinkovitost in uspešnost ultrazvočnega razbijanja. |
Nadzor temperature | Nastavite določeno temperaturo za ultrazvočno razbijanje. Sonicator s UIP400MTP ploščo lahko spremlja temperaturo vzorca in ustrezno prilagodi ultrazvočno razbijanje. Recirkulacijska hladilna tekočina ohladi vsako vdolbinico v plošči za natančen nadzor temperature. |
Protokoliranje in daljinsko upravljanje | Vsako ultrazvočno vožnjo je mogoče nadzorovati iz računalnika. Namestitev programske opreme ni potrebna. Za daljinsko upravljanje in spremljanje UIP400MTP lahko uporabite svoj standardni brskalnik (npr. Chrome, Firefox, Edge ali Safari) v katerem koli operacijskem sistemu (npr. MacOS, Windows, Android, iOS ali Linux). Vsaka ultrazvočna vožnja proizvede podroben protokol za ultrazvočno razbijanje za oceno in dokumentacijo. Datoteka protokola je v nelastniškem formatu CSV, ki ga lahko odprete s želenim programom, npr. Microsoft Excel, Apple Numbers ali OpenOffice Calc. |
Robusten in zanesljiv | Zasnovan in izdelan v Nemčiji po najvišjih standardih kakovosti, UIP400MTP ni le zmogljiv, ampak tudi izjemno trpežen. Njegova zasnova izpolnjuje industrijske standarde in zlahka prenese strogost vsakodnevne uporabe v zahtevnem laboratorijskem okolju. UIP400MTP lahko uporabljate neprekinjeno 24 ur, 7 dni v tednu pri operacijah z visoko zmogljivostjo. |
Kako UIP400MTP olajša miniaturizacijo testa
Hielscherjev sonikator z več vdolbicami UIP400MTP igra ključno vlogo pri miniaturizaciji testov, kar znanstvenikom in zdravnikom omogoča, da zmanjšajo količino testov, ne da bi pri tem ogrozili natančnost ali natančnost. Ta zmogljivost je neprecenljiva na področjih, kot so mikrobiologija, odkrivanje zdravil, diagnostika, personalizirana medicina in klinična diagnostika, kjer miniaturizirani testi omogočajo učinkovitejše, stroškovno učinkovitejše in hitrejše testiranje.
- Brezkontaktna ultrazvočna razbijanje v 96-jamičnih ploščah
Brezkontaktna tehnologija ultrazvočne razbijanje UIP400MTP je idealna za miniaturizirane formate testov. Z namestitvijo plošč s 96 vdolbinicami lahko ta sonikator hkrati obdela zelo majhne volumne vzorcev v več vdolbinicah. Tradicionalne metode ultrazvočnega razbijanja se pogosto borijo z doslednostjo pri manjših količinah zaradi neenakomerne porazdelitve energije, vendar UIP400MTP zagotavlja enakomerne ultrazvočne valove v vseh vrtinah in ohranja zanesljive rezultate tudi v miniaturiziranih formatih.
- Natančnost in enakomernost med vzorci
Miniaturizacija zahteva natančen nadzor nad pripravo vzorca, saj so manjše količine lahko bolj občutljive na spremembe. Osredotočena ultrazvočna obdelava, ki jo zagotavlja UIP400MTP, zagotavlja, da vsaka vdolbinica prejme enako raven ultrazvočne obdelave, kar je bistveno za ohranjanje natančnosti in ponovljivosti v vseh vzorcih. Ta doslednost je ključnega pomena na področjih, kot so odkrivanje zdravil in klinična diagnostika, kjer lahko tudi majhna odstopanja vplivajo na rezultate. Preberite več o osredotočeni ultrazvočni obdelavi! - Učinkovita liza celic in striženje DNK v zmanjšanih količinah
Z manjšimi količinami postaneta učinkovita liza celic in striženje DNK bolj zahtevna, vendar sta ključnega pomena za ustvarjanje visokokakovostnih rezultatov testov. Ultrazvočni valovi visoke intenzivnosti UIP400MTP so dovolj močni, da dosežejo učinkovite motnje celic in striženje DNK tudi pri zmanjšanih količinah. Ta zmogljivost omogoča raziskovalcem, da pridobijo potrebno kakovost lizatov in fragmentov DNK, ne da bi morali povečati količine, zaradi česar je idealno orodje za miniaturizirane delovne tokove.
- Prihranki pri stroških in učinkovita raba virov
Miniaturizirani testi porabijo manj reagentov in zmanjšajo odpadke vzorcev, kar je še posebej koristno pri delu z redkimi ali dragimi vzorci. UIP400MTP to podpira z omogočanjem visoko zmogljive priprave vzorcev v majhnih količinah, kar znanstvenikom omogoča, da povečajo svoje vire. Na področjih, kot je personalizirana medicina, kjer so vzorci, pridobljeni iz bolnikov, lahko omejeni, je ta učinkovitost še posebej ugodna. - Povečana prepustnost in hitrost
Z zmanjšanjem obsega testov UIP400MTP pomaga laboratorijem obdelati več vzorcev v krajšem časovnem okviru, kar znatno poveča prepustnost. Ta hitra obdelava je ključnega pomena na področjih z velikim povpraševanjem, kot sta diagnostika in odkrivanje zdravil, kjer lahko časovno občutljivi rezultati neposredno vplivajo na oskrbo bolnikov ali rezultate raziskav. Miniaturizirani testi v kombinaciji z visoko prepustnostjo UIP400MTP omogočajo hitrejše testiranje in analizo v velikem obsegu. - Podpira avtomatizacijo in visoko zmogljivo presejanje
Združljivost UIP400MTP z vsemi standardnimi formati plošč z več vdolbinicami omogoča brezhibno integracijo z avtomatiziranimi sistemi, ki se uporabljajo pri visoko zmogljivem pregledu. Ta integracija je velika prednost na področjih, kot sta mikrobiologija in odkrivanje zdravil, kjer je hitra, avtomatizirana obdelava bistvenega pomena za pregled velikih knjižnic spojin ali analizo številnih mikrobnih sevov.
UIP400MTP olajša miniaturizacijo testa z zagotavljanjem zanesljive ultrazvočne razbijanja za majhne količine, kar zagotavlja natančnost in doslednost med vzorci. Njegova sposobnost ravnanja z miniaturiziranimi testi z visoko natančnostjo, ponovljivostjo in učinkovitostjo omogoča znanstvenikom in zdravnikom, da zmanjšajo količine, hkrati pa dosežejo hitrejše, stroškovno učinkovite in visokokakovostne rezultate na različnih raziskovalnih in kliničnih področjih.
Testi, ki jih omogoča UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator
Zvočni UIP400MTP z več vdolbicami se uporablja za teste, ki vključujejo motnje celic za sproščanje beljakovin in biomolekul, raziskave biofilma in protimikrobno testiranje, kot so:
- ELISA: Sonication se uporablja, ko priprava vzorca vključuje razbijanje odprtih celic za pridobivanje beljakovinskih izvlečkov.
- Preskusi MBEC (najmanjša koncentracija izkoreninjenja biofilma): Za določanje koncentracije protimikrobnih snovi, potrebnih za izkoreninjenje uveljavljenih biofilmov. Preberite več o uporabi UIP400MTP za MBEC teste, vključno s protokolom.
- Preskusi MBIC (najmanjša zaviralna koncentracija biofilma): Za ocenjevanje sposobnosti protimikrobnih snovi, da preprečijo nastajanje biofilma.
- Preskusi kvantifikacije biofilma: Za motečenje biofilmov za merjenje biomase ali sposobnosti preživetja celic z uporabo metod, kot so štetje CFU ali spektrofotometrija.
- Visoko zmogljiv pregled drog: Za ocenjevanje učinkovitosti protimikrobnih spojin proti bakterijam, ki tvorijo biofilm, v obliki z več jamicami.
- Ekstrakcija zunajceličnega matriksa: ECM Extraction is an essential sample preparation step before numerous assays. Poiščite protokol za ekstrakcijo zunajceličnega matriksa z UIP400MTP tukaj!
- PMCA: Protein Misfolding Cyclic Amplification is an indispensable step for reliable prion detection. Learn how the UIP400MTP facilitates high-throughput PMCA for robust results!
Literatura / Reference
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Pogosto zastavljena vprašanja
Kaj je Assay Sonication?
Ultrazvočna razbijanje je tehnika, ki uporablja ultrazvočne valove za motnje celic, striženje DNK in raztapljanje beljakovin ali kromatina, kar omogoča učinkovito pripravo vzorcev za biokemične teste.
Kaj je test?
Test je laboratorijski postopek, ki se uporablja za merjenje prisotnosti, količine ali aktivnosti določene snovi ali analita v vzorcu, pogosto za oceno bioloških, kemijskih ali biokemičnih lastnosti. Testi so pogost postopek v kliničnih laboratorijih, znanosti o življenju, molekularni biologiji, farmakologiji, okoljski biologiji in rudarstvu.
Kakšna je razlika med testom in testom?
Pogoji “Testom” in “preizkus” se pogosto uporabljajo zamenljivo, vendar imajo v znanstvenih kontekstih različne pomene:
- Testom: Preskus je natančen, kvantitativni ali polkvantitativni analitski postopek, namenjen merjenju prisotnosti, količine ali funkcionalne aktivnosti določene snovi (analita) v vzorcu. Testi so običajno dobro opredeljeni, ponovljivi protokoli, ki se uporabljajo za ocenjevanje čistosti, koncentracije ali biološke aktivnosti. Pogosto se uporabljajo v biokemičnih, farmakoloških ali kemijskih analizah.
- Preizkus: Test je širši izraz, ki se nanaša na katero koli metodo ali postopek, ki se uporablja za ocenjevanje lastnosti ali funkcionalnosti vzorca ali sistema. Testi so lahko kvalitativni ali kvantitativni in lahko segajo od preprostih ocen (npr. pH test) do bolj zapletenih ocen. Za razliko od testov preskusi morda ne zahtevajo tako visoke stopnje specifičnosti ali kvantitativnega merjenja.
Če povzamemo, medtem ko so vsi testi testi, niso vsi testi testi. Testi so običajno bolj specifični in kvantitativni, medtem ko lahko testi vključujejo širok spekter postopkov z različno specifičnostjo in podrobnostmi.
Katere so tri vrste testov?
Tri glavne vrste testov so:
- Biokemični testi: Ti testi merijo aktivnost ali koncentracijo specifičnih molekul (kot so encimi, substrati ali metaboliti) v biokemičnih reakcijah. Pogosto se uporabljajo za analizo encimske kinetike, vezavnih afinitet in presnovnih poti.
- Preskusi na osnovi celic: Celični testi ocenjujejo učinke spojin, beljakovin ali drugih snovi na žive celice. Merijo parametre, kot so sposobnost preživetja celic, proliferacija, citotoksičnost, signalne poti in izražanje genov, kar zagotavlja vpogled v celične odzive in učinke zdravil.
- Imunski testi: Imunski testi uporabljajo protitelesa za odkrivanje in kvantificiranje specifičnih antigenov ali analitov v vzorcu. Pogosti tipi vključujejo ELISA (encimski imunosorbentni test), zahodno blotting in imunofluorescenco. Ti testi se pogosto uporabljajo v diagnostiki in raziskavah za odkrivanje beljakovin, hormonov in patogenov.
Vsak od teh testov je bistvenega pomena pri raziskavah, diagnostiki in razvoju zdravil, saj zagotavljajo kvantitativne ali kvalitativne podatke o različnih bioloških ali kemijskih lastnostih.
Kateri so najpomembnejši testi v znanosti o življenju in mikrobiologiji?
- Encimski imunosorbentni test (ELISA): ELISA je široko uporabljen imunski test za odkrivanje in kvantifikacijo specifičnih beljakovin, protiteles ali antigenov v bioloških vzorcih. Neprecenljiv je za diagnosticiranje bolezni, sledenje imunskim odzivom in odkrivanje biomarkerjev. Sonication se uporablja za lizo celic ali tkiv za sproščanje ciljnih beljakovin pri analizi znotrajceličnih komponent.
- Preskusi verižne reakcije s polimerazo (PCR): PCR in njegove različice (kot sta qPCR in RT-PCR) razmnožujejo DNA ali RNA, kar omogoča hitro odkrivanje in kvantifikacijo specifičnega genskega materiala. Ti testi so ključnega pomena pri odkrivanju patogenov, genetskih študijah in diagnostiki. Sonication se uporablja za ekstrakcijo DNA iz celic ali tkiv, zlasti če preučujemo mikrobne ali evkariontske celice z robustnimi celičnimi stenami ali membranami.
- Zahodni blotting: Ta tehnika zazna in kvantificira specifične beljakovine v vzorcu, kar zagotavlja informacije o izražanju beljakovin, molekulski masi in posttranslacijskih modifikacijah. V veliki meri se uporablja v molekularni biologiji in raziskavah bolezni. Sonication se uporablja za liziranje celic ali tkiv za sproščanje in striženje beljakovin, ki jih pripravljajo na analizo.
- Poročevalec Gene ugotavlja: Ti testi merijo izražanje genov in regulativno aktivnost z uvedbo reporterskih genov, kot sta GFP ali luciferaza, v celice. Pogosto se uporabljajo za preučevanje izražanja genov, aktivnosti promotorjev in učinkov zdravil na signalne poti. Sonication se včasih uporablja pri lizi celic za analizo reporterskih genskih produktov, kot so encimi, kot je luciferaza, v celičnih testih.
- Testi kromatinske imunoprecipitacije (ChIP): Testi ChIP raziskujejo interakcije protein-DNA, kar raziskovalcem omogoča preučevanje transkripcijskih faktorjev, sprememb histonov in epigenetske regulacije izražanja genov, kar je pomembno v študijah regulacije genov in raziskavah bolezni. Sonication je ključni korak za striženje kromatina v ustrezne velikosti fragmentov, kar omogoča učinkovito imunoprecipitacijo.
- Luminexovi testi: Ti testi na osnovi multipleksnih kroglic hkrati merijo več analitov (npr. Citokine, hormone) v enem vzorcu, kar je koristno pri imunologiji, onkologiji in odkrivanju biomarkerjev. Sonication se uporablja za pripravo celičnih ali tkivnih lizatov za merjenje znotrajceličnih analitov, vendar ni potrebna za vzorce plazme ali seruma.

Hielscher Ultrasonics proizvaja visoko zmogljive ultrazvočne homogenizatorje iz laboratorij k industrijska velikost.