Как обработка ультразвуком может значительно усилить действие лизоцима при лизисе бактериальных клеток
, Kathrin Hielscher, опубликовано в разделе Новости Hielscher
Разрушение бактериальных клеток – важнейший этап в биотехнологии, фармацевтических исследованиях и производстве белков. Одно из наиболее распространённых средств для этой задачи – лизоцим, фермент, ослабляющий клеточные стенки бактерий. Однако, несмотря на эффективность лизоцима, сам по себе он часто действует недостаточно быстро или интенсивно – особенно при работе с плотными культурами или бактериями, модифицированными для сверхэкспрессии белков.
Здесь на помощь приходит обработка ультразвуком. Исследователи всё чаще используют ультразвуковую обработку для значительного повышения эффективности лизиса клеток с помощью лизоцима. При совместном применении лизоцим и обработка ультразвуком образуют высокоэффективную взаимодополняющую систему, обеспечивающую более быстрые, полные и воспроизводимые результаты.
Почему одного лизоцима часто недостаточно
Лизоцим действует, расщепляя пептидогликан – ключевой структурный компонент клеточных стенок бактерий. Этот ферментативный подход отличается мягким воздействием и широко применяется, особенно для E. coli. Однако в реальных лабораторных условиях обработка одним лишь лизоцимом может иметь ограничения.
К распространённым проблемам относятся:
- Неполное разрушение клеток в культурах высокой плотности или агрегированных культурах
- Длительное время инкубации
- Снижение эффективности в отношении бактерий со сверхэкспрессией или бактерий, адаптированных к стрессу
- Вариабельность от партии к партии
Эти ограничения могут отрицательно влиять на последующие процессы, такие как экстракция белков, осветление и очистка, – в конечном итоге снижая выход и стабильность результатов.
Научные основы синергии лизоцима и обработки ультразвуком
При обработке ультразвуком в жидкий образец вводятся ультразвуковые волны высокой интенсивности. Эти волны создают микроскопические пузырьки, которые быстро схлопываются в процессе, известном как кавитация. Возникающие силы сдвига, изменения давления и микроструи физически разрушают клеточные структуры.
Когда обработку ультразвуком применяют после обработки лизоцимом или одновременно с ней, эти два метода взаимно усиливают друг друга несколькими важными способами:
- Облегчение доступа к клеточной стенке
Лизоцим ослабляет клеточную стенку бактерий, делая её гораздо более уязвимой к механическим силам, создаваемым ультразвуком. - Более быстрый лизис клеток
Ультразвуковая энергия значительно сокращает время, необходимое для полного разрушения клеток, по сравнению с одной лишь ферментативной обработкой. - Более равномерная обработка
Обработка ультразвуком улучшает перемешивание, обеспечивая равномерное воздействие как лизоцима, так и механических нагрузок на все клетки. - Более высокий выход белков
Более полный лизис означает большее высвобождение внутриклеточных белков, ферментов и метаболитов – это повышает общую степень извлечения.
Типичная последовательность обработки ультразвуком с применением лизоцима
В лабораториях, работающих с бактериальными штаммами со сверхэкспрессией, широко используемая последовательность обработки сочетает ферментативный и ультразвуковой лизис:
- Ресуспендирование клеток
Собранный осадок бактериальных клеток ресуспендируют в подходящем буфере для лизиса, содержащем лизоцим, обычно в концентрациях 0,1–1 mg/mL. Мягкая обработка ультразвуком способствует быстрому и равномерному ресуспендированию клеток. - Предварительная ферментативная обработка
Суспензию инкубируют в течение 10–30 минут при контролируемой температуре (обычно от 4 °C до 25 °C), позволяя лизоциму ослабить клеточную стенку. - Ультразвуковое разрушение
Предварительно обработанную суспензию подвергают обработке ультразвуком с помощью ультразвукового процессора Hielscher, используя оптимизированные амплитуду, импульсный режим и охлаждение. - Осветление
Клеточные остатки удаляют центрифугированием или фильтрацией, получая осветлённый лизат, богатый целевыми белками.
Почему исследователи выбирают ультразвуковые аппараты Hielscher
Ультразвуковые аппараты Hielscher особенно хорошо подходят для лизиса клеток с применением лизоцима благодаря своей точности и гибкости. Основные преимущества включают:
- Регулируемые амплитуда и подводимая энергия для воспроизводимой обработки
- Работа в импульсном режиме для уменьшения накопления тепла
- Эффективная кавитация в широком диапазоне объёмов и вязкостей
- Простое масштабирование от лабораторных образцов микролитрового объёма до промышленного производства
Это сочетание делает системы Hielscher ценными инструментами как в исследовательских лабораториях, так и на крупных производственных предприятиях.
Ультразвуковой аппарат UIP400MTP для многолуночных планшетов для высокопроизводительной подготовки образцов
Ключевые факторы оптимизации результатов
Чтобы максимально использовать возможности обработки ультразвуком с применением лизоцима, исследователи тщательно настраивают несколько параметров:
- Концентрация лизоцима: Используйте минимальную эффективную дозу, чтобы контролировать затраты и свести к минимуму помехи на последующих этапах.
- Ультразвуковая энергия: Применяйте достаточную мощность для обеспечения полного лизиса без повреждения чувствительных белков.
- Контроль температуры: Системы охлаждения или ледяные бани помогают защитить термочувствительные целевые вещества.
- Настройки импульсного режима: Прерывистая обработка ультразвуком повышает эффективность кавитации и стабильность образцов.
Усильте действие лизоцимов с помощью обработки ультразвуком!
Сочетание лизоцима с ультразвуковым разрушением обеспечивает надёжное и высокоэффективное решение для лизиса бактериальных клеток. Обработка ультразвуком повышает эффективность ферментативной обработки, обеспечивая более быструю обработку, более полное разрушение и более высокий выход внутриклеточных продуктов.
Используя точно регулируемые и масштабируемые ультразвуковые системы, такие как системы Hielscher, исследователи могут тонко настраивать свои рабочие процессы в соответствии с требованиями современной биотехнологии – как в небольшой лаборатории, так и на промышленной производственной линии.
Высокопроизводительный лизис бактерий с помощью ультразвукового аппарата UIP400MTP для микропланшетов
Литература / Ссылки
- Ghosh, A., Bhar, K. & Siddhanta, A. (2019): Oxygen sequestration by Leghemoglobin is positively regulated via its interaction with another late nodulin, Nlj16 of Lotus japonicus. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 28, 2019. 414–423.
- Hannah K. Lembke; Adeline Espinasse; Mckenna G. Hanson; Christian J. Grimme;Zhe Tan; Theresa M. Reineke; Erin E. Carlson (2023): Cationic Polymers Enable Internalization of Negatively Charged Chemical Probes into Bacteria. ACS Chem Biol . 2023 September 15; 18(9): 2063–2072.
- Müller MRA, Ehrmann MA, Vogel RF (2000): Multiplex PCR for the Detection ofLactobacillus pontis and Two Related Species in a Sourdough Fermentation. Applied Environmental Microbiology 66, 2000.
- Di Giosia, Matteo; Bomans, Paul; Bottoni, Andrea; Cantelli, Andrea; Falini, Giuseppe; Franchi, Paola; Guarracino, Giuseppe; Friedrich, Heiner; Lucarini, Marco; Paolucci, Francesco; Rapino, Stefania; Sommerdijk, Nico; Soldà, Alice; valle, Francesco ; Zerbetto, Francesco; Calvaresi, Matteo (2018): Proteins as Supramolecular Hosts for C60: A True Solution of C60 in Water. Nanoscale 10(21); 2018.
Часто задаваемые вопросы
Что такое лизоцимы?
Лизоцимы – это антимикробные ферменты, которые катализируют гидролиз β(1→4)-гликозидных связей в пептидогликане, ключевом структурном компоненте клеточных стенок бактерий, вызывая ослабление клеточной стенки и лизис, особенно у грамположительных бактерий и грамотріцательных клеток с повышенной проницаемостью.
Каковы преимущества и ограничения лизиса клеток с использованием лизосом?
Лизис клеток с использованием лизоцимов обладает такими преимуществами, как мягкие условия реакции, сохранение функциональности белков и низкая механическая нагрузка, однако его ограничивают медленная кинетика, неполный лизис в плотных или устойчивых бактериальных культурах, сниженная эффективность в отношении неповреждённых наружных мембран грамотрицательных бактерий и вариабельность, зависящая от физиологии клеток и условий роста.
Как обработка ультразвуком усиливает действие лизоцимов?
Обработка ультразвуком усиливает активность лизоцима, механически разрушая клеточные стенки бактерий и повышая их проницаемость за счёт сил сдвига, возникающих при кавитации. Это улучшает доступ фермента к пептидогликану, ускоряет кинетику лизиса и обеспечивает более полное и однородное разрушение клеток.

