Metabolomika, ko veicina augstas caurlaidspējas ultraskaņas apstrāde
Metabolomika ir pētniecības joma, kurā tiek izmantotas augstas caurlaidspējas metodes, lai raksturotu un kvantificētu mazas molekulas dažādos biofluīdos, piemēram, urīnā, serumā, plazmā, izkārnījumos un siekalās, atklājot unikālus vielmaiņas parakstus. Augstas caurlaidspējas ultraskaņas UIP400MTP, kas paredzēta vairāku urbumu plāksnēm, ir spēcīgs līdzeklis šo paraugu šūnu lizēšanai, veicinot metabolītu izdalīšanos lejupējai analīzei. Šī precīzā un uzticamā pieeja ir būtiska metabolomikai, kur vissvarīgākais ir precīzs pētījuma dizains, rūpīga paraugu sagatavošana, optimizēta platformas iestatīšana, visaptveroša datu analīze un jēgpilna bioloģiskā interpretācija. Metabolomikā tiek izmantotas gan mērķtiecīgas pieejas, kas koncentrējas uz konkrētām molekulu klasēm, piemēram, ogļhidrātiem, lipīdiem un aminoskābēm, gan nemērķa metodes, kas sniedz plašu pārskatu par metaboliskajiem profiliem paraugā, atklājot metaboliskās signalizācijas sarežģīto sarežģītību.
UIP400MTP ir bezkontakta, augstas caurlaidspējas sonikators šūnu līzei un metabolītu ekstrakcijai vairāku iedobju plāksnēs
Augstas caurlaidspējas parauga sagatavošana ar 96 urbumu plāksnes Sonicator UIP400MTP
Bezkontakta ultraskaņas UIP400MTP izmantošana kombinācijā ar 96 urbumu plāksnēm ir efektīva metode augstas caurlaidspējas homogenizācijai un metabolītu ekstrakcijai. Šī iestatīšana ļauj izvairīties no tieša kontakta ar paraugu, samazinot savstarpējas inficēšanās risku, vienlaikus apstrādājot vairākus paraugus.
Soli pa solim homogenizācijas protokols ar 96-Well Sonicator UIP400MTP
- metabolomisko paraugu sagatavošana
Paraugu izvietojums: Katru paraugu (piemēram, fekālijas, zarnu audus vai luminālo saturu) izdala atsevišķās iedobēs ar 96 iedobju plati vai mikroplati.
Šķīdinātāju: Organiskie šķīdinātāji, piemēram, metanols, etanols, acetonitrils, hloroforms un to (ūdens) maisījumi, ir būtiski metabolītu ekstrakcijai, palīdzot intracelulārajiem metabolītiem izdalīties no šūnu matricas. Katrā iedobē izmanto 100–300 μl šķīdinātāja, nodrošinot pietiekamu tilpumu, lai paraugu pilnībā iegremdētu.
Iekšējie standarti: Pēc izvēles katrai iedobei pievieno iekšējos standartus, lai normalizētu pakārtotās metabolomiskās analīzes laikā. - Sakabes vidēja iestatīšana
Ūdens līmenis: Novietojiet 96well plāksni uz ultraskaņas platformas, kas piepildīta ar ūdeni (sakabes vide), kā aprakstīts rokasgrāmatā. - UIP400MTP parametru konfigurācija
Barošanas iestatījumi: Pielāgojiet ultraskaņas amplitūdu līdz 50–80% no maksimālās jaudas, lai nodrošinātu efektīvu homogenizāciju.
Pulsa režīms: Iestatiet ultraskaņas ciklu uz alternatīviem impulsiem (piemēram, 30 sekundes IESLĒGTS, 30 sekundes IZSLĒGTS), lai ļautu dzesēt un novērstu parauga pārkaršanu.
Kopējais laiks: 4–10 minūtes, atkarībā no parauga sarežģītības un izturības.
Temperatūras kontrole: Izmantojiet laboratorijas dzesētāju, lai uzturētu ūdeni 4–8 ° C temperatūrā ultraskaņas apstrādes laikā, lai aizsargātu karstumjutīgus metabolītus. - ultraskaņas apstrādes process
Sāciet ultraskaņas ciklu UIP400MTP.
Pārraugiet procesu, izmantojot UIP400MTP saskarni.
Kavitācijas efekts homogenizēs paraugus un lizēs šūnas iedobēs, atbrīvojot intracelulāros metabolītus šķīdinātājā. - PostSonication
Centrifugēšanas: Pēc ultraskaņas apstrādes, ja nepieciešams, pārnesiet plāksnes saturu savākšanas mēģenēs. Centrifugē ar 4 000–6 000 × g 10 minūtes, lai granulētu nešķīstošus gružus un šūnu materiālu.
Supernatant kolekcija: Centrifugātu uzmanīgi pārnes no katras iedobes jaunās mēģenēs vai platēs analīzei.
Izvēles žāvēšana: Ja nepieciešama koncentrācija, žāvējiet centrifugātus, izmantojot vakuuma koncentratoru (piemēram, SpeedVac), tad izšķīdiniet nelielā tilpumā atbilstoša šķīdinātāja.
Izmantojiet UIP400MTP multi-well-plate sonicator augstas caurlaidspējas apstrādes jaudu un atvieglojiet metabolomisko izpēti un analīzi!
UIP400MTP augstas caurlaidspējas sonikators metabolomikas pētījumiem vairāku iedobju platēs, 96 iedobju platēs, mēģenēs un Petri trauciņos.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator augstas caurlaidspējas paraugu sagatavošanai metabolomikas pētījumos.
Bezkontakta ultraskaņas apstrādes princips ar UIP400MTP
UIP400MTP izmanto ultraskaņas viļņus 96 urbumu plāksnes akām netieši, izmantojot sakabes vidi (piemēram, ūdeni). Šie viļņi rada kavitāciju, kas traucē šūnas un atbrīvo metabolītus bez fiziska kontakta starp ultraskaņas zondi un paraugu.
“Es rakstu, lai pateiktos jums par mūsu fantastisko pieredzi, izmantojot jūsu UIP400MTP sonikatoru, lai nodrošinātu vienmērīgu un konsekventu fekāliju mikrobioma paraugu baktēriju līzi. Mēs virzām aploksni augstas caurlaidspējas līzes tehnoloģijai, un jūsu instruments ir labi piemērots šim uzdevumam. Daži no galvenajiem akcentiem ir šādi:
- Darbības vienkāršība – Instruments ir viegli lietojams, un pielāgošana ir vienkārša, izmantojot izvēlnes izvēles
- augsta caurlaidspēja – lieliski piemērots plākšņu apstrādei ar 96 paraugiem vienlaikus
- Pat visu kuģu ultraskaņas apstrāde – Ierīce spēja piegādāt tādu pašu daudzumu ultraskaņas uz visām akām, kas bija ļoti svarīgi mūsu lietojumam
- Hielscher komandas atbalsts – Atbalsts bija lielisks, jūs vienmēr bijāt mums blakus treniņos, lai atbildētu uz mūsu jautājumiem un risinātu problēmas, ar ieteikumiem, kas palīdzēja mums sasniegt mūsu mērķi.
Vēlreiz paldies par jūsu palīdzību un palīdzību, jo mēs strādājām, lai optimizētu mūsu protokolus.”
Marks D. Driskols, Ph.D. – Galvenais zinātniskais darbinieks – Intus Biosciences
Vairāku urbumu plāksnes ultraskaņas UIP400MTP atvieglo augstas caurlaidspējas paraugu sagatavošanu, piemēram, metabolītu pētniecībā un analīzē.
96 urbumu plāksnes sonikators UIP400MTP: Ultraskaņas pārraides šķidrums ieskauj visas akas un nodrošina vienmērīgu katra parauga ultraskaņu
UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator galvenās iezīmes
| augstas caurlaidspējas ultraskaņas apstrāde | Lieliski piemērots 96 urbumiem un citām daudzprofilu plāksnēm, UIP400MTP ļauj vienlaicīgi, identiski apstrādāt ar ultraskaņu vairākiem paraugiem, ievērojami saīsinot paraugu sagatavošanas ilgumu un palielinot lielu paraugu skaita testēšanas caurlaidspēju. |
| Izmantojiet izvēlēto Multiwell plāksni | UIP400MTP ir paredzēts, lai apstrādātu visas standarta daudzvietīgās plāksnes, PCR plāksnes vai mikrotitrēšanas plāksnes. Jūs izvēlaties saviem eksperimentiem vispiemērotāko plati. Tā kā UIP400MTP nav nepieciešami patentēti palīgmateriāli, tas ietaupa daudz naudas! |
| Bezkontakta ultrasonikācija | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP izmanto intensīvu ultraskaņu, neko neievietojot paraugā. Jūs varat apstrādāt ealed daudzviet plāksnes, slēgtus traukus un flakonus. Hielscher piegādā jums pielāgotus paraugu turētājus visiem nestandarta flakoniem vai traukiem. |
| Precizitāte un kontrole | Precīza kontrole un viedā programmatūra ļauj optimāli iestatīt ultraskaņas parametrus, kas atbilst jūsu īpašajām apstrādes vajadzībām. Jūs saņemat maksimālu ultraskaņas apstrādes efektivitāti un efektivitāti katram eksperimentam. |
| temperatūras kontrole | Iestatiet noteiktu temperatūru jūsu ultraskaņas apstrādei. UIP400MTP plāksnes sonikators var uzraudzīt parauga temperatūru un attiecīgi pielāgot ultraskaņu. Recirkulācijas dzesēšanas šķidrums atdzesē katru iedobi platē, lai precīzi kontrolētu temperatūru. |
| Protokols un tālvadība | Katru ultraskaņas darbību var kontrolēt no datora. Programmatūras instalēšana nav nepieciešama. Varat izmantot savu standarta pārlūkprogrammu (piemēram, Chrome, Firefox, Edge vai Safari) jebkurā operētājsistēmā (piemēram, MacOS, Windows, Android, iOS vai Linux), lai attālināti vadītu un uzraudzītu UIP400MTP. Katrs ultraskaņas apstrādes posms rada detalizētu ultraskaņas apstrādes protokolu novērtēšanai un dokumentācijai. Protokola fails ir nepatentētā CSV formātā, kuru var atvērt ar vēlamo programmu, piemēram, Microsoft Excel, Apple Numbers vai OpenOffice Calc. |
| Izturīgs un uzticams | Projektēts un būvēts Vācijā atbilstoši augstākajiem kvalitātes standartiem, UIP400MTP ir ne tikai jaudīgs, bet arī ļoti izturīgs. Tā dizains atbilst rūpniecības standartiem un viegli iztur ikdienas lietošanas stingrību prasīgā laboratorijas vidē. Jūs varat izmantot UIP400MTP nepārtraukti 24 stundas 7 dienas nedēļā augstas caurlaidspējas operācijās. |
- augsta efektivitāte
- vismodernākās tehnoloģijas
- uzticamība & Stabilitāti
- regulējama, precīza procesa vadība
- inteliģenta programmatūra
- viedās funkcijas (piemēram, programmējamas, datu protokolēšana, tālvadības pults);
- viegli un droši lietojams
- zema apkope
- CIP (tīrā vietā)
Projektēšana, ražošana un konsultācijas – Kvalitāte ražots Vācijā
Hielscher ultrasonikatori ir labi pazīstami ar saviem augstākajiem kvalitātes un dizaina standartiem. Robustums un viegla darbība ļauj vienmērīgi integrēt mūsu ultrasonikatorus rūpnieciskajās iekārtās. Hielscher ultrasonikatori viegli apstrādā neapstrādātus apstākļus un prasīgu vidi.
Hielscher Ultrasonics ir ISO sertificēts uzņēmums un īpašu uzsvaru liek uz augstas veiktspējas ultrasonikatoriem, kas piedāvā vismodernākās tehnoloģijas un lietotājdraudzīgumu. Protams, Hielscher ultrasonikatori atbilst CE prasībām un atbilst UL, CSA un RoHs prasībām.
Bezkontakta ultraskaņas UIP400MTP metabolomiskā parauga sagatavošanai mikroplatēs.
Literatūra / Atsauces
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Biežāk uzdotie jautājumi par metabolomikas pētījumiem
Kas ir mikrobioms?
Mikrobioms attiecas uz mikroorganismu, tostarp baktēriju, vīrusu, sēnīšu un arheju, kolektīvo kopienu, kā arī to ģenētisko materiālu, kas apdzīvo noteiktu vidi, piemēram, cilvēka ķermeni. Tam ir izšķiroša loma saimniekorganisma veselībā, ietekmējot vielmaiņu, imūno funkciju un aizsardzību pret patogēniem, vienlaikus to veido tādi faktori kā uzturs, dzīvesveids un vide.
Kas ir metabolomika?
Metabolomika ir visaptverošs metabolītu pētījums, kas ir mazas molekulas, kas rodas vielmaiņas procesos bioloģiskajā sistēmā. Tas ietver šo molekulu identificēšanu, kvantificēšanu un analīzi, lai izprastu šūnu funkcijas, vielmaiņas ceļus un to, kā tie reaģē uz ģenētiskām, vides vai patoloģiskām izmaiņām.
Kas ir metabolome?
Metaboloms ir pilns mazu molekulu jeb metabolītu kopums, kas noteiktā laikā atrodas bioloģiskā sistēmā, piemēram, šūnā, audos vai organismā. Tas atspoguļo sistēmas bioķīmisko aktivitāti un fizioloģisko stāvokli, sniedzot ieskatu vielmaiņā un tās mijiedarbībā ar vidi.
Hielscher Ultrasonics ražo augstas veiktspējas ultraskaņas homogenizatorus no Lab līdz rūpnieciskais izmērs.