Uji Sonikasi – Sonokasior Assay-At-Once UIP400MTP
Sonikasi adalah teknik penting dalam protokol laboratorium, terutama untuk aplikasi seperti uji imunopresipitasi kromatin (ChIP). Dengan menggunakan energi ultrasonik untuk memecah sel, geser DNA, dan melarutkan kromatin, sonikasi memungkinkan peneliti untuk menyiapkan sampel dengan lebih efisien dan dapat direproduksi. Sonikator pelat multi-sumur Hielscher adalah salah satu alat paling canggih dan efektif yang tersedia untuk tujuan ini, merampingkan alur kerja throughput tinggi dengan mengakomodasi hingga pelat 96 sumur.
Keuntungan Utama Sonicator Pelat Multi-Sumur untuk Pengujian
Sonikator pelat 96-sumur non-kontak Hielscher, seperti UIP400MTP, menawarkan pendekatan yang sangat andal dan terkontrol untuk lisis sel dan geser kromatin. Desain non-kontak ini memastikan bahwa setiap sumur diperlakukan secara seragam, memberikan hasil yang konsisten di seluruh jumlah sampel yang tinggi. Dengan sonicator ini, peneliti dapat melakukan beberapa proses, termasuk:
- Lisis Sel: Sonikasi yang efektif memecahkan membran sel terbuka, melepaskan isi seluler.
- Geser DNA dan RNA: Gelombang ultrasonik intensitas tinggi memecah DNA dan RNA ke ukuran yang diinginkan, penting untuk pengujian hilir.
- Fragmentasi Kromatin: Memotong kromatin menjadi potongan-potongan kecil untuk analisis hilir, seperti imunopresipitasi kromatin (ChIP), pengurutan DNA, atau studi epigenetik lainnya. Baca lebih lanjut tentang fragmentasi kromatin menggunakan UIP400MTP!
- Pelarutan: Meningkatkan kelarutan komponen sampel, membantu dalam persiapan sampel uji yang seragam dan dapat direproduksi.
Fungsi-fungsi ini sangat penting untuk persiapan sampel throughput tinggi dan miniaturisasi sampel, karena memungkinkan peneliti memproses beberapa sampel dengan risiko kontaminasi silang yang minimal.
Pentingnya Sonikasi dalam Uji ChIP
Uji Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) bergantung pada pemotongan kromatin yang tepat untuk menghasilkan fragmen DNA dengan ukuran optimal, biasanya antara 200-600 pasangan basa (bp). Fragmen ini diperlukan untuk imunopresipitasi yang efektif, resolusi puncak yang akurat, dan hasil yang andal dalam pengujian ChIP-Seq. Sonikator Hielscher UIP400MTP Assay-At-Once sangat cocok untuk protokol ChIP, memberikan fragmentasi kromatin yang seragam di beberapa sumur. Manfaat dari presisi ini dalam alur kerja ChIP meliputi:
- Hasil Kromatin Tinggi: Sonikasi yang efisien melepaskan lebih banyak kromatin dari setiap sampel.
- Konsistensi di seluruh sampel: Sonikator multi-sumur mempertahankan ukuran fragmen yang konsisten di semua sumur, mengurangi variabilitas dalam pengujian ChIP.
- Sensitivitas dan resolusi yang ditingkatkan dalam ChIP-Seq: DNA yang terfragmentasi dengan benar memastikan resolusi puncak yang lebih jelas, faktor penting dalam mendeteksi interaksi protein-DNA yang tepat.
Peran Sonikasi yang Andal dalam Pengujian yang Sukses
Untuk pengujian yang melibatkan jumlah sampel yang tinggi, seperti dalam diagnostik klinis atau penemuan obat, reproduktifitas dan throughput sangat penting. Sonicator pelat multi-sumur Hielscher memberikan solusi dengan memfasilitasi persiapan sampel yang seragam di sejumlah besar sumur. Konsistensi ini tidak hanya meningkatkan ketahanan pengujian tetapi juga meningkatkan efisiensi alur kerja secara keseluruhan, menghemat waktu dan sumber daya di laboratorium.
Sonikator pelat multi-sumur Hielscher sangat berharga dalam protokol pengujian, terutama yang membutuhkan pemrosesan throughput tinggi. Dengan memastikan lisis sel yang andal, geser DNA, dan pelarutan, sonicator ini mengoptimalkan persiapan sampel untuk hasil yang akurat dan dapat direproduksi. Untuk peneliti yang bekerja dengan uji ChIP, sonicator UIP400MTP menawarkan alat yang kuat yang meningkatkan hasil kromatin, konsistensi fragmen, dan sensitivitas pengujian—pada akhirnya mengarah pada eksperimen yang lebih sukses dan wawasan yang lebih jelas.
Fitur Utama Sonicator Multiwell UIP400MTP
Sonikasi throughput tinggi | Sangat cocok untuk 96-sumur dan pelat multiwell lainnya, UIP400MTP memungkinkan sonikasi simultan dan identik dari beberapa sampel, secara signifikan mempersingkat durasi persiapan sampel dan meningkatkan throughput pengujian jumlah sampel yang tinggi. |
Gunakan pelat multiwell pilihan Anda | UIP400MTP ini dirancang untuk sonikasi pelat multiwell standar, pelat PCR, atau pelat mikrotiter. Anda memilih piring yang paling cocok untuk eksperimen Anda. Karena UIP400MTP tidak memerlukan bahan habis pakai berpemilik, ini menghemat banyak uang! |
Ultrasonikasi Non-Kontak | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP menerapkan ultrasound intens tanpa memasukkan apa pun ke dalam sampel. Anda dapat sonikasi pelat multiwell ealed, bejana tertutup, dan vial. Hielscher memasok Anda pemegang sampel yang disesuaikan untuk botol atau bejana non-standar. |
Presisi dan Kontrol | Kontrol presisi dan perangkat lunak cerdas memungkinkan Anda mengatur parameter ultrasonik agar sesuai dengan kebutuhan pemrosesan spesifik Anda secara optimal. Anda mendapatkan efisiensi dan efektivitas sonikasi maksimum untuk setiap percobaan. |
kontrol suhu | Atur suhu tertentu untuk sonikasi Anda. Sonicator pelat UIP400MTP dapat memantau suhu sampel dan menyesuaikan sonikasi yang sesuai. Cairan pendingin yang bersirkulasi kembali mendinginkan setiap sumur di pelat untuk kontrol suhu yang tepat. |
Protokol dan Remote Control | Setiap sonikasi dapat dikontrol dari komputer. Tidak diperlukan instalasi perangkat lunak. Anda dapat menggunakan browser standar Anda (misalnya Chrome, Firefox, Edge, atau Safari) pada sistem operasi apa pun (misalnya MacOS, Windows, Android, iOS, atau Linux) untuk mengontrol dan memantau UIP400MTP dari jarak jauh. Setiap sonikasi menghasilkan protokol sonikasi terperinci untuk evaluasi dan dokumentasi. File protokol dalam format CSV non-eksklusif, yang dapat Anda buka dengan program pilihan Anda, misalnya Microsoft Excel, Apple Numbers, atau OpenOffice Calc. |
kuat dan dapat diandalkan | Dirancang dan dibangun di Jerman dengan standar kualitas tertinggi, UIP400MTP ini tidak hanya bertenaga tetapi juga sangat tahan lama. Desainnya memenuhi standar industri dan dengan mudah menahan kerasnya penggunaan sehari-hari di lingkungan laboratorium yang menuntut. Anda dapat menggunakan UIP400MTP terus menerus 24 jam, 7 hari seminggu dalam operasi throughput tinggi. |
Bagaimana UIP400MTP Memfasilitasi Miniaturisasi Pengujian
UIP400MTP sonicator pelat multi-sumur Hielscher memainkan peran penting dalam miniaturisasi pengujian, memungkinkan para ilmuwan dan dokter untuk mengurangi volume pengujian tanpa mengorbankan akurasi atau presisi. Kemampuan ini sangat berharga di berbagai bidang seperti mikrobiologi, penemuan obat, diagnostik, pengobatan yang dipersonalisasi, dan diagnostik klinis, di mana pengujian miniatur memungkinkan pengujian yang lebih efisien, hemat biaya, dan cepat.
- Sonikasi Non-kontak dalam Pelat 96-Sumur
Teknologi sonikasi non-kontak UIP400MTP sangat cocok untuk format pengujian miniatur. Dengan mengakomodasi pelat 96 sumur, sonicator ini dapat memproses volume sampel yang sangat kecil secara bersamaan di beberapa sumur. Metode sonikasi tradisional sering berjuang dengan konsistensi pada volume yang lebih rendah karena distribusi energi yang tidak merata, tetapi UIP400MTP memberikan gelombang ultrasonik yang seragam di semua sumur, mempertahankan hasil yang dapat diandalkan bahkan dalam format miniatur.
- Presisi dan Keseragaman di Seluruh Sampel
Miniaturisasi memerlukan kontrol yang tepat atas persiapan sampel, karena volume yang lebih kecil dapat lebih sensitif terhadap variasi. Sonikasi terfokus yang disampaikan oleh UIP400MTP memastikan bahwa setiap sumur menerima tingkat sonikasi yang identik, yang penting untuk menjaga akurasi dan reproduktifitas di semua sampel. Konsistensi ini adalah kunci dalam bidang-bidang seperti penemuan obat dan diagnostik klinis, di mana variasi kecil pun dapat memengaruhi hasil. Baca lebih lanjut tentang sonikasi terfokus! - Lisis Sel yang Efisien dan Geser DNA dalam Volume yang Dikurangi
Dengan volume yang lebih kecil, lisis sel yang efisien dan pemotongan DNA menjadi lebih menantang, namun sangat penting untuk menghasilkan hasil pengujian berkualitas tinggi. Gelombang ultrasonik intensitas tinggi UIP400MTP cukup kuat untuk mencapai gangguan sel yang efektif dan pemotongan DNA bahkan dalam volume yang dikurangi. Kemampuan ini memungkinkan peneliti untuk mendapatkan kualitas lisat dan fragmen DNA yang diperlukan tanpa perlu meningkatkan volume, menjadikannya alat yang ideal untuk alur kerja miniatur.
- Penghematan Biaya dan Efisiensi Sumber Daya
Pengujian miniatur mengonsumsi lebih sedikit reagen dan mengurangi limbah sampel, yang sangat bermanfaat saat bekerja dengan sampel langka atau mahal. UIP400MTP mendukung hal ini dengan memungkinkan persiapan sampel throughput tinggi dalam volume kecil, memungkinkan para ilmuwan memaksimalkan sumber daya mereka. Dalam bidang-bidang seperti pengobatan yang dipersonalisasi, di mana sampel yang berasal dari pasien dapat dibatasi, efisiensi ini sangat menguntungkan. - Peningkatan Throughput dan Kecepatan
Dengan mengurangi volume pengujian, UIP400MTP membantu laboratorium memproses lebih banyak sampel dalam jangka waktu yang lebih singkat, sehingga secara signifikan meningkatkan throughput. Pemrosesan cepat ini sangat penting dalam bidang dengan permintaan tinggi seperti diagnostik dan penemuan obat, di mana hasil yang sensitif terhadap waktu dapat secara langsung memengaruhi perawatan pasien atau hasil penelitian. Pengujian miniatur yang dikombinasikan dengan kapasitas throughput tinggi UIP400MTP memungkinkan pengujian dan analisis skala besar yang lebih cepat. - Mendukung otomatisasi dan penyaringan throughput tinggi
Kompatibilitas UIP400MTP dengan format pelat multi-sumur standar memungkinkan integrasi tanpa batas dengan sistem otomatis yang digunakan dalam penyaringan throughput tinggi. Integrasi ini merupakan keuntungan utama di bidang-bidang seperti mikrobiologi dan penemuan obat, di mana pemrosesan otomatis yang cepat sangat penting untuk menyaring perpustakaan senyawa besar atau menganalisis banyak strain mikroba.
UIP400MTP memfasilitasi miniaturisasi pengujian dengan memberikan sonikasi yang andal untuk volume kecil, memastikan presisi dan konsistensi di seluruh sampel. Kemampuannya untuk menangani pengujian miniatur dengan akurasi, reproduktifitas, dan efisiensi tinggi memungkinkan para ilmuwan dan dokter untuk mengurangi volume sambil mencapai hasil yang lebih cepat, hemat biaya, dan berkualitas tinggi di berbagai bidang penelitian dan klinis.
Pengujian Difasilitasi oleh UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator
UIP400MTP sonicator pelat multi-sumur digunakan untuk pengujian yang melibatkan gangguan sel untuk melepaskan protein dan biomolekul, penelitian biofilm dan pengujian antimikroba, seperti:
- ELISA: Sonikasi digunakan ketika persiapan sampel melibatkan pemecahan sel terbuka untuk mendapatkan ekstrak protein.
- Uji MBEC (Konsentrasi Pemberantasan Biofilm Minimum): Untuk menentukan konsentrasi agen antimikroba yang diperlukan untuk memberantas biofilm yang sudah mapan. Baca lebih lanjut tentang menggunakan UIP400MTP untuk pengujian MBEC termasuk protokol.
- Uji MBIC (Konsentrasi Penghambatan Biofilm Minimum): Untuk menilai kemampuan antimikroba untuk mencegah pembentukan biofilm.
- Uji Kuantifikasi Biofilm: Untuk mengganggu biofilm untuk mengukur biomassa atau viabilitas sel menggunakan metode seperti hitungan CFU atau spektrofotometri.
- Skrining Obat Throughput Tinggi: Untuk mengevaluasi kemanjuran senyawa antimikroba terhadap bakteri pembentuk biofilm dalam format multi-sumur.
- Ekstraksi Matriks Ekstraseluler: Ekstraksi ECM adalah langkah persiapan sampel yang penting sebelum berbagai pengujian. Temukan protokol untuk Ekstraksi Matriks Ekstraseluler melalui tinggi dengan UIP400MTP di sini!
- PMCA: Amplifikasi Siklik Kesalahan Lipat Protein adalah langkah yang sangat diperlukan untuk deteksi prion yang andal. Pelajari bagaimana UIP400MTP memfasilitasi PMCA throughput tinggi untuk hasil yang kuat!
Literatur / Referensi
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Pertanyaan yang Sering Diajukan
Apa itu Uji Sonikasi?
Sonikasi uji adalah teknik yang menggunakan gelombang ultrasonik untuk mengganggu sel, memotong DNA, dan melarutkan protein atau kromatin, memungkinkan persiapan sampel yang efisien untuk uji biokimia.
Apa itu Pengujian?
Pengujian adalah prosedur laboratorium yang digunakan untuk mengukur keberadaan, kuantitas, atau aktivitas zat atau analit tertentu dalam sampel, seringkali untuk menilai sifat biologis, kimia, atau biokimia. Pengujian adalah prosedur umum di laboratorium klinis, ilmu kehidupan, biologi molekuler, farmakologi, biologi lingkungan, dan pertambangan.
Apa Perbedaan antara Pengujian dan Tes?
Istilah “Pengujian kadar logam” dan “ujian” sering digunakan secara bergantian, tetapi memiliki arti yang berbeda dalam konteks ilmiah:
- Pengujian kadar logam: Pengujian adalah prosedur analitik yang tepat, kuantitatif atau semi-kuantitatif yang dirancang untuk mengukur keberadaan, jumlah, atau aktivitas fungsional zat tertentu (analit) dalam sampel. Pengujian biasanya merupakan protokol yang terdefinisi dengan baik dan dapat direproduksi yang digunakan untuk menilai kemurnian, konsentrasi, atau aktivitas biologis. Mereka sering digunakan dalam analisis biokimia, farmakologis, atau kimia.
- Ujian: Tes adalah istilah yang lebih luas yang mengacu pada metode atau proses apa pun yang digunakan untuk mengevaluasi properti atau fungsionalitas sampel atau sistem. Tes dapat bersifat kualitatif atau kuantitatif, dan dapat berkisar dari penilaian sederhana (misalnya, tes pH) hingga evaluasi yang lebih kompleks. Tidak seperti pengujian, tes mungkin tidak memerlukan tingkat spesifisitas atau pengukuran kuantitatif yang tinggi.
Singkatnya, meskipun semua pengujian adalah tes, tidak semua tes adalah tes. Pengujian biasanya lebih spesifik dan kuantitatif, sedangkan tes dapat mencakup berbagai prosedur dengan spesifisitas dan detail yang bervariasi.
Apa Tiga Jenis Pengujian?
Tiga jenis utama pengujian adalah:
- Uji Biokimia: Uji ini mengukur aktivitas atau konsentrasi molekul tertentu (seperti enzim, substrat, atau metabolit) dalam reaksi biokimia. Mereka banyak digunakan untuk menganalisis kinetika enzim, afinitas pengikatan, dan jalur metabolisme.
- Uji Berbasis Sel: Uji berbasis sel menilai efek senyawa, protein, atau zat lain pada sel hidup. Mereka mengukur parameter seperti viabilitas sel, proliferasi, sitotoksisitas, jalur pensinyalan, dan ekspresi gen, memberikan wawasan tentang respons seluler dan efek obat.
- Immunoassay: Immunoassay menggunakan antibodi untuk mendeteksi dan mengukur antigen atau analit spesifik dalam sampel. Jenis umum termasuk ELISA (enzyme-linked immunosorbent assay), western blotting, dan immunofluorescence. Pengujian ini banyak digunakan dalam diagnostik dan penelitian untuk mendeteksi protein, hormon, dan patogen.
Masing-masing pengujian ini sangat penting dalam penelitian, diagnostik, dan pengembangan obat, karena memberikan data kuantitatif atau kualitatif tentang sifat biologis atau kimia yang berbeda.
Apa Tes Paling Penting dalam Ilmu Hayati dan Mikrobiologi?
- Uji Imunosorben Terkait Enzim (ELISA): ELISA adalah immunoassay yang banyak digunakan untuk mendeteksi dan mengukur protein, antibodi, atau antigen spesifik dalam sampel biologis. Ini sangat berharga untuk mendiagnosis penyakit, melacak respons imun, dan deteksi biomarker. Sonikasi digunakan untuk melisiskan sel atau jaringan untuk melepaskan protein target jika menganalisis komponen intraseluler.
- Uji Polymerase Chain Reaction (PCR): PCR dan variannya (seperti qPCR dan RT-PCR) memperkuat DNA atau RNA, memungkinkan deteksi dan kuantifikasi materi genetik spesifik dengan cepat. Pengujian ini sangat penting dalam deteksi patogen, studi genetik, dan diagnostik. Sonikasi digunakan untuk ekstraksi DNA dari sel atau jaringan, terutama jika mempelajari sel mikroba atau eukariotik dengan dinding atau membran sel yang kuat.
- Blotting Barat: Teknik ini mendeteksi dan mengukur protein spesifik dalam sampel, memberikan informasi tentang ekspresi protein, berat molekul, dan modifikasi pasca-translasi. Ini banyak digunakan dalam biologi molekuler dan penelitian penyakit. Sonikasi digunakan untuk melisiskan sel atau jaringan untuk melepaskan dan menggeser protein, mempersiapkannya untuk analisis.
- Uji Gen Reporter: Pengujian ini mengukur ekspresi gen dan aktivitas regulasi dengan memperkenalkan gen reporter seperti GFP atau luciferase ke dalam sel. Mereka banyak digunakan untuk mempelajari ekspresi gen, aktivitas promotor, dan efek obat pada jalur pensinyalan. Sonikasi kadang-kadang digunakan jika lisis sel untuk menganalisis produk gen reporter, seperti enzim seperti luciferase, dalam pengujian berbasis sel.
- Uji Imunopresipitasi Kromatin (ChIP): Uji ChIP menyelidiki interaksi protein-DNA, memungkinkan peneliti untuk mempelajari faktor transkripsi, modifikasi histon, dan regulasi epigenetik ekspresi gen, penting dalam studi regulasi gen dan penelitian penyakit. Sonikasi adalah langkah kunci untuk memotong kromatin menjadi ukuran fragmen yang sesuai, memungkinkan imunopresipitasi yang efektif.
- Uji Luminex: Uji berbasis manik-manik multipleks ini secara bersamaan mengukur beberapa analit (misalnya, sitokin, hormon) dalam satu sampel, berguna dalam penemuan imunologi, onkologi, dan biomarker. Sonikasi digunakan untuk menyiapkan lisat sel atau jaringan untuk mengukur analit intraseluler, tetapi tidak diperlukan untuk sampel plasma atau serum.

Hielscher Ultrasonics memproduksi homogenizer ultrasonik berkinerja tinggi dari laboratorium hingga ukuran industri.