Extracellular Matrix Extraction 96-Well Sonicator UIP400MTP-ով
Ավանդական Extracellular Matrix (EM) արդյունահանման մեթոդները հաճախ ներառում են մի քանի քայլեր՝ բիոֆիլմի մատրիցը խաթարելու համար: Այնուամենայնիվ, այս տեխնիկան կարող է ժամանակատար և անհետևողական լինել, ինչը հանգեցնում է արդյունքների փոփոխականության: UIP400MTP 96-հորանոց ափսեի ձայնագրիչով EM արդյունահանման գործընթացը զգալիորեն հեշտացվում է՝ ապահովելով բարձր արդյունավետության ձևաչափերով բիոֆիլմի բարձր արդյունավետ, ճշգրիտ և միատեսակ խափանում: UIP400MTP-ն օգտագործում է կենտրոնացված ուլտրաձայն՝ վերահսկվող կավիտացիա առաջացնելու համար՝ արդյունավետորեն քայքայելով բիոֆիլմի մատրիցը՝ միաժամանակ պահպանելով բիոֆիլմի մեջ ներկառուցված բջիջների կենսունակությունն ու ամբողջականությունը: UIP400MTP-ի օգտագործումը մեծացնում է ներքևի վերլուծությունների վերարտադրելիությունն ու ճշգրտությունը, ինչպիսիք են նյութափոխանակության և պրոտեոմիկ անալիզները, կենսունակության թեստերը և հակամանրէային զգայունության ուսումնասիրությունները: Հեշտացնելով էլեկտրաէներգիայի արտահանումը, UIP400MTP-ն հետազոտողներին հնարավորություն է տալիս հետևողական և բարձրորակ արդյունքների հասնել՝ ավելի խորը պատկերացումներ տալով կենսաֆիլմի դինամիկայի և արտաքին գործակալների հետ փոխազդեցությունների վերաբերյալ:
արտաբջջային մատրիցային արդյունահանում
Արտբջջային մատրիցը (EM) կենսաթաղանթների կարևոր բաղադրիչն է, որը ձևավորվում է այնպիսի միկրոօրգանիզմների կողմից, ինչպիսին է Candida albicans-ը: Բաղկացած պոլիսախարիդներից, սպիտակուցներից, լիպիդներից և արտաբջջային ԴՆԹ-ից՝ ԷՄ-ն ապահովում է կառուցվածքային ամբողջականություն, միջնորդում է կպչունությունը մակերեսներին և զգալիորեն նպաստում է հակամանրէային դիմադրությանը: ԷՄ-ի արդյունահանումը և վերլուծությունը կարևոր է բիոֆիլմի կենսաբանությունը հասկանալու, դեղամիջոցների դիմադրության մեխանիզմները պարզելու և նոր թերապևտիկ թիրախները բացահայտելու համար:
Արձանագրություն արտաբջջային մատրիցով (EM) արդյունահանման Candida albicans բիոֆիլմերից UIP400MTP-ով
Այս արձանագրությունը կենտրոնանում է ստատիկ Candida albicans բիոֆիլմերի արտաբջջային մատրիցայի (EM) արդյունահանման վրա: UIP400MTP sonicator-ի ինտեգրում` փոխարինելու ավանդական քերելը կամ ֆերմենտի վրա հիմնված քայլերը` բարելավված արդյունավետության և վերարտադրելիության համար:
Պահանջվող նյութեր
EM արդյունահանման քայլ առ քայլ հրահանգներ
- Ստատիկ բիոֆիլմի ձևավորում
Ստատիկ բիոֆիլմերի համար պատվաստեք C. albicans-ը 96 հորատանցք ունեցող ափսեի հորերի մեջ՝ օգտագործելով RPMI-1640 միջավայր: Յուրաքանչյուր հորատանցք պետք է պարունակի պատվաստանյութի հետևողական ծավալ (օրինակ՝ 200 µL մեկ հորատանցքում):
Ինկուբացնել թիթեղը 37°C-ում ստատիկ պայմաններում 24 ժամ, որպեսզի ջրհորի մակերեսների վրա բիոֆիլմ առաջանա: - Բիոֆիլմի պատրաստում արդյունահանման համար
Ինկուբացիայից հետո նրբորեն ասպիրացիայի ենթարկեք և հեռացրեք օգտագործված միջավայրը յուրաքանչյուր հորից՝ առանց բիոֆիլմը խանգարելու:
Յուրաքանչյուր լավ լվացեք մանրէազերծ PBS-ով (օրինակ՝ 200 µL), որպեսզի հեռացնեք թույլ կցված բջիջները և պլանկտոնային բեկորները: Կրկնեք այս քայլը երկու անգամ:
Յուրաքանչյուր հորի մեջ ավելացրեք թարմ PBS կամ արդյունահանման բուֆեր (օրինակ՝ 200 µL)՝ պատրաստվելու համար արտազատմանը: - Sonication UIP400MTP-ով
Տեղադրեք PBS կամ արդյունահանման բուֆեր պարունակող 96 հորատանցք ունեցող ափսեը UIP400MTP sonicator սկուտեղի մեջ: Բազմափոր թիթեղը ճիշտ տեղադրելու համար հետևեք ձեռնարկի հրահանգներին:
5-6 րոպե ներծծում են ներծծումը մեղմ միջավայրում (60% ամպլիտուդ, զարկերակային ռեժիմ)՝ ապահովելով բիոֆիլմի կառուցվածքի միատեսակ խախտում և EM բաղադրիչների ազատում:
Օգտագործեք UIP400MTP sonicator-ի ջերմաստիճանի վերահսկում (ջերմաստիճանի ցուցիչ և կարգավորումներ)՝ չափից ավելի տաքացումից կամ նմուշի վնասումից խուսափելու համար: - Կատիոնների փոխանակման խեժի (CER) բուժում
Յուրաքանչյուր ջրհորից փոխանցեք արտահոսող հեղուկը նոր 96 հորանի ափսեի մեջ:
Յուրաքանչյուր հորի մեջ ավելացրեք CER կասեցման կրկնակի ծավալ (պատրաստված PBS-ում կամ բուֆերում) (օրինակ՝ 400 µL ընդհանուր ծավալը մեկ հորում):
Փակեք ափսեը և ինկուբացրեք այն ափսեի թափահարողի կամ պտտվող սարքի վրա 400 պտույտ/րոպե արագությամբ 3 ժամ, որպեսզի թույլատրվի EM բաղադրիչները կապել և մեկուսացնել: - Տարանջատում և զտում
Թիթեղը ցենտրիֆուգեք 2000 × գ 10 րոպեով, որպեսզի խեժն ու բջիջները առանձնացնեն վերին հեղուկից:
Զգուշորեն տեղափոխեք EM պարունակող վերին նյութը յուրաքանչյուր հորից նոր 96 հորանի ափսե:
Զտեք վերին նյութը 0,22 մկմ ֆիլտրի միջով, օգտագործելով ափսեի վրա հիմնված վակուումային բազմազան համակարգ կամ համարժեք՝ մաքուր EM քաղվածք ստանալու համար: - ԷՄ-ի վերլուծություն
Օգտագործեք այնպիսի մեթոդներ, ինչպիսիք են UPLC-Q-TOF-MS-ը մետաբոլիտների ոչ նպատակային պրոֆիլավորման համար, կամ օգտագործեք հատուկ վերլուծություններ (օրինակ՝ BCA սպիտակուցների, տրիգլիցերիդների և ածխաջրերի քանակական փաթեթների համար)՝ EM բաղադրիչները բնութագրելու համար:
Բարձր թողունակությամբ արտաբջջային մատրիցային արդյունահանում
UIP400MTP sonicator-ով արտաբջջային մատրիցով (EM) արդյունահանման բարձր արդյունավետությունը հեղափոխել է նմուշի պատրաստումը բիոֆիլմի հատկությունների ճշգրիտ վերլուծություն պահանջող վերլուծությունների համար: UIP400MTP-ն օգտագործում է ուլտրաձայնային ալիքներ՝ ճշգրիտ և միատեսակ կերպով խաթարելու բիոֆիլմի մատրիցը՝ հնարավորություն տալով EM բաղադրիչների արդյունավետ թողարկումը՝ միաժամանակ պահպանելով բջիջների կենսունակությունը և ամբողջականությունը: Այս մոտեցումը զգալիորեն բարձրացնում է անալիզների հուսալիությունը, ինչպիսիք են կենսաֆիլմի կենսունակության թեստերը, պրոտեոմիկ և նյութափոխանակության ուսումնասիրությունները և հակամանրէային զգայունության գնահատումները:
Կենսաթաղանթի վերականգնման անալիզների համար, ինչպիսիք են գաղութների ձևավորման միավորի (CFU) հաշվարկը, EM արդյունահանումը UIP400MTP-ով ապահովում է ռեագենտների անխոչընդոտ մուտքը կենսաթաղանթում ներկառուցված բջիջներ: Նմանապես, պրոտեոմիկ և նյութափոխանակության անալիզները, ինչպիսիք են UPLC-Q-TOF-MS-ը, օգուտ են քաղում սպիտակուցների, լիպիդների և մետաբոլիտների բարձր եկամտաբեր մեկուսացումից: UIP400MTP-ն աջակցում է նաև հակամանրէային զգայունության ճշգրիտ թեստին, որը թույլ է տալիս ճշգրիտ որոշել բիոֆիլմի MIC և MBEC արժեքները: Ավելին, UIP400MTP-ով նպաստված արդյունավետ արդյունահանումը օգնում է ֆերմենտային ակտիվության վերլուծություններին, բաղադրիչների քանակականացմանը և կառուցվածքային ուսումնասիրություններին, որոնք արժեքավոր պատկերացումներ են տալիս բիոֆիլմի ճարտարապետության, կպչման և դիմադրության մեխանիզմներում արտաբջջային մատրիցների դերի մասին:
Բարձր թողունակությամբ, վերարտադրվող արդյունահանման այս մեթոդը օպտիմիզացնում է ԷՄ պատրաստումը` ապահովելով բարձր արդյունքներ կենսաթաղանթի հետ կապված մի շարք փորձարկումների ընթացքում:
Բարձր թողունակությամբ EM արդյունահանում UIP400MTP 96 ջրհորի ափսեի ձայնային սարքով
Գրականություն / Հղումներ
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Հաճախակի տրվող հարցեր
Ո՞րն է արտաբջջային մատրիցայի նպատակը:
Արտաբջջային մատրիցը (EM կամ ECM) ապահովում է կառուցվածքային աջակցություն բջիջներին, կարգավորում է միջբջջային հաղորդակցությունը և ազդում բջիջների վարքագծի վրա:
Ի՞նչ է անում Extracellular Matrix-ը հյուսվածքների համար:
Հյուսվածքների համար EM-ը ծառայում է որպես փայտամած, որը պահպանում է կառուցվածքային ամբողջականությունը, հեշտացնում է մեխանիկական ճկունությունը և միջնորդում է կենսաքիմիական ազդանշաններ՝ կարգավորելու գործընթացները, ինչպիսիք են աճը, տարբերակումը և վերականգնումը:
Ի՞նչ է արտաբջջային մատրիցային կպչունությունը:
Արտաբջջային մատրիցային կպչունությունը վերաբերում է բջիջների և ԷՄ-ի միջև փոխազդեցությանը, որը հիմնականում միջնորդվում է բջջային մակերեսի կպչուն մոլեկուլների միջոցով, ինչպիսիք են ինտեգրինը, ինչը հնարավորություն է տալիս բջիջների խարսխմանը, ազդանշանի փոխակերպմանը և միգրացիային:
Ինչու՞ է արտաբջջային մատրիցը արդյունահանվում վերլուծությունների համար:
ԷՄ-ն արդյունահանվում է անալիզների համար՝ ուսումնասիրելու դրա բաղադրությունը, հասկանալու նրա դերը բջջային գործընթացներում և ուսումնասիրելու դրա ազդեցությունը հիվանդության առաջընթացի վրա, ներառյալ բիոֆիլմի ձևավորումը և հակամանրէային դիմադրությունը:
Որո՞նք են արտաբջջային մատրիցայի արդյունահանման ընդհանուր ընթացակարգերը:
Ընդհանուր արդյունահանման ընթացակարգերը ներառում են ֆիզիկական մեթոդներ, ինչպիսիք են ուլտրաձայնային ախտահանումը, քիմիական բուժումը լվացող միջոցներով կամ աղերով, և ֆերմենտային մարսողություն՝ EM բաղադրիչները մեկուսացնելու համար՝ պահպանելով դրանց ամբողջականությունը:
Ի՞նչ է ապաբջջային արտաբջջային մատրիցը (dECM):
Ապաբջջազերծված արտաբջջային մատրիցը (dECM) ստացվում է հյուսվածքներից բջջային նյութը հեռացնելու միջոցով՝ պահպանելով ԷՄ-ի կառուցվածքային և կենսաքիմիական հատկությունները: Այն օգտագործվում է ռեգեներատիվ բժշկության մեջ՝ որպես հյուսվածքների ճարտարագիտության և բջիջների կուլտուրայի փայտամած։
Կարդացեք ավելին արտաբջջային մատրիցի ուլտրաձայնային օժանդակությամբ ապաբջջայինացման մասին:
Hielscher Ultrasonics-ը արտադրում է բարձր արդյունավետության ուլտրաձայնային հոմոգենիզատորներ լաբորատորիա դեպի արդյունաբերական չափս.


