הכנת דגימות באולטרסאונד לבדיקות ELISA
בדיקות כגון ELISA נמצאות בשימוש נרחב לאבחון במבחנה, לזיהוי חלבונים הקשורים למחלות ולבקרת איכות (למשל ניטור אלרגנים במזון). הכנת דגימות באולטרסאונד היא שיטה מהירה, אמינה ובת־שחזור לפירוק תאים ולבידוד חלבונים תוך־תאיים, DNA, RNA ואברונים. Hielscher Ultrasonics מציעה מגוון פתרונות אולטרסוניים להכנה נוחה של דגימות בודדות, בקבוקונים מרובים וכן פלטות מיקרוטיטר ופלטות בעלות 96 באריות.
ELISA – בדיקת ספיחה אימונולוגית קשורת אנזים
ELISA הם ראשי התיבות באנגלית של בדיקת ספיחה אימונולוגית קשורת אנזים, והיא שיטת אנליזה ביוכימית נפוצה המשתייכת לקטגוריית בדיקות הקישור לליגנד. בבדיקת ELISA מוסיפים דגימה נוזלית לפאזה מוצקה נייחת בעלת תכונות קישור מיוחדות. בדרך כלל, הפאזה המוצקה הנייחת מיושמת כציפוי על פלטת באריות או על פלטת ELISA. לאחר מכן מוסיפים בזה אחר זה ריאגנטים נוזליים שונים, מדגירים ושוטפים, כך שבסופו של דבר מתרחש שינוי אופטי (למשל התפתחות צבע כתוצאה מתוצר של תגובה אנזימטית) בנוזל הסופי שבבארית. השינוי האופטי מאפשר למדוד את כמות האנליט באמצעות מה שמכונה "קריאה" כמותית. לצורך הקריאה הכמותית משתמשים בספקטרופוטומטר, בפלואורומטר או בלומינומטר לזיהוי ולמדידה של עוצמת האור העובר. רגישות הזיהוי מושפעת מהגברת האות במהלך התגובות האנליטיות. מכיוון שתגובות אנזימטיות הן תהליכי הגברה שנחקרו היטב ונמצאו אמינים, משתמשים באנזימים ליצירת האות. האנזימים מקושרים לריאגנטים המשמשים לזיהוי ביחסים קבועים כדי לאפשר כימות מדויק, ומכאן גם השם בדיקת ספיחה אימונולוגית "קשורת אנזים".
מכיוון שבדיקות ELISA מבוצעות בפלטות מיקרוטיטר / פלטות בעלות 96 באריות, השיטה מוכרת כשיטת בדיקה מבוססת פלטות ומשמשת, למשל, באבחון קליני במבחנה, במחקר, בפיתוח תרופות וכדומה, לזיהוי ולכימות של נוגדנים, פפטידים, חלבונים והורמונים.
שיטת ELISA משמשת לעיתים קרובות ככלי אבחוני ברפואה, בביוטכנולוגיה ובפתולוגיה של צמחים, והיא גם אמצעי מדידה חשוב לבקרת איכות בתעשיות רבות.
היחידה האולטרסונית להכנת דגימות VialTweeter משמשת לפירוק תאים ולהפקת חלבונים לפני בדיקות ELISA
הכנת דגימות באולטרסאונד לפני ELISA
לפני שניתן לבצע את בדיקת ELISA, הדגימות דורשות שלבי הכנה כגון פירוק תאים והפקת חלבונים תוך־תאיים, DNA, RNA וכדומה. היתרון של פירוק תאים ובידוד חלבונים באולטרסאונד הוא היעילות הגבוהה, האמינות ויכולת השחזור. כל הגורמים הללו חשובים לקבלת אבחון ותוצאות מחקר באיכות גבוהה
- טיפול אחיד בדגימה
- פירוק מלא של התאים
- הפקה מלאה של חלבונים (למשל נוגדנים, DNA)
- התאמה מיטבית לסוג התא
- לכל גודל דגימה
- ניתן לשחזור
- בקרת טמפרטורה
- תיעוד נתונים אוטומטי בכרטיס SD
פרוטוקול לפירוק תאים באולטרסאונד לפני ELISA
- לתרביות תאים: לפני פירוק התאים באולטרסאונד, יש לסרכז את התאים במשך 5 דקות ב־270 x g במיקרוצנטריפוגה. יש להסיר את הנוזל העליון בשאיבה ולהרחיף מחדש את התאים ב־30 – 100 μL של בופר RIPA. לאחר מכן יש להדגיר את משקע התאים על קרח במשך 30 דקות.
- כעת דגימת התאים מוכנה לפירוק באולטרסאונד:
יש להשתמש במכשיר אולטרסוני מסוג גשוש (למשל UP200Ht עם גשוש S26d2) או במכשיר אולטרסוני לטיפול בדגימות מרובות (למשל VialTweeter לסוניקציה בו־זמנית של עד 10 בקבוקונים או UIP400MPT לפלטות מיקרוטיטר / פלטות בעלות 96 באריות), בהתאם למספר הדגימות שיש להכין.
לסוניקציה של דגימה בודדת באמצעות גשוש, יש להכניס את התאים למבחנות מיקרוצנטריפוגה בנפח 1.5 mL. - יש להגדיר מראש בתפריט הדיגיטלי של המכשיר האולטרסוני את משך הטיפול באולטרסאונד, את סך האנרגיה המושקעת, את מצב המחזור ו/או את גבולות הטמפרטורה. כך מובטחות סוניקציה אמינה ביותר וחזרתיות.
- הכניסו את הסונוטרודה והפעילו את המכשיר האולטרסוני. הניעו בעדינות את קצה המיקרו של הגשוש האולטרסוני בתוך הדגימה כדי לבצע סוניקציה אחידה של הדגימה.
ברוב סוגי התאים, הליזיס האולטרסוני יושלם לאחר 2–4 מחזורים של סוניקציה במשך 10 sec. - לאחר הסוניקציה, הוציאו את הסונוטרודה מהדגימה. יש להדגיר את הדגימות על קרח במשך 5 min. לאחר מכן, בצעו צנטריפוגה ב-10,000 x g במשך 20 min כדי לשקע את שברי התאים. העבירו את הנוזלים העליונים למבחנת מיקרוצנטריפוגה חדשה. סמנו את האנליטים ואחסנו ב--20°C.
- ניתן לנקות את הסונוטרודה האולטרסונית באמצעות ניגוב יסודי באלכוהול או באמצעות סוניקציה בכוס מעבדה מלאה באלכוהול, למשל אתנול בריכוז 70%. ניתן לעקר באוטוקלב את כל הגשושים האולטרסוניים העשויים מטיטניום.
מיצוי חלבונים מתאי E.coli באמצעות הגשוש האולטרסוני UP200St
- שטפו את הרקמה ב-PBS קר כקרח (0.01M, pH=7.4) כדי להסיר ביסודיות את עודפי הדם שעבר המוליזה.
- שקלו את הרקמה (כליה, לב, ריאה, טחול וכו') ופוררו אותה לחתיכות קטנות, שאותן יש להעביר הומוגניזציה ב-PBS. נפח ה-PBS הדרוש תלוי במשקל הרקמה. ככלל אצבע, עבור 1g של רקמה נדרשים כ-9mL של PBS. מומלץ להוסיף ל-PBS מעכב פרוטאז כלשהו. (לחלופין, ניתן להשתמש ב-RIPA או בבופר ליזיס היפוטוני המכיל תערובת של מעכבי פרוטאז ופוספטאז.)
- בהתאם לגודל הרקמה, טיפול קצר בוורטקס (כ-1–2 min בפולסים של 15 sec) עשוי לסייע בטיפול המקדים ברקמה.
- הרכיבו קצה מיקרו, למשל S26d2, על המכשיר האולטרסוני. הניחו את מבחנת הדגימה המכילה את הרקמה באמבט קרח.
- בצעו סוניקציה של הדגימה באמצעות המכשיר האולטרסוני, למשל UP200St (משרעת של 80%), במשך 1 min במצב פולסים (15sec הפעלה, 15sec הפסקה). השאירו את הדגימה באמבט הקרח.
- לאחר מכן, ההומוגנטים עוברים צנטריפוגה לקבלת מקטעים ספציפיים (ציטוזוליים, גרעיניים, מיטוכונדריאליים או ליזוזומליים), כדי להעשיר את החלבון לצורך האנליזה. לאחר צנטריפוגה של הדגימה במשך 5 דקות ב-5000×g, אוספים את הנוזל העליון.
בקרת טמפרטורה אמינה במהלך סוניקציה
הטמפרטורה היא גורם מכריע המשפיע על התהליך, והיא חשובה במיוחד בטיפול בדגימות ביולוגיות, למשל למניעת פירוק תרמי של חלבונים. כמו כל השיטות המכניות להכנת דגימות, סוניקציה מייצרת חום. עם זאת, ניתן לשלוט היטב בטמפרטורת הדגימות בעת שימוש במכשירי Hielscher Ultrasonics. אנו מציגים בפניכם אפשרויות שונות לניטור ולבקרה של טמפרטורת הדגימות במהלך הכנתן לפני האנליזה באמצעות מכשיר אולטרסוני מסוג גשוש או באמצעות VialTweeter.
- ניטור טמפרטורת הדגימה: כל המעבדים האולטרסוניים הדיגיטליים של Hielscher מצוידים בתוכנה חכמה ובחיישן טמפרטורה הניתן לחיבור. חברו את חיישן הטמפרטורה למכשיר האולטרסוני (למשל, UP200Ht, UP200St, VialTweeter, מכשיר הסוניקציה לפלטות מרובות באריות UIP400MTP) והכניסו את קצה חיישן הטמפרטורה לאחת ממבחנות הדגימה. באמצעות צג מגע דיגיטלי צבעוני, תוכלו להגדיר בתפריט המעבד האולטרסוני טווח טמפרטורה ספציפי לסוניקציה של הדגימה. המכשיר האולטרסוני יעצור אוטומטית כאשר הטמפרטורה תגיע לערך המרבי, וישהה את הפעולה עד שטמפרטורת הדגימה תרד לערך התחתון של הטמפרטורה המוגדרת ∆. לאחר מכן הסוניקציה תתחיל שוב באופן אוטומטי. תכונה חכמה זו מונעת פירוק הנגרם מחום.
- ביחידה האולטרסונית לטיפול בדגימות מרובות VialTweeter, ניתן לקרר מראש את גוש הטיטניום המחזיק את מבחנות הדגימה. הכניסו את גוש ה-VialTweeter (רק את הסונוטרודה ללא המתמר!) למקרר או למקפיא כדי לקרר מראש את גוש הטיטניום ולסייע בעיכוב עליית הטמפרטורה בדגימה. אם אפשר, ניתן לקרר מראש גם את הדגימה עצמה.
- השתמשו באמבט קרח או בקרח יבש לקירור במהלך הסוניקציה. הניחו את מבחנות הדגימה באמבט קרח במהלך הסוניקציה. עבור VialTweeter, השתמשו במגש רדוד מלא בקרח יבש והניחו את VialTweeter על הקרח היבש כדי שהחום יוכל להתפזר במהירות.
לקוחות ברחבי העולם משתמשים במכשירים האולטרסוניים של Hielscher המצוידים בגשושית, וכן ביחידות הסוניקציה למספר דגימות VialTweeter ו-UIP400MTP, להכנת הדגימות היומיומית שלהם במעבדות ביולוגיות, ביוכימיות, רפואיות וקליניות. באמצעות התוכנה החכמה ובקרת הטמפרטורה של המעבדים של Hielscher, הטמפרטורה מבוקרת באופן אמין ונמנעת התפרקות של הדגימות עקב חום. הכנת דגימות אולטרסונית באמצעות הפתרונות האולטרסוניים של Hielscher מספקת תוצאות אמינות ביותר וניתנות לשחזור!
קראו עוד על סוניקציה בתפוקה גבוהה באמצעות מכשיר הסוניקציה לפלטות מרובות באריות UIP400MTP לבדיקות!
צרו איתנו קשר! / שאלו אותנו!
ספרות / מקורות
- Brandy Verhalen , Stefan Ernst, Michael Börsch, Stephan Wilkens (2012): Dynamic Ligand-induced Conformational Rearrangements in P-glycoprotein as Probed by Fluorescence Resonance Energy Transfer Spectroscopy. J Biol Chem. 2012 Jan 6;287(2): 1112-27.
- Claudia Lindemann, Nataliya Lupilova, Alexandra Müller, Bettina Warscheid, Helmut E. Meyer, Katja Kuhlmann, Martin Eisenacher, Lars I. Leichert (2013): Redox Proteomics Uncovers Peroxynitrite-Sensitive Proteins that Help Escherichia coli to Overcome Nitrosative Stress. J Biol Chem. 2013 Jul 5; 288(27): 19698–19714.
- Elahe Motevaseli, Mahdieh Shirzad, Seyed Mohammad Akrami, Azam-Sadat Mousavi, Akbar Mirsalehian, Mohammad Hossein Modarressi (2013): Normal and tumour cervical cells respond differently to vaginal lactobacilli, independent of pH and lactate. ed. Microbiol. 2013 Jul; 62(Pt 7):1065-1072.
- Nico Böhmer, Andreas Dautel, Thomas Eisele, Lutz Fischer (2012): Recombinant expression, purification and characterisation of the native glutamate racemase from Lactobacillus plantarum NC8. Protein Expr Purif. 2013 Mar;88(1):54-60.
עובדות שכדאי לדעת
אילו סוגים של ELISA קיימים?
קיימים כמה סוגים של ELISA, הנבדלים זה מזה בעיקרון הפעולה שלהם. הם מוכרים בשם ELISA ישירה, ELISA עקיפה, ELISA מסוג סנדוויץ', ELISA תחרותית ו-ELISA הפוכה. להלן סקירה של סוגי ה-ELISA השונים, המאפיינים העיקריים שלהם וההבדלים ביניהם.
ניתן לבצע ELISA במתכונת איכותנית או כמותית. תוצאות איכותניות מספקות תשובה פשוטה של חיובי או שלילי, ואילו ב-ELISA כמותית משווים את הצפיפות האופטית (OD) של הדגימה לעקומת כיול, שהיא בדרך כלל סדרת מיהולים של תמיסה בריכוז ידוע של מולקולת המטרה.
ELISA ישירה
ELISA ישירה היא מתכונת הבדיקה הפשוטה ביותר של Elisa, שבה משתמשים רק בנוגדן ראשוני המסומן באנזים ואין צורך בנוגדנים שניוניים. הנוגדן הראשוני המסומן באנזים נקשר ישירות למטרה, כלומר לאנטיגן. תמיסת האנטיגן המכילה בופר מתווספת לכל בארית בפלטת מיקרוטיטר (בדרך כלל פלטות בעלות 96 באריות, פלטות ELISA), ושם האנטיגן נצמד למשטח הפלסטיק באמצעות אינטראקציות בין מטענים חשמליים. כאשר האנזים המקושר לנוגדן הראשוני מגיב עם הסובסטרט שלו, הוא יוצר אות נראה לעין שניתן למדוד באמצעות ספקטרופוטומטר, פלואורומטר או לומינומטר.
ELISA עקיפה
לבדיקת ELISA עקיפה נדרשים גם נוגדן ראשוני וגם נוגדן שניוני. עם זאת, בניגוד ל-ELISA ישירה, הנוגדן המסומן באנזים הוא הנוגדן השניוני ולא הנוגדן הראשוני. האנטיגן מקובע לפלטת הבאריות והנוגדן הראשוני נקשר אליו. לאחר מכן, הנוגדן השניוני המסומן באנזים נקשר לנוגדן הראשוני. לבסוף, האנזים המקושר לנוגדן השניוני מגיב עם הסובסטרט שלו ליצירת אות נראה לעין שניתן לזהות.
ELISA מסוג סנדוויץ'
בעוד שבבדיקות ELISA ישירה ועקיפה האנטיגן מקובע כציפוי על פני השטח של פלטת הבאריות, ב-ELISA מסוג סנדוויץ' הנוגדן מקובע למשטח הפלסטיק של פלטת ה-ELISA. הנוגדנים המקובעים ב-ELISA מסוג סנדוויץ' מוכרים בשם נוגדני לכידה. בנוסף לנוגדני הלכידה, ב-ELISA מסוג סנדוויץ' נדרשים גם נוגדנים המכונים נוגדני זיהוי. נוגדני הזיהוי כוללים נוגדן זיהוי ראשוני שאינו מסומן ונוגדן זיהוי שניוני המסומן באנזים.
בתהליך המתרחש בשלבים, האנטיגן הנבדק נקשר לנוגדן הלכידה המקובע לפלטה. לאחר מכן, נוגדן הזיהוי הראשוני נקשר לאנטיגן. בהמשך, נוגדן הזיהוי השניוני נקשר לנוגדן הזיהוי הראשוני. בשלב התגובה האחרון, האנזים מגיב עם הסובסטרט שלו ליצירת אות נראה לעין שניתן לזהות באופן אופטי.
ELISA תחרותית
ELISA תחרותית, המכונה גם ELISA בעיכוב, היא סוג ה-ELISA המורכב ביותר משום שהיא כרוכה בשימוש באנטיגן מעכב. ניתן להתאים כל אחת משלוש המתכונות, ELISA ישירה, עקיפה וסנדוויץ', למתכונת של ELISA תחרותית. ב-ELISA תחרותית, האנטיגן המעכב ואנטיגן המטרה מתחרים על הקישור לנוגדן הראשוני.
לצורך ELISA תחרותית, מדגירים נוגדן לא מסומן בנוכחות האנטיגן שלו, כלומר הדגימה. לאחר מכן מוסיפים את תצמידי הנוגדן/אנטיגן הקשורים האלה לבאר המצופה באנטיגן.
שוטפים את הפלטה כדי להסיר נוגדנים שלא נקשרו. שמה של ELISA תחרותית נובע מכך שככל שיש יותר אנטיגן בדגימה, כך נוצרים יותר תצמידי אנטיגן-נוגדן. משמעות הדבר היא שפחות נוגדנים לא קשורים זמינים לקישור לאנטיגן שבבאר, והאנטיגנים חייבים להתחרות על נוגדן זמין. מוסיפים נוגדן שניוני התואם לנוגדן הראשוני. נוגדן שני זה מצומד לאנזים. כאשר מוסיפים את המצע, האנזימים שנותרו מייצרים אות כרומוגני או פלואורסצנטי.
בשלב זה עוצרים את התגובה כדי למנוע רוויה של האות בהמשך.
חלק מערכות ה-ELISA התחרותית כוללות אנטיגן מצומד לאנזים במקום נוגדן מצומד לאנזים. האנטיגן המסומן מתחרה עם האנטיגן שבדגימה (שאינו מסומן) על אתרי הקישור של הנוגדן הראשוני. ככל שיש פחות אנטיגן בדגימה, כך נשאר בבאר יותר אנטיגן מסומן והאות חזק יותר.
ELISA הפוכה
ב-ELISA הפוכה אין משתמשים בפלטות בארות, אלא משאירים את האנטיגנים בתרחיף בנוזל הבדיקה. בדיקת ELISA הפוכה מודדת את כמות הנוגדן הקשור באמצעות אנטיגן. היא פותחה במיוחד כדי לזהות ולחקור את חלבון המעטפת של נגיף מערב הנילוס ואת האופן שבו הוא מסוגל למצוא נוגדנים ספציפיים לנגיף.
אילו סמנים אנזימטיים משמשים ב-ELISA?
הרשימה שלהלן מציגה את הסמנים האנזימטיים הנפוצים ביותר המשמשים בבדיקות ELISA, המאפשרים למדוד את תוצאות הבדיקה עם השלמתה.
- OPD (o-פנילנדיאמין דיהידרוכלוריד) מקבל צבע ענבר לזיהוי HRP (פראוקסידאז של חזרת), המשמש לעיתים קרובות כחלבון מצומד.
- TMB (3,3',5,5'-טטרמתילבנזידין) מקבל צבע כחול בעת זיהוי HRP ומקבל צבע צהוב לאחר הוספת חומצה גופרתית או זרחתית.
- ABTS (מלח דיאמוניום של 2,2'-אזינוביס [חומצה 3-אתילבנזותיאזולין-6-סולפונית]) מקבל צבע ירוק בעת זיהוי HRP.
- PNPP (p-ניטרופניל פוספט, מלח דו-נתרני) מקבל צבע צהוב בעת זיהוי פוספטאז בסיסי.

