Μεταβολομική διευκολύνεται από υπερήχους υψηλής απόδοσης
Η μεταβολομική είναι το ερευνητικό πεδίο που χρησιμοποιεί τεχνικές υψηλής απόδοσης για τον χαρακτηρισμό και την ποσοτικοποίηση μικρών μορίων σε διάφορα βιορευστά, όπως ούρα, ορός, πλάσμα, κόπρανα και σάλιο, αποκαλύπτοντας μοναδικές μεταβολικές υπογραφές. Η UIP400MTP υπερήχων υψηλής απόδοσης, σχεδιασμένη για πλάκες πολλαπλών φρεατίων, είναι ένα ισχυρό εργαλείο για τη λύση κυττάρων σε αυτά τα δείγματα, διευκολύνοντας την απελευθέρωση μεταβολιτών για ανάλυση κατάντη. Αυτή η ακριβής και αξιόπιστη προσέγγιση είναι απαραίτητη για τη μεταβολομική, όπου ο ακριβής σχεδιασμός της μελέτης, η σχολαστική προετοιμασία του δείγματος, η βελτιστοποιημένη ρύθμιση της πλατφόρμας, η ολοκληρωμένη ανάλυση δεδομένων και η ουσιαστική βιολογική ερμηνεία είναι υψίστης σημασίας. Η μεταβολομική χρησιμοποιεί τόσο στοχευμένες προσεγγίσεις, οι οποίες επικεντρώνονται σε συγκεκριμένες κατηγορίες μορίων όπως υδατάνθρακες, λιπίδια και αμινοξέα, όσο και μη στοχευμένες τεχνικές, οι οποίες παρέχουν μια ευρεία επισκόπηση των μεταβολικών προφίλ μέσα σε ένα δείγμα, αποκαλύπτοντας την περίπλοκη πολυπλοκότητα της μεταβολικής σηματοδότησης.
Το UIP400MTP είναι ένας υπερηχητής χωρίς επαφή, υψηλής απόδοσης για κυτταρική λύση και εκχύλιση μεταβολιτών σε πλάκες πολλαπλών φρεατίων
Προετοιμασία δείγματος υψηλής απόδοσης με τον υπερηχητικό πλάκα 96 φρεατίων UIP400MTP
Η χρήση του UIP400MTP υπερήχων χωρίς επαφή σε συνδυασμό με πλάκες 96 φρεατίων είναι μια αποτελεσματική μέθοδος ομογενοποίησης υψηλής απόδοσης και εκχύλισης μεταβολίτη. Αυτή η ρύθμιση αποφεύγει την άμεση επαφή με το δείγμα, μειώνοντας τον κίνδυνο διασταυρούμενης μόλυνσης κατά την επεξεργασία πολλαπλών δειγμάτων ταυτόχρονα.
Πρωτόκολλο βήμα προς βήμα για ομογενοποίηση με UIP400MTP 96-Well Sonicator
- Προετοιμασία μεταβολομικών δειγμάτων
Τοποθέτηση δείγματος: Διανείμετε κάθε δείγμα (π.χ. κόπρανα, εντερικό ιστό ή περιεχόμενο του αυλού) σε μεμονωμένες κοιλότητες πλάκας ή μικροπλάκας 96 κοιλοτήτων.
Διαλύτης: Οι οργανικοί διαλύτες, όπως η μεθανόλη, η αιθανόλη, το ακετονιτρίλιο, το χλωροφόρμιο και τα (υδατικά) μείγματά τους, είναι απαραίτητα για την εκχύλιση μεταβολιτών, βοηθώντας στην απελευθέρωση ενδοκυτταρικών μεταβολιτών από την κυτταρική μήτρα. Χρησιμοποιούνται 100–300 μL διαλύτη ανά κοιλότητα, εξασφαλίζοντας επαρκή όγκο για την πλήρη βύθιση του δείγματος.
Εσωτερικά πρότυπα: Προαιρετικά, προσθέστε εσωτερικά πρότυπα σε κάθε φρεάτιο για ομαλοποίηση κατά τη διάρκεια της κατάντη μεταβολομικής ανάλυσης. - Ρύθμιση μέσου σύζευξης
Στάθμη νερού: Τοποθετήστε την πλάκα 96 φρεατίων στην πλατφόρμα υπερήχων γεμάτη με νερό (το μέσο ζεύξης) όπως περιγράφεται στο εγχειρίδιο. - UIP400MTP Διαμόρφωση παραμέτρων
Ρυθμίσεις ισχύος: Ρυθμίστε το πλάτος υπερήχων στο 50-80% της μέγιστης ισχύος για αποτελεσματική ομογενοποίηση.
Λειτουργία παλμού: Ρυθμίστε τον κύκλο υπερήχων σε εναλλασσόμενους παλμούς (π.χ., 30 δευτερόλεπτα ON, 30 δευτερόλεπτα OFF) για να επιτρέψετε την ψύξη και να αποτρέψετε την υπερθέρμανση του δείγματος.
Συνολικός χρόνος: 4-10 λεπτά, ανάλογα με την πολυπλοκότητα και τη σκληρότητα του δείγματος.
Έλεγχος θερμοκρασίας: Χρησιμοποιήστε ένα εργαστηριακό ψυκτικό συγκρότημα για να διατηρήσετε το νερό στους 4-8 ° C κατά τη διάρκεια της υπερήχησης για την προστασία των ευαίσθητων στη θερμότητα μεταβολιτών. - διαδικασία υπερήχων
Ξεκινήστε το UIP400MTP για κύκλους υπερήχων.
Παρακολουθήστε τη διαδικασία μέσω της διεπαφής UIP400MTP.
Το φαινόμενο σπηλαίωσης θα ομογενοποιήσει τα δείγματα και θα λύσει τα κύτταρα μέσα στα πηγάδια, απελευθερώνοντας ενδοκυτταρικούς μεταβολίτες στο διαλύτη. - Μετακατεργασία με υπερήχους
Φυγοκέντριση: Μετά από κατεργασία με υπερήχους, μεταφέρετε τα περιεχόμενα της πλάκας σε σωλήνες συλλογής, εάν χρειάζεται. Φυγοκεντρήστε στα 4.000-6.000 × g για 10 λεπτά για να σβήσετε αδιάλυτα υπολείμματα και κυτταρικό υλικό.
Συλλογή υπερκείμενου υγρού: Μεταφέρετε προσεκτικά το υπερκείμενο υγρό από κάθε κοιλότητα σε νέους σωλήνες ή τρυβλία για ανάλυση.
Προαιρετικό στέγνωμα: Ξηρά υπερκείμενα με τη χρήση συμπυκνωτή κενού (π.χ. SpeedVac), εάν απαιτείται συγκέντρωση, ανασυνιστώνται σε μικρό όγκο του κατάλληλου διαλύτη.
Επωφεληθείτε από την ικανότητα επεξεργασίας υψηλής απόδοσης του υπερηχητικού πλάκας UIP400MTP πολλαπλών φρεατίων και διευκολύνετε τη μεταβολομική σας έρευνα και ανάλυση!
UIP400MTP υπερήχων υψηλής απόδοσης για μεταβολομική έρευνα σε πλάκες πολλαπλών φρεατίων, πλάκες 96 φρεατίων, σωλήνες και τρυβλία Petri.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator για προετοιμασία δείγματος υψηλής απόδοσης στη μεταβολομική έρευνα.
Αρχή της μη επαφής κατεργασία με υπερήχους με UIP400MTP
Το UIP400MTP εφαρμόζει υπερηχητικά κύματα στα πηγάδια μιας πλάκας 96 φρεατίων έμμεσα μέσω ενός μέσου σύζευξης (π.χ. νερό). Αυτά τα κύματα δημιουργούν σπηλαίωση, η οποία διαταράσσει τα κύτταρα και απελευθερώνει μεταβολίτες χωρίς φυσική επαφή μεταξύ του ανιχνευτή υπερήχων και του δείγματος.
“Σας γράφω για να σας ευχαριστήσω για τη φανταστική εμπειρία μας χρησιμοποιώντας τον UIP400MTP σας υπερήχων για ομοιόμορφη και συνεπή βακτηριακή λύση δειγμάτων μικροβιώματος κοπράνων. Πιέζουμε το φάκελο για τεχνολογία λύσης υψηλής απόδοσης και το όργανό σας είναι κατάλληλο για την εργασία. Μερικά από τα βασικά σημεία είναι:
- Ευκολία λειτουργίας – Το όργανο είναι εύκολο στη χρήση και η προσαρμογή είναι απλή χρησιμοποιώντας τις επιλογές μενού
- υψηλή απόδοση – Εξαιρετικό για το χειρισμό πλακών, με 96 δείγματα κάθε φορά
- Ακόμη και υπερήχηση όλων των σκαφών – Η συσκευή ήταν σε θέση να παραδώσει την ίδια ποσότητα υπερήχων σε όλα τα πηγάδια, κάτι που ήταν ζωτικής σημασίας για την εφαρμογή μας
- Υποστήριξη από την ομάδα Hielscher – Η υποστήριξη ήταν εξαιρετική, ήσασταν πάντα εκεί για εμάς στην προπόνηση, για να απαντήσετε στις ερωτήσεις μας και να αντιμετωπίσετε προβλήματα, με προτάσεις που μας βοήθησαν να φτάσουμε στο στόχο μας.
Σας ευχαριστούμε και πάλι για τη βοήθεια και τη βοήθειά σας καθώς εργαζόμασταν για τη βελτιστοποίηση των πρωτοκόλλων μας.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Επιστημονικός Διευθυντής – Intus Βιοεπιστήμες
Ο υπερηχητικός πλάκα πολλαπλών φρεατίων διευκολύνει UIP400MTP την προετοιμασία δειγμάτων υψηλής απόδοσης, π.χ. στην έρευνα και ανάλυση μεταβολιτών.
Υπερήχων πλάκας 96 φρεατίων UIP400MTP: Το υγρό μετάδοσης υπερήχων περιβάλλει όλα τα πηγάδια και παρέχει ομοιόμορφη υπερήχηση κάθε δείγματος
Βασικά χαρακτηριστικά του UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator
| υπερήχηση υψηλής απόδοσης | Ιδανικό για 96-φρεάτια και άλλες πλάκες πολλαπλών φρεατίων, το UIP400MTP επιτρέπει την ταυτόχρονη, πανομοιότυπη υπερήχηση πολλαπλών δειγμάτων, μειώνοντας σημαντικά τη διάρκεια της προετοιμασίας του δείγματος και αυξάνοντας την απόδοση των δοκιμών υψηλού αριθμού δειγμάτων. |
| Χρησιμοποιήστε την πλάκα πολλαπλών φρεατίων της επιλογής σας | Το UIP400MTP έχει σχεδιαστεί για να υπερήχων οποιεσδήποτε τυποποιημένες πλάκες πολλαπλών φρεατίων, πλάκες PCR ή πλάκες μικροτιτλοδότησης. Επιλέγετε την πλάκα που είναι πιο κατάλληλη για τα πειράματά σας. Καθώς η UIP400MTP δεν απαιτεί ιδιόκτητα αναλώσιμα, αυτό σας εξοικονομεί πολλά χρήματα! |
| Υπερήχους χωρίς επαφή | Το Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP εφαρμόζει έντονο υπερηχογράφημα χωρίς να εισάγει τίποτα στο δείγμα. Μπορείτε να υπερήχων ealed πλάκες πολλαπλών πηγαδιών, κλειστά δοχεία και φιαλίδια. Hielscher σας προμηθεύει προσαρμοσμένες υποδοχές δειγμάτων για οποιαδήποτε μη τυποποιημένα φιαλίδια ή δοχεία. |
| Ακρίβεια και έλεγχος | Ο έλεγχος ακριβείας και το έξυπνο λογισμικό σάς επιτρέπουν να ρυθμίσετε τις παραμέτρους υπερήχων ώστε να ταιριάζουν βέλτιστα στις συγκεκριμένες ανάγκες επεξεργασίας σας. Παίρνετε τη μέγιστη αποδοτικότητα και αποτελεσματικότητα υπερήχων για κάθε πείραμα. |
| Έλεγχος θερμοκρασίας | Ορίστε μια συγκεκριμένη θερμοκρασία για την υπερήχηση σας. Ο υπερήχων πλάκας UIP400MTP μπορεί να παρακολουθεί τη θερμοκρασία του δείγματος και να ρυθμίζει ανάλογα την υπερήχηση. Ένα ανακυκλούμενο ψυκτικό υγρό ψύχει κάθε φρεάτιο στην πλάκα για ακριβή έλεγχο της θερμοκρασίας. |
| Πρωτόκολλο και τηλεχειριστήριο | Κάθε εκτέλεση υπερήχων μπορεί να ελεγχθεί από έναν υπολογιστή. Δεν απαιτείται εγκατάσταση λογισμικού. Μπορείτε να χρησιμοποιήσετε το τυπικό πρόγραμμα περιήγησής σας (π.χ. Chrome, Firefox, Edge ή Safari) σε οποιοδήποτε λειτουργικό σύστημα (π.χ. MacOS, Windows, Android, iOS ή Linux) για τον έλεγχο και την παρακολούθηση των UIP400MTP εξ αποστάσεως. Κάθε εκτέλεση υπερήχων παράγει ένα λεπτομερές πρωτόκολλο υπερήχων για αξιολόγηση και τεκμηρίωση. Το αρχείο πρωτοκόλλου είναι σε μη ιδιόκτητη μορφή CSV, την οποία μπορείτε να ανοίξετε με το πρόγραμμα που προτιμάτε, π.χ. Microsoft Excel, Apple Numbers ή OpenOffice Calc. |
| Στιβαρό και αξιόπιστο | Σχεδιασμένο και κατασκευασμένο στη Γερμανία σύμφωνα με τα υψηλότερα πρότυπα ποιότητας, το UIP400MTP δεν είναι μόνο ισχυρό αλλά και εξαιρετικά ανθεκτικό. Ο σχεδιασμός του πληροί τα βιομηχανικά πρότυπα και αντέχει εύκολα στις κακουχίες της καθημερινής χρήσης σε ένα απαιτητικό εργαστηριακό περιβάλλον. Μπορείτε να χρησιμοποιείτε το UIP400MTP συνεχώς 24 ώρες, 7 ημέρες την εβδομάδα σε λειτουργίες υψηλής απόδοσης. |
- υψηλή απόδοση
- Τεχνολογία αιχμής
- αξιοπιστία & Ευρωστία
- Ρυθμιζόμενος, ακριβής έλεγχος της διαδικασίας
- έξυπνο λογισμικό
- έξυπνες λειτουργίες (π.χ. προγραμματιζόμενες, πρωτόκολλο δεδομένων, τηλεχειριστήριο)
- εύκολο και ασφαλές στη λειτουργία
- χαμηλή συντήρηση
- CIP (επιτόπιος καθαρισμός)
Σχεδιασμός, Κατασκευή και Συμβουλευτική – Ποιότητα Made in Germany
Hielscher υπερήχων είναι γνωστή για την υψηλότερη ποιότητα και τα πρότυπα σχεδιασμού τους. Η ευρωστία και η εύκολη λειτουργία επιτρέπουν την ομαλή ενσωμάτωση των υπερήχων μας σε βιομηχανικές εγκαταστάσεις. Οι σκληρές συνθήκες και τα απαιτητικά περιβάλλοντα αντιμετωπίζονται εύκολα από τους υπερήχους Hielscher.
Hielscher Υπέρηχοι είναι μια πιστοποιημένη εταιρεία ISO και δίνουν ιδιαίτερη έμφαση σε υψηλής απόδοσης υπερήχων που διαθέτουν state-of-the-art τεχνολογία και φιλικότητα προς το χρήστη. Φυσικά, Hielscher υπερήχων είναι CE συμβατό και πληρούν τις απαιτήσεις των UL, CSA και RoHs.
Υπερήχων χωρίς επαφή UIP400MTP για παρασκευή μεταβολομικού δείγματος σε μικροπλάκες.
Βιβλιογραφία / Αναφορές
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Συχνές ερωτήσεις για: Metabolomic Research
Τι είναι το μικροβίωμα;
Το μικροβίωμα αναφέρεται στη συλλογική κοινότητα μικροοργανισμών, συμπεριλαμβανομένων βακτηρίων, ιών, μυκήτων και αρχαίων, καθώς και του γενετικού τους υλικού, που κατοικούν σε ένα συγκεκριμένο περιβάλλον, όπως το ανθρώπινο σώμα. Παίζει κρίσιμο ρόλο στην υγεία του ξενιστή επηρεάζοντας το μεταβολισμό, την ανοσολογική λειτουργία και την προστασία από παθογόνους παράγοντες, ενώ διαμορφώνεται από παράγοντες όπως η διατροφή, ο τρόπος ζωής και το περιβάλλον.
Τι είναι η Μεταβολομική;
Η μεταβολομική είναι η ολοκληρωμένη μελέτη των μεταβολιτών, τα οποία είναι μικρά μόρια που παράγονται κατά τη διάρκεια μεταβολικών διεργασιών μέσα σε ένα βιολογικό σύστημα. Περιλαμβάνει την ταυτοποίηση, την ποσοτικοποίηση και την ανάλυση αυτών των μορίων για την κατανόηση των κυτταρικών λειτουργιών, των μεταβολικών οδών και του τρόπου με τον οποίο ανταποκρίνονται σε γενετικές, περιβαλλοντικές ή παθολογικές αλλαγές.
Τι είναι ο μεταβολισμός;
Ο μεταβολισμός είναι το πλήρες σύνολο μικρών μορίων ή μεταβολιτών που υπάρχουν μέσα σε ένα βιολογικό σύστημα, όπως ένα κύτταρο, ιστό ή οργανισμό, σε μια δεδομένη στιγμή. Αντικατοπτρίζει τη βιοχημική δραστηριότητα και τη φυσιολογική κατάσταση του συστήματος, παρέχοντας πληροφορίες για το μεταβολισμό και τις αλληλεπιδράσεις του με το περιβάλλον.
Hielscher Υπέρηχοι κατασκευάζει υψηλής απόδοσης υπερήχων ομογενοποιητές από εργαστήριο προς βιομηχανικό μέγεθος.