Η μεταβολομική διευκολύνεται με κατεργασία με υπερήχους υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας
Η μεταβολομική είναι το ερευνητικό πεδίο που χρησιμοποιεί τεχνικές υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας για τον χαρακτηρισμό και την ποσοτικοποίηση μικρών μορίων σε διάφορα βιολογικά υγρά, όπως ούρα, ορό, πλάσμα, κόπρανα και σάλιο, αποκαλύπτοντας μοναδικές μεταβολικές υπογραφές. Η συσκευή υπερήχων υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας UIP400MTP, σχεδιασμένη για πλάκες πολλαπλών βοθρίων, αποτελεί ισχυρό εργαλείο για τη λύση των κυττάρων σε αυτά τα δείγματα, διευκολύνοντας την απελευθέρωση μεταβολιτών για επακόλουθη ανάλυση. Αυτή η ακριβής και αξιόπιστη προσέγγιση είναι ουσιώδης για τη μεταβολομική, όπου ο ακριβής σχεδιασμός της μελέτης, η σχολαστική προετοιμασία των δειγμάτων, η βελτιστοποιημένη διαμόρφωση της πλατφόρμας, η ολοκληρωμένη ανάλυση των δεδομένων και η ουσιαστική βιολογική ερμηνεία έχουν πρωταρχική σημασία. Η μεταβολομική χρησιμοποιεί τόσο στοχευμένες προσεγγίσεις, οι οποίες εστιάζουν σε συγκεκριμένες κατηγορίες μορίων, όπως υδατάνθρακες, λιπίδια και αμινοξέα, όσο και μη στοχευμένες τεχνικές, οι οποίες παρέχουν μια ευρεία επισκόπηση των μεταβολικών προφίλ ενός δείγματος, αποκαλύπτοντας τη σύνθετη πολυπλοκότητα της μεταβολικής σηματοδότησης.
Προετοιμασία δειγμάτων υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας με τη συσκευή υπερήχων UIP400MTP για πλάκες 96 βοθρίων
Η χρήση της συσκευής υπερήχων χωρίς επαφή UIP400MTP σε συνδυασμό με πλάκες 96 βοθρίων αποτελεί αποτελεσματική μέθοδο για ομογενοποίηση και εκχύλιση μεταβολιτών υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας. Αυτή η διάταξη αποφεύγει την άμεση επαφή με το δείγμα, μειώνοντας τον κίνδυνο διασταυρούμενης επιμόλυνσης κατά την ταυτόχρονη επεξεργασία πολλαπλών δειγμάτων.
Πρωτόκολλο βήμα προς βήμα για ομογενοποίηση με τη συσκευή υπερήχων UIP400MTP για πλάκες 96 βοθρίων
- Προετοιμασία δειγμάτων για μεταβολομική ανάλυση
Τοποθέτηση δειγμάτων: Διανείμετε κάθε δείγμα (π.χ. κόπρανα, εντερικό ιστό ή περιεχόμενο του εντερικού αυλού) σε ξεχωριστά βοθρία μιας πλάκας ή μικροπλάκας 96 βοθρίων.
Διαλύτης: Οι οργανικοί διαλύτες, όπως η μεθανόλη, η αιθανόλη, το ακετονιτρίλιο, το χλωροφόρμιο και τα (υδατικά) μείγματά τους, είναι απαραίτητοι για την εκχύλιση μεταβολιτών, καθώς συμβάλλουν στην απελευθέρωση ενδοκυτταρικών μεταβολιτών από την κυτταρική μήτρα. Χρησιμοποιήστε 100–300 µL διαλύτη ανά βοθρίο, εξασφαλίζοντας επαρκή όγκο για την πλήρη βύθιση του δείγματος.
Εσωτερικά πρότυπα: Προαιρετικά, προσθέστε εσωτερικά πρότυπα σε κάθε βοθρίο για κανονικοποίηση κατά την επακόλουθη μεταβολομική ανάλυση. - Προετοιμασία του μέσου σύζευξης
Στάθμη νερού: Τοποθετήστε την πλάκα 96 βοθρίων στην πλατφόρμα κατεργασίας με υπερήχους που είναι γεμάτη με νερό (το μέσο σύζευξης), όπως περιγράφεται στο εγχειρίδιο. - Διαμόρφωση παραμέτρων της UIP400MTP
Ρυθμίσεις ισχύος: Ρυθμίστε το πλάτος των υπερήχων στο 50–80% της μέγιστης ισχύος για αποτελεσματική ομογενοποίηση.
Παλμική λειτουργία: Ρυθμίστε τον κύκλο κατεργασίας με υπερήχους ώστε να εναλλάσσονται παλμοί λειτουργίας και παύσης (π.χ. 30 δευτερόλεπτα λειτουργίας, 30 δευτερόλεπτα παύσης), για να επιτρέπεται η ψύξη και να αποτρέπεται η υπερθέρμανση των δειγμάτων.
Συνολικός χρόνος: 4–10 λεπτά, ανάλογα με την πολυπλοκότητα και την ανθεκτικότητα του δείγματος.
Έλεγχος θερμοκρασίας: Χρησιμοποιήστε έναν εργαστηριακό ψύκτη για να διατηρείτε το νερό στους 4–8°C κατά την κατεργασία με υπερήχους, ώστε να προστατεύονται οι θερμοευαίσθητοι μεταβολίτες. - Διαδικασία κατεργασίας με υπερήχους
Θέστε σε λειτουργία την UIP400MTP για τους κύκλους κατεργασίας με υπερήχους.
Παρακολουθήστε τη διαδικασία μέσω της διεπαφής της UIP400MTP.
Η δράση της σπηλαίωσης θα ομογενοποιήσει τα δείγματα και θα προκαλέσει λύση των κυττάρων μέσα στα βοθρία, απελευθερώνοντας ενδοκυτταρικούς μεταβολίτες στον διαλύτη. - Μετά την κατεργασία με υπερήχους
Φυγοκέντρηση: Μετά την κατεργασία με υπερήχους, μεταφέρετε το περιεχόμενο της πλάκας σε σωληνάρια συλλογής, εάν χρειάζεται. Φυγοκεντρήστε στα 4.000–6.000 × g για 10 λεπτά, ώστε τα αδιάλυτα υπολείμματα και το κυτταρικό υλικό να σχηματίσουν ίζημα.
Συλλογή υπερκειμένου: Μεταφέρετε προσεκτικά το υπερκείμενο από κάθε βοθρίο σε νέα σωληνάρια ή πλάκες για ανάλυση.
Προαιρετική ξήρανση: Ξηράνετε τα υπερκείμενα χρησιμοποιώντας συμπυκνωτή κενού (π.χ. SpeedVac), εάν απαιτείται συμπύκνωση, και στη συνέχεια ανασυστήστε τα σε μικρό όγκο του κατάλληλου διαλύτη.
Αξιοποιήστε την υψηλή διεκπεραιωτική ικανότητα επεξεργασίας της συσκευής υπερήχων UIP400MTP για πλάκες πολλαπλών βοθρίων και διευκολύνετε τη μεταβολομική έρευνα και ανάλυσή σας!
Συσκευή υπερήχων υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας UIP400MTP για μεταβολομική έρευνα σε πλάκες πολλαπλών βοθρίων, πλάκες 96 βοθρίων, σωληνάρια και τρυβλία Petri.
Αρχή της κατεργασίας με υπερήχους χωρίς επαφή με την UIP400MTP
Το UIP400MTP εφαρμόζει κύματα υπερήχων στα βοθρία μιας πλάκας 96 βοθρίων έμμεσα, μέσω ενός μέσου σύζευξης (π.χ. νερού). Αυτά τα κύματα δημιουργούν σπηλαίωση, η οποία προκαλεί κυτταρική διάρρηξη και απελευθερώνει μεταβολίτες χωρίς φυσική επαφή μεταξύ του ακροδέκτη της συσκευής υπερήχων και του δείγματος.
“Σας γράφω για να σας ευχαριστήσω για την εξαιρετική εμπειρία που είχαμε χρησιμοποιώντας τη συσκευή υπερήχων UIP400MTP για την ομοιόμορφη και επαναλήψιμη λύση βακτηρίων σε δείγματα μικροβιώματος κοπράνων. Διευρύνουμε τα όρια της τεχνολογίας λύσης υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας και το όργανό σας είναι ιδιαίτερα κατάλληλο για αυτόν τον σκοπό. Ορισμένα από τα βασικά πλεονεκτήματα είναι:
- Ευκολία χειρισμού – το όργανο είναι εύχρηστο και η προσαρμογή των ρυθμίσεων είναι απλή μέσω των επιλογών του μενού
- Υψηλή διεκπεραιωτική ικανότητα – εξαιρετικό για την επεξεργασία πλακών, με 96 δείγματα κάθε φορά
- Ομοιόμορφη κατεργασία με υπερήχους όλων των δοχείων – η συσκευή μπόρεσε να παρέχει την ίδια ποσότητα κατεργασίας με υπερήχους σε όλα τα βοθρία, κάτι που ήταν καθοριστικό για την εφαρμογή μας
- Υποστήριξη από την ομάδα της Hielscher – η υποστήριξη ήταν εξαιρετική, ήσασταν πάντα δίπλα μας κατά την εκπαίδευση, για να απαντήσετε στις ερωτήσεις μας και να αντιμετωπίσετε προβλήματα, με προτάσεις που μας βοήθησαν να πετύχουμε τον στόχο μας.
Σας ευχαριστούμε και πάλι για τη βοήθεια και την υποστήριξή σας καθώς εργαζόμασταν για τη βελτιστοποίηση των πρωτοκόλλων μας.”
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Επιστημονικός Διευθυντής – Intus Biosciences
Η συσκευή υπερήχων UIP400MTP για πλάκες πολλαπλών βοθρίων διευκολύνει την προετοιμασία δειγμάτων υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας, π.χ. στην έρευνα και την ανάλυση μεταβολιτών.
Βασικά χαρακτηριστικά της συσκευής υπερήχων UIP400MTP για πλάκες πολλαπλών βοθρίων
| Κατεργασία με υπερήχους υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας | Απόλυτα κατάλληλο για πλάκες 96 βοθρίων και άλλες πλάκες πολλαπλών βοθρίων, το UIP400MTP επιτρέπει την ταυτόχρονη, πανομοιότυπη κατεργασία πολλών δειγμάτων με υπερήχους, μειώνοντας σημαντικά τη διάρκεια της προετοιμασίας των δειγμάτων και αυξάνοντας τη διεκπεραιωτική ικανότητα των δοκιμών με μεγάλο αριθμό δειγμάτων. |
| Χρησιμοποιήστε την πλάκα πολλαπλών βοθρίων της επιλογής σας | Το UIP400MTP έχει σχεδιαστεί για την κατεργασία με υπερήχους οποιωνδήποτε τυπικών πλακών πολλαπλών βοθρίων, πλακών PCR ή πλακών μικροτιτλοδότησης. Εσείς επιλέγετε την καταλληλότερη πλάκα για τα πειράματά σας. Καθώς το UIP400MTP δεν απαιτεί αναλώσιμα αποκλειστικής κατασκευής, εξοικονομείτε πολλά χρήματα! |
| Κατεργασία με υπερήχους χωρίς επαφή | Η συσκευή υπερήχων UIP400MTP για πλάκες πολλαπλών βοθρίων εφαρμόζει υπερήχους υψηλής έντασης χωρίς να εισάγεται οτιδήποτε στο δείγμα. Μπορείτε να υποβάλετε σε κατεργασία με υπερήχους σφραγισμένες πλάκες πολλαπλών βοθρίων, κλειστά δοχεία και φιαλίδια. Η Hielscher σάς παρέχει ειδικά προσαρμοσμένες βάσεις συγκράτησης δειγμάτων για οποιαδήποτε μη τυποποιημένα φιαλίδια ή δοχεία. |
| Ακρίβεια και έλεγχος | Ο έλεγχος ακριβείας και το έξυπνο λογισμικό σάς επιτρέπουν να ρυθμίζετε τις παραμέτρους των υπερήχων ώστε να ανταποκρίνονται βέλτιστα στις συγκεκριμένες ανάγκες επεξεργασίας σας. Επιτυγχάνετε τη μέγιστη απόδοση και αποτελεσματικότητα της κατεργασίας με υπερήχους για κάθε πείραμα. |
| Έλεγχος θερμοκρασίας | Ορίστε μια συγκεκριμένη θερμοκρασία για την κατεργασία σας με υπερήχους. Η συσκευή υπερήχων UIP400MTP για πλάκες μπορεί να παρακολουθεί τη θερμοκρασία του δείγματος και να προσαρμόζει ανάλογα την κατεργασία με υπερήχους. Ένα ψυκτικό υγρό ανακυκλοφορίας ψύχει κάθε βοθρίο της πλάκας για ακριβή έλεγχο της θερμοκρασίας. |
| Καταγραφή και απομακρυσμένος έλεγχος | Κάθε εκτέλεση κατεργασίας με υπερήχους μπορεί να ελέγχεται από υπολογιστή. Δεν απαιτείται εγκατάσταση λογισμικού. Μπορείτε να χρησιμοποιήσετε το συνηθισμένο πρόγραμμα περιήγησής σας (π.χ. Chrome, Firefox, Edge ή Safari) σε οποιοδήποτε λειτουργικό σύστημα (π.χ. MacOS, Windows, Android, iOS ή Linux) για τον απομακρυσμένο έλεγχο και την παρακολούθηση του UIP400MTP. Κάθε εκτέλεση κατεργασίας με υπερήχους παράγει μια λεπτομερή καταγραφή της κατεργασίας για αξιολόγηση και τεκμηρίωση. Το αρχείο καταγραφής είναι σε μη ιδιόκτητη μορφή CSV, την οποία μπορείτε να ανοίξετε με το πρόγραμμα της προτίμησής σας, π.χ. Microsoft Excel, Apple Numbers ή OpenOffice Calc. |
| Στιβαρό και αξιόπιστο | Σχεδιασμένο και κατασκευασμένο στη Γερμανία σύμφωνα με τα υψηλότερα πρότυπα ποιότητας, το UIP400MTP είναι τόσο ισχυρό όσο και εξαιρετικά ανθεκτικό. Ο σχεδιασμός του πληροί βιομηχανικά πρότυπα και αντέχει εύκολα στις καταπονήσεις της καθημερινής χρήσης σε ένα απαιτητικό εργαστηριακό περιβάλλον. Μπορείτε να χρησιμοποιείτε το UIP400MTP συνεχώς, 24 ώρες την ημέρα, 7 ημέρες την εβδομάδα, σε εργασίες υψηλής διεκπεραιωτικής ικανότητας. |
- υψηλή απόδοση
- τεχνολογία αιχμής
- αξιοπιστία και στιβαρότητα
- ρυθμιζόμενος, ακριβής έλεγχος της διεργασίας
- έξυπνο λογισμικό
- έξυπνες λειτουργίες (π.χ., δυνατότητα προγραμματισμού, καταγραφή δεδομένων, τηλεχειρισμός)
- εύκολος και ασφαλής χειρισμός
- χαμηλές απαιτήσεις συντήρησης
- CIP (επιτόπιος καθαρισμός)
Σχεδιασμός, κατασκευή και συμβουλευτική – Ποιότητα κατασκευασμένη στη Γερμανία
Οι συσκευές υπερήχων της Hielscher είναι ευρέως γνωστές για τα υψηλότερα πρότυπα ποιότητας και σχεδιασμού τους. Η στιβαρότητα και ο εύκολος χειρισμός επιτρέπουν την ομαλή ενσωμάτωση των συσκευών υπερήχων μας σε βιομηχανικές εγκαταστάσεις. Οι συσκευές υπερήχων της Hielscher ανταποκρίνονται με ευκολία σε αντίξοες συνθήκες και απαιτητικά περιβάλλοντα.
Η Hielscher Ultrasonics είναι μια εταιρεία πιστοποιημένη κατά ISO και δίνει ιδιαίτερη έμφαση στις συσκευές υπερήχων υψηλών επιδόσεων που διαθέτουν τεχνολογία αιχμής και είναι φιλικές προς τον χρήστη. Φυσικά, οι συσκευές υπερήχων της Hielscher συμμορφώνονται με τις απαιτήσεις CE και πληρούν τις απαιτήσεις των UL, CSA και RoHs.
Συσκευή υπερήχων χωρίς επαφή UIP400MTP για την προετοιμασία δειγμάτων μεταβολομικής σε μικροπλάκες.
Βιβλιογραφία / Αναφορές
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Συχνές ερωτήσεις σχετικά με τη μεταβολομική έρευνα
Τι είναι το μικροβίωμα;
Το μικροβίωμα αναφέρεται στη συνολική κοινότητα μικροοργανισμών, συμπεριλαμβανομένων βακτηρίων, ιών, μυκήτων και αρχαίων, καθώς και στο γενετικό τους υλικό, που απαντούν σε ένα συγκεκριμένο περιβάλλον, όπως το ανθρώπινο σώμα. Διαδραματίζει κρίσιμους ρόλους στην υγεία του ξενιστή επηρεάζοντας τον μεταβολισμό, τη λειτουργία του ανοσοποιητικού συστήματος και την προστασία από παθογόνους μικροοργανισμούς, ενώ διαμορφώνεται από παράγοντες όπως η διατροφή, ο τρόπος ζωής και το περιβάλλον.
Τι είναι η μεταβολομική;
Η μεταβολομική είναι η ολοκληρωμένη μελέτη των μεταβολιτών, οι οποίοι είναι μικρά μόρια που παράγονται κατά τις μεταβολικές διεργασίες μέσα σε ένα βιολογικό σύστημα. Περιλαμβάνει την ταυτοποίηση, την ποσοτικοποίηση και την ανάλυση αυτών των μορίων για την κατανόηση των κυτταρικών λειτουργιών, των μεταβολικών οδών και του τρόπου με τον οποίο ανταποκρίνονται σε γενετικές, περιβαλλοντικές ή παθολογικές μεταβολές.
Τι είναι το μεταβόλωμα;
Το μεταβόλωμα είναι το πλήρες σύνολο των μικρών μορίων, ή μεταβολιτών, που υπάρχουν μέσα σε ένα βιολογικό σύστημα, όπως ένα κύτταρο, ένας ιστός ή ένας οργανισμός, σε μια δεδομένη χρονική στιγμή. Αντανακλά τη βιοχημική δραστηριότητα και τη φυσιολογική κατάσταση του συστήματος, παρέχοντας πληροφορίες για τον μεταβολισμό και τις αλληλεπιδράσεις του με το περιβάλλον.
Η Hielscher Ultrasonics κατασκευάζει ομογενοποιητές υπερήχων υψηλών επιδόσεων από εργαστηριακό έως βιομηχανικό μέγεθος.


