Сдвиг хроматина: высокая производительность и бесконтактная точность
Сдвиг хроматина является важным этапом во многих рабочих процессах молекулярной биологии, позволяющим фрагментировать хроматин на точные размеры для таких применений, как ChIP и NGS. Многолуночный ультразвуковой аппарат UIP400MTP произвел революцию в этом процессе благодаря своей высокопроизводительной бесконтактной технологии, обеспечивающей непревзойденную эффективность, воспроизводимость и целостность образца. В этой статье исследуется, как UIP400MTP упрощает и улучшает сдвиг хроматина, отвечая требованиям современных исследований.
Сдвиг хроматина в медико-биологической отрасли
Сдвиг хроматина, процесс фрагментации хроматина на управляемые размеры, является важным шагом в молекулярной биологии, особенно для эпигенетических исследований, иммунопреципитации хроматина (ChIP) и секвенирования нового поколения (NGS). Этот метод используется для выделения комплексов ДНК-белок, изучения модификаций гистонов и идентификации ДНК-связывающих белков. Достижение стабильной и воспроизводимой фрагментации хроматина имеет решающее значение для получения высококачественных данных, и это в значительной степени зависит от оборудования и методов, используемых в процессе резки.
Традиционные методы сдвига хроматина часто сопряжены с такими проблемами, как загрязнение образца, переменные результаты и нехватка времени. По мере расширения масштабов исследований, особенно в условиях высокой пропускной способности, растет спрос на инновационные решения, которые обеспечивают стабильные результаты на нескольких образцах. Многолуночный планшетный ультразвуковой аппарат UIP400MTP предлагает передовой, высокопроизводительный и бесконтактный подход, устанавливая новый стандарт сдвига хроматина.
Оптимизируйте сдвиг хроматина с помощью многолуночного планшетного ультразвукового аппарата UIP400MTP
Высокопроизводительный ультразвуковой аппарат UIP400MTP выделяется среди методов резки хроматина, превосходя традиционные методы, такие как ферментативное разложение и механическая резка. Сочетая высокую производительность с бесконтактной обработкой ультразвуком, он обеспечивает превосходную воспроизводимость, скорость и целостность образца, что делает его предпочтительным выбором для современных исследовательских рабочих процессов.
- Высокая производительность
Способность UIP400MTP обрабатывать несколько образцов одновременно значительно экономит время и усилия. Это устраняет необходимость в повторяющейся ручной обработке образцов, что позволяет исследователям сосредоточиться на последующих анализах и повышении общей производительности. - Бесконтактная ультразвуковая обработка для обеспечения целостности образца
Бесконтактная ультразвуковая обработка не только защищает образцы от загрязнения, но и сводит к минимуму риск механического износа оборудования. Это гарантирует, что чувствительные биологические образцы обрабатываются в контролируемой и стерильной среде. - Равномерная фрагментация
Воспроизводимость является краеугольным камнем надежных исследований. UIP400MTP гарантирует, что каждая лунка получает идентичное ультразвуковое воздействие, в результате чего образуются однородные фрагменты хроматина. Такая однородность имеет решающее значение для таких экспериментов, как ChIP и NGS, где постоянство в подготовке образцов напрямую влияет на качество данных. - Масштабируемость и гибкость
UIP400MTP подходит как для небольших экспериментов, так и для крупномасштабных исследований. Исследователи могут легко настроить систему для различных объемов образцов, что делает ее универсальным инструментом для различных применений. - Снижение риска перекрестного загрязнения
Традиционные методы, предполагающие прямой контакт, такие как ультразвуковая обработка зондом, сопряжены с риском загрязнения от образца к образцу. Бесконтактный подход UIP400MTP устраняет этот риск, что делает его особенно подходящим для чувствительных приложений, таких как эпигенетические исследования.
Применение метода сдвига хроматина с помощью UIP400MTP
UIP400MTP идеально подходит для:
- Иммунопреципитация хроматина (ChIP): Точный сдвиг хроматина обеспечивает оптимальное связывание антител со специфическими ДНК-белковыми комплексами.
- Секвенирование нового поколения (NGS): Равномерная фрагментация ДНК имеет решающее значение для подготовки библиотеки секвенирования, обеспечивая высокое качество чтения.
- Исследования модификации гистонов: Последовательное получение хроматина позволяет исследователям анализировать взаимодействия гистона и ДНК с высокой точностью.
- Эпигенетические исследования: UIP400MTP поддерживает исследование паттернов метилирования ДНК и других эпигенетических модификаций с помощью воспроизводимой обработки образцов.
Высокопроизводительные ультразвуковые аппараты
- Высокая эффективность
- Современные технологии
- надёжность & робастность
- Регулируемое, точное управление процессом
- партия & встроенный
- для любого объема
- Интеллектуальное программное обеспечение
- интеллектуальные функции (например, программируемые, протоколирование передачи данных, дистанционное управление)
- Простота и безопасность в эксплуатации
- Низкие эксплуатационные расходы
- CIP (безразборная мойка)
Проектирование, производство и консалтинг – Качество «Сделано в Германии»
Ультразвуковые аппараты Hielscher хорошо известны своими высочайшими стандартами качества и дизайна. Надежность и простота в эксплуатации позволяют без проблем интегрировать наши ультразвуковые аппараты в промышленные объекты. Ультразвуковые аппараты Hielscher легко справляются с суровыми условиями и требовательными условиями окружающей среды.
Hielscher Ultrasonics является компанией, сертифицированной по стандарту ISO, и уделяет особое внимание высокопроизводительным ультразвуковым аппаратам, отличающимся самыми современными технологиями и удобством в использовании. Конечно, ультразвуковые аппараты Hielscher соответствуют требованиям CE и соответствуют требованиям UL, CSA и RoHs.
В таблице ниже приведена приблизительная производительность обработки наших лабораторных ультразвуковых аппаратов:
| Рекомендуемые устройства | Объем партии | Расход |
|---|---|---|
| UIP400MTP 96-луночный ультразвуковой аппарат | Многолуночные / микротитровальные планшеты | н.а. |
| Ультразвуковой чашечный рожок | CupHorn для флаконов или стакана | н.а. |
| ГДмини2 | Ультразвуковой микропоточный реактор | н.а. |
| VialTweeter | 0от 0,5 до 1,5 мл | н.а. |
| УП100Ч | от 1 до 500 мл | От 10 до 200 мл/мин |
| УП200Хт, УП200Ст | От 10 до 1000 мл | от 20 до 200 мл/мин |
| УП400Ст | от 10 до 2000 мл | от 20 до 400 мл/мин |
| Ультразвуковая встряхиватель для сит | н.а. | н.а. |
Литература / Литература
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- UIP400MTP-Multi-well-Plate-Sonicator-Infographic
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Часто задаваемые вопросы
Что такое фрагментация хроматина?
Фрагментация хроматина — это процесс расщепления хроматина, комплекса ДНК и белков, на более мелкие, управляемые фрагменты. Это достигается для облегчения изучения ДНК-белковых взаимодействий, модификаций гистонов или доступности ДНК в приложениях молекулярной биологии, таких как иммунопреципитация хроматина (ChIP) и секвенирование нового поколения (NGS). Этот процесс гарантирует, что хроматин фрагментируется до определенного диапазона размеров, как правило, с помощью физических методов, таких как ультразвуковое или ферментативное расщепление, сохраняя при этом целостность комплексов ДНК-белка для последующего анализа.
Что такое хроматиновое сшивка?
Сшивание хроматина — это биохимический процесс, используемый для стабилизации взаимодействий между ДНК и белками или другими молекулами, связанными с хроматином. Он включает в себя использование сшивающих агентов, таких как формальдегид, для эффективного создания ковалентных связей между взаимодействующими молекулами “замораживание” их взаимодействие на месте. Этот метод широко используется в иммунопреципитации хроматина (ChIP) и связанных с ним анализах для сохранения нативной структуры хроматина и облегчения идентификации ДНК-белка или белок-белковых взаимодействий во время последующего анализа.
Что вызывает уплотнение хроматина?
Уплотнение хроматина в первую очередь вызвано взаимодействиями между гистонами и ДНК, а также фолдингом более высокого порядка, опосредованным линкерными гистонами (такими как H1), хроматин-ассоциированными белками и эпигенетическими модификациями, такими как метилирование гистонов или деацетилирование. Эти факторы способствуют более плотной упаковке нуклеосом, снижая доступность ДНК. Клеточные условия, такие как концентрация ионов, и такие процессы, как деление клеток или подавление экспрессии генов, также способствуют уплотнению хроматина.
Hielscher Ultrasonics производит высокопроизводительные ультразвуковые гомогенизаторы от лаборатория Кому промышленного размера.




