Метаболомика, облегченная высокопроизводительной ультразвуковой обработкой
Метаболомика — это область исследований, в которой используются высокопроизводительные методы для характеристики и количественного определения малых молекул в различных биожидкостях, таких как моча, сыворотка, плазма, фекалии и слюна, раскрывая уникальные метаболические сигнатуры. Высокопроизводительный ультразвуковой UIP400MTP, предназначенный для многолуночных планшетов, является мощным инструментом для лизирования клеток в этих образцах, облегчая высвобождение метаболитов для последующего анализа. Этот точный и надежный подход имеет важное значение для метаболомики, где первостепенное значение имеют точный дизайн исследования, тщательная подготовка образцов, оптимизированная настройка платформы, всесторонний анализ данных и содержательная биологическая интерпретация. Метаболомика использует как целевые подходы, которые сосредоточены на конкретных классах молекул, таких как углеводы, липиды и аминокислоты, так и нецелевые методы, которые обеспечивают широкий обзор метаболических профилей в образце, раскрывая сложную сложность метаболической сигнализации.
Высокопроизводительная пробоподготовка с помощью 96-луночного планшетного ультразвукового аппарата UIP400MTP
Использование бесконтактного ультразвукового UIP400MTP в сочетании с 96-луночными планшетами является эффективным методом высокопроизводительной гомогенизации и экстракции метаболитов. Такая конфигурация позволяет избежать прямого контакта с образцом, снижая риск перекрестного загрязнения при одновременной обработке нескольких образцов.
Пошаговый протокол гомогенизации с помощью 96-луночного ультразвукового аппарата UIP400MTP
- Подготовка метаболомных образцов
Размещение образца: Диспенсируйте каждый образец (например, кал, ткань кишечника или содержимое люминала) в отдельные лунки 96-луночного планшета или микропланшета.
Растворитель: Органические растворители, такие как метанол, этанол, ацетонитрил, хлороформ и их (водные) смеси, необходимы для экстракции метаболитов, способствуя высвобождению внутриклеточных метаболитов из клеточного матрикса. Используйте 100–300 μл растворителя на лунку, обеспечивая достаточный объем для полного погружения образца.
Внутренние стандарты: При необходимости добавьте внутренние стандарты в каждую лунку для нормализации во время последующего метаболомного анализа. - Настройка соединительной среды
Уровень воды: Поместите пластину 96well на платформу для ультразвуковой обработки, заполненную водой (соединительной средой), как описано в руководстве. - UIP400MTP Настройка параметров
Настройки питания: Отрегулируйте амплитуду ультразвука до 50–80% от максимальной мощности для эффективной гомогенизации.
Импульсный режим: Установите цикл ультразвуковой обработки на чередование импульсов (например, 30 секунд ВКЛ, 30 секунд ВЫКЛ), чтобы обеспечить охлаждение и предотвратить перегрев образца.
Общее время: 4–10 минут, в зависимости от сложности и прочности образца.
Контроль температуры: Используйте лабораторный охладитель для поддержания температуры воды на уровне 4–8 °C во время ультразвуковой обработки для защиты чувствительных к теплу метаболитов. - Процесс обработки ультразвуком
Запустите UIP400MTP для циклов ультразвуковой обработки.
Контролируйте процесс через интерфейс UIP400MTP.
Эффект кавитации гомогенизирует образцы и лизирует клетки в лунках, высвобождая внутриклеточные метаболиты в растворитель. - Постультразвуковая обработка
Центрифугирование: После ультразвуковой обработки при необходимости переложите содержимое пластины в пробирки для сбора. Центрифугируйте при 4 000–6 000 × г в течение 10 минут для гранулирования нерастворимого мусора и клеточного материала.
Коллекция надосадочной жидкости: Осторожно переложите надосадочную жидкость из каждой лунки в новые пробирки или планшеты для анализа.
Дополнительная сушка: Высушите надосадочную жидкость с помощью вакуумного концентратора (например, SpeedVac), если требуется концентрация, затем восстановите в небольшом объеме соответствующий растворитель.
Воспользуйтесь преимуществами высокопроизводительной вычислительной мощности многолуночного ультразвукового аппарата UIP400MTP и упростите свои метаболомные исследования и анализ!
UIP400MTP высокопроизводительный ультразвуковой аппарат для метаболомных исследований в многолуночных планшетах, 96-луночных планшетах, пробирках и чашках Петри.
Принцип бесконтактной ультразвуковой обработки с UIP400MTP
UIP400MTP подает ультразвуковые волны на лунки 96-луночной пластины опосредованно через связующую среду (например, воду). Эти волны создают кавитацию, которая разрушает клетки и высвобождает метаболиты без физического контакта между зондом ультразвукового аппарата и образцом.
“Я пишу, чтобы поблагодарить вас за наш фантастический опыт использования вашего ультразвукового аппарата UIP400MTP для равномерного и последовательного бактериального лизиса образцов фекального микробиома. Мы расширяем границы возможностей технологии лизиса с высокой пропускной способностью, и ваш инструмент хорошо подходит для этой задачи. Вот некоторые из ключевых моментов:
- Простота в эксплуатации – Инструмент прост в использовании, а настройка проста с помощью пунктов меню
- Высокая пропускная способность – Отлично подходит для работы с пластинами, с 96 образцами одновременно
- Равномерная ультразвук всех сосудов – Устройство смогло подавать одинаковое количество ультразвука во все скважины, что было критически важно для нашего приложения
- Поддержка от команды Hielscher – Поддержка была отличной, вы всегда были рядом с нами на тренингах, чтобы ответить на наши вопросы и решить проблемы, с предложениями, которые помогли нам достичь нашей цели.
Еще раз благодарим вас за вашу помощь и содействие в работе над оптимизацией наших протоколов.”
Марк Д. Дрисколл, доктор философии – Главный научный сотрудник – Интус Бионауки
Многолуночный планшетный ультразвуковой аппарат UIP400MTP обеспечивает высокую производительность подготовки образцов, например, при исследовании и анализе метаболитов.
Основные характеристики многолуночного ультразвукового аппарата UIP400MTP
| Высокопроизводительная ультразвуковая обработка | Идеально подходит для 96-луночных и других многолуночных планшетов, UIP400MTP позволяет проводить одновременную, идентичную ультразвуковую обработку нескольких образцов, значительно сокращая продолжительность подготовки образцов и увеличивая производительность тестирования с большим количеством образцов. |
| Используйте планшет Multiwell по вашему выбору | UIP400MTP предназначен для ультразвуковой обработки любых стандартных многолуночных планшетов, ПЦР-планшетов или микротитровых планшетов. Вы выбираете тарелку, наиболее подходящую для ваших экспериментов. Поскольку для UIP400MTP не требуются фирменные расходные материалы, это значительно экономит вам деньги! |
| Бесконтактное ультразвуковое исследование | Пластинчатый ультразвуковой аппарат Multiwell UIP400MTP подает интенсивный ультразвук, ничего не вводя в образец. Вы можете обрабатывать ультразвуком многолуночные планшеты, закрытые сосуды и флаконы. Hielscher поставляет вам индивидуальные держатели для образцов для любых нестандартных флаконов или сосудов. |
| Точность и контроль | Прецизионное управление и интеллектуальное программное обеспечение позволяют оптимально настраивать параметры ультразвука в соответствии с вашими конкретными потребностями в обработке. Вы получаете максимальную эффективность и результативность ультразвука для каждого эксперимента. |
| Контроль температуры | Установите определенную температуру для ультразвуковой обработки. Ультразвуковой аппарат UIP400MTP пластины может контролировать температуру образца и соответствующим образом регулировать ультразвуковую обработку. Рециркуляционная охлаждающая жидкость охлаждает каждую лунку в пластине для точного контроля температуры. |
| Протоколирование и дистанционное управление | Каждым прогоном ультразвука можно управлять с компьютера. Установка программного обеспечения не требуется. Вы можете использовать стандартный браузер (например, Chrome, Firefox, Edge или Safari) в любой операционной системе (например, MacOS, Windows, Android, iOS или Linux) для удаленного управления и мониторинга UIP400MTP. При каждом прогоне ультразвука создается подробный протокол обработки ультразвуком для оценки и документирования. Файл протокола находится в непроприетарном формате CSV, который вы можете открыть с помощью предпочитаемой вами программы, например, Microsoft Excel, Apple Numbers или OpenOffice Calc. |
| Прочный и надежный | Спроектированный и изготовленный в Германии в соответствии с высочайшими стандартами качества, UIP400MTP не только мощный, но и удивительно прочный. Его конструкция соответствует промышленным стандартам и легко выдерживает суровые условия ежедневного использования в сложных лабораторных условиях. Вы можете использовать UIP400MTP непрерывно 24 часа, 7 дней в неделю в операциях с высокой пропускной способностью. |
- Высокая эффективность
- Современные технологии
- надёжность & робастность
- Регулируемое, точное управление процессом
- Интеллектуальное программное обеспечение
- интеллектуальные функции (например, программируемые, протоколирование передачи данных, дистанционное управление)
- Простота и безопасность в эксплуатации
- Низкие эксплуатационные расходы
- CIP (безразборная мойка)
Проектирование, производство и консалтинг – Качество «Сделано в Германии»
Ультразвуковые аппараты Hielscher хорошо известны своими высочайшими стандартами качества и дизайна. Надежность и простота в эксплуатации позволяют без проблем интегрировать наши ультразвуковые аппараты в промышленные объекты. Ультразвуковые аппараты Hielscher легко справляются с суровыми условиями и требовательными условиями окружающей среды.
Hielscher Ultrasonics является компанией, сертифицированной по стандарту ISO, и уделяет особое внимание высокопроизводительным ультразвуковым аппаратам, отличающимся самыми современными технологиями и удобством в использовании. Конечно, ультразвуковые аппараты Hielscher соответствуют требованиям CE и соответствуют требованиям UL, CSA и RoHs.
Бесконтактный ультразвуковой аппарат UIP400MTP для подготовки метаболомных образцов в микропланшетах.
Литература / Литература
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Часто задаваемые вопросы о метаболомных исследованиях
Что такое микробиом?
Микробиом относится к коллективному сообществу микроорганизмов, включая бактерии, вирусы, грибы и археи, а также их генетический материал, которые населяют определенную среду, такую как организм человека. Он играет важнейшую роль в здоровье хозяина, влияя на метаболизм, иммунную функцию и защиту от патогенов, в то же время формируясь под влиянием таких факторов, как диета, образ жизни и окружающая среда.
Что такое метаболомика?
Метаболомика — это всестороннее изучение метаболитов, которые представляют собой малые молекулы, образующиеся в ходе метаболических процессов в биологической системе. Он включает в себя идентификацию, количественную оценку и анализ этих молекул для понимания клеточных функций, метаболических путей и того, как они реагируют на генетические, экологические или патологические изменения.
Что такое метаболом?
Метаболом — это полный набор малых молекул или метаболитов, присутствующих в биологической системе, такой как клетка, ткань или организм, в определенный момент времени. Он отражает биохимическую активность и физиологическое состояние системы, давая представление о метаболизме и его взаимодействии с окружающей средой.
Hielscher Ultrasonics производит высокопроизводительные ультразвуковые гомогенизаторы от лаборатория Кому промышленного размера.



