Протокол анализа MBEC с использованием ультразвукового устройства UIP400MTP для 96-луночных планшетов
Анализ MBEC используется для определения концентрации антимикробных средств, необходимой для уничтожения биоплёнок, сформировавшихся на крышках со штифтами. Для оценки жизнеспособности биоплёнок их сначала необходимо отделить от крышек со штифтами 96-луночного планшета. Обработка ультразвуком – самый надёжный и эффективный метод такого отделения. Ультразвуковое устройство UIP400MTP для многолуночных планшетов специально разработано для обработки аналитических планшетов с максимальной эффективностью и удобством, что упрощает и ускоряет высокопроизводительное проведение анализов MBEC.
Обработка ультразвуком для отделения биоплёнок
Обработка ультразвуком – важнейший этап анализов минимальной концентрации, уничтожающей биоплёнку (MBEC), позволяющий эффективно отделять клетки биоплёнки от поверхности, к которой они прикреплены. Биоплёнки по своей природе представляют собой структурированные сообщества микроорганизмов, заключённых во внеклеточный матрикс, который делает их значительно более устойчивыми к антимикробным средствам по сравнению с планктонными клетками. При проведении анализов MBEC обработка ультразвуком использует ультразвуковые волны для создания контролируемой кавитации, разрушающей матрикс биоплёнки и высвобождающей заключённые в нём клетки в суспензию. Этот этап обеспечивает равномерное распределение клеток биоплёнки в среде для восстановления, способствуя точной оценке жизнеспособности методами посева, разведения или спектрофотометрии. Без надлежащего отделения биоплёнки остаточные компоненты матрикса могут защищать клетки, приводя к недооценке эффективности антимикробных средств. Поэтому обработка ультразвуком незаменима для получения надёжных и воспроизводимых значений MBEC, отражающих истинный потенциал исследуемых средств в отношении уничтожения биоплёнок. Ультразвуковое устройство UIP400MTP для многолуночных планшетов позволяет легко выполнять высокопроизводительную подготовку образцов в аналитических планшетах.
Ультразвуковое устройство UIP400MTP для многолуночных планшетов облегчает высокопроизводительную подготовку образцов в аналитических планшетах.
Протокол анализа минимальной концентрации, уничтожающей биоплёнку (MBEC)
Этап 1: Формирование биоплёнки
- Подготовьте бактериальную суспензию:
Выращивайте бактерии в подходящих средах до логарифмической фазы роста.
Разведите бактериальную культуру до заданной оптической плотности (например, OD600 ~0,1). - Инокулируйте 96-луночный планшет:
Добавьте бактериальную суспензию (например, 150–200 µL) в каждую лунку стандартного 96-луночного микротитрационного планшета. - Установите крышку со штифтами:
Поместите крышку со штифтами на инокулированный планшет, чтобы обеспечить формирование биоплёнок на поверхностях штифтов. - Инкубируйте планшет:
Инкубируйте собранную систему при подходящей температуре (например, 37°C) в течение 24–48 часов без встряхивания, чтобы способствовать росту биоплёнок.
Этап 2: Обработка антимикробными средствами
- Подготовьте растворы антимикробных средств:
Приготовьте растворы антимикробных средств в диапазоне концентраций в свежих средах.
Подвергните биоплёнки воздействию антимикробных средств:
Снимите крышку со штифтами с планшета с бактериальной культурой и промойте её в стерильном физиологическом растворе или PBS для удаления планктонных клеток.
Поместите крышку со штифтами в новый 96-луночный планшет, содержащий растворы антимикробных средств. - Инкубируйте планшет:
Инкубируйте в течение заданного периода (например, 24 часов), чтобы обеспечить воздействие антимикробных средств.
Ультразвуковое устройство UIP400MTP для многолуночных планшетов для высокопроизводительной подготовки образцов
Этап 3: Обработка ультразвуком с помощью устройства UIP400MTP для 96-луночных планшетов
Этап обработки ультразвуком имеет решающее значение для отделения биоплёнок от крышек со штифтами с целью оценки жизнеспособности. При использовании ультразвукового устройства UIP400MTP выполните следующие действия:
- Подготовьте систему:
Заполните каждую лунку нового 96-луночного планшета средой для восстановления (например, нейтрализующим бульоном или свежей питательной средой). - Перенесите крышку со штифтами:
Снимите крышку со штифтами с планшета для обработки антимикробными средствами.
Промойте крышку со штифтами в стерильном физиологическом растворе или PBS для удаления остаточных антимикробных средств. - Разместите планшет и ультразвуковое устройство:
Установите крышку со штифтами на планшет со средой для восстановления.
Поместите планшет со средой для восстановления на платформу ультразвукового устройства UIP400MTP, убедившись, что планшет расположен по центру и устойчив. - Настройте параметры обработки ультразвуком:
Установите параметры обработки ультразвуком на UIP400MTP (настройки можно адаптировать к биоплёнке):
Амплитуда: 70–100%.
Время обработки ультразвуком: 1–3 минуты (корректируйте с учётом прочности биоплёнки) в циклическом режиме. - Обработайте ультразвуком:
Запустите процесс обработки ультразвуком. Ультразвуковые колебания отделят биоплёнки от поверхностей штифтов и перенесут их в среду для восстановления. - Контролируйте процесс:
Используйте подключаемый датчик температуры для контроля температуры образцов в лунках. Для охлаждения UIP400MTP можно подключить к лабораторному охладителю. - Действия после обработки ультразвуком:
Немедленно перенесите среду для восстановления (теперь содержащую отделённые биоплёнки) в новый стерильный планшет для последующего анализа.
(A) Планшет, содержащий TSB с 2% глюкозы, используемый для формирования биоплёнок, восстановления клеток и
определения MIC и MBCB; (B) Крышка со штифтами для формирования стафилококковых биоплёнок. определение MIC и MBCB; (B) Крышка со штифтами для формирования стафилококковых биоплёнок.
Клетки биоплёнок, сформировавшихся на штифтах, отделяли обработкой ультразвуком (ультразвуковая технология Hielscher) в течение 5 min в 96-луночных планшетах, содержащих свежую культуральную среду для восстановления клеток.
(Изображение и исследование: ©de Oliveira et al., 2016)
Этап 4: Оценка жизнеспособности
Выполните посев и культивирование отделённых биоплёнок:
- Выполните последовательные разведения среды для восстановления и посев на агар для подсчёта колониеобразующих единиц (CFU).
В качестве альтернативы используйте колориметрический или флуоресцентный анализ жизнеспособности. - Запишите результаты:
Определите MBEC как самую низкую концентрацию антимикробного средства, при которой была устранена обнаруживаемая жизнеспособность биоплёнки.
Проектирование, производство и консультирование – качество, произведённое в Германии
Ультразвуковые устройства Hielscher хорошо известны высочайшими стандартами качества и проектирования. Прочность и простота эксплуатации позволяют беспрепятственно интегрировать наши ультразвуковые устройства в промышленные объекты. Ультразвуковые устройства Hielscher легко справляются с суровыми условиями и сложной эксплуатационной средой.
Hielscher Ultrasonics – компания, сертифицированная по ISO, которая уделяет особое внимание высокопроизводительным ультразвуковым устройствам с передовыми технологиями и удобством использования. Разумеется, ультразвуковые устройства Hielscher соответствуют требованиям CE и отвечают требованиям UL, CSA и RoHs.
Упростите подготовку образцов в 96-луночных и аналитических планшетах с помощью ультразвукового устройства UIP400MTP для многолуночных планшетов
Литература / Ссылки
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator — Non-Contact Sonicator — Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
Часто задаваемые вопросы
Что такое анализ MBEC?
Анализ минимальной концентрации, уничтожающей биоплёнку (MBEC), – стандартизированный метод определения самой низкой концентрации антимикробного средства, необходимой для уничтожения бактерий, связанных с биоплёнкой. Он включает выращивание биоплёнок на специализированных поверхностях, воздействие на них антимикробными средствами в разных концентрациях и оценку жизнеспособности отделённых клеток после разрушения биоплёнки, обычно посредством обработки ультразвуком, для определения эффективности обработки.
В чём разница между MBIC и MBEC?
Минимальная концентрация, ингибирующая биоплёнку (MBIC), – самая низкая концентрация антимикробного средства, необходимая для предотвращения формирования биоплёнки, тогда как минимальная концентрация, уничтожающая биоплёнку (MBEC), – самая низкая концентрация, необходимая для уничтожения уже сформировавшейся биоплёнки. MBIC ориентирована на предотвращение образования биоплёнок, а MBEC оценивает эффективность обработки против зрелых биоплёнок.
Какие планшеты обычно используются для анализов MBEC?
Микротитрационные планшеты, обычно используемые для анализов MBEC, как правило, представляют собой 96-луночные планшеты из полистирола или полипропилена. Эти материалы обеспечивают подходящую поверхность для формирования биоплёнок и химически устойчивы к антимикробным средствам, исследуемым в ходе анализа. Полистироловые планшеты часто предпочитают благодаря их оптической прозрачности, которая полезна для последующих анализов, таких как спектрофотометрические или флуоресцентные измерения. Конструкция этих планшетов включает съёмные крышки со штифтами, необходимые для анализа, поскольку биоплёнки формируются на штифтах, погружённых в лунки с питательными средами. Стандартизированные планшеты, например соответствующие протоколу анализа MBEC, специально разработаны для обеспечения воспроизводимости и совместимости с ультразвуковым устройством UIP400MTP или другим оборудованием для обработки.
Что такое планшеты с PEG-крышкой?
Планшеты с PEG-крышкой – специализированные многолуночные планшетные системы, в которых крышка оснащена небольшими выступами или штифтами из полиэтиленгликоля (PEG), входящими в каждую лунку. Эти штифты обеспечивают поверхность для формирования микробных биоплёнок в контролируемых условиях, имитируя рост биоплёнок в реальных условиях. Конструкция позволяет биоплёнкам развиваться на штифтах, в то время как лунки содержат питательные среды или антимикробные средства, обеспечивая высокопроизводительное тестирование чувствительности биоплёнок к обработке, например в анализах MBEC и MBIC.
Hielscher Ultrasonics производит высокопроизводительные ультразвуковые гомогенизаторы от лабораторных до промышленных размеров.