מחקר מיקרוביום ואנליזה קלינית יעילים על ידי סוניקציה
סוניקציה היא טכניקה רבת עוצמה הנמצאת בשימוש נרחב במחקר מיקרוביום ובאנליזה קלינית ומאפשרת הכנת דגימות בתפוקה גבוהה. השיטה האולטרסונית יעילה במיוחד לעיבוד דגימות ביולוגיות מורכבות, כגון אלה המכילות מיקרואורגניזמים. השימוש בסוניקציה מאפשר ליזה של תאים, מיצוי וניתוח של חומצות גרעין, חלבונים ומטבוליטים, ומאפשר הבנה עמוקה יותר של קהילות מיקרוביאליות ותפקידן בבריאות ובמחלות. הסוניקטורים בעלי התפוקה הגבוהה של Hielscher ידועים בזכות הדיוק, היעילות והתוצאות הניתנות לשחזור שלהם, מה שהופך אותם לבחירה מצוינת למחקרי מיקרוביום.
נצל את היתרונות של סוניקציה בעלת תפוקה גבוהה במחקר מיקרוביום
סוניק הלוחות בעל 96 הקידוחים UIP400MTP מייעל את מחקר המיקרוביום על ידי הכנת דגימות בתפוקה גבוהה
הכנת דגימה בתפוקה גבוהה עם Sonicator בעל 96 בארות Plate Sonicator UIP400MTP
יישומי סוניקציה במחקר מיקרוביום
ליזה יעילה של תאים
סוניקציה יעילה מאוד בשכיבת תאים מיקרוביאליים, כולל אלה עם דפנות תאים קשיחות, כגון חיידקים ופטריות גראם-חיוביים. הגלים העל-קוליים יוצרים בועות-קוויטציה בדגימה, שקורסות ויוצרות גלי הלם ששוברים את קירות התאים ואת קרומי התא. תהליך זה מבטיח שיבוש מקיף של התאים ושחרור יעיל של תוכן תוך-תאי, כגון דנ"א, רנ"א וחלבונים.
פיצול DNA מבוקר
עבור יישומים כמו ריצוף הדור הבא, לעתים קרובות יש צורך לגזור דנ"א למקטעים קטנים ואחידים יותר. סוניקציה מספקת שליטה מדויקת על תהליך הפיצול, ומאפשרת לחוקרים להשיג מקטעי DNA בגודל הרצוי. בקרה זו היא קריטית להכנת ספריות רצף ולהבטחת נתוני רצף באיכות גבוהה.
הומוגניזציה משופרת של דגימות
במחקר מיקרוביום, דגימות מכילות לעתים קרובות תערובת מגוונת של מיקרואורגניזמים. סוניקציה מסייעת להשיג פיזור אחיד של מיקרואורגניזמים אלה בתוך הדגימה, ומבטיחה תוצאות עקביות וניתנות לשחזור. הומוגניזציה זו חיונית לניתוח כמותי מדויק, כגון קביעת שפע מיקרוביאלי או מדידת פעילויות מטבוליות ספציפיות.
מיצוי מטבוליטים אמין
מיצוי מטבוליטים אמין על ידי סוניקציה היא טכניקה נפוצה במטבולומיקה לבידוד מולקולות קטנות מדגימות ביולוגיות. סוניקציה משתמשת בתנודות מכניות המשבשות את קרום התא, ומקלות על שחרור מטבוליטים תוך-תאיים לממס. שיטה זו יעילה, ניתנת לשחזור ותואמת לסוגי דגימות שונים, מה שהופך אותה לכלי רב ערך למחקרים מטבוליים ממוקדים בעלי תפוקה גבוהה. קרא עוד על מיצוי מטבוליטים קולי!
“אני כותב כדי להודות לך על החוויה הפנטסטית שלנו בשימוש בסוניקטור UIP400MTP שלך לליזה חיידקית אחידה ועקבית של דגימות מיקרוביום צואה. אנו דוחפים את המעטפת לטכנולוגיית ליזה בתפוקה גבוהה, והמכשיר שלך מתאים היטב למשימה. כמה מהדגשים העיקריים הם:
- קלות תפעול - המכשיר קל לשימוש, וההתאמה האישית פשוטה באמצעות אפשרויות התפריט
- תפוקה גבוהה - מעולה לטיפול בצלחות, עם 96 דגימות בכל פעם
- אפילו סוניקציה של כל כלי השיט - המכשיר היה מסוגל לספק את אותה כמות של סוניקציה לכל הבארות, וזה היה קריטי עבור היישום שלנו
- תמיכה מצוות Hielscher- התמיכה הייתה מצוינת, תמיד היית שם בשבילנו באימונים, לענות על השאלות שלנו ולטפל בבעיות, עם הצעות שעזרו לנו להגיע למטרה שלנו.
שוב תודה על עזרתך ועזרתך בזמן שפעלנו לייעל את הפרוטוקולים שלנו.”
מארק ד. דריסקול, Ph.D. – מדען ראשי – Intus Biosciences
כיצד מיישמים סוניקציה במחקר ואבחון מיקרוביום?
מטבולומיקה, מטגנומיקה ומטפרוטאומיקה שזורות זו בזו במחקר המיקרוביום, שכן הן מספקות יחד הבנה מקיפה של קהילות מיקרוביאליות ותפקודיהן. ליזיס, טיהור חלבונים ופיצול DNA / RNA הם שלבי הכנת דגימה חיוניים היעילים באמצעות UIP400MTP הסוניקטור בעל 96 בארות.
מטבולומיקה וניתוח מטבוליזם
מטבולומיקה כוללת מחקר שיטתי של מטבוליטים של מולקולות קטנות בתוך מערכת ביולוגית. במחקר מיקרוביום, סוניקציה משמשת לליזה של תאים מיקרוביאליים, שחרור מטבוליטים תוך-תאיים. ניתן לעבד מספרים גבוהים בדגימה במהירות באמצעות UIP400MTP הסוניקטור בעל 96 הקידוחים. המטבוליטים המופקים מכומתים לאחר מכן באמצעות טכניקות מתקדמות כגון ספקטרומטריית מסות (MS) וספקטרוסקופיית תהודה מגנטית גרעינית (NMR). הנתונים המתקבלים מספקים תמונת מצב של המצב המטבולי של מיקרוביום, וחושפים תובנות לגבי הפעילויות והאינטראקציות הביוכימיות בתוך קהילות מיקרוביות.
מטאגנומיקה ומטא-טרנסקריפטומיקה
מטגנומיקה כוללת ניתוח מקיף של חומר גנטי שנאסף ישירות מדגימות סביבתיות. סוניקציה ממלאת תפקיד מכריע בתהליך זה על ידי שכיבת תאים מיקרוביאליים כדי לחלץ דנ"א באיכות גבוהה, אשר לאחר מכן מרוצף כדי לזהות ולכמת את מיני החיידקים הנוכחים. במטא-טרנסקריפטומיקס, RNA מופק באמצעות שיטות סוניקציה דומות כדי לחקור פרופילי ביטוי גנים בקהילות מיקרוביאליות שונות. עבור ריצוף DNA ו- RNA, חומצות הגרעין חייבות להיות מקוטעות לאורך זוג בסיס מסוים. כל המשימות הללו מבוצעות באופן אמין ומהיר על ידי הסוניקטור בעל התפוקה הגבוהה UIP400MTP!
פרוטאומיקה
אנליזות פרוטאומיות דורשות מיצוי חלבונים מתאי מיקרוביאליים. סוניקציה משמשת ביעילות כדי לשבש תאים, שחרור חלבונים לתוך התמיסה. לאחר מכן ניתן לטהר ולנתח את החלבונים האלה כדי להבין את תפקידיהם התפקודיים בתוך המיקרוביום ואת מעורבותם במסלולים מטבוליים. עם הסוניקטור UIP400MTP Multi-Well Plate, תוכלו לבצע את משימת הליזה ומיצוי החלבונים תוך דקות וליצור תוצאות ניתנות לשחזור לקבלת תובנות לגבי התהליכים הביולוגיים המונעים על ידי חלבונים בקהילות מיקרוביות.
מטפרוטאומיקה
מטפרוטאומיקה מרחיבה את האנליזה הפרוטאומית לקהילות מיקרוביאליות שלמות, וחוקרת את תכולת החלבונים הקולקטיבית כדי להבין ביטוי פונקציונלי ואינטראקציות בתוך המיקרוביום. סוניקציה משמשת לליז תאים, שחרור החלבונים אשר לאחר מכן מטוהרים ומנותחים באמצעות טכניקות כמו ספקטרומטריית מסות. גישה זו מספקת תובנות מפורטות על תהליכים ביולוגיים פעילים והתאמות של קהילות מיקרוביאליות בסביבות שונות.
נצל את יכולת העיבוד בעלת התפוקה הגבוהה של הסוניקטור UIP400MTP Multi-Well Plate Sonicator והקל על המחקר והניתוח של המיקרוביום שלך!
UIP400MTP סוניקטור בעל תפוקה גבוהה למחקר מיקרוביום בצלחות מרובות בארות, צלחות 96 בארות, צינורות וצלחות פטרי.
תכונות עיקריות של UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator
| סוניקציה בתפוקה גבוהה | UIP400MTP מתאים באופן מושלם ל-96 בארות וללוחות רב-בארים אחרים, ומאפשר סוניקציה זהה בו זמנית של מספר דגימות, מקצר משמעותית את משך הכנת הדגימה ומגדיל את התפוקה של בדיקת מספר דגימה גבוה. |
| השתמש בצלחת Multiwell לבחירתך | ה- UIP400MTP נועד להסוניק כל צלחות מולטיוול סטנדרטיות, צלחות PCR או לוחות מיקרוטייטר. אתה בוחר את הצלחת המתאימה ביותר לניסויים שלך. מכיוון UIP400MTP אינו דורש חומרים מתכלים קנייניים, זה חוסך לך הרבה כסף! |
| אולטרסאונד ללא מגע | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP מפעיל אולטרסאונד אינטנסיבי מבלי להכניס דבר לדגימה. אתה יכול sonicate צלחות multiwell ealed, כלים סגורים בקבוקונים. Hielscher מספקת לך מחזיקי מדגם מותאם אישית עבור כל בקבוקונים או כלים שאינם סטנדרטיים. |
| דיוק ובקרה | בקרה מדויקת ותוכנה חכמה מאפשרת לך להגדיר את הפרמטרים העל-קוליים כך שיתאימו לצרכי העיבוד הספציפיים שלך בצורה אופטימלית. אתה מקבל יעילות סוניקציה מקסימלית ואפקטיביות עבור כל ניסוי. |
| בקרת טמפרטורה | הגדר טמפרטורה ספציפית עבור הסוניקציה שלך. הסוניקטור בעל הצלחת UIP400MTP יכול לנטר את טמפרטורת הדגימה ולהתאים את הסוניקציה בהתאם. נוזל קירור חוזר מצנן כל באר בצלחת לבקרת טמפרטורה מדויקת. |
| פרוטוקולים ושלט רחוק | ניתן לשלוט בכל ריצת סוניקציה ממחשב. אין צורך בהתקנת תוכנה. אתה יכול להשתמש בדפדפן הרגיל שלך (למשל Chrome, Firefox, Edge או Safari) בכל מערכת הפעלה (למשל MacOS, Windows, Android, iOS או Linux) כדי לשלוט ולנטר את UIP400MTP מרחוק. כל ריצת סוניקציה מייצרת פרוטוקול סוניקציה מפורט להערכה ותיעוד. קובץ הפרוטוקול הוא בפורמט CSV שאינו קנייני, שניתן לפתוח עם התוכנית המועדפת עליך, למשל Microsoft Excel, Apple Numbers או OpenOffice Calc. |
| חזק ואמין | UIP400MTP תוכנן ונבנה בגרמניה בתקני האיכות הגבוהים ביותר, והוא לא רק עוצמתי אלא גם עמיד להפליא. העיצוב שלו עומד בסטנדרטים תעשייתיים ועומד בקלות בתלאות השימוש היומיומי בסביבת מעבדה תובענית. באפשרותך להשתמש UIP400MTP ברציפות 24 שעות, 7 ימים בשבוע בפעולות בעלות תפוקה גבוהה. |
- יעילות גבוהה
- טכנולוגיה חדישה
- מהימנות & חוסן
- בקרת תהליך מתכווננת ומדויקת
- תוכנה חכמה
- תכונות חכמות (למשל, ניתנות לתכנות, פרוטוקול נתונים, שלט רחוק)
- קל ובטוח לתפעול
- תחזוקה נמוכה
- CIP (נקי במקום)
תכנון, ייצור וייעוץ – איכות תוצרת גרמניה
Hielscher ultrasonicators ידועים באיכות הגבוהה ביותר שלהם סטנדרטים עיצוב. חוסן ותפעול קל מאפשרים שילוב חלק של האולטרסאונד שלנו במתקנים תעשייתיים. תנאים קשים וסביבות תובעניות מטופלים בקלות על ידי אולטרסוניקטורים Hielscher.
Hielscher Ultrasonics היא חברה מוסמכת ISO לשים דגש מיוחד על ultrasonicators ביצועים גבוהים שמציעות טכנולוגיה חדישה וידידותיות למשתמש. כמובן, Hielscher ultrasonicators הם תואמי CE ולעמוד בדרישות של UL, CSA ו RoHs.
UIP400MTP סוניקטור ללא מגע להכנת דגימת מיקרוביום בצלחות מרובות בארות.
ספרות / מקורות
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
שאלות נפוצות לגבי Microbiome Research
מה סוניקציה עושה לחיידקים?
סוניקציה משבשת תאי חיידקים על ידי שימוש בגלי קול בתדר גבוה, מה שגורם לקוויטציה המייצרת גלי הלם וכוחות מכניים, מה שמוביל לליזה של תאים ולשחרור תוכן תוך תאי.
באילו שיטות משתמשים כדי לחקור מיקרוביום?
שיטות לחקר מיקרוביום כוללות טכניקות ריצוף דנ"א כמו ריצוף גנים 16S rRNA ומטגנומיקה, כמו גם שעתוק, פרוטאומיקה ומטבולומיקה לניתוח פונקציות מיקרוביאליות ואינטראקציות. כלים ביואינפורמטיים משמשים כדי לפרש את הנתונים העצומים שנוצרו.
מהן הטכניקות המשמשות בניתוח מיקרוביום?
טכניקות המשמשות בניתוח מיקרוביום כוללות ריצוף גנים 16S rRNA לפרופיל טקסונומי, ריצוף מטאגנומי לניתוח גנטי מקיף, metatranscriptomics לחקר ביטוי גנים, metaproteomics לניתוח חלבונים, ומטבוליקה לזיהוי תוצרים מטבוליים. כלים ביואינפורמטיים חיוניים לעיבוד נתונים ופענוח.
מהן מטבולומיקה, מטגנומיקה ומטפרוטאומיקה בחקר המיקרוביום?
במחקר מיקרוביום, מטבולומיקה מנתחת את המולקולות הקטנות והמטבוליטים המיוצרים על ידי מיקרובים, ומספקת תובנות לגבי הפעילות המטבולית שלהם. מטאגנומיקה כרוכה בריצוף הגנום הקולקטיבי של קהילות מיקרוביאליות כדי להבין את ההרכב הגנטי שלהן ואת הפוטנציאל התפקודי שלהן. מטפרוטאומיקה חוקרת את כל תכולת החלבונים במיקרוביום, וחושפת את הביטוי הפונקציונלי של גנים ואת התפקידים שחלבונים ממלאים בתוך הקהילה המיקרוביאלית.
מהן מושבות חיידקים בחקר המיקרוביום?
מושבות חיידקים במחקר מיקרוביום הן קבוצות של חיידקים הגדלים מתאים בודדים או בודדים על מצע גידול מוצק, ויוצרים צבירים גלויים. מושבות אלה מייצגות אוכלוסיות שבטים המשמשות לחקר המאפיינים, המגוון והתפקודים של זני חיידקים ספציפיים בתוך קהילה מיקרוביאלית.
Hielscher Ultrasonics מייצרת הומוגנייזרים קוליים בעלי ביצועים גבוהים מ המעבדה ל גודל תעשייתי.



