פרוטוקול למבחן ריכוז מעכב מינימלי (MIC)
מבחן הריכוז המעכב המינימלי (MIC) המבוסס על ביופילם הוא שיטה חיונית להערכת יעילותם של חומרים אנטימיקרוביאליים נגד מיקרואורגניזמים הקשורים לביופילם, המפגינים עמידות מוגברת בשל המטריצה החוץ-תאית המגינה עליהם. שלב מכריע במבחן זה הוא ניתוק מבני הביופילם לשחרור תאים המשוקעים בהם, לצורך הערכה מדויקת של חיות התאים. מכשיר הסוניקציה לצלחות מרובות באריות UIP400MTP מקל על תהליך זה באמצעות שימוש באולטרסאונד ממוקד ליצירת קוויטציה מבוקרת, המנתקת ביעילות תאי ביופילם ומפזרת אותם בתרחיף אחיד. פירוק מדויק והדיר זה של הביופילם משפר את המהימנות ואת התפוקה של מבחני MIC, והופך את UIP400MTP לכלי חיוני לקידום חקר הביופילם.
מדוע כדאי להשתמש בסוניקציה במהלך מבחני MIC?
- נתונים מדויקים והדירים: קבלו תרחיפי תאים אחידים המבטלים את ההגנה שמספקת המטריצה, וכך מבטיחים שספירות המושבות וקריאות הצפיפות האופטית שלכם ישקפו נאמנה את היעילות האנטימיקרוביאלית.
- יעילות בתפוקה גבוהה: עבדו צלחת שלמה בת 96 באריות בו-זמנית בתוך 1–3 דקות בלבד, והחליפו גירוד ידני איטי ולא עקבי בתהליך עבודה יעיל.
- שמירה על חיות התאים: נתקו בעדינות תאים המשוקעים בביופילם ללא הנזק הפיזי הנגרם מגירוד, תוך שמירה על שיעורי הישרדות גבוהים יותר לצורך חישובי MIC/MBEC מהימנים.
- אפס סיכון לזיהום צולב: הפיקו תועלת מתכנון ללא מגע המבוסס על קרן אולטרסונית בצורת כוס, המטפל בכל הבאריות באופן אחיד ללא מגע של גשושיות בדגימות או בבאריות בודדות.
- התאמה לדרישות תקנים: התאימו את המתודולוגיה שלכם לפרוטוקולים מתוקפים הנהוגים בתעשייה, כגון ASTM E2799-22, והקנו לנתונים שלכם אמינות רבה יותר לצורכי רגולציה או פרסום.
- סקר תרופות וטיפולים בביטחון: הסתמכו על תוצאות הרגישות שלכם כדי לקבל החלטות מושכלות יותר בנוגע ליעילות אנטימיקרוביאלית, לאפיון פרופיל עמידות או לפיתוח טיפולים.
הגדילו את תפוקת המעבדה שלכם תוך שמירה על חיות התאים. ספרו לנו באיזה סוג מיקרופלטה אתם משתמשים וקבלו המלצות לניתוק יעיל של ביופילם ולפיזור תאים באמצעות סוניקציה בתפוקה גבוהה.
מכשיר הסוניקציה למיקרופלטות UIP400MTP לניתוק ביופילם הניתן לבקרה מדויקת במבחני MIC ו-MBEC.
סוניקציה לניתוק ביופילם
מבחן MIC המבוסס על ביופילם מודד בדרך כלל חיות חיידקים או עיכוב גדילה באמצעות שיטות כגון זריעה על צלחות, ספירת מושבות או מדידות צפיפות אופטית. סוניקציה היא שלב מכריע במבחני MIC המבוססים על ביופילם בעת הערכת הרגישות של מיקרואורגניזמים הקשורים לביופילם לחומרים אנטימיקרוביאליים. תפקידה העיקרי הוא לנתק תאים המשוקעים במטריצת הביופילם ולפזר אותם בתרחיף אחיד לצורך אנליזה מדויקת.
ביופילמים עמידים במידה ניכרת יותר לחומרים אנטימיקרוביאליים בהשוואה לתאים פלנקטוניים, ולכן ניתוק נאות חיוני לאנליזה מדויקת. במהלך תהליך זה, גלים אולטרסוניים יוצרים קוויטציה מבוקרת, המפרקת את מטריצת הביופילם ומשחררת תאים המשוקעים בה לתרחיף אחיד בתוך מצע ההתאוששות. שלב זה מאפשר הערכות מדויקות של חיות התאים שפוזרו מתוך הביופילם באמצעות שיטות כגון זריעה על צלחות, מיהול וספירת מושבות. פירוק נאות של ביופילם באמצעות סוניקציה מונע משאריות רכיבי המטריצה להגן על התאים, הגנה שעלולה אחרת להוביל להערכת חסר של הפעילות האנטימיקרוביאלית. מכשיר הסוניקציה לצלחות מרובות באריות UIP400MTP מתאים במיוחד למטרה זו, ומציע תנאי סוניקציה מדויקים והדירים כדי להבטיח הכנה מהימנה ובתפוקה גבוהה של צלחות מבחן.
מדוע סוניקציה נחוצה במבחני ריכוז מעכב מינימלי המבוססים על ביופילם
למדידות חיות ולספירת תאים נדרשים ניתוק ופיזור מלאים ומהימנים של תאים בודדים. UIP400MTP מסייע לניתוק אחיד של ביופילם ולפיזור אחיד של תאים ללא פגיעה בהם, לקבלת תוצאות מבחן אמינות.
- מורכבות הביופילם: ביופילמים הם קהילות מיקרוביאליות מאורגנות העטופות במטריצה של חומר פולימרי חוץ-תאי (EPS), המגינה על המיקרואורגניזמים ומגבירה את עמידותם לחומרים אנטימיקרוביאליים.
- פיזור אחיד: כדי למדוד במדויק את חיותם של תאים המשוקעים בביופילם או את רגישותם לחומרים אנטימיקרוביאליים, יש תחילה לנתק את הביופילם ולפרקו לתרחיף הומוגני.
בעוד שבדיקת MIC רגילה מודדת עמידות של תאים פלנקטוניים, סוניקציה חיונית לבדיקות Biofilm-MIC ו-MBEC כדי להבטיח שחזור של אוכלוסיית התאים המתאימה כבסיס לבדיקה.
פרוטוקול לבדיקת ריכוז מעכב מזערי המבוססת על ביופילם
בדיקת הריכוז המעכב המזערי (MIC) קובעת את הריכוז הנמוך ביותר של חומר אנטימיקרוביאלי הנדרש לעיכוב צמיחה נראית לעין של מיקרואורגניזמים. פרוטוקול זה מיועד למיקרואורגניזמים הקשורים לביופילם, תוך שימוש במכשיר הסוניקציה לצלחות מרובות באריות UIP400MTP לפירוק הביופילם.
שלב 1: הכנת מזרע החיידקים
- הכינו את תרחיף החיידקים:
גדלו חיידקים במצעי גידול מתאימים עד לאמצע שלב הגידול הלוגריתמי.
דללו את התרבית להשגת צפיפות תאים מתוקננת (למשל, תקן 0.5 McFarland או OD600 ~0.1). - הכינו תמיסות אנטימיקרוביאליות:
דללו את החומר האנטימיקרוביאלי במצע מתאים ליצירת טווח ריכוזים (למשל, דילולים סדרתיים פי שניים). - חלקו לצלחת בעלת 96 באריות:
הוסיפו את התמיסות האנטימיקרוביאליות לבאריות של צלחת סטנדרטית בעלת 96 באריות, לנפח סופי של ~150–200 µL בכל בארית.
כללו בקרות צמיחה (ללא חומר אנטימיקרוביאלי) ובקרות סטריליות (ללא מזרע חיידקים).
שלב 2: היווצרות ביופילם על מכסה עם פינים
- חברו את המכסה עם הפינים:
הניחו את המכסה הייעודי עם הפינים על הבאריות שנזרעו, תוך הקפדה שהפינים יהיו שקועים במלואם בתרחיף החיידקים. - הדגירו את הצלחת:
הדגירו בטמפרטורה המתאימה (למשל, 37°C) למשך זמן מוגדר (למשל, 24 שעות) בתנאים סטטיים כדי לאפשר היווצרות ביופילם על הפינים. - שטפו את הפינים:
הסירו את המכסה עם הפינים מתרחיף החיידקים ושטפו בעדינות בתמיסת מלח סטרילית או ב-PBS להסרת תאים פלנקטוניים המחוברים באופן רופף. - חשפו לחומרים אנטימיקרוביאליים:
העבירו את המכסה עם הפינים לצלחת חדשה בעלת 96 באריות המכילה את הדילולים האנטימיקרוביאליים שהוכנו קודם לכן.
הדגירו למשך פרק זמן מוגדר (למשל, 24 שעות) בתנאים סטטיים כדי לאפשר לחומר האנטימיקרוביאלי לפעול על הביופילמים.
שלב 3: חשיפה לחומרים אנטימיקרוביאליים
מכשיר הסוניקציה לצלחות מרובות באריות UIP400MTP להכנת דגימות בתפוקה גבוהה
שלב 4: סוניקציה באמצעות מכשיר הסוניקציה למיקרופלטות UIP400MTP
שלב הסוניקציה חיוני לניתוק ביופילמים מהמכסים עם הפינים לצורך הערכת חיות. בצעו את השלבים הבאים עבור מכשיר הסוניקציה UIP400MTP:
- הכינו את המערך:
מלאו כל בארית בצלחת חדשה בעלת 96 באריות במצע התאוששות (למשל, מרק מנטרל או מצע גידול סטרילי). - העבירו את המכסה עם הפינים:
הסירו את המכסה עם הפינים מצלחת הטיפול האנטימיקרוביאלי.
שטפו את המכסה עם הפינים בתמיסת מלח סטרילית או ב-PBS להסרת שאריות של חומרים אנטימיקרוביאליים. - מקמו את הצלחת במכשיר הסוניקציה:
חברו את המכסה עם הפינים לצלחת המכילה את מצע ההתאוששות.
הניחו את הצלחת המכילה את מצע ההתאוששות במכשיר הסוניקציה UIP400MTP, תוך הקפדה שהצלחת תהיה ממורכזת ויציבה כמתואר במדריך. - כוונו את פרמטרי הסוניקציה:
הגדירו את פרמטרי הסוניקציה ב-UIP400MTP (ניתן להתאים את ההגדרות לביופילם):
משרעת: 70–100%.
משך הסוניקציה: 1–3 דקות (התאימו לפי מבנה הביופילם) במצב מחזורי. - בצעו סוניקציה:
התחילו את תהליך הסוניקציה. הגלים האולטרסוניים יפרקו את מטריצת הביופילם וינתקו את התאים אל מצע ההתאוששות. - נטרו את התהליך:
השתמשו בחיישן הטמפרטורה הניתן לחיבור כדי לנטר את טמפרטורת הדגימות בבאריות. ניתן לחבר את UIP400MTP לצ'ילר מעבדתי לצורך קירור. - טיפול לאחר הסוניקציה:
העבירו מיד את מצע ההתאוששות המכיל את הביופילמים שנותקו לצלחת סטרילית חדשה לצורך ניתוח בהמשך.
(A) צלחת המכילה TSB עם 2% גלוקוז, המשמשת ליצירת ביופילם, להשבת תאים ולקביעת MIC ו-MBEC; (B) מכסה עם פינים ליצירת ביופילמים של סטפילוקוקים.
תאי הביופילם שנוצרו על הפינים נותקו באמצעות סוניקציה (Hielscher Ultrasound Technology) במשך 5 min בצלחות בעלות 96 באריות המכילות מצע תרבית טרי להשבת התאים.
(תמונה ומחקר: ©de Oliveira et al., 2016)
שלב 4: הערכת חיות
זרעו וגדלו בתרבית את הביופילמים שנותקו:
- בצעו מיהולים סדרתיים של מצע ההשבה וזרעו על אגר לספירת יחידות יוצרות מושבה (CFU).
- העריכו את ה-MIC:
קבעו את ה-MIC כריכוז הנמוך ביותר של החומר האנטימיקרוביאלי המעכב לחלוטין צמיחה מיקרוביאלית נראית לעין במצע ההשבה.
עברו לסוניקציה מדויקת ללא מגע כדי להבטיח תרחיף תאים אחיד ותוצאות MIC מהימנות!
מי מפיק תועלת מסוניקציה במהלך בדיקות MIC?
- יצרני מכשור רפואי: לבדיקת יעילותם של ציפויי משטחים ולתיקוף פרוטוקולי ניקוי למכשירים המועדים להיווצרות ביופילם.
- מיקרוביולוגים קליניים: לאבחון מדויק של זיהומים הקשורים לשתלים (כגון PJI) באמצעות השבת חיידקים מרכיבי מכשור רפואי.
- מפתחי תרופות: להערכת יעילותם של חומרים אנטימיקרוביאליים חדשים נגד פתוגנים עמידים המשובצים בביופילם.
- חוקרים באקדמיה: לעריכת מחקרים בתפוקה גבוהה ובעלי הדירות על הביולוגיה של ביופילמים ועל מנגנוני עמידות לחומרים אנטימיקרוביאליים.
- צוותי בקרת איכות בתעשייה: להערכת הצטברות ביולוגית ויעילותם של חומרי חיטוי בסביבות תעשייתיות (למשל, באמצעות תקני ASTM E2799-22).
תכנון, ייצור וייעוץ – איכות תוצרת גרמניה
המכשירים האולטרסוניים של Hielscher מוכרים בזכות תקני האיכות והתכנון הגבוהים ביותר שלהם. עמידות וקלות תפעול מאפשרות שילוב חלק של המכשירים האולטרסוניים שלנו במתקנים תעשייתיים. מכשירי הסוניקציה של Hielscher מתמודדים בקלות עם תנאים קשים וסביבות תובעניות.
Hielscher Ultrasonics היא חברה מוסמכת ISO ושמה דגש מיוחד על מכשירים אולטרסוניים בעלי ביצועים גבוהים, המשלבים טכנולוגיה מהמתקדמות ביותר וידידותיות למשתמש. כמובן, המכשירים האולטרסוניים של Hielscher תואמים לדרישות CE ועומדים בדרישות UL, CSA ו-RoHs.
ייעלו את הכנת הדגימות בצלחות בעלות 96 באריות ובצלחות בדיקה באמצעות מכשיר הסוניקציה לצלחות מרובות באריות UIP400MTP
ספרות / מקורות
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
שאלות נפוצות
מהי בדיקת MIC?
בדיקת הריכוז המעכב המזערי (MIC) היא בדיקה תקנית המשמשת לקביעת הריכוז הנמוך ביותר של חומר אנטימיקרוביאלי הנדרש לעיכוב צמיחה נראית לעין של מיקרואורגניזם. היא מבוצעת בדרך כלל בשיטות מיקרודילול במצע נוזלי או דילול באגר, שבהן מיקרואורגניזמים נחשפים למיהולים סדרתיים של החומר האנטימיקרוביאלי. בדיקות MIC חיוניות להערכת יעילות אנטימיקרוביאלית, להכוונת הטיפול הקליני ולהערכת רמות העמידות הן במיקרואורגניזמים פלנקטוניים והן במיקרואורגניזמים הקשורים לביופילם.
מה ההבדל בין בדיקת הריכוז המעכב המזערי המבוססת על ביופילם לבין בדיקת MBIC?
בדיקת הריכוז המעכב המינימלי (MIC) המבוססת על ביופילם ובדיקת הריכוז המינימלי המעכב ביופילם (MBIC) קשורות זו לזו, אך שונות במטרתן ובשיטתן.
בדיקת MIC המבוססת על ביופילם מעריכה את הריכוז הנמוך ביותר של חומר אנטימיקרוביאלי הנדרש לעיכוב צמיחה נראית לעין של ביופילם או חיותו, ומתמקדת בתאים הקשורים לביופילם ולא בחיידקים פלנקטוניים. לעומת זאת, בדיקת MBIC מודדת באופן ספציפי את יכולתו של חומר אנטימיקרוביאלי למנוע היווצרות ביופילם, ולא לטפל בביופילמים שכבר נוצרו. אף ששתי הבדיקות עוסקות בחיידקים הקשורים לביופילם, בדיקת MIC המבוססת על ביופילם מתייחסת לטיפול, ואילו בדיקת MBIC מדגישה מניעה, ולכן הן כלים משלימים לחקר היעילות האנטימיקרוביאלית נגד ביופילמים.
באילו ביופילמים משתמשים בבדיקות MIC?
ביופילמים מיקרוביאליים ותאים פלנקטוניים משמשים שניהם בבדיקות הריכוז המעכב המינימלי (MIC) לחקר היעילות האנטימיקרוביאלית בתנאים שונים.
- תאים פלנקטוניים:
תאים פלנקטוניים הם תאים מיקרוביאליים יחידים הצפים בחופשיות ומשמשים כמודל המקובל לבדיקות MIC מסורתיות. מיקרואורגניזמים נפוצים כוללים את Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus ו-Candida albicans. בדיקות אלה קובעות את ה-MIC הנדרש לעיכוב צמיחתם של תאים החיים בחופשיות, והן חיוניות לסינון אנטימיקרוביאלי ראשוני. - תאים הקשורים לביופילם:
תאי ביופילם הם מיקרואורגניזמים המשובצים במטריצה חוץ-תאית, המגבירה במידה ניכרת את עמידותם לחומרים אנטימיקרוביאליים. בדיקות MIC של ביופילמים כוללות לעיתים קרובות:- חיידקים גראם-שליליים: Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa ו-Klebsiella pneumoniae, הידועים ביצירת ביופילמים בזיהומים ובסביבות תעשייתיות.
- חיידקים גראם-חיוביים: Staphylococcus aureus (כולל MRSA), Staphylococcus epidermidis ו-Enterococcus faecalis, המעורבים בדרך כלל בזיהומים הקשורים לאביזרים רפואיים.
- פטריות: Candida albicans ומינים קרובים, בעלי חשיבות בזיהומים פטרייתיים הקשורים לביופילם.
- ביופילמים של תערובת מינים: אלה משמשים לעיתים לשחזור ביופילמים טבעיים מרובי מינים של מיקרואורגניזמים, כגון אלה המצויים בפצעים כרוניים או באילוח ביולוגי במערכות תעשייתיות.
באמצעות השוואת ערכי MIC של תאים פלנקטוניים ושל תאים הקשורים לביופילם, חוקרים יכולים להעריך את העמידות המוגברת של ביופילמים ולזהות חומרים היעילים נגד קהילות מיקרוביאליות עמידות יותר אלה.
מה ההבדל בין MIC ל-MBEC?
הריכוז המעכב המינימלי (MIC) הוא הריכוז הנמוך ביותר של חומר אנטימיקרוביאלי הנדרש למניעת היווצרות ביופילם, ואילו הריכוז המינימלי להכחדת ביופילם (MBEC) הוא הריכוז הנמוך ביותר הנדרש להכחדת ביופילם שכבר התבסס. MIC מתמקד במניעת ביופילם, ואילו MBEC מעריך את יעילות הטיפול נגד ביופילמים בשלים.
באילו פלטות משתמשים בדרך כלל בבדיקות MBEC?
פלטות מיקרוטיטר המשמשות בדרך כלל לבדיקות MBEC הן לרוב פלטות בעלות 96 באריות העשויות מפוליסטירן או מפוליפרופילן. חומרים אלה מספקים משטח מתאים להיווצרות ביופילם ועמידים מבחינה כימית לחומרים האנטימיקרוביאליים הנבדקים במהלך הבדיקה. פלטות פוליסטירן מועדפות באופן נרחב בשל שקיפותן האופטית, המהווה יתרון בניתוחים בהמשך התהליך, כגון מדידות ספקטרופוטומטריות או מדידות המבוססות על פלואורסצנציה. מבנה הפלטות כולל מכסים נשלפים עם פינים, החיוניים לבדיקה מכיוון שהביופילמים נוצרים על הפינים הטבולים בבאריות המכילות מצעי גידול. פלטות תקניות, כגון אלה התואמות לפרוטוקול בדיקת MBEC, מתוכננות במיוחד להבטחת הדירות ותאימות לסוניקטור UIP400MTP או לציוד עיבוד אחר.
מהן פלטות עם מכסה PEG?
צלחות עם מכסה PEG הן מערכות ייעודיות של צלחות מרובות באריות, שבהן המכסה מצויד ביתדות או בפינים קטנים העשויים מפוליאתילן גליקול (PEG) ונמשכים לתוך כל בארית. יתדות אלו מספקות משטח להיווצרות ביופילם מיקרוביאלי בתנאים מבוקרים, תוך הדמיית צמיחת ביופילם בתנאי העולם האמיתי. התכנון מאפשר לביופילמים להתפתח על היתדות בזמן שהבאריות מכילות מצעי גידול או חומרים אנטימיקרוביאליים, וכך מאפשר בדיקה בתפוקה גבוהה של רגישות ביופילמים לטיפולים, כגון במבחני MBEC, MBIC ו-MIC.
מהו היתרון של ניתוק ביופילם באמצעות אולטרסאונד בהשוואה לגירוד תאים?
ניתוק ביופילם באמצעות אולטרסאונד מציע יתרון משמעותי על פני גירוד תאים, בכך שהוא מספק שיטה לא פולשנית, אחידה ויעילה ביותר להסרת ביופילמים ממשטחים. בניגוד לגירוד, שעלול להיות לא אחיד ולפגוע במשטח שמתחת לביופילם או בתאים, גלים אולטרסוניים חודרים למטריצת הביופילם ומפרקים אותה מבלי לפגוע בשלמותם של מבנים סמוכים. שיטה זו מבטיחה הדירות, ממזערת את הסיכון לזיהום ויעילה במיוחד ביישומים הדורשים הסרה מדויקת של ביופילם, כגון מחקרים מיקרוביולוגיים או בדיקות של מכשור רפואי. קראו עוד על האופן שבו מכשיר הסוניקציה UIP400MTP עולה על גירוד תאים!

