פרוטוקול בדיקת MBEC באמצעות מכשיר הסוניקציה לפלטות של 96 באריות UIP400MTP
בדיקת MBEC משמשת לקביעת ריכוז החומרים האנטימיקרוביאליים הדרוש לסילוק ביופילמים שנוצרו על מכסים בעלי פינים. כדי להעריך את חיות הביופילמים, יש לנתק אותם תחילה מהמכסים בעלי הפינים של פלטה בת 96 באריות. סוניקציה היא השיטה האמינה והיעילה ביותר לניתוק זה. מכשיר הסוניקציה לפלטות מרובות באריות UIP400MTP תוכנן במיוחד לעיבוד פלטות בדיקה ביעילות ובנוחות מרביות, תוך ייעול והאצה של בדיקות MBEC בתפוקה גבוהה.
סוניקציה לניתוק ביופילמים
סוניקציה היא שלב חיוני בבדיקות הריכוז המזערי להכחדת ביופילם (MBEC), המאפשר ניתוק יעיל של תאי הביופילם מהמשטח שאליו הם צמודים. ביופילמים הם מטבעם קהילות מאורגנות של מיקרואורגניזמים העטופות במטריצה חוץ־תאית, המקנה להם עמידות גבוהה משמעותית לחומרים אנטימיקרוביאליים בהשוואה לתאים פלנקטוניים. במהלך בדיקות MBEC, הסוניקציה משתמשת בגלים אולטרסוניים ליצירת קוויטציה מבוקרת, המפרקת את מטריצת הביופילם ומשחררת את התאים המשוקעים בה לתרחיף. שלב זה מבטיח פיזור אחיד של תאי הביופילם במצע ההתאוששות, ומאפשר הערכות מדויקות של חיות התאים באמצעות זריעה על מצע, מיהול או שיטות ספקטרופוטומטריות. ללא ניתוק נאות של הביופילם, רכיבים שיוריים של המטריצה עלולים להגן על התאים ולהוביל להערכת חסר של היעילות האנטימיקרוביאלית. לכן, סוניקציה חיונית לקבלת ערכי MBEC אמינים והדירים, המשקפים את פוטנציאל ההכחדה האמיתי של החומרים הנבדקים. מכשיר הסוניקציה לפלטות מרובות באריות UIP400MTP מאפשר הכנת דגימות בקלות ובתפוקה גבוהה בפלטות בדיקה.
מכשיר הסוניקציה לפלטות מרובות באריות UIP400MTP מקל על הכנת דגימות בתפוקה גבוהה בפלטות בדיקה.
פרוטוקול בדיקת הריכוז המזערי להכחדת ביופילם (MBEC)
שלב 1: יצירת ביופילם
- הכינו את תרחיף החיידקים:
גדלו חיידקים במצעי גידול מתאימים עד לשלב הגידול הלוגריתמי.
מהלו את תרבית החיידקים לצפיפות אופטית מוגדרת (למשל, OD600 ~0.1). - זרעו את הפלטה בת 96 הבאריות:
הוסיפו את תרחיף החיידקים (למשל, 150–200 µL) לכל בארית בפלטת מיקרוטיטר תקנית בת 96 באריות. - חברו את המכסה בעל הפינים:
הניחו את המכסה בעל הפינים על הפלטה שנזרעה כדי לאפשר יצירת ביופילם על פני הפינים. - הדגירו את הפלטה:
הדגירו את המערכת בטמפרטורה מתאימה (למשל, 37°C) למשך 24–48 שעות ללא טלטול כדי לעודד את צמיחת הביופילם.
שלב 2: טיפול בחומרים אנטימיקרוביאליים
- הכינו תמיסות אנטימיקרוביאליות:
הכינו סדרת ריכוזים של חומרים אנטימיקרוביאליים במצעי גידול טריים.
חשפו את הביופילמים לחומרים האנטימיקרוביאליים:
הסירו את המכסה בעל הפינים מתרבית החיידקים ושטפו אותו בתמיסת מלח סטרילית או ב־PBS כדי להסיר תאים פלנקטוניים.
הניחו את המכסה בעל הפינים בפלטה חדשה בת 96 באריות המכילה את התמיסות האנטימיקרוביאליות. - הדגירו את הפלטה:
הדגירו למשך פרק זמן מוגדר (למשל, 24 שעות) כדי לאפשר חשיפה לחומרים האנטימיקרוביאליים.
מכשיר הסוניקציה לפלטות מרובות באריות UIP400MTP להכנת דגימות בתפוקה גבוהה
שלב 3: סוניקציה באמצעות מכשיר הסוניקציה לפלטות של 96 באריות UIP400MTP
שלב הסוניקציה קריטי לניתוק הביופילמים מהמכסים בעלי הפינים לצורך הערכת חיותם. בצעו את השלבים הבאים עבור מכשיר הסוניקציה UIP400MTP:
- הכינו את המערכת:
מלאו כל בארית בפלטה חדשה בת 96 באריות במצע התאוששות (למשל, מרק מנטרל או מצע גידול טרי). - העבירו את המכסה בעל הפינים:
הסירו את המכסה בעל הפינים מפלטת הטיפול האנטימיקרוביאלי.
שטפו את המכסה בעל הפינים בתמיסת מלח סטרילית או ב־PBS כדי להסיר שאריות של חומרים אנטימיקרוביאליים. - מקמו את הפלטה ואת מכשיר הסוניקציה:
חברו את המכסה בעל הפינים לפלטה המכילה את מצע ההתאוששות.
הניחו את פלטת מצע ההתאוששות על משטח מכשיר הסוניקציה UIP400MTP, וודאו שהפלטה ממורכזת ויציבה. - התאימו את פרמטרי הסוניקציה:
הגדירו את פרמטרי הסוניקציה ב־UIP400MTP (ניתן להתאים את ההגדרות לביופילם):
משרעת: 70–100%.
משך הסוניקציה: 1–3 דקות (התאימו בהתאם לעמידות הביופילם) במצב מחזורי. - בצעו סוניקציה:
התחילו את תהליך הסוניקציה. התנודות האולטרסוניות ינתקו את הביופילמים מפני הפינים אל מצע ההתאוששות. - נטרו את התהליך:
השתמשו בחיישן הטמפרטורה הניתן לחיבור כדי לנטר את טמפרטורת הדגימות בבאריות. ניתן לחבר את UIP400MTP לצ'ילר מעבדתי לצורך קירור. - טיפול לאחר הסוניקציה:
העבירו מיד את מצע ההתאוששות (המכיל כעת ביופילמים שנותקו) לפלטה סטרילית חדשה לצורך אנליזות המשך.
(A) פלטה המכילה TSB עם 2% גלוקוז, ששימשה ליצירת ביופילם, להתאוששות התאים ולצורך
קביעת MIC ו־MBCB; (B) מכסה בעל פינים ליצירת ביופילמים של סטפילוקוקים. קביעת MIC ו־MBCB; (B) מכסה בעל פינים ליצירת ביופילמים של סטפילוקוקים.
תאי הביופילם שנוצרו על הפינים נותקו באמצעות סוניקציה (Hielscher Ultrasound Technology) למשך 5 min בפלטות של 96 באריות המכילות מצע תרבית טרי להתאוששות התאים.
(תמונה ומחקר: ©de Oliveira et al., 2016)
שלב 4: הערכת חיות
זרעו וגדלו את הביופילמים שנותקו:
- בצעו מיהולים סדרתיים של מצע ההתאוששות וזרעו על אגר כדי לספור יחידות יוצרות מושבה (CFU).
לחלופין, השתמשו בבדיקת חיות קולורימטרית או מבוססת פלואורסצנציה. - תעדו את התוצאות:
קבעו את ערך ה־MBEC כריכוז הנמוך ביותר של החומר האנטימיקרוביאלי שהכחיד את חיות הביופילם הניתנת לזיהוי.
תכנון, ייצור וייעוץ – איכות תוצרת גרמניה
מכשירי האולטרסאונד של Hielscher ידועים בסטנדרטים הגבוהים ביותר של איכות ותכנון. עמידות וקלות תפעול מאפשרות שילוב חלק של מכשירי האולטרסאונד שלנו במתקנים תעשייתיים. מכשירי הסוניקציה של Hielscher מתמודדים בקלות עם תנאים קשים וסביבות תובעניות.
Hielscher Ultrasonics היא חברה בעלת הסמכת ISO, והיא שמה דגש מיוחד על מכשירי אולטרסאונד בעלי ביצועים גבוהים, המשלבים טכנולוגיה מתקדמת ביותר וידידותיות למשתמש. כמובן, מכשירי האולטרסאונד של Hielscher תואמים לדרישות CE ועומדים בדרישות UL, CSA ו־RoHs.
ייעלו את הכנת הדגימות בפלטות של 96 באריות ובפלטות בדיקה באמצעות מכשיר הסוניקציה לפלטות מרובות באריות UIP400MTP
ספרות / מקורות
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
שאלות נפוצות
מהי בדיקת MBEC?
בדיקת הריכוז המזערי להכחדת ביופילם (MBEC) היא שיטה מתוקננת המשמשת לקביעת הריכוז הנמוך ביותר של חומר אנטימיקרוביאלי הדרוש להכחדת חיידקים הקשורים לביופילם. היא כוללת גידול ביופילמים על משטחים ייעודיים, חשיפתם לריכוזים שונים של חומרים אנטימיקרוביאליים והערכת חיותם של התאים שנותקו לאחר פירוק הביופילם, בדרך כלל באמצעות סוניקציה, כדי להעריך את יעילות הטיפול.
מה ההבדל בין MBIC ל־MBEC?
הריכוז המזערי לעיכוב ביופילם (MBIC) הוא הריכוז הנמוך ביותר של חומר אנטימיקרוביאלי הדרוש למניעת יצירת ביופילם, ואילו הריכוז המזערי להכחדת ביופילם (MBEC) הוא הריכוז הנמוך ביותר הדרוש להכחדת ביופילם מבוסס. MBIC מתמקד במניעת ביופילם, ואילו MBEC מעריך את יעילות הטיפול נגד ביופילמים בשלים.
באילו פלטות משתמשים בדרך כלל לבדיקות MBEC?
פלטות המיקרוטיטר המשמשות בדרך כלל לבדיקות MBEC הן לרוב פלטות של 96 באריות העשויות מפוליסטירן או מפוליפרופילן. חומרים אלה מספקים משטח מתאים ליצירת ביופילם ועמידים מבחינה כימית לחומרים האנטימיקרוביאליים הנבדקים במהלך הבדיקה. פלטות פוליסטירן מועדפות באופן נרחב בזכות שקיפותן האופטית, המועילה לאנליזות המשך כגון מדידות ספקטרופוטומטריות או מבוססות פלואורסצנציה. מבנה הפלטות הללו כולל מכסים נשלפים בעלי פינים, החיוניים לבדיקה משום שהביופילמים נוצרים על הפינים הטבולים בבאריות המכילות מצעי גידול. פלטות מתוקננות, כגון אלה התואמות לפרוטוקול בדיקת MBEC, מתוכננות במיוחד להבטחת הדירות ותאימות למכשיר הסוניקציה UIP400MTP או לציוד עיבוד אחר.
מהן פלטות בעלות מכסה PEG?
פלטות בעלות מכסה PEG הן מערכות ייעודיות של פלטות מרובות באריות, שבהן המכסה מצויד בפינים או ביתדות קטנים מפוליאתילן גליקול (PEG), הבולטים לתוך כל בארית. פינים אלה מספקים משטח ליצירת ביופילם מיקרוביאלי בתנאים מבוקרים, המדמים צמיחת ביופילם בתנאי העולם האמיתי. המבנה מאפשר לביופילמים להתפתח על הפינים בזמן שהבאריות מכילות מצעי גידול או חומרים אנטימיקרוביאליים, וכך מאפשר בדיקה בתפוקה גבוהה של רגישות הביופילם לטיפולים, כגון בבדיקות MBEC ו־MBIC.
Hielscher Ultrasonics מייצרת הומוגנייזרים אולטרסוניים בעלי ביצועים גבוהים החל בקנה מידה מעבדתי ועד לקנה מידה תעשייתי.