Секвениране на РНК с UIP400MTP Sonicator с висока производителност
Увеличаване на силата на експериментите с NGS
Едно от значителните предимства на използването на UIP400MTP на Hielscher в експериментите с NGS е рентабилната способност за увеличаване на броя на повторенията, като по този начин се увеличава статистическата мощ. Повече реплики водят до по-стабилни и значими резултати. Броят на наблюдаваните диференциално експресирани гени се увеличава пропорционално на броя на четенията на реплика. Това увеличение на точките от данни води до по-точни и смислени биологични прозрения.
Използването на UIP400MTP соникатора, увеличавайки броя на репликациите, не надуваше разходите, свързани с NGS.
Секвениране на РНК с помощта на Hielscher UIP400MTP Sonicator
Разходите за труд в експериментите с NGS остават постоянни, независимо от размера на партидата, която се обработва. Независимо дали работите с малки или големи партиди проби, трудът остава относително постоянен. Тази последователност е от решаващо значение за лабораториите с висока производителност, които се стремят да увеличат максимално продукцията. Чрез оптимизиране на работните процеси и използване на автоматизация, тези лаборатории могат да обработват по-големи обеми проби, без да правят допълнителни разходи за труд, като по този начин повишават ефективността и производителността.
С увеличен брой повторения въздействието на неуспешна проба е значително сведено до минимум. При традиционните настройки неуспешната проба може да има значителен ефект върху общите резултати, потенциално изисквайки допълнителни серии и увеличени разходи. Въпреки това, като има повече повторения, дефектните проби могат да бъдат изключени от анализа, без да се повлияе значително на общия резултат. Тази излишност намалява потенциалните отпадъци и свързаните с тях разходи, което прави изследователския процес по-рентабилен и надежден.
Използване на автоматизация и миниатюризация за намаляване на разходите за подготовка на библиотеката
Hielscher UIP400MTP се интегрира безпроблемно със системите за автоматизация, като значително намалява разходите за подготовка на библиотеката. Автоматизираните роботи за работа с течности са способни на прецизно пипетиране с малък обем, което предлага няколко предимства. Прецизното пипетиране минимизира необходимото количество реагенти. Това е особено полезно, когато става въпрос за скъпи или ограничени ресурси, което позволява на изследователите да провеждат повече експерименти в рамките на същия бюджет. Автоматизацията осигурява последователно боравене с проби, подобрявайки възпроизводимостта на резултатите. Последователното пипетиране намалява променливостта, което е жизненоважно за високопроизводителното секвениране, където дори малки несъответствия могат да доведат до значителни грешки. Автоматизацията ускорява процеса на подготовка на библиотеката, позволявайки на изследователите да се съсредоточат върху анализа и интерпретацията на данни, а не върху ръчното пипетиране. Тази повишена ефективност не само спестява време, но също така позволява по-висока производителност и по-бързо получаване на резултатите.
Hielscher UIP400MTP Sonication: Усъвършенствана ултразвукова диагностика за фрагментация на РНК
В основата на ефективността на UIP400MTP е използването на интензивна контролирана ултразвукова кавитация за фрагментация на РНК. Този метод се откроява със своята ефективност и надеждност в сравнение с традиционните техники за фрагментиране.
Високопроизводително РНК-секвениране в многоямкови плочи
Предимства на ултразвуковата кавитация
За разлика от ензимните или топлинните методи за фрагментация, които често изискват обширна оптимизация, ултразвуковата кавитация с UIP400MTP дава последователни и възпроизводими резултати в различни проби и условия. Тази надеждност е от решаващо значение за гарантиране на качеството и целостта на РНК пробите.
Ултразвуковата кавитация гарантира, че РНК е фрагментирана равномерно, което е от съществено значение за висококачествената подготовка на библиотеката. Равномерната фрагментация води до по-точни данни за секвениране, което позволява по-добро откриване на диференциално експресирани гени и други геномни характеристики.
UIP400MTP е проектиран да обработва няколко проби в пластини с няколко ямки едновременно, което го прави идеален за приложения с висока производителност. Тази мащабируемост позволява на лабораториите да обработват ефективно голям брой проби, спестявайки време и ресурси.
Приложение в клинични и изследователски условия
Интегрирането на UIP400MTP на Hielscher в работните потоци на NGS има значителни последици както за клиничните, така и за изследователските условия. В клиничната геномика UIP400MTP гарантира, че секвенирането на РНК се извършва с най-високите стандарти за прецизност и надеждност. Това води до по-добри диагностични резултати и по-персонализирани планове за лечение на пациентите.
В изследователска среда способността на UIP400MTP да се справя с високопроизводително секвениране позволява по-обширни и подробни изследвания. Изследователите могат да изследват сложни биологични въпроси с по-голяма увереност, знаейки, че техните РНК проби се обработват с най-съвременна ултразвукова технология.
Улеснете вашата РНК-секвайзер с UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator
Многоямковият пластинчатият ултразвукораздвижител Hielscher UIP400MTP е основен инструмент в областта на секвенирането на РНК. Чрез увеличаване на мощността на експериментите с NGS чрез повече реплики и използване на автоматизация за намаляване на разходите, UIP400MTP адресира някои от ключовите предизвикателства при секвенирането с висока производителност. Неговата усъвършенствана ултразвукова технология осигурява здрава, възпроизводима и равномерна фрагментация на РНК, което го прави незаменим актив както за клинични, така и за изследователски приложения.
Инвестирането в UIP400MTP на Hielscher означава инвестиране в бъдещето на геномиката, където висококачественото, надеждно и ефективно секвениране на РНК е от решаващо значение за напредъка на нашето разбиране за биологията и подобряване на резултатите от здравеопазването.
Ние от Hielscher ще се радваме да работим с вас по вашия процес на секвениране на РНК. Моля, свържете се с нас, за да организираме демонстрация и да обсъдим вашите изисквания за ултразвук.
Допълнителна информация
Често задавани въпроси: Секвениране на РНК
- За какво се използва секвенирането на РНК?
РНК секвенирането (РНК-Seq) е мощна техника, използвана за анализ на транскриптома, пълния набор от РНК транскрипти, произведени от генома при специфични обстоятелства или в специфични клетъчни типове. Той помага при разбирането на моделите на генна експресия, идентифицирането на нови транскрипти, откриването на генни сливания и характеризирането на алтернативни събития на сплайсинг. Освен това RNA-Seq е от решаващо значение за идентифицирането на диференциално експресирани гени между състоянията, което е от съществено значение в изследванията на заболяванията, биологията на развитието и изследванията на функционалната геномика. Многоямковият пластинчатият ултразвукораздирател Hielscher UIP400MTP често се използва за подобряване на стъпката на фрагментация на РНК, осигурявайки последователна и надеждна подготовка на пробата за високопроизводително секвениране. - Какви са стъпките на секвениране на РНК?
Процесът на секвениране на РНК включва няколко ключови стъпки: изолиране на РНК, фрагментация на РНК (често се постига с помощта на многоямковия ултразвук на Hielscher UIP400MTP за ефективна и равномерна фрагментация), обратна транскрипция за създаване на комплементарна ДНК (кДНК), подготовка на библиотеката, включително добавяне на адаптери, амплификация и секвениране. След това генерираните данни се обработват и анализират с помощта на инструменти за биоинформатика, за да се приведат показанията в съответствие с референтен геном или транскриптом, да се определят количествено нивата на експресия и да се идентифицират диференциално експресирани гени и нови транскрипти. - RNA-Seq същото ли е като ДНК секвенирането?
Не, РНК-Seq не е същото като ДНК секвенирането. RNA-Seq се фокусира върху секвенирането на РНК молекулите, предоставяйки представа за генната експресия и динамиката на транскриптома. За разлика от това, ДНК секвенирането определя точната последователност на нуклеотидите в ДНК, разкривайки генетичния план и вариации в генома. - RNA-Seq NGS техника ли е?
Да, секвенирането на РНК (RNA-Seq) е вид секвениране от следващо поколение (NGS). Той използва технологии за секвениране с висока производителност, за да предостави изчерпателна представа за транскриптома, позволявайки подробен анализ на генната експресия, алтернативен сплайсинг и вариации на транскрипта. - PCR същото ли е като секвенирането на РНК?
Не, PCR (полимеразна верижна реакция) и РНК секвениране са различни техники. PCR се използва за амплифициране на специфични ДНК или РНК последователности, което улеснява изучаването им в детайли. RNA-Seq, от друга страна, секвенира целия транскриптом, осигурявайки по-широк и по-подробен поглед върху генната експресия и регулация. - Защо РНК-Seq е по-добър от микрочиповия чиф?
RNA-Seq предлага няколко предимства пред микрочиповата технология. Той осигурява по-висока чувствителност и специфичност, откривайки по-широк диапазон от нива на експресия и идентифицирайки нови транскрипти, които микрочиповете могат да пропуснат. РНК-Seq също не е ограничена от предварително проектирани сонди, позволяващи откриването на неизвестни досега секвенции. Ултразвукът Hielscher UIP400MTP подобрява RNA-Seq, като осигурява висококачествена, последователна фрагментация на РНК, което е от решаващо значение за точните резултати от секвенирането. - Какви са недостатъците на RNA-Seq?
Въпреки предимствата си, RNA-Seq има някои ограничения. Може да бъде по-скъпо и да изисква по-сложен анализ на данни в сравнение с други методи. Освен това РНК-Seq може да бъде чувствителна към качеството на пробата и методите за подготовка. Въпреки това, използването на усъвършенствани инструменти като многоямковия плачен ултразвук Hielscher UIP400MTP може да смекчи някои от тези проблеми, като осигури последователна и надеждна фрагментация на РНК, подобрявайки цялостното качество на данните. - РНК секвениране генетично изследване ли е?
Секвенирането на РНК обикновено не се счита за генетично тестване, което обикновено се отнася до анализ на ДНК за идентифициране на генетични варианти, свързани със заболявания. Въпреки това, RNA-Seq може да допълни генетичното тестване, като предостави представа за това как генетичните варианти влияят на генната експресия и функция, предлагайки по-цялостно разбиране на основната биология. - По-добър ли е RNA-Seq от qPCR?
RNA-Seq и количествен PCR (qPCR) служат за различни цели и имат различни предимства. РНК-Seq предоставя цялостен поглед върху транскриптома, идентифицирайки и определяйки количествено всички налични видове РНК. qPCR, от друга страна, е много чувствителен и специфичен за количествено определяне на известни целеви последователности. Докато RNA-Seq предлага по-широки прозрения, qPCR често се използва за валидиране на констатациите на RNA-Seq. Ултразвуковият уред Hielscher UIP400MTP подобрява RNA-Seq, като осигурява равномерна и надеждна фрагментация на РНК, което е от решаващо значение за точни и възпроизводими резултати от секвенирането.