Yuqori unumdorlikdagi ultratovush bilan ishlov berish orqali osonlashtirilgan metabolomika
Metabolomika – siydik, qon zardobi, plazma, najas va soʻlak kabi turli biologik suyuqliklardagi kichik molekulalarni tavsiflash va miqdoriy aniqlash uchun yuqori unumdorlikdagi usullardan foydalanib, oʻziga xos metabolik belgilarni ochib beradigan tadqiqot sohasi. Koʻp quduqchali planshetlar uchun moʻljallangan, yuqori unumdorlikdagi UIP400MTP sonikatori ushbu namunalardagi hujayralarni lizis qilish uchun kuchli vosita boʻlib, keyingi tahlil uchun metabolitlarning ajralib chiqishini osonlashtiradi. Ushbu aniq va ishonchli yondashuv metabolomika uchun muhimdir; bu sohada tadqiqotni aniq rejalashtirish, namunalarni puxta tayyorlash, platformani optimal sozlash, maʼlumotlarni har tomonlama tahlil qilish va biologik jihatdan mazmunli talqin qilish birinchi darajali ahamiyatga ega. Metabolomika uglevodlar, lipidlar va aminokislotalar kabi molekulalarning muayyan sinflariga qaratilgan maqsadli yondashuvlardan ham, namunadagi metabolik profillar haqida keng tasavvur berib, metabolik signal uzatishning murakkab tuzilishini ochib beradigan maqsadsiz usullardan ham foydalanadi.
UIP400MTP – koʻp quduqchali planshetlarda hujayra lizisi va metabolitlarni ekstraksiya qilish uchun kontaktsiz, yuqori unumdorlikdagi sonikator
96 quduqchali planshetlar uchun UIP400MTP sonikatori yordamida namunalarni yuqori unumdorlik bilan tayyorlash
Kontaktsiz UIP400MTP sonikatoridan 96 quduqchali planshetlar bilan birgalikda foydalanish yuqori unumdorlikdagi gomogenizatsiya va metabolitlar ekstraksiyasi uchun samarali usuldir. Bunday tuzilma namuna bilan bevosita kontaktni bartaraf etib, bir nechta namunaga bir vaqtda ishlov berishda oʻzaro ifloslanish xavfini kamaytiradi.
96 quduqchali planshetlar uchun UIP400MTP sonikatori yordamida gomogenizatsiya qilishning bosqichma-bosqich protokoli
- Metabolomik namunalarni tayyorlash
Namunalarni joylashtirish: Har bir namunani (masalan, najas, ichak toʻqimasi yoki ichak boʻshligʻidagi tarkibni) 96 quduqchali planshet yoki mikroplanshetning alohida quduqchalariga taqsimlang.
Erituvchi: Metanol, etanol, atsetonitril, xloroform va ularning (suvli) aralashmalari kabi organik erituvchilar metabolitlarni ekstraksiya qilish uchun zarur boʻlib, hujayra ichidagi metabolitlarning hujayra matritsasidan ajralib chiqishiga yordam beradi. Har bir quduqcha uchun 100–300 µL erituvchidan foydalaning va uning hajmi namunani toʻliq botirish uchun yetarli boʻlishini taʼminlang.
Ichki standartlar: Ixtiyoriy ravishda, keyingi metabolomik tahlilda normallashtirish uchun har bir quduqchaga ichki standartlarni qoʻshing. - Ultratovush energiyasini uzatuvchi muhitni tayyorlash
Suv sathi: 96 quduqchali planshetni qoʻllanmada tavsiflanganidek suv (ultratovush energiyasini uzatuvchi muhit) bilan toʻldirilgan ultratovush bilan ishlov berish platformasiga joylashtiring. - UIP400MTP parametrlarini sozlash
Quvvat sozlamalari: Samarali gomogenizatsiya uchun ultratovush amplitudasini maksimal quvvatning 50–80% iga sozlang.
Impuls rejimi: Sovishga imkon berish va namunaning haddan tashqari qizib ketishining oldini olish uchun ultratovush bilan ishlov berish siklini navbatma-navbat impulslar berishga sozlang (masalan, 30 soniya YOQILGAN, 30 soniya OʻCHIRILGAN).
Umumiy vaqt: Namunaning murakkabligi va mustahkamligiga qarab, 4–10 daqiqa.
Haroratni nazorat qilish: Issiqlikka sezgir metabolitlarni himoya qilish uchun ultratovush bilan ishlov berish davomida suvni 4–8°C da saqlash maqsadida laboratoriya sovitgichidan foydalaning. - Ultratovush bilan ishlov berish jarayoni
Ultratovush bilan ishlov berish sikllari uchun UIP400MTP ni ishga tushiring.
Jarayonni UIP400MTP interfeysi orqali kuzating.
Kavitatsiya taʼsiri namunalarni gomogenizatsiya qiladi va quduqchalardagi hujayralarni lizis qilib, hujayra ichidagi metabolitlarni erituvchiga chiqaradi. - Ultratovush bilan ishlov berishdan keyingi bosqich
Sentrifugalash: Ultratovush bilan ishlov berishdan soʻng, zarur boʻlsa, planshet tarkibini yigʻish probirkalariga oʻtkazing. Erimaydigan qoldiqlar va hujayra materialini choʻktirish uchun 4 000–6 000 × g da 10 daqiqa sentrifugalang.
Supernatantni yigʻish: Har bir quduqchadagi supernatantni tahlil uchun yangi probirkalar yoki planshetlarga ehtiyotkorlik bilan oʻtkazing.
Ixtiyoriy quritish: Konsentrlash zarur boʻlsa, supernatantlarni vakuum konsentratori (masalan, SpeedVac) yordamida quriting, soʻng mos erituvchining kichik hajmida qayta eriting.
Koʻp quduqchali planshetlar uchun UIP400MTP sonikatorining yuqori unumdorlikdagi ishlov berish imkoniyatidan foydalaning va metabolomik tadqiqotlaringiz hamda tahlillaringizni osonlashtiring!
Yuqori unumdorlikdagi UIP400MTP sonikatori koʻp quduqchali planshetlar, 96 quduqchali planshetlar, probirkalar va Petri idishlarida metabolomik tadqiqotlar oʻtkazish uchun.
Metabolomik tadqiqotlarda namunalarni yuqori unumdorlik bilan tayyorlash uchun koʻp quduqchali planshetlarga moʻljallangan UIP400MTP sonikatori.
UIP400MTP yordamida kontaktsiz ultratovush bilan ishlov berish tamoyili
UIP400MTP ultratovush toʻlqinlarini 96 quduqchali planshetning quduqchalariga energiyani uzatuvchi muhit (masalan, suv) orqali bilvosita uzatadi. Ushbu toʻlqinlar kavitatsiyani hosil qiladi; kavitatsiya sonikator zondi bilan namuna oʻrtasida jismoniy kontakt boʻlmagan holda hujayralarni parchalaydi va metabolitlarni ajratib chiqaradi.
«Najas mikrobiomi namunalaridagi bakteriyalarni bir tekis va izchil lizis qilish uchun UIP400MTP sonikatoringizdan foydalanishdagi ajoyib tajribamiz uchun sizga minnatdorlik bildirish maqsadida yozyapman. Biz yuqori unumdorlikdagi lizis texnologiyasi imkoniyatlari chegaralarini kengaytiryapmiz va qurilmangiz ushbu vazifaga juda mos keladi. Asosiy afzalliklardan ayrimlari quyidagilar:
- Ishlatish qulayligi – qurilmadan foydalanish oson, menyudagi variantlar orqali ehtiyojga mos sozlash ham sodda
- Yuqori unumdorlik – bir vaqtning oʻzida 96 ta namunali planshetlarga ishlov berish uchun juda yaxshi
- Barcha idishlarga bir tekis ultratovush bilan ishlov berish – qurilma barcha quduqchalarga bir xil miqdorda ultratovush bilan ishlov bera oldi, bu bizning qoʻllanishimiz uchun hal qiluvchi ahamiyatga ega edi
- Hielscher jamoasining qoʻllab-quvvatlashi – yordam juda yaxshi boʻldi, siz bizga oʻrgatishda, savollarimizga javob berishda va muammolarni hal qilishda doimo yonimizda boʻldingiz hamda maqsadimizga erishishga yordam bergan tavsiyalarni berdingiz.
Protokollarimizni optimallashtirish ustida ishlaganimizda koʻrsatgan yordamingiz va koʻmagingiz uchun yana bir bor rahmat.»
Mark D. Driscoll, Ph.D. – Bosh ilmiy direktor – Intus Biosciences
Koʻp quduqchali planshetlar uchun UIP400MTP sonikatori, masalan, metabolitlarni tadqiq qilish va tahlil qilishda namunalarni yuqori unumdorlik bilan tayyorlashni osonlashtiradi.
96 quduqchali planshetlar uchun UIP400MTP sonikatori: ultratovushni uzatuvchi suyuqlik barcha quduqchalarni oʻrab turadi va har bir namunaga bir tekis ultratovush bilan ishlov berilishini taʼminlaydi
Koʻp quduqchali planshetlar uchun UIP400MTP sonikatorining asosiy xususiyatlari
| Yuqori unumdorlikdagi ultratovush bilan ishlov berish | 96 quduqchali va boshqa koʻp quduqchali planshetlar uchun juda mos keladigan UIP400MTP bir nechta namunaga bir vaqtda, bir xil ultratovush bilan ishlov berish imkonini beradi, bu namunalarni tayyorlash vaqtini sezilarli darajada qisqartiradi va koʻp sonli namunalarni tekshirish unumdorligini oshiradi. |
| Oʻzingiz tanlagan koʻp quduqchali planshetdan foydalaning | UIP400MTP har qanday standart koʻp quduqchali planshetlar, PCR planshetlari yoki mikrotitr planshetlariga ultratovush bilan ishlov berish uchun moʻljallangan. Tajribalaringiz uchun eng mos planshetni oʻzingiz tanlaysiz. UIP400MTP faqat ishlab chiqaruvchiga xos sarf materiallarini talab qilmagani sababli, bu sizga katta mablagʻni tejash imkonini beradi! |
| Kontaktsiz ultratovush bilan ishlov berish | Koʻp quduqchali planshetlar uchun UIP400MTP sonikatori namunaga hech narsa kiritmasdan kuchli ultratovush taʼsirini qoʻllaydi. Siz germetik yopilgan koʻp quduqchali planshetlar, yopiq idishlar va flakonlarga ultratovush bilan ishlov berishingiz mumkin. Hielscher har qanday nostandart flakonlar yoki idishlar uchun sizga maxsus moslashtirilgan namuna tutqichlarini taqdim etadi. |
| Aniqlik va boshqaruv | Aniq boshqaruv va aqlli dasturiy taʼminot ultratovush parametrlarini ishlov berishga oid muayyan ehtiyojlaringizga eng maqbul tarzda moslab sozlash imkonini beradi. Har bir tajribada ultratovush bilan ishlov berishning maksimal samaradorligi va natijadorligiga erishasiz. |
| Haroratni nazorat qilish | Ultratovush bilan ishlov berish uchun muayyan haroratni belgilang. Planshetlar uchun UIP400MTP sonikatori namuna haroratini kuzatishi va ultratovush bilan ishlov berishni shunga mos ravishda sozlashi mumkin. Qayta aylanib turuvchi sovituvchi suyuqlik haroratni aniq nazorat qilish uchun planshetdagi har bir quduqchani sovitadi. |
| Jarayonni qayd etish va masofadan boshqarish | Har bir ultratovush bilan ishlov berish jarayonini kompyuterdan boshqarish mumkin. Dasturiy taʼminotni oʻrnatish talab qilinmaydi. UIP400MTP ni masofadan boshqarish va kuzatish uchun har qanday operatsion tizimda (masalan, MacOS, Windows, Android, iOS yoki Linux) odatiy brauzeringizdan (masalan, Chrome, Firefox, Edge yoki Safari) foydalanishingiz mumkin. Har bir ultratovush bilan ishlov berish jarayoni baholash va hujjatlashtirish uchun batafsil ultratovush bilan ishlov berish qaydini yaratadi. Qayd fayli muayyan ishlab chiqaruvchiga xos boʻlmagan CSV formatida boʻlib, uni oʻzingiz tanlagan dasturda, masalan, Microsoft Excel, Apple Numbers yoki OpenOffice Calc da ochishingiz mumkin. |
| Mustahkam va ishonchli | Germaniyada eng yuqori sifat standartlariga muvofiq loyihalashtirilgan va ishlab chiqarilgan UIP400MTP nafaqat kuchli, balki nihoyatda chidamli hamdir. Uning tuzilishi sanoat standartlariga javob beradi va talabchan laboratoriya muhitida kundalik foydalanishning ogʻir sharoitlariga osonlik bilan bardosh beradi. UIP400MTP dan yuqori unumdorlikdagi ishlov berish jarayonlarida kuniga 24 soat, haftasiga 7 kun uzluksiz foydalanishingiz mumkin. |
- yuqori samaradorlik
- eng ilgʻor texnologiya
- ishonchlilik va mustahkamlik
- sozlanadigan, aniq jarayon boshqaruvi
- intellektual dasturiy taʼminot
- aqlli funksiyalar (masalan, dasturlash imkoniyati, maʼlumotlarni qayd etish, masofadan boshqarish)
- ishlatish oson va xavfsiz
- kam texnik xizmat talab qiladi
- CIP (joyida tozalash)
Loyihalash, ishlab chiqarish va maslahat berish – Germaniyada yaratilgan sifat
Hielscher ultratovush qurilmalari eng yuqori sifat va loyihalash standartlari bilan mashhur. Mustahkamlik va ishlatishning osonligi ultratovush qurilmalarimizni sanoat obyektlariga muammosiz integratsiya qilish imkonini beradi. Hielscher ultratovush qurilmalari ogʻir sharoitlar va yuqori talablar qoʻyiladigan muhitlarda osongina ishlaydi.
Hielscher Ultrasonics – ISO sertifikatiga ega kompaniya boʻlib, eng ilgʻor texnologiya va foydalanuvchiga qulaylikni oʻzida mujassam etgan yuqori unumdorlikdagi ultratovush qurilmalariga alohida eʼtibor qaratadi. Albatta, Hielscher ultratovush qurilmalari CE talablariga mos keladi va UL, CSA hamda RoHs talablariga javob beradi.
Kontaktsiz UIP400MTP sonikatori mikroplanshetlarda metabolomik namunalarni tayyorlash uchun.
Adabiyotlar / Manbalar
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Metabolomik tadqiqotlar haqida tez-tez beriladigan savollar
Mikrobiom nima?
Mikrobiom deganda inson tanasi kabi muayyan muhitda yashaydigan mikroorganizmlar, jumladan bakteriyalar, viruslar, zamburugʻlar va arxeyalar hamda ularning genetik materialining umumiy majmuasi tushuniladi. U metabolizm, immun funksiyasi va patogenlardan himoyalanishga taʼsir koʻrsatib, xoʻjayin organizmning salomatligida muhim rol oʻynaydi; ayni paytda uning oʻzi ovqatlanish, turmush tarzi va atrof-muhit kabi omillar taʼsirida shakllanadi.
Metabolomika nima?
Metabolomika – biologik tizimdagi metabolik jarayonlar davomida hosil boʻladigan kichik molekulalar, yaʼni metabolitlarni har tomonlama oʻrganishdir. U hujayra funksiyalari, metabolik yoʻllar va ularning genetik, atrof-muhitga oid yoki patologik oʻzgarishlarga qanday javob berishini tushunish uchun ushbu molekulalarni identifikatsiya qilish, miqdoriy aniqlash va tahlil qilishni oʻz ichiga oladi.
Metabolom nima?
Metabolom – muayyan vaqtda hujayra, toʻqima yoki organizm kabi biologik tizimda mavjud boʻlgan kichik molekulalar, yaʼni metabolitlarning toʻliq majmuasidir. U tizimning biokimyoviy faolligi va fiziologik holatini aks ettirib, metabolizm va uning atrof-muhit bilan oʻzaro taʼsirlari haqida maʼlumot beradi.
Hielscher Ultrasonics yuqori unumdorlikdagi ultratovushli gomogenizatorlarni laboratoriya oʻlchamidan tortib sanoat oʻlchamigacha ishlab chiqaradi.