Metabolomika yuqori o'tkazuvchan sonikatsiya yordamida osonlashtiriladi
Metabolomika - bu siydik, zardob, plazma, najas va tupurik kabi turli xil biosuyuqliklardagi kichik molekulalarni tavsiflash va miqdorini aniqlash uchun yuqori samarali usullardan foydalanadigan tadqiqot sohasi bo'lib, noyob metabolik belgilarni ochib beradi. Ko'p quduqli plitalar uchun mo'ljallangan, yuqori samarali sonikator UIP400MTP bu namunalardagi hujayralarni parchalash uchun kuchli vosita bo'lib, quyi oqim tahlili uchun metabolitlarni chiqarishni osonlashtiradi. Ushbu aniq va ishonchli yondashuv metabolomika uchun juda muhimdir, bu erda aniq o'rganish dizayni, sinchkovlik bilan namuna tayyorlash, optimallashtirilgan platformani sozlash, har tomonlama ma'lumotlarni tahlil qilish va mazmunli biologik talqin qilish muhim ahamiyatga ega. Metabolomikada uglevodlar, lipidlar va aminokislotalar kabi molekulalarning ma'lum sinflariga qaratilgan maqsadli yondashuvlar va metabolik signalizatsiyaning murakkab murakkabligini ochib beradigan namunadagi metabolik profillarning keng ko'rinishini ta'minlaydigan maqsadli bo'lmagan usullar qo'llaniladi.
UIP400MTP - bu ko'p quduqli plitalarda hujayra lizisi va metabolitlarni olish uchun kontaktsiz, yuqori o'tkazuvchan sonikator.
96-quduqli Plitalar Sonicator UIP400MTP bilan yuqori mahsuldorlikka ega namuna tayyorlash
UIP400MTP kontaktsiz sonikatorini 96 quduqli plitalar bilan birgalikda ishlatish yuqori samarali gomogenizatsiya va metabolitlarni olishning samarali usuli hisoblanadi. Ushbu sozlash namuna bilan to'g'ridan-to'g'ri aloqa qilishdan saqlaydi, bir vaqtning o'zida bir nechta namunalarni qayta ishlash paytida o'zaro kontaminatsiya xavfini kamaytiradi.
96-quduqli Sonicator UIP400MTP bilan gomogenlashtirish uchun bosqichma-bosqich protokol
- Metabolomik namunalarni tayyorlash
Namuna joylashtirish: Har bir namunani (masalan, najas, ichak to'qimasi yoki luminal tarkibi) 96-quduqli plastinka yoki mikroplastinkaning alohida quduqlariga soling.
Erituvchi: Metanol, etanol, asetonitril, xloroform va ularning (suvli) aralashmalari kabi organik erituvchilar hujayra matritsasidan hujayra ichidagi metabolitlarni chiqarishga yordam beradigan metabolitlarni olish uchun zarurdir. Har bir quduqqa 100–300 mkL erituvchidan foydalaning, bu namunani toʻliq suvga botirish uchun yetarli hajmni taʼminlang.
Ichki standartlar: Majburiy emas, quyi oqimdagi metabolomik tahlil paytida normalizatsiya qilish uchun har bir quduqqa ichki standartlar qo'shing. - Birlashtiruvchi vositani sozlash
Suv darajasi: Qo'llanmada ta'riflanganidek, 96 quduqli plastinani suv bilan to'ldirilgan sonikatsiya platformasiga (birlashtiruvchi vosita) joylashtiring. - UIP400MTP parametr konfiguratsiyasi
Quvvat sozlamalari: Samarali gomogenizatsiya uchun ultratovush amplitudasini maksimal quvvatning 50-80% ga sozlang.
Puls rejimi: Sovutish va namunaning haddan tashqari qizib ketishining oldini olish uchun sonikatsiya davrini muqobil impulslarga (masalan, 30 soniya ON, 30 soniya OFF) sozlang.
Umumiy vaqt: Namuna murakkabligi va qattiqligiga qarab 4–10 daqiqa.
Harorat nazorati: Issiqlikka sezgir metabolitlarni himoya qilish uchun sonikatsiya paytida suvni 4-8 ° C darajasida ushlab turish uchun laboratoriya sovutgichidan foydalaning. - sonikatsiya jarayoni
Sonikatsiya davrlari uchun UIP400MTP ni ishga tushiring.
Jarayonni UIP400MTP interfeysi orqali kuzatib boring.
Kavitatsiya effekti namunalarni bir hil holga keltiradi va hujayra ichidagi metabolitlarni erituvchiga chiqaradi. - PostSonication
Santrifüjlash: Sonikatsiyadan so'ng, agar kerak bo'lsa, plastinka tarkibini yig'ish naychalariga o'tkazing. Erimaydigan qoldiqlarni va uyali materialni granulalash uchun 4000-6000 × g da 10 daqiqa davomida santrifüj qiling.
Supernatantlar to'plami: Har bir quduqdagi supernatantni ehtiyotkorlik bilan tahlil qilish uchun yangi naychalarga yoki plitalarga o'tkazing.
Ixtiyoriy quritish: Agar konsentratsiya zarur bo'lsa, vakuumli kontsentrator (masalan, SpeedVac) yordamida supernatantlarni quriting, keyin tegishli erituvchining kichik hajmida qayta tiklang.
UIP400MTP ko'p quduqli plastinka sonikatorining yuqori o'tkazuvchanlik ishlash qobiliyatidan foydalaning va metabolomik tadqiqotlar va tahlillaringizni osonlashtiring!
UIP400MTP yuqori o'tkazuvchan sonikator ko'p quduqli plitalar, 96 quduqli plitalar, naychalar va Petri idishlarida metabolik tadqiqotlar uchun.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator metabolomik tadqiqotlarda yuqori o'tkazuvchanlik namunalarini tayyorlash uchun.
UIP400MTP bilan kontaktsiz sonikatsiya printsipi
UIP400MTP ultratovush to'lqinlarini 96 quduqli plastinka quduqlariga bilvosita ulash muhiti (masalan, suv) orqali qo'llaydi. Ushbu to'lqinlar hujayralarni buzadigan kavitatsiyani hosil qiladi va sonikator probi va namuna o'rtasida jismoniy aloqa qilmasdan metabolitlarni chiqaradi.
“Najas mikrobioma namunalarining bir xil va izchil bakterial lizis uchun UIP400MTP sonikatoridan foydalanganimiz uchun ajoyib tajribamiz uchun sizga minnatdorchilik bildiraman. Biz yuqori o'tkazuvchanlik lizis texnologiyasi uchun konvertni surmoqdamiz va sizning asbobingiz vazifaga juda mos keladi. Asosiy diqqatga sazovor joylarning ba'zilari:
- Operatsion qulayligi – Asbobdan foydalanish oson va menyu tanlash orqali sozlash oson
- Yuqori o'tkazuvchanlik – bir vaqtning o'zida 96 ta namunaga ega bo'lgan plitalar bilan ishlash uchun juda yaxshi
- Hatto barcha tomirlarning sonikatsiyasi – qurilma barcha quduqlarga bir xil miqdordagi sonikatsiyani etkazib bera oldi, bu bizning dasturimiz uchun juda muhim edi
- Hielscher jamoasidan yordam – qo'llab-quvvatlash ajoyib edi, siz har doim mashg'ulotlarda biz bilan birga bo'ldingiz, savollarimizga javob berdingiz va muammolarimizni hal qildingiz, maqsadimizga erishishimizga yordam beradigan takliflar bilan.
Protokollarimizni optimallashtirish ustida ishlaganimizda yordamingiz va yordamingiz uchun yana bir bor rahmat.”
Mark D. Driskoll, PhD. – Bosh ilmiy xodim – Intus Biosciences
Ko'p quduqli plastinka sonikatori UIP400MTP, masalan, metabolitlarni tadqiq qilish va tahlil qilishda yuqori samarali namuna tayyorlashni osonlashtiradi.
96-quduqli plastinka sonikatori UIP400MTP: ultratovush o'tkazuvchi suyuqlik barcha quduqlarni o'rab oladi va har bir namunaning bir xil sonikatsiyasini ta'minlaydi.
UIP400MTP ko'p quduqli plastinka sonikatorining asosiy xususiyatlari
| Yuqori mahsuldor sonikatsiya | 96-quduqli va boshqa ko'p quduqli plitalar uchun juda mos keladigan UIP400MTP bir nechta namunalarni bir vaqtning o'zida, bir xil sonikatsiya qilish imkonini beradi, namuna tayyorlash muddatini sezilarli darajada qisqartiradi va yuqori namunalar sonini sinovdan o'tkazish qobiliyatini oshiradi. |
| O'zingiz tanlagan ko'p teshikli plastinkadan foydalaning | UIP400MTP har qanday standart multiwell plitalari, PCR plitalari yoki mikrotiter plitalarini sonikatsiya qilish uchun mo'ljallangan. Tajribalaringiz uchun eng mos plastinkani tanlaysiz. UIP400MTP xususiy sarf materiallarini talab qilmagani uchun bu sizga ko'p pul tejaydi! |
| Kontaktsiz ultratovush | Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP namunaga hech narsa kiritmasdan intensiv ultratovushni qo'llaydi. Ealed multiwell plitalari, yopiq idishlar va flakonlarni sonikatsiya qilishingiz mumkin. Hielscher har qanday nostandart flakonlar yoki idishlar uchun moslashtirilgan namuna ushlagichlarini taqdim etadi. |
| Aniqlik va nazorat | Nozik nazorat va aqlli dasturiy ta'minot sizga ultratovush parametrlarini maxsus ishlov berish ehtiyojlaringizga mos ravishda o'rnatishga imkon beradi. Har bir tajriba uchun maksimal sonikatsiya samaradorligi va samaradorligini olasiz. |
| Haroratni nazorat qilish | Sonikatsiya uchun ma'lum bir haroratni o'rnating. UIP400MTP plastinka sonikatori namuna haroratini kuzatishi va sonikatsiyani mos ravishda sozlashi mumkin. Qayta aylanuvchi sovutish suyuqligi haroratni aniq nazorat qilish uchun plastinkadagi har bir quduqni sovutadi. |
| Protokollashtirish va masofadan boshqarish | Har bir sonikatsiyani kompyuterdan boshqarish mumkin. Dasturiy ta'minotni o'rnatish shart emas. UIP400MTP ni masofadan boshqarish va kuzatish uchun istalgan operatsion tizimda (masalan, MacOS, Windows, Android, iOS yoki Linux) standart brauzeringizdan (masalan, Chrome, Firefox, Edge yoki Safari) foydalanishingiz mumkin. Har bir sonikatsiya jarayoni baholash va hujjatlar uchun batafsil sonikatsiya protokolini ishlab chiqaradi. Protokol fayli xususiy bo'lmagan CSV formatida bo'lib, uni o'zingiz yoqtirgan dastur, masalan, Microsoft Excel, Apple Numbers yoki OpenOffice Calc bilan ochishingiz mumkin. |
| Mustahkam va ishonchli | Germaniyada eng yuqori sifat standartlari asosida ishlab chiqilgan va qurilgan UIP400MTP nafaqat kuchli, balki juda bardoshlidir. Uning dizayni sanoat standartlariga javob beradi va talabchan laboratoriya sharoitida kundalik foydalanishning qiyinchiliklariga osongina bardosh beradi. UIP400MTP dan haftada 7 kun 24 soat uzluksiz foydalanishingiz mumkin. |
- yuqori samaradorlik
- eng zamonaviy texnologiya
- ishonchlilik & mustahkamlik
- sozlanishi, aniq jarayon nazorati
- aqlli dasturiy ta'minot
- aqlli xususiyatlar (masalan, dasturlashtiriladigan, ma'lumotlarni protokollash, masofadan boshqarish)
- oson va xavfsiz ishlash
- past texnik xizmat ko'rsatish
- CIP (joyida toza)
Dizayn, ishlab chiqarish va konsalting – Germaniyada ishlab chiqarilgan sifat
Hielscher ultrasonikatorlari eng yuqori sifat va dizayn standartlari bilan mashhur. Mustahkamlik va qulay foydalanish ultratovush qurilmalarimizni sanoat ob'ektlariga silliq integratsiya qilish imkonini beradi. Qo'pol sharoitlar va talabchan muhit Hielscher ultrasonikatorlari tomonidan osonlik bilan hal qilinadi.
Hielscher Ultrasonics ISO sertifikatiga ega kompaniya bo'lib, eng zamonaviy texnologiya va foydalanuvchilarga qulaylik bilan ajralib turadigan yuqori samarali ultratovush apparatlariga alohida e'tibor beradi. Albatta, Hielscher ultrasonikatorlari Idoralar talablariga javob beradi va UL, CSA va RoHs talablariga javob beradi.
UIP400MTP kontaktsiz sonikator mikroplatalarda metabolomik namunani tayyorlash uchun.
Adabiyot / Adabiyotlar
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Metabolomik tadqiqotlar haqida tez-tez so'raladigan savollar
Mikrobioma nima?
Mikrobioma mikroorganizmlarning, jumladan, bakteriyalar, viruslar, zamburug'lar va arxeyalarning, shuningdek, ma'lum bir muhitda, masalan, inson tanasida yashovchi ularning genetik materiallarining jamoaviy birlashmasini anglatadi. Metabolizmga, immunitet funktsiyasiga va patogenlardan himoyalanishga ta'sir qilish orqali mezbon salomatligida muhim rol o'ynaydi, shu bilan birga ovqatlanish, turmush tarzi va atrof-muhit kabi omillar ta'sirida shakllanadi.
Metabolomika nima?
Metabolomika - bu biologik tizimdagi metabolik jarayonlarda hosil bo'lgan kichik molekulalar bo'lgan metabolitlarni har tomonlama o'rganish. U hujayra funktsiyalarini, metabolik yo'llarni va ularning genetik, atrof-muhit yoki patologik o'zgarishlarga qanday javob berishini tushunish uchun ushbu molekulalarni aniqlash, miqdorni aniqlash va tahlil qilishni o'z ichiga oladi.
Metabolome nima?
Metabolom ma'lum bir vaqtda biologik tizimda, masalan, hujayra, to'qima yoki organizmda mavjud bo'lgan kichik molekulalar yoki metabolitlarning to'liq to'plamidir. U tizimning biokimyoviy faolligi va fiziologik holatini aks ettiradi, metabolizm va uning atrof-muhit bilan o'zaro ta'siri haqida tushuncha beradi.
Hielscher Ultrasonics kompaniyasi yuqori samarali ultratovushli homogenizatorlarni ishlab chiqaradi laboratoriya uchun sanoat hajmi.