Метаболомика олакшана ултразвуком високог протока
Метаболомика је поље истраживања које користи технике високе пропусности за карактеризацију и квантификацију малих молекула у различитим биофлуидима, као што су урин, серум, плазма, фецес и пљувачка, откривајући јединствене метаболичке потписе. Соникатор високог протока УИП400МТП, дизајниран за плоче са више бунара, је моћан алат за лизу ћелија у овим узорцима, олакшавајући ослобађање метаболита за анализу низводно. Овај прецизан и поуздан приступ је од суштинског значаја за метаболомику, где су тачан дизајн студије, педантна припрема узорака, оптимизована поставка платформе, свеобухватна анализа података и смислена биолошка интерпретација најважнији. Метаболомика користи оба циљана приступа, који се фокусирају на специфичне класе молекула као што су угљени хидрати, липиди и аминокиселине, и нециљане технике, које пружају широк преглед метаболичких профила унутар узорка, откривајући сложену сложеност метаболичке сигнализације.
Високо пропусна припрема узорака са соницатором за плоче са 96 јажица УИП400МТП
Коришћење бесконтактног соникатора УИП400МТП у комбинацији са плочама са 96 јажица је ефикасан метод за хомогенизацију високог протока и екстракцију метаболита. Ово подешавање избегава директан контакт са узорком, смањујући ризик од унакрсне контаминације док се истовремено обрађује више узорака.
Корак по корак протокол за хомогенизацију са 96-бунарски Соницатор УИП400МТП
- Припрема метаболомских узорака
Пример пласмана: Распоредите сваки узорак (нпр. измет, цревно ткиво или садржај лумина) у појединачне јажице плоче или микроплоче са 96 бунарчића.
растварач: Органски растварачи, као што су метанол, етанол, ацетонитрил, хлороформ и њихове (водене) смеше, су неопходни за екстракцију метаболита, помажући у ослобађању интрацелуларних метаболита из ћелијског матрикса. Користите 100–300 µЛ растварача по бунарчићу, обезбеђујући довољну запремину да се узорак потпуно потопи.
Интерни стандарди: Опционо, додајте интерне стандарде у сваки бунар ради нормализације током низводне метаболомске анализе. - Подешавање средњег споја
Ниво воде: Поставите плочу са 96 јажица на платформу за соникацију напуњену водом (медијум за спајање) као што је описано у приручнику. - Конфигурација параметара УИП400МТП
Подешавања напајања: Подесите ултразвучну амплитуду на 50–80% максималне снаге за ефикасну хомогенизацију.
Пулсни режим: Поставите циклус соникације на наизменичне импулсе (нпр. 30 секунди УКЉУЧЕНО, 30 секунди ИСКЉУЧЕНО) да бисте омогућили хлађење и спречили прегревање узорка.
Укупно време: 4–10 минута, у зависности од сложености и жилавости узорка.
Контрола температуре: Користите лабораторијски расхладни уређај да одржавате воду на 4–8 °Ц током ултразвука како бисте заштитили метаболите осетљиве на топлоту. - процес соникације
Покрените УИП400МТП за циклусе соникације.
Пратите процес преко УИП400МТП интерфејса.
Ефекат кавитације ће хомогенизовати узорке и лизирати ћелије унутар бунара, ослобађајући интрацелуларне метаболите у растварач. - ПостСоницатион
Центрифугирање: Након соникације, пренесите садржај плоче у епрувете за сакупљање ако је потребно. Центрифугирајте на 4.000–6.000 × г 10 минута да бисте пелетирали нерастворљиве остатке и ћелијски материјал.
Колекција супернатаната: Пажљиво пребаците супернатант из сваког лежишта у нове епрувете или плоче за анализу.
Опционо сушење: Осушите супернатанте користећи вакуум концентратор (нпр. СпеедВац) ако је потребна концентрација, а затим их реконституисати у малој запремини одговарајућег растварача.
Искористите капацитет обраде високе пропусности УИП400МТП соникатора плоча са више бунара и олакшајте своје метаболомско истраживање и анализу!
УИП400МТП соникатор високог протока за метаболомска истраживања у плочама са више бунара, плочама са 96 бунарчића, епруветама и Петријевим посудама.
Принцип бесконтактне соникације са УИП400МТП
УИП400МТП примењује ултразвучне таласе на бунарчиће плоче са 96 јажица индиректно преко медијума за спајање (нпр. воде). Ови таласи стварају кавитацију, која омета ћелије и ослобађа метаболите без физичког контакта између сонде сонде и узорка.
“Пишем да вам се захвалим на нашем фантастичном искуству коришћења вашег УИП400МТП соникатора за уједначену и доследну бактеријску лизу узорака фекалног микробиома. Проширујемо оквир за технологију лизе високе пропусности, а ваш инструмент је добро прилагођен задатку. Неки од кључних нагласака су:
- Лакоћа рада – инструмент је једноставан за коришћење, а прилагођавање је једноставно коришћењем избора менија
- висока пропусност – одличан за руковање плочама, са 96 узорака истовремено
- Чак и соникација свих судова – уређај је био у стању да испоручи исту количину соникације у све бунаре, што је било кључно за нашу примену
- Подршка Хиелсцхер тима – подршка је била одлична, увек сте били ту за нас на тренинзима, да одговорите на наша питања и решавамо проблеме, са сугестијама које су нам помогле да дођемо до циља.
Хвала вам још једном на помоћи и помоћи док смо радили на оптимизацији наших протокола.”
Марк Д. Дрисцолл, Пх.Д. – Главни научни референт – Интус Биосциенцес
Соникатор плоча са више бунара УИП400МТП олакшава припрему узорака високог протока, нпр. у истраживању и анализи метаболита.
Кључне карактеристике УИП400МТП соникатора плоча са више бунара
| ултразвук високе пропусности | Савршено погодан за плоче са 96 јажица и друге плоче са више јажица, УИП400МТП омогућава истовремену, идентичну соникацију више узорака, значајно скраћујући трајање припреме узорка и повећавајући пропусност тестирања великог броја узорака. |
| Користите вишенаменску плочу по вашем избору | УИП400МТП је дизајниран за ултразвучну обраду свих стандардних плоча са више јажица, ПЦР плоча или микротитарских плоча. Ви бирате плочу која највише одговара вашим експериментима. Пошто УИП400МТП не захтева власнички потрошни материјал, ово вам штеди много новца! |
| Бесконтактна ултразвук | Мултивелл Плате Соницатор УИП400МТП примењује интензиван ултразвук без уметања било чега у узорак. Можете да обрадите соникиране плоче са више јажица, затворене посуде и бочице. Хиелсцхер вам испоручује прилагођене држаче узорака за све нестандардне бочице или посуде. |
| Прецизност и контрола | Прецизна контрола и паметни софтвер вам омогућавају да подесите ултразвучне параметре тако да оптимално одговарају вашим специфичним потребама обраде. Добијате максималну ефикасност и ефективност соникације за сваки експеримент. |
| контрола температуре | Подесите одређену температуру за соникацију. Соникатор плоча УИП400МТП може пратити температуру узорка и у складу с тим прилагодити соникацију. Рециркулацијска расхладна течност хлади сваки бунар у плочи за прецизну контролу температуре. |
| Протоколирање и даљинско управљање | Сваки рад ултразвука може се контролисати са рачунара. Није потребна инсталација софтвера. Можете да користите свој стандардни претраживач (нпр. Цхроме, Фирефок, Едге или Сафари) на било ком оперативном систему (нпр. МацОС, Виндовс, Андроид, иОС или Линук) да контролишете и надгледате УИП400МТП даљински. Сваки циклус ултразвука производи детаљан протокол соникације за процену и документацију. Датотека протокола је у не-власничком ЦСВ формату, који можете да отворите помоћу жељеног програма, нпр. Мицрософт Екцел, Аппле Нумберс или ОпенОффице Цалц. |
| Робустан и поуздан | Дизајниран и направљен у Немачкој према највишим стандардима квалитета, УИП400МТП није само моћан већ и изузетно издржљив. Његов дизајн испуњава индустријске стандарде и лако издржава свакодневну употребу у захтевном лабораторијском окружењу. Можете користити УИП400МТП непрекидно 24 сата, 7 дана у недељи у операцијама велике пропусности. |
- висока ефикасност
- најсавременија технологија
- поузданост & робусност
- подесива, прецизна контрола процеса
- интелигентни софтвер
- паметне функције (нпр. програмирање, протоколирање података, даљинско управљање)
- једноставан и сигуран за рад
- минимално одржавање
- ЦИП (чишћење на месту)
Дизајн, производња и консалтинг – Квалитет Маде ин Германи
Хиелсцхер ултрасоникатори су познати по свом највишем квалитету и стандардима дизајна. Робусност и једноставан рад омогућавају несметану интеграцију наших ултразвучних апарата у индустријске објекте. Хиелсцхер ултрасоникатори се лако носе са тешким условима и захтевним окружењима.
Хиелсцхер Ултрасоницс је ИСО сертификована компанија и ставља посебан нагласак на ултрасоникаторе високих перформанси са најсавременијом технологијом и једноставношћу за коришћење. Наравно, Хиелсцхер ултрасоникатори су усаглашени са ЦЕ и испуњавају захтеве УЛ, ЦСА и РоХ.
Бесконтактни соникатор УИП400МТП за припрему метаболомских узорака у микроплочама.
Литература / Референце
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Често постављана питања о метаболомском истраживању
Шта је микробиом?
Микробиом се односи на колективну заједницу микроорганизама, укључујући бактерије, вирусе, гљиве и археје, као и њихов генетски материјал, који насељавају одређено окружење, као што је људско тело. Он игра критичну улогу у здрављу домаћина тако што утиче на метаболизам, имунолошку функцију и заштиту од патогена, док га обликују фактори као што су исхрана, начин живота и животна средина.
Шта је метаболомика?
Метаболомика је свеобухватна студија метаболита, који су мали молекули произведени током метаболичких процеса унутар биолошког система. То укључује идентификацију, квантификацију и анализу ових молекула да би се разумеле ћелијске функције, метаболички путеви и како они реагују на генетске, еколошке или патолошке промене.
Шта је Метаболом?
Метаболом је комплетан скуп малих молекула, или метаболита, присутних унутар биолошког система, као што је ћелија, ткиво или организам, у датом тренутку. Он одражава биохемијску активност и физиолошко стање система, пружајући увид у метаболизам и његове интеракције са околином.
Хиелсцхер Ултрасоницс производи ултразвучне хомогенизаторе високих перформанси од лаб до индустријска величина.



