Մետաբոլոմիկայի դյուրացում բարձր թողունակությամբ ուլտրաձայնային մշակման միջոցով
Մետաբոլոմիկան հետազոտական ոլորտ է, որն օգտագործում է բարձր թողունակությամբ մեթոդներ՝ տարբեր կենսահեղուկներում, օրինակ՝ մեզում, շիճուկում, պլազմայում, կղանքում և թքում փոքր մոլեկուլները բնութագրելու և քանակապես որոշելու համար՝ բացահայտելով յուրահատուկ նյութափոխանակային պատկերներ։ Բազմահոր թիթեղների համար նախատեսված բարձր թողունակությամբ ուլտրաձայնային մշակման UIP400MTP սարքը հզոր գործիք է այս նմուշներում բջիջների լիզիսի համար՝ նպաստելով մետաբոլիտների ազատմանը հետագա վերլուծության նպատակով։ Այս ճշգրիտ և հուսալի մոտեցումն էական նշանակություն ունի մետաբոլոմիկայում, որտեղ առաջնային կարևորություն ունեն հետազոտության ճշգրիտ պլանավորումը, նմուշների մանրակրկիտ նախապատրաստումը, հարթակի օպտիմալացված կարգաբերումը, տվյալների համապարփակ վերլուծությունը և կենսաբանական իմաստալից մեկնաբանությունը։ Մետաբոլոմիկան օգտագործում է ինչպես թիրախային մոտեցումներ, որոնք կենտրոնանում են մոլեկուլների որոշակի դասերի՝ ածխաջրերի, լիպիդների և ամինաթթուների վրա, այնպես էլ ոչ թիրախային մեթոդներ, որոնք տալիս են նմուշի նյութափոխանակային պրոֆիլների լայն ընդհանուր պատկեր՝ բացահայտելով նյութափոխանակային ազդանշանային գործընթացների բազմաշերտ բարդությունը։
UIP400MTP սարքը բազմահոր թիթեղներում բջիջների լիզիսի և մետաբոլիտների էքստրակցիայի համար նախատեսված անհպում, բարձր թողունակությամբ ուլտրաձայնային մշակման սարք է
Նմուշների բարձր թողունակությամբ նախապատրաստում 96 հորով թիթեղների ուլտրաձայնային մշակման UIP400MTP սարքով
Անհպում ուլտրաձայնային մշակման UIP400MTP սարքի օգտագործումը 96 հորով թիթեղների հետ համատեղ արդյունավետ մեթոդ է բարձր թողունակությամբ հոմոգենացման և մետաբոլիտների էքստրակցիայի համար։ Այս համակարգը բացառում է նմուշի հետ անմիջական շփումը՝ նվազեցնելով խաչաձև աղտոտման վտանգը միաժամանակ բազմաթիվ նմուշներ մշակելիս։
Հոմոգենացման քայլ առ քայլ ընթացակարգ 96 հորով թիթեղների ուլտրաձայնային մշակման UIP400MTP սարքով
- Մետաբոլոմիկական նմուշների նախապատրաստում
Նմուշների տեղադրում. Յուրաքանչյուր նմուշը (օրինակ՝ կղանքը, աղիքային հյուսվածքը կամ աղիքի լուսանցքի պարունակությունը) տեղադրեք 96 հորով թիթեղի կամ միկրոթիթեղի առանձին հորերում։
Լուծիչ. Օրգանական լուծիչները, օրինակ՝ մեթանոլը, էթանոլը, ացետոնիտրիլը, քլորոֆորմը և դրանց (ջրային) խառնուրդները, էական նշանակություն ունեն մետաբոլիտների էքստրակցիայի համար՝ նպաստելով ներբջջային մետաբոլիտների ազատմանը բջջային մատրիքսից։ Յուրաքանչյուր հորի համար օգտագործեք 100–300 µL լուծիչ՝ ապահովելով նմուշն ամբողջությամբ ընկղմելու համար բավարար ծավալ։
Ներքին ստանդարտներ. Ըստ ցանկության՝ յուրաքանչյուր հորի մեջ ավելացրեք ներքին ստանդարտներ՝ հետագա մետաբոլոմիկական վերլուծության ընթացքում նորմավորման համար։ - Ուլտրաձայնի փոխանցման միջավայրի նախապատրաստում
Ջրի մակարդակ. 96 հորով թիթեղը տեղադրեք ջրով (ուլտրաձայնի փոխանցման միջավայրով) լցված ուլտրաձայնային մշակման հարթակի վրա՝ ինչպես նկարագրված է ձեռնարկում։ - UIP400MTP սարքի պարամետրերի կարգաբերում
Հզորության կարգավորումներ. Արդյունավետ հոմոգենացման համար ուլտրաձայնային տատանումների ամպլիտուդը կարգավորեք առավելագույն հզորության 50–80%-ի չափով։
Իմպուլսային ռեժիմ. Ուլտրաձայնային մշակման ցիկլը կարգավորեք հերթագայվող իմպուլսներով (օրինակ՝ 30 վայրկյան միացված, 30 վայրկյան անջատված), որպեսզի հնարավոր լինի սառեցումը և կանխվի նմուշների գերտաքացումը։
Ընդհանուր տևողություն. 4–10 րոպե՝ կախված նմուշի բարդությունից և ամրությունից։
Ջերմաստիճանի վերահսկում. Օգտագործեք լաբորատոր սառեցնող սարք՝ ուլտրաձայնային մշակման ընթացքում ջուրը 4–8°C ջերմաստիճանում պահելու և ջերմազգայուն մետաբոլիտները պաշտպանելու համար։ - Ուլտրաձայնային մշակման գործընթաց
Գործարկեք UIP400MTP սարքը՝ ուլտրաձայնային մշակման ցիկլերը կատարելու համար։
Հետևեք գործընթացին UIP400MTP սարքի միջերեսի միջոցով։
Կավիտացիայի ազդեցությունը կհոմոգենացնի նմուշները և հորերում կառաջացնի բջիջների լիզիս՝ ներբջջային մետաբոլիտներն ազատելով լուծիչի մեջ։ - Ուլտրաձայնային մշակումից հետո
Ցենտրիֆուգում. Ուլտրաձայնային մշակումից հետո, անհրաժեշտության դեպքում, թիթեղի պարունակությունը տեղափոխեք հավաքման փորձանոթների մեջ։ Ցենտրիֆուգեք 4 000–6 000 × g պայմաններում 10 րոպե՝ չլուծվող մնացորդներն ու բջջային նյութը նստեցնելու համար։
Վերնստվածքային հեղուկի հավաքում. Յուրաքանչյուր հորից վերնստվածքային հեղուկը զգուշորեն տեղափոխեք նոր փորձանոթների կամ թիթեղների մեջ՝ վերլուծության համար։
Ըստ ցանկության չորացում. Եթե խտացում է պահանջվում, վերնստվածքային հեղուկները չորացրեք վակուումային խտացուցիչով (օրինակ՝ SpeedVac), ապա վերալուծեք համապատասխան լուծիչի փոքր ծավալի մեջ։
Օգտվեք բազմահոր թիթեղների ուլտրաձայնային մշակման UIP400MTP սարքի բարձր թողունակությամբ մշակման հնարավորություններից և դյուրացրեք ձեր մետաբոլոմիկական հետազոտություններն ու վերլուծությունները։
Բարձր թողունակությամբ ուլտրաձայնային մշակման UIP400MTP սարք բազմահոր թիթեղներում, 96 հորով թիթեղներում, փորձանոթներում և Պետրիի թասերում մետաբոլոմիկական հետազոտությունների համար։
Բազմահոր թիթեղների ուլտրաձայնային մշակման UIP400MTP սարք՝ մետաբոլոմիկական հետազոտություններում նմուշների բարձր թողունակությամբ նախապատրաստման համար։
UIP400MTP սարքով անհպում ուլտրաձայնային մշակման սկզբունքը
UIP400MTP սարքն ուլտրաձայնային ալիքներն անուղղակիորեն փոխանցում է 96 փոսիկ ունեցող թիթեղի փոսիկներին՝ փոխանցման միջավայրի (օրինակ՝ ջրի) միջոցով։ Այս ալիքներն առաջացնում են կավիտացիա, որը քայքայում է բջիջները և ազատում մետաբոլիտները՝ առանց ուլտրաձայնային մշակման սարքի զոնդի և նմուշի միջև ֆիզիկական շփման։
«Գրում եմ՝ շնորհակալություն հայտնելու ձեր UIP400MTP ուլտրաձայնային մշակման սարքն օգտագործելիս մեր ունեցած հիանալի փորձի համար՝ կղանքի միկրոբիոմի նմուշներում բակտերիաների միատեսակ և կայուն լիզիս իրականացնելու գործում։ Մենք ընդլայնում ենք բարձր թողունակությամբ լիզիսի տեխնոլոգիայի հնարավորությունների սահմանները, և ձեր սարքը շատ հարմար է այս առաջադրանքի համար։ Հիմնական առավելություններից են՝
- Շահագործման պարզություն – սարքը հեշտ է օգտագործել, իսկ ընտրացանկի տարբերակների միջոցով կարգավորումները հարմարեցնելը պարզ է
- Բարձր թողունակություն – գերազանց է թիթեղների մշակման համար՝ միաժամանակ 96 նմուշով
- Բոլոր անոթների հավասարաչափ ուլտրաձայնային մշակում – սարքը կարողացավ բոլոր փոսիկներում ապահովել նույն չափաբաժնով ուլտրաձայնային մշակում, ինչը վճռորոշ էր մեր կիրառության համար
- Աջակցություն Hielscher ընկերության թիմից – աջակցությունը գերազանց էր. դուք միշտ մեր կողքին էիք՝ ուսուցման ընթացքում, մեր հարցերին պատասխանելու և խնդիրները լուծելու համար՝ առաջարկություններով, որոնք օգնեցին մեզ հասնել մեր նպատակին։
Կրկին շնորհակալություն ձեր օգնության և աջակցության համար, երբ աշխատում էինք օպտիմալացնել մեր ընթացակարգերը»։
Mark D. Driscoll, Ph.D. – գլխավոր գիտական տնօրեն – Intus Biosciences
Բազմափոսիկ թիթեղների համար նախատեսված UIP400MTP ուլտրաձայնային մշակման սարքը հեշտացնում է նմուշների բարձր թողունակությամբ նախապատրաստումը, օրինակ՝ մետաբոլիտների հետազոտության և վերլուծության մեջ։
96 փոսիկ ունեցող թիթեղների համար նախատեսված UIP400MTP ուլտրաձայնային մշակման սարք. ուլտրաձայնը փոխանցող հեղուկը շրջապատում է բոլոր փոսիկները և ապահովում յուրաքանչյուր նմուշի հավասարաչափ ուլտրաձայնային մշակում
Բազմափոսիկ թիթեղների համար նախատեսված UIP400MTP ուլտրաձայնային մշակման սարքի հիմնական առանձնահատկությունները
| Բարձր թողունակությամբ ուլտրաձայնային մշակում | Կատարյալ հարմար լինելով 96 փոսիկ ունեցող և այլ բազմափոսիկ թիթեղների համար՝ UIP400MTP սարքը հնարավորություն է տալիս միաժամանակ և նույն կերպ ուլտրաձայնով մշակել բազմաթիվ նմուշներ՝ զգալիորեն կրճատելով նմուշների նախապատրաստման տևողությունը և մեծացնելով մեծ թվով նմուշների փորձարկման թողունակությունը։ |
| Օգտագործեք ձեր ընտրած բազմափոսիկ թիթեղը | UIP400MTP սարքը նախատեսված է ցանկացած ստանդարտ բազմափոսիկ թիթեղի, PCR թիթեղի կամ միկրոտիտրային թիթեղի ուլտրաձայնային մշակման համար։ Դուք ընտրում եք ձեր փորձերի համար ամենահարմար թիթեղը։ Քանի որ UIP400MTP սարքը չի պահանջում արտադրողին հատուկ ծախսանյութեր, դուք զգալի գումար եք խնայում։ |
| Անկոնտակտ ուլտրաձայնային մշակում | Բազմափոսիկ թիթեղների համար նախատեսված UIP400MTP ուլտրաձայնային մշակման սարքը կիրառում է ինտենսիվ ուլտրաձայն՝ առանց նմուշի մեջ որևէ բան մտցնելու։ Դուք կարող եք ուլտրաձայնով մշակել հերմետիկ փակված բազմափոսիկ թիթեղներ, փակ անոթներ և սրվակներ։ Hielscher ընկերությունը ձեզ տրամադրում է անհատական պատվերով պատրաստված նմուշակալներ՝ ցանկացած ոչ ստանդարտ սրվակների կամ անոթների համար։ |
| Ճշգրտություն և կառավարում | Ճշգրիտ կառավարումը և խելացի ծրագրային ապահովումը հնարավորություն են տալիս ուլտրաձայնային պարամետրերը սահմանել այնպես, որ դրանք լավագույնս համապատասխանեն մշակման ձեր կոնկրետ կարիքներին։ Յուրաքանչյուր փորձի համար դուք ստանում եք ուլտրաձայնային մշակման առավելագույն արդյունավետություն և արդյունավորություն։ |
| Ջերմաստիճանի վերահսկում | Ձեր ուլտրաձայնային մշակման համար սահմանեք որոշակի ջերմաստիճան։ Թիթեղների համար նախատեսված UIP400MTP ուլտրաձայնային մշակման սարքը կարող է վերահսկել նմուշի ջերմաստիճանը և համապատասխանաբար կարգավորել ուլտրաձայնային մշակումը։ Վերաշրջանառվող հովացնող հեղուկը սառեցնում է թիթեղի յուրաքանչյուր փոսիկը՝ ջերմաստիճանի ճշգրիտ վերահսկման համար։ |
| Տվյալների գրանցում և հեռակառավարում | Ուլտրաձայնային մշակման յուրաքանչյուր գործարկում կարելի է կառավարել համակարգչից։ Ծրագրային ապահովման տեղադրում անհրաժեշտ չէ։ Դուք կարող եք օգտագործել ձեր սովորական դիտարկիչը (օրինակ՝ Chrome, Firefox, Edge կամ Safari) ցանկացած օպերացիոն համակարգում (օրինակ՝ MacOS, Windows, Android, iOS կամ Linux)՝ UIP400MTP սարքը հեռավար կառավարելու և վերահսկելու համար։ Ուլտրաձայնային մշակման յուրաքանչյուր գործարկման արդյունքում ստեղծվում է մշակման մանրամասն հաշվետվություն՝ գնահատման և փաստաթղթավորման համար։ Հաշվետվության ֆայլը բաց CSV ձևաչափով է, որը կարող եք բացել ձեր նախընտրած ծրագրով, օրինակ՝ Microsoft Excel, Apple Numbers կամ OpenOffice Calc։ |
| Ամուր և հուսալի | Գերմանիայում որակի ամենաբարձր չափանիշներով նախագծված և արտադրված UIP400MTP սարքը ոչ միայն հզոր է, այլև առանձնահատուկ դիմացկուն։ Դրա կառուցվածքը համապատասխանում է արդյունաբերական ստանդարտներին և հեշտությամբ դիմակայում է խիստ պահանջներով լաբորատոր միջավայրում ամենօրյա օգտագործման ծանրաբեռնվածությանը։ Դուք կարող եք UIP400MTP սարքն անընդհատ օգտագործել օրական 24 ժամ, շաբաթական 7 օր՝ բարձր թողունակությամբ աշխատանքներում։ |
- բարձր արդյունավետություն
- ամենաարդիական տեխնոլոգիա
- հուսալիություն և ամրություն
- գործընթացի կարգավորելի, ճշգրիտ կառավարում
- խելացի ծրագրային ապահովում
- խելացի գործառույթներ (օրինակ՝ ծրագրավորման հնարավորություն, տվյալների գրանցում, հեռակառավարում)
- հեշտ և անվտանգ շահագործում
- տեխնիկական սպասարկման ցածր պահանջներ
- CIP (մաքրում տեղում)
Նախագծում, արտադրություն և խորհրդատվություն – Գերմանիայում ստեղծված որակ
Hielscher ուլտրաձայնային սարքերը հայտնի են որակի և նախագծման իրենց ամենաբարձր չափանիշներով։ Ամրությունն ու շահագործման դյուրինությունը թույլ են տալիս մեր ուլտրաձայնային սարքերը սահուն ինտեգրել արդյունաբերական կայանքներում։ Hielscher ուլտրաձայնային սարքերը հեշտությամբ դիմանում են ծանր պայմաններին և խիստ պահանջներ ներկայացնող միջավայրերին։
Hielscher Ultrasonics ընկերությունն ունի ISO հավաստագրում և հատուկ ուշադրություն է դարձնում ժամանակակից տեխնոլոգիայով ու օգտագործման դյուրինությամբ առանձնացող բարձր արտադրողականությամբ ուլտրաձայնային սարքերին։ Իհարկե, Hielscher ուլտրաձայնային սարքերը համապատասխանում են CE պահանջներին և բավարարում են UL, CSA և RoHs պահանջները։
UIP400MTP անկոնտակտ ուլտրաձայնային մշակման սարք միկրոպլանշետներում մետաբոլոմային նմուշապատրաստման համար։
Գրականություն / Հղումներ
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation — English version — Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten — deutsch — Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator — Non-Contact Sonicator — Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Հաճախ տրվող հարցեր մետաբոլոմային հետազոտությունների մասին
Ի՞նչ է միկրոբիոմը։
Միկրոբիոմը որոշակի միջավայրում, օրինակ՝ մարդու մարմնում բնակվող միկրոօրգանիզմների, այդ թվում՝ բակտերիաների, վիրուսների, սնկերի և արքեաների ամբողջական համայնքն է՝ նրանց գենետիկական նյութի հետ միասին։ Այն առանցքային դերեր է կատարում հյուրընկալ օրգանիզմի առողջության պահպանման գործում՝ ազդելով նյութափոխանակության, իմունային գործառույթի և ախտածիններից պաշտպանության վրա, միաժամանակ ձևավորվելով այնպիսի գործոնների ազդեցությամբ, ինչպիսիք են սննդակարգը, կենսակերպը և շրջակա միջավայրը։
Ի՞նչ է մետաբոլոմիկան։
Մետաբոլոմիկան մետաբոլիտների համապարփակ ուսումնասիրությունն է. դրանք փոքր մոլեկուլներ են, որոնք առաջանում են կենսաբանական համակարգի ներսում ընթացող նյութափոխանակային գործընթացների ժամանակ։ Այն ներառում է այդ մոլեկուլների նույնականացումը, քանակական որոշումը և վերլուծությունը՝ հասկանալու բջջային գործառույթները, նյութափոխանակային ուղիները և դրանց արձագանքը գենետիկական, շրջակա միջավայրի կամ ախտաբանական փոփոխություններին։
Ի՞նչ է մետաբոլոմը։
Մետաբոլոմը տվյալ պահին կենսաբանական համակարգում, օրինակ՝ բջջում, հյուսվածքում կամ օրգանիզմում առկա փոքր մոլեկուլների՝ մետաբոլիտների ամբողջական հավաքածուն է։ Այն արտացոլում է համակարգի կենսաքիմիական ակտիվությունն ու ֆիզիոլոգիական վիճակը՝ պատկերացում տալով նյութափոխանակության և շրջակա միջավայրի հետ դրա փոխազդեցությունների մասին։
Hielscher Ultrasonics ընկերությունն արտադրում է բարձր արտադրողականությամբ ուլտրաձայնային հոմոգենիզատորներ՝ լաբորատոր չափերից մինչև արդյունաբերական չափեր։