Protokoll för MBEC-analys med ultraljudsapparaten UIP400MTP för 96-brunnsplattor
MBEC-analysen används för att bestämma den koncentration av antimikrobiella medel som behövs för att eliminera biofilmer som bildats på stiftlock. För att bedöma biofilmernas viabilitet måste biofilmerna först lossas från stiftlocken på en 96-brunnsplatta. Ultraljudsbehandling är den mest tillförlitliga och effektiva metoden för denna lösgöring. Ultraljudsapparaten UIP400MTP för flerbrunnsplattor är särskilt utformad för att behandla analysplattor med maximal effektivitet och användarvänlighet, vilket effektiviserar och påskyndar MBEC-analyser med hög provgenomströmning.
Ultraljudsbehandling för lösgöring av biofilm
Ultraljudsbehandling är ett avgörande steg i analyser av minsta biofilmeradikerande koncentration (MBEC), eftersom den möjliggör effektiv lösgöring av biofilmsceller från ytan där de sitter fast. Biofilmer är till sin natur strukturerade samhällen av mikroorganismer inneslutna i en extracellulär matris, vilket gör dem betydligt mer motståndskraftiga mot antimikrobiella medel än planktoniska celler. Vid MBEC-analyser används ultraljudsvågor för att skapa kontrollerad kavitation, som bryter upp biofilmsmatrisen och frigör inbäddade celler till en suspension. Detta steg säkerställer att biofilmscellerna fördelas jämnt i återhämtningsmediet, vilket underlättar noggranna viabilitetsbedömningar genom utplattning, spädning eller spektrofotometriska metoder. Om biofilmen inte lossas ordentligt kan kvarvarande matriskomponenter skydda cellerna, vilket kan leda till att de antimikrobiella medlens effekt underskattas. Därför är ultraljudsbehandling oumbärlig för att erhålla tillförlitliga och reproducerbara MBEC-värden som återspeglar de testade medlens verkliga eradikeringsförmåga. Ultraljudsapparaten UIP400MTP för flerbrunnsplattor möjliggör enkel provberedning med hög provgenomströmning i analysplattor.
Ultraljudsapparaten UIP400MTP för flerbrunnsplattor underlättar provberedning med hög provgenomströmning i analysplattor.
Analysprotokoll för minsta biofilmeradikerande koncentration (MBEC)
Steg 1: Biofilmsbildning
- Förbered bakteriesuspensionen:
Odla bakterier i lämpliga medier tills de befinner sig i logaritmisk tillväxtfas.
Späd bakteriekulturen till en definierad optisk densitet (t.ex. OD600 ~0,1). - Inokulera 96-brunnsplattan:
Tillsätt bakteriesuspensionen (t.ex. 150–200 µL) i varje brunn i en standardmikrotiterplatta med 96 brunnar. - Sätt på stiftlocket:
Placera stiftlocket på den inokulerade plattan så att biofilm kan bildas på stiftens ytor. - Inkubera plattan:
Inkubera uppställningen vid lämplig temperatur (t.ex. 37°C) i 24–48 timmar utan skakning för att främja biofilmstillväxt.
Steg 2: Behandling med antimikrobiella medel
- Förbered antimikrobiella lösningar:
Förbered en serie koncentrationer av antimikrobiella medel i färska medier.
Exponera biofilmerna för antimikrobiella medel:
Ta bort stiftlocket från bakteriekulturen och skölj det i steril koksaltlösning eller PBS för att avlägsna planktoniska celler.
Placera stiftlocket i en ny 96-brunnsplatta som innehåller de antimikrobiella lösningarna. - Inkubera plattan:
Inkubera under en definierad tidsperiod (t.ex. 24 timmar) för att låta de antimikrobiella medlen verka.
Ultraljudsapparaten UIP400MTP för flerbrunnsplattor för provberedning med hög provgenomströmning
Steg 3: Ultraljudsbehandling med ultraljudsapparaten UIP400MTP för 96-brunnsplattor
Ultraljudssteget är avgörande för att lossa biofilmer från stiftlocken så att viabiliteten kan bedömas. Följ dessa steg för ultraljudsapparaten UIP400MTP:
- Förbered uppställningen:
Fyll varje brunn i en ny 96-brunnsplatta med återhämtningsmedium (t.ex. neutraliserande buljong eller färskt odlingsmedium). - Flytta stiftlocket:
Ta bort stiftlocket från plattan för antimikrobiell behandling.
Skölj stiftlocket i steril koksaltlösning eller PBS för att avlägsna kvarvarande antimikrobiella medel. - Placera plattan och ultraljudsapparaten:
Sätt stiftlocket på plattan med återhämtningsmedium.
Placera plattan med återhämtningsmedium på ultraljudsapparaten UIP400MTP:s plattform och se till att plattan är centrerad och står stabilt. - Justera ultraljudsparametrarna:
Ställ in ultraljudsparametrarna på UIP400MTP (inställningarna kan anpassas till biofilmen):
Amplitud: 70–100%.
Ultraljudsbehandlingstid: 1–3 minuter (anpassa efter biofilmens motståndskraft) i cykelläge. - Ultraljudsbehandla:
Starta ultraljudsbehandlingen. Ultraljudsvibrationerna lossar biofilmerna från stiftens ytor så att de hamnar i återhämtningsmediet. - Övervaka processen:
Använd den anslutningsbara temperatursensorn för att övervaka provtemperaturen i brunnarna. UIP400MTP kan anslutas till en laboratoriekylare för kylning. - Hantering efter ultraljudsbehandling:
Överför omedelbart återhämtningsmediet (som nu innehåller lossade biofilmer) till en ny steril platta för efterföljande analys.
(A) Platta med TSB med 2% glukos som används för biofilmsbildning, återvinning av celler och
bestämning av MIC och MBCB; (B) Lock med stift för bildning av stafylokockbiofilmer. bestämning av MIC och MBCB; (B) Lock med stift för bildning av stafylokockbiofilmer.
Biofilmscellerna som bildats på stiften lossades genom ultraljudsbehandling (Hielscher Ultrasound Technology) i 5 min i 96-brunnsplattor med färskt odlingsmedium för återvinning av cellerna.
(Bild och studie: ©de Oliveira et al., 2016)
Steg 4: Viabilitetsbedömning
Platta ut och odla lossade biofilmer:
- Gör seriespädningar av återhämtningsmediet och platta ut på agar för att räkna kolonibildande enheter (CFU).
Använd alternativt en kolorimetrisk eller fluorescensbaserad viabilitetsanalys. - Registrera resultaten:
Bestäm MBEC som den lägsta koncentrationen av ett antimikrobiellt medel som eliminerade all detekterbar viabilitet i biofilmen.
Konstruktion, tillverkning och rådgivning – kvalitet tillverkad i Tyskland
Hielschers ultraljudsapparater är välkända för sina högsta standarder inom kvalitet och konstruktion. Robusthet och enkel användning gör att våra ultraljudsapparater smidigt kan integreras i industrianläggningar. Hielschers ultraljudsapparater klarar enkelt tuffa förhållanden och krävande miljöer.
Hielscher Ultrasonics är ett ISO-certifierat företag och lägger särskild vikt vid högpresterande ultraljudsapparater med den senaste tekniken och hög användarvänlighet. Hielschers ultraljudsapparater är självklart CE-kompatibla och uppfyller kraven i UL, CSA och RoHs.
Effektivisera provberedningen i 96-brunnsplattor och analysplattor med ultraljudsapparaten UIP400MTP för flerbrunnsplattor
Litteratur / Referenser
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Microplate Sonicator Validated in Peer-Reviewed Proteomics Study
Vanliga frågor
Vad är MBEC-analysen?
Analysen av minsta biofilmeradikerande koncentration (MBEC) är en standardiserad metod som används för att bestämma den lägsta koncentration av ett antimikrobiellt medel som krävs för att eradikera biofilmsassocierade bakterier. Den innebär att biofilmer odlas på särskilda ytor, exponeras för olika koncentrationer av antimikrobiella medel och att de lossade cellernas viabilitet bedöms efter att biofilmen brutits upp, vanligtvis genom ultraljudsbehandling, för att utvärdera behandlingens effekt.
Vad är skillnaden mellan MBIC och MBEC?
Minsta biofilmhämmande koncentration (MBIC) är den lägsta koncentration av ett antimikrobiellt medel som krävs för att förhindra biofilmsbildning, medan minsta biofilmeradikerande koncentration (MBEC) är den lägsta koncentration som behövs för att eradikera en etablerad biofilm. MBIC fokuserar på att förebygga biofilm, medan MBEC bedömer behandlingens effekt mot mogna biofilmer.
Vilka plattor används vanligen för MBEC-analyser?
Mikrotiterplattor som vanligen används för MBEC-analyser är vanligtvis 96-brunnsplattor tillverkade av polystyren eller polypropen. Dessa material ger en lämplig yta för biofilmsbildning och är kemiskt beständiga mot de antimikrobiella medel som testas under analysen. Polystyrenplattor föredras i stor utsträckning på grund av sin optiska klarhet, vilket är fördelaktigt för efterföljande analyser såsom spektrofotometriska eller fluorescensbaserade mätningar. Dessa plattor har avtagbara stiftlock, som är nödvändiga för analysen eftersom biofilmer bildas på stiften som är nedsänkta i brunnarna med odlingsmedier. Standardiserade plattor, såsom de som uppfyller kraven i MBEC-analysprotokollet, är särskilt konstruerade för att säkerställa reproducerbarhet och kompatibilitet med ultraljudsapparaten UIP400MTP eller annan behandlingsutrustning.
Vad är plattor med PEG-lock?
Plattor med PEG-lock är specialiserade system med flerbrunnsplattor där locket är utrustat med små tappar eller stift av polyetylenglykol (PEG) som sträcker sig ned i varje brunn. Dessa stift ger en yta för mikrobiell biofilmsbildning under kontrollerade förhållanden och efterliknar biofilmstillväxt i verkliga miljöer. Konstruktionen gör att biofilmer kan utvecklas på stiften medan brunnarna innehåller odlingsmedier eller antimikrobiella medel, vilket möjliggör testning med hög provgenomströmning av biofilmers känslighet för behandlingar, såsom i MBEC- och MBIC-analyser.
Hielscher Ultrasonics tillverkar högpresterande ultraljudshomogenisatorer från laboratoriestorlek till industriell storlek.