Modul în care sonicarea poate supraîncărca lizozima pentru liza celulelor bacteriene
, Kathrin Hielscher, publicat în Hielscher News
Desfacerea celulelor bacteriene este o etapă esențială în biotehnologie, cercetarea farmaceutică și producția de proteine. Unul dintre cele mai comune instrumente pentru această sarcină este lizozimul, o enzimă care slăbește pereții celulari bacterieni. Dar, deși lizozimul este eficient, de multe ori nu este suficient de rapid sau de puternic pe cont propriu – în special atunci când este vorba de culturi dense sau de bacterii modificate pentru a supraexprima proteine.
Aici intervine sonicizarea. Cercetătorii se bazează din ce în ce mai mult pe prelucrarea cu ultrasunete pentru a îmbunătăți dramatic liza celulară bazată pe lizozimă. Atunci când sunt utilizate împreună, lizozima și sonicarea formează un sistem complementar extrem de eficient, care oferă rezultate mai rapide, mai complete și mai reproductibile.
De ce lizozima singură este adesea insuficientă
Lizozima acționează prin descompunerea peptidoglicanului, o componentă structurală cheie a pereților celulari bacterieni. Această abordare enzimatică este delicată și utilizată pe scară largă, în special pentru E. coli. Cu toate acestea, în condiții reale de laborator, numai tratamentul cu lizozimă poate fi limitativ.
Provocările comune includ:
- Întreruperea incompletă a celulelor în culturi cu densitate mare sau agregate
- Perioade lungi de incubare
- Eficacitate redusă în bacteriile supraexprimate sau adaptate la stres
- Variabilitatea de la un lot la altul
Aceste limitări pot avea un impact negativ asupra proceselor din aval, cum ar fi extracția, clarificarea și purificarea proteinelor, reducând astfel randamentul și consistența.
Știința din spatele sinergiei Lysozyme-Sonication
Sonicarea introduce unde ultrasonice de mare intensitate într-o probă lichidă. Aceste unde generează bule microscopice care se prăbușesc rapid într-un proces cunoscut sub numele de cavitare. Forțele de forfecare, schimbările de presiune și microjeturile rezultate perturbă fizic structurile celulare.
Atunci când sonicarea este aplicată după - sau alături de - tratamentul enzimatic, cele două metode se consolidează reciproc în mai multe moduri importante:
- Acces mai ușor la peretele celular
Lizozima slăbește peretele celular bacterian, făcându-l mult mai vulnerabil la forțele mecanice create de ultrasunete. - Liza celulară mai rapidă
Energia ultrasonică scurtează dramatic timpul necesar pentru a obține distrugerea completă a celulelor în comparație cu tratamentul enzimatic singur. - Procesare mai uniformă
Sonicarea îmbunătățește amestecarea, asigurând că toate celulele sunt expuse în mod constant atât la lizozimă, cât și la stres mecanic. - Producții mai mari de proteine
O liză mai completă înseamnă o eliberare mai mare de proteine intracelulare, enzime și metaboliți - îmbunătățind recuperarea generală.
O procedură tipică de sonicare asistată de lizozimă
În laboratoarele care lucrează cu tulpini bacteriene supraexprimate, un flux de lucru bine stabilit combină liza enzimatică și ultrasonică:
- Resuspensie celulară
Peleții bacterieni recoltați sunt resuspendați într-un tampon de liză adecvat care conține lizozimă, de obicei la concentrații de 0,1-1 mg/mL. Sonicarea ușoară favorizează o resuspensie rapidă și uniformă a celulelor. - Pretratament enzimatic
Suspensia este incubată timp de 10-30 de minute la temperaturi controlate (de obicei între 4 °C și 25 °C), permițând lizozimei să slăbească peretele celular. - Perturbare cu ultrasunete
Suspensia pretratată este sonicată utilizând un procesor cu ultrasunete Hielscher, cu amplitudine, mod de puls și răcire optimizate. - Clarificare
Resturile celulare sunt îndepărtate prin centrifugare sau filtrare, lăsând un lizat clarificat bogat în proteine țintă.
De ce aleg cercetătorii Sonicatoarele Hielscher
Datorită preciziei și flexibilității lor, ultrasunetele Hielscher sunt deosebit de potrivite pentru liza celulară asistată de lizozimă. Principalele avantaje includ:
- Amplitudine reglabilă și intrare de energie pentru procesare reproductibilă
- Funcționare în modul puls pentru a reduce acumularea de căldură
- Cavitație eficientă într-o gamă largă de volume și vâscozități
- Scalabilitate ușoară de la probe de laborator de microlitri la producție industrială
Această combinație face din sistemele Hielscher instrumente valoroase atât în laboratoarele de cercetare, cât și în mediile de producție la scară largă.
Sonicator cu plăci cu mai multe godeuri UIP400MTP pentru prepararea probelor cu randament ridicat
Factori cheie pentru optimizarea rezultatelor
Pentru a profita la maximum de sonicarea asistată de lizozimă, cercetătorii reglează cu atenție mai mulți parametri:
- Concentrația de lizozimă: Utilizați cea mai mică doză eficientă pentru a controla costurile și a minimiza interferențele în aval.
- Energie ultrasonică: Aplicați suficientă putere pentru a asigura o liză completă fără a deteriora proteinele sensibile.
- Gestionarea temperaturii: Sistemele de răcire sau băile de gheață ajută la protejarea țintelor sensibile la căldură.
- Setări puls: Sonicarea intermitentă îmbunătățește eficiența cavitării și stabilitatea probei.
Stimulați lizozimele cu sonicare!
Combinarea lizozimei cu disrupția ultrasonică oferă o soluție fiabilă, de înaltă performanță pentru liza celulelor bacteriene. Sonicarea sporește eficiența tratamentului enzimatic, oferind o procesare mai rapidă, o disoluție mai completă și randamente mai mari de produse intracelulare.
Cu ajutorul sistemelor ultrasonice precis controlabile și scalabile, precum cele de la Hielscher, cercetătorii își pot ajusta fluxurile de lucru pentru a răspunde cerințelor biotehnologiei moderne – fie într-un laborator mic sau într-o linie de producție industrială.
Liza bacteriilor la mare viteză cu sonicatorul de microplăci UIP400MTP
Literatură / Referințe
- Ghosh, A., Bhar, K. & Siddhanta, A. (2019): Oxygen sequestration by Leghemoglobin is positively regulated via its interaction with another late nodulin, Nlj16 of Lotus japonicus. Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology 28, 2019. 414–423.
- Hannah K. Lembke; Adeline Espinasse; Mckenna G. Hanson; Christian J. Grimme;Zhe Tan; Theresa M. Reineke; Erin E. Carlson (2023): Cationic Polymers Enable Internalization of Negatively Charged Chemical Probes into Bacteria. ACS Chem Biol . 2023 September 15; 18(9): 2063–2072.
- Müller MRA, Ehrmann MA, Vogel RF (2000): Multiplex PCR for the Detection ofLactobacillus pontis and Two Related Species in a Sourdough Fermentation. Applied Environmental Microbiology 66, 2000.
- Di Giosia, Matteo; Bomans, Paul; Bottoni, Andrea; Cantelli, Andrea; Falini, Giuseppe; Franchi, Paola; Guarracino, Giuseppe; Friedrich, Heiner; Lucarini, Marco; Paolucci, Francesco; Rapino, Stefania; Sommerdijk, Nico; Soldà, Alice; valle, Francesco ; Zerbetto, Francesco; Calvaresi, Matteo (2018): Proteins as Supramolecular Hosts for C60: A True Solution of C60 in Water. Nanoscale 10(21); 2018.
Întrebări frecvente
Ce sunt lizozimele?
Lizozimele sunt enzime antimicrobiene care catalizează hidroliza legăturilor glicozidice β(1→4) din peptidoglican, o componentă structurală cheie a pereților celulari bacterieni, ducând la slăbirea peretelui celular și liză, în special la bacteriile Gram-pozitive și celulele Gram-negative permeabilizate.
Care sunt avantajele și limitările lizei celulare cu ajutorul lizozomilor?
Liza celulară cu ajutorul lizozomelor oferă avantaje precum condiții de reacție blânde, conservarea funcționalității proteinelor și stres mecanic redus, dar este limitată de o cinetică lentă, liză incompletă în culturi bacteriene dense sau rezistente, eficacitate redusă împotriva membranelor externe Gram-negative intacte și variabilitate în funcție de fiziologia celulară și condițiile de creștere.
Cum se intensifică lizozimele prin sonicare?
Sonicarea intensifică activitatea lizozimei prin întreruperea mecanică și permeabilizarea pereților celulari bacterieni prin forțe de forfecare induse de cavitație, ceea ce crește accesul enzimei la peptidoglican, accelerează cinetica lizei și duce la o întrerupere celulară mai completă și mai omogenă.


