استبدل كشط الخلايا بجهاز المعالجة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP ذي معدل معالجة العينات المرتفع
يُعد فصل خطوط الخلايا الملتصقة واستخلاصها من الصفائح متعددة الآبار لإجراء التحليل متعدد الأوميكس مهمة يومية في المختبرات. ويحل فصل الخلايا بمعدل مرتفع باستخدام جهاز معالجة الصفائح متعددة الآبار بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP محل كشط الخلايا يدويًا، مما يؤدي إلى مردود أعلى من RNA والدهون الكلية والمستقلبات القطبية الكلية. وتدمج طريقة جديدة جهاز المعالجة بالموجات فوق الصوتية Hielscher UIP400MTP مع محطة العمل Beckman Coulter i7 لمناولة السوائل، مما يتيح معالجة الخلايا بكفاءة وبمعدل مرتفع وقابلية لتكرار النتائج لاستخلاص RNA والمستقلبات والدهون. وتتفوق الطريقة المعروضة على طرق كشط الخلايا اليدوية التقليدية بتحقيق قابلية أفضل لتكرار النتائج ومردود أعلى عبر أنواع مختلفة من الخلايا والظروف التجريبية.
بسّط فصل الخلايا باستخدام جهاز معالجة الصفائح الدقيقة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP
تؤدي أنظمة زراعة الخلايا الملتصقة دورًا حاسمًا في أبحاث علم السموم والطب الحيوي. وفي هذا السياق، تناول Cruchley-Fuge وآخرون (2024) تحديًا مهمًا في مشروع PrecisionTox الذي يركز على استخدام تقنيات الأوميكس لتقييم مخاطر المواد الكيميائية. واستهدف المشروع تحليل آلاف العينات المعالجة بمواد كيميائية متنوعة بمعدل معالجة مرتفع. ولتلبية هذا الطلب، طوّر الباحثون سير عمل آليًا يجمع جهاز المعالجة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP مع بروتوكولات استخلاص ثنائي الطور معتمدة لإجراء التحليل بالاستشراب السائل المقترن بمطيافية الكتلة (LC-MS). وتقيّم دراستهم فعالية جهاز معالجة الصفائح متعددة الآبار بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP في فصل الخلايا الملتصقة مقارنةً بالكشط اليدوي وغيره من الطرق التقليدية.
تبسيط التحليل متعدد الأوميكس: الاستخلاص الآلي للخلايا الملتصقة باستخدام UIP400MTP
استخدم فريق الباحثة Laura Cruchley-Fuge من جامعة برمنغهام ثلاثة خطوط خلايا بشرية: HepG2 (خلايا سرطان الكبد)، وHepaRG (خلايا متمايزة شبيهة بالخلايا الكبدية)، وH295R (خلايا سرطان الغدة الكظرية). وزُرعت هذه الخلايا في صفائح ذات 24 بئرًا و96 بئرًا، وعُرّضت لمواد كيميائية اختبارية مثل الأفلاتوكسين B1 والفورسكولين.
التصميم التجريبي:
- المرحلة 1: تحسين إعدادات قدرة جهاز المعالجة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP ومقارنتها بكشط الخلايا يدويًا والحمامات المائية بالموجات فوق الصوتية. واستُخدمت خلايا HepG2 لتقييم استرجاع RNA والمستقلبات والدهون.
- المرحلة 2: دمج UIP400MTP في سير عمل للاستخلاص ثنائي الطور باستخدام نظام Beckman Coulter i7. وأُجري التحقق باستخدام خلايا HepaRG وH295R.
سير عمل الاستخلاص: شمل سير العمل التعريض للمواد الكيميائية في الصفائح متعددة الآبار، وفصل الخلايا باستخدام UIP400MTP، والاستخلاص ثنائي الطور بطريقة Bligh & Dyer (B&D). وأُجري تحليل LC-MS باستخدام جهاز Thermo Scientific Orbitrap Exploris 120 للمركبات المحبة للدهون والقطبية. وتتضمن طريقة B&D، التي تُعد معيارًا ذهبيًا للتقدير الكمي للدهون، استخلاصًا على خطوتين باستخدام الميثانول والكلوروفورم والماء، يليه التقدير الكمي للدهون في طور الكلوروفورم.
يسهّل جهاز معالجة الصفائح الدقيقة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP فصل خطوط الخلايا الملتصقة من الصفائح متعددة الآبار وأطباق بتري
النتائج:
- المرحلة 1: حُددت الظروف المثلى للمعالجة بالموجات فوق الصوتية عند قدرة 60%.
حقق UIP400MTP أعلى استرجاع لـ RNA مع قابلية استثنائية لتكرار النتائج مقارنةً بالكشط اليدوي والحمامات بالموجات فوق الصوتية.
كان استرجاع المستقلبات القطبية متسقًا بين الطرق، بينما كان استرجاع الدهون أفضل بصورة ملحوظة باستخدام UIP400MTP. - المرحلة 2: أظهر التحقق على خلايا HepaRG وH295R قابلية عالية لتكرار النتائج في بيانات أوميكس الدهون وأوميكس المستقلبات، كما دلّ على ذلك التجمع المتقارب لقيم PCA.
وجرى التمييز بفعالية بين المعالجات بالأفلاتوكسين B1 والفورسكولين والعينات الضابطة، مما يؤكد حساسية الطريقة وموثوقيتها.
جهاز معالجة الصفائح الدقيقة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP لفصل الخلايا بمعدل معالجة مرتفع
“يوفر جهاز المعالجة بالموجات فوق الصوتية Hielscher UIP400MTP نهجًا بديلًا عالي الجودة وقابلًا لتكرار النتائج عن «المعيار الذهبي» المتمثل في كشط الخلايا يدويًا، مما يؤدي إلى مردود أعلى من RNA والدهون الكلية والمستقلبات القطبية الكلية.” (Cruchley-Fuge et al., 2024)
يسلط Cruchley-Fuge وآخرون الضوء على مزايا جهاز المعالجة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP في معالجة الخلايا الملتصقة. ومن خلال استبدال الكشط اليدوي، تعزز هذه الطريقة قابلية تكرار النتائج ومعدل معالجة العينات والمردود، مما يجعلها أداة بالغة القيمة للدراسات واسعة النطاق مثل PrecisionTox. ولا يقتصر دمج UIP400MTP في مسارات العمل الآلية على تقليل التباين، بل يبسّط أيضًا العمليات التي تتطلب جهدًا يدويًا مكثفًا، مما يتيح الحصول على بيانات عالية الجودة للتحليل متعدد الأوميكس.
يسهّل عمل Cruchley-Fuge وآخرين (2024) معالجة مزارع الخلايا الملتصقة للتحليل متعدد الأوميكس ويبسّطها. ويضمن دمج جهاز المعالجة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP مع مسارات العمل الآلية تحضيرًا متسقًا وفعالًا للعينات، مما يجعله مناسبًا بصورة مثالية لأبحاث علم السموم ذات معدل معالجة العينات المرتفع.
التصميم والتصنيع والاستشارات – جودة صُنعت في ألمانيا
تشتهر أجهزة المعالجة بالموجات فوق الصوتية من Hielscher بأعلى معايير الجودة والتصميم. وتتيح المتانة وسهولة التشغيل دمج أجهزتنا للمعالجة بالموجات فوق الصوتية بسلاسة في المنشآت الصناعية. وتتعامل أجهزة المعالجة بالموجات فوق الصوتية من Hielscher بسهولة مع الظروف القاسية والبيئات المتطلبة.
شركة Hielscher Ultrasonics حاصلة على شهادة ISO، وتولي اهتمامًا خاصًا بأجهزة المعالجة بالموجات فوق الصوتية عالية الأداء التي تتميز بأحدث التقنيات وسهولة الاستخدام. وبالطبع، تتوافق أجهزة المعالجة بالموجات فوق الصوتية من Hielscher مع CE وتلبي متطلبات UL وCSA وRoHs.
المؤلفات / المراجع
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
الأسئلة الشائعة
ما المقصود بفصل الخلايا؟
يشير فصل الخلايا في الأبحاث إلى عملية فصل الخلايا الملتصقة عن سطح وعاء الزراعة أو الركيزة. ويُجرى ذلك عادةً لجمع الخلايا لاستخدامها في تطبيقات لاحقة مثل التحليل أو الزراعة الفرعية أو الحفظ بالتبريد. ويمكن تحقيق الفصل باستخدام طرق إنزيمية (مثل التربسين)، أو عوامل كيميائية (مثل EDTA)، أو طرق ميكانيكية (مثل الكشط)، أو تقنيات فيزيائية مثل المعالجة بالموجات فوق الصوتية، بحسب نوع الخلايا ومتطلبات البحث.
كيف تُفصل الخلايا الملتصقة؟
يتضمن فصل الخلايا الملتصقة باستخدام المعالجة بالموجات فوق الصوتية تطبيق موجات فوق صوتية مركزة لتفكيك التصاق الخلايا بالسطح ضمن بيئة مضبوطة. ويحقق جهاز معالجة الصفائح الدقيقة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP ذلك تحديدًا بتوليد اهتزازات ميكانيكية موضعية تفك الروابط بين الخلايا وسطح الزراعة. وتشمل الخطوات الأساسية:
- التحضير: تُنمّى الخلايا في صفائح متعددة الآبار، وقد تُعرّض لمواد كيميائية محددة كجزء من التصميم التجريبي.
- المعالجة بالموجات فوق الصوتية: يُبرمج جهاز المعالجة بالموجات فوق الصوتية UIP400MTP بإعدادات محسّنة (مثل قدرة 60%) لضمان الفصل الفعال دون إتلاف الخلايا أو المساس بسلامة الجزيئات الحيوية.
- التحكم في درجة الحرارة: يحافظ الجهاز على ثبات درجة الحرارة لمنع تدهور الخلايا أو الجزيئات الناجم عن الحرارة أثناء العملية.
- ما بعد الفصل: تُخضع الخلايا المفصولة لبروتوكولات استخلاص لاحقة، مثل طريقة Bligh & Dyer ثنائية الطور، لاسترجاع RNA والدهون والمستقلبات.
تتفوق هذه الطريقة على الكشط اليدوي بفضل أتمتتها وقابليتها لتكرار النتائج وقدرتها على معالجة العينات بكفاءة وبمعدل مرتفع.
ما المقصود بفصل الخلايا دون إتلافها؟
يشير فصل الخلايا دون إتلافها إلى عملية فصل الخلايا الملتصقة عن ركيزتها دون المساس بحيويتها أو سلامتها أو وظائفها. ويُحقق ذلك باستخدام طرق لطيفة مثل المعالجة المضبوطة بالموجات فوق الصوتية أو المحاليل الخالية من الإنزيمات.
ويُعد تجنب تدمير الخلايا أمرًا حاسمًا للحفاظ على خصائصها البنيوية والجزيئية، وهي خصائص ضرورية لدقة التطبيقات اللاحقة مثل التحليل متعدد الأوميكس أو الاختبارات الوظيفية أو الاستخدام العلاجي. وقد تطلق الخلايا المتضررة محتوياتها الداخلية، مما قد يربك النتائج التجريبية أو يخل بجودة العينات.
ما ميزة فصل الخلايا دون إنزيمات؟
يوفر فصل الخلايا دون إنزيمات عدة مزايا، منها الحفاظ على بروتينات سطح الخلية ومستقبلاتها، والحفاظ على حيوية الخلايا، وتجنب التلف الإنزيمي المحتمل للجزيئات الحيوية. ويُعد هذا النهج مفيدًا بصورة خاصة للتطبيقات اللاحقة الحساسة، مثل قياس التدفق الخلوي أو أوميكس البروتينات أو الاختبارات الوظيفية، التي قد تخل فيها التغيرات الإنزيمية بجودة البيانات أو النتائج التجريبية. إضافةً إلى ذلك، غالبًا ما تكون الطرق الخالية من الإنزيمات أكثر قابلية لتكرار النتائج، ويمكن تكييفها لمسارات عمل ذات معدل معالجة عينات مرتفع.
تصنّع Hielscher Ultrasonics مجانسات بالموجات فوق الصوتية عالية الأداء بأحجام تتراوح من الحجم المخبري إلى الحجم الصناعي.

