أبحاث الميكروبيوم والتحليل السريري مبسطة بواسطة Sonication
Sonication هي تقنية قوية تستخدم على نطاق واسع في أبحاث الميكروبيوم والتحليل السريري لتسهيل إعداد عينة عالية الإنتاجية. طريقة الموجات فوق الصوتية فعالة بشكل خاص لمعالجة العينات البيولوجية المعقدة ، مثل تلك التي تحتوي على الكائنات الحية الدقيقة. استخدام صوتنة يسهل تحلل الخلايا، واستخراج وتحليل الأحماض النووية، والبروتينات، والمستقلبات، مما يتيح فهم أعمق للمجتمعات الميكروبية وأدوارها في الصحة والمرض. تشتهر صوتيات Hielscher عالية الإنتاجية بدقتها وكفاءتها ونتائجها القابلة للتكرار ، مما يجعلها خيارا ممتازا لدراسات الميكروبيوم.
استفد من الصوتنة عالية الإنتاجية في أبحاث الميكروبيوم
سونيكاتور لوحة 96 بئر UIP400MTP يبسط أبحاث الميكروبيوم عن طريق تحضير عينات عالية الإنتاجية
تحضير العينات عالي الإنتاجية باستخدام جهاز Sonic UIP400MTP ator ذو 96 بئرا
تطبيقات الصوتنة في أبحاث الميكروبيوم
تحلل الخلية الفعال
Sonication فعال للغاية في تحلل الخلايا الميكروبية ، بما في ذلك تلك ذات الجدران الخلوية الصلبة ، مثل البكتيريا والفطريات إيجابية الجرام. تولد الموجات فوق الصوتية فقاعات تجويف في العينة ، والتي تنهار وتخلق موجات صدمة تكسر جدران الخلايا والأغشية المفتوحة. تضمن هذه العملية تعطيل الخلايا الشامل والإطلاق الفعال للمحتويات داخل الخلايا ، مثل الحمض النووي والحمض النووي الريبي والبروتينات.
تجزئة الحمض النووي الخاضعة للرقابة
بالنسبة لتطبيقات مثل تسلسل الجيل التالي ، غالبا ما يكون من الضروري قص الحمض النووي إلى أجزاء أصغر وموحدة. يوفر Sonication تحكما دقيقا في عملية التجزئة ، مما يسمح للباحثين بالحصول على شظايا الحمض النووي بالحجم المطلوب. يعد عنصر التحكم هذا أمرا بالغ الأهمية لإعداد مكتبات التسلسل وضمان بيانات تسلسل عالية الجودة.
تجانس العينة المحسن
في أبحاث الميكروبيوم ، غالبا ما تحتوي العينات على مزيج متنوع من الكائنات الحية الدقيقة. يساعد Sonication على تحقيق توزيع موحد لهذه الكائنات الحية الدقيقة داخل العينة ، مما يضمن نتائج متسقة وقابلة للتكرار. هذا التجانس أمر بالغ الأهمية للتحليل الكمي الدقيق ، مثل تحديد وفرة الميكروبات أو قياس أنشطة التمثيل الغذائي المحددة.
“أكتب إليكم لأشكركم على تجربتنا الرائعة في استخدام صوتيتكور UIP400MTP الخاص بك للتحلل البكتيري الموحد والمتسق لعينات الميكروبيوم البرازي. نحن ندفع الظرف للحصول على تقنية تحلل عالية الإنتاجية ، وأداتك مناسبة تماما لهذه المهمة. بعض النقاط الرئيسية هي:
- سهولة التشغيل - الأداة سهلة الاستخدام ، والتخصيص واضح ومباشر باستخدام خيارات القائمة
- إنتاجية عالية - ممتازة للتعامل مع الألواح ، مع 96 عينة في وقت واحد
- حتى صوتنة جميع السفن - كان الجهاز قادرا على توصيل نفس الكمية من الصوتنة إلى جميع الآبار ، وهو أمر بالغ الأهمية لتطبيقنا
- دعم من فريق Hielscher - كان الدعم ممتازا ، كنت دائما هناك من أجلنا في التدريب ، للإجابة على أسئلتنا ومعالجة المشكلات ، مع الاقتراحات التي ساعدتنا في الوصول إلى هدفنا.
نشكرك مرة أخرى على مساعدتك ومساعدتك حيث عملنا على تحسين بروتوكولاتنا.”
مارك د. دريسكول ، دكتوراه – الرئيس التنفيذي للشؤون العلمية – إنتوس للعلوم البيولوجية
كيف يتم تطبيق Sonication في أبحاث الميكروبيوم والتشخيص؟
تتشابك الأيضات والميتاجينوميات والميتابروتيوميات في أبحاث الميكروبيوم لأنها توفر مجتمعة فهما شاملا للمجتمعات الميكروبية ووظائفها. يعد التحلل وتنقية البروتين وتجزئة الحمض النووي / الحمض النووي الريبي خطوات أساسية لإعداد العينات يتم تبسيطها باستخدام UIP400MTP صوتي للوحة 96 بئرا.
الأيض وتحليل الأيض
يتضمن الأيض الدراسة المنهجية لمستقلبات الجزيئات الصغيرة داخل النظام البيولوجي. في أبحاث الميكروبيوم ، يتم استخدام صوتنة لتحلل الخلايا الميكروبية ، وإطلاق المستقلبات داخل الخلايا. يمكن معالجة أعداد العينات العالية بسرعة باستخدام UIP400MTP صوتي للوحة 96 بئرا. ثم يتم قياس المستقلبات المستخرجة باستخدام تقنيات متقدمة مثل قياس الطيف الكتلي (MS) والتحليل الطيفي بالرنين المغناطيسي النووي (NMR). توفر البيانات الناتجة لمحة عن الحالة الأيضية للميكروبيوم ، وتكشف عن رؤى حول الأنشطة والتفاعلات الكيميائية الحيوية داخل المجتمعات الميكروبية.
الميتاجينوميكس والميتاترانسكريبتوميكس
يتضمن علم الميتاجينوميكس التحليل الشامل للمواد الوراثية المستردة مباشرة من العينات البيئية. يلعب Sonication دورا حاسما في هذه العملية عن طريق تحليل الخلايا الميكروبية لاستخراج الحمض النووي عالي الجودة ، والذي يتم تسلسله بعد ذلك لتحديد الأنواع الميكروبية الموجودة وقياسها. في metatranscriptomics ، يتم استخراج الحمض النووي الريبي باستخدام طرق صوتنة مماثلة لدراسة ملامح التعبير الجيني عبر المجتمعات الميكروبية المختلفة. لتسلسل الحمض النووي والحمض النووي الريبي ، يجب تجزئة الأحماض النووية إلى طول زوج أساسي معين. يتم تنفيذ كل هذه المهام بشكل موثوق وسريع من قبل UIP400MTP صوتي عالي الإنتاجية!
البروتيوميات
تتطلب التحليلات البروتينية استخراج البروتينات من الخلايا الميكروبية. يستخدم Sonication بشكل فعال لتعطيل الخلايا ، وإطلاق البروتينات في الحل. يمكن بعد ذلك تنقية هذه البروتينات وتحليلها لفهم أدوارها الوظيفية داخل الميكروبيوم ومشاركتها في المسارات الأيضية. مع صوتنة لوحة متعددة الآبار UIP400MTP ، يمكنك أداء مهمة التحلل واستخراج البروتين في غضون دقائق مما يخلق نتائج قابلة للتكرار لاكتساب نظرة ثاقبة للعمليات البيولوجية التي تقودها البروتينات في المجتمعات الميكروبية.
الميتابروتيوميات
توسع Metaproteomics التحليل البروتيني ليشمل المجتمعات الميكروبية بأكملها ، وتدرس محتوى البروتين الجماعي لفهم التعبير الوظيفي والتفاعلات داخل الميكروبيوم. يستخدم Sonication لتحلل الخلايا ، وإطلاق البروتينات التي يتم تنقيتها وتحليلها من خلال تقنيات مثل قياس الطيف الكتلي. يوفر هذا النهج رؤى مفصلة حول العمليات البيولوجية النشطة وتكيفات المجتمعات الميكروبية في بيئات مختلفة.
استفد من قدرة المعالجة عالية الإنتاجية لجهاز صوتي لوحة UIP400MTP متعدد الآبار وقم بتسهيل أبحاث وتحليل الميكروبيوم الخاص بك!
UIP400MTP صوتي عالي الإنتاجية لأبحاث الميكروبيوم في ألواح متعددة الآبار وألواح 96 بئرا وأنابيب وأطباق بتري.
UIP400MTP Multiwell Plate Sonicator لإعداد العينات عالية الإنتاجية في تشخيص الميكروبيوم.
يسهل UIP400MTP صوتي متعدد الآبار إعداد العينات عالية الإنتاجية ، على سبيل المثال في أبحاث الميكروبيوم والتشخيص.
UIP400MTP صوتي للوحة 96 بئرا: يحيط السائل الذي ينقل الموجات فوق الصوتية بجميع الآبار ويوفر صوتنة موحدة لكل عينة
الميزات الرئيسية لجهاز سونيكاتور لوحة متعدد الآبار UIP400MTP
| صوتنة عالية الإنتاجية | مناسب تماما ل 96 بئرا وألواح أخرى متعددة الآبار ، يسمح UIP400MTP بصوتنة متزامنة ومتطابقة لعينات متعددة ، مما يقلل بشكل كبير من مدة تحضير العينة ويزيد من إنتاجية اختبار رقم العينة العالي. |
| استخدم لوحة متعددة الآبار من اختيارك | تم تصميم UIP400MTP لصوتنة أي لوحات قياسية متعددة الآبار أو لوحات PCR أو لوحات عيار دقيق. يمكنك اختيار اللوحة الأنسب لتجاربك. نظرا لأن UIP400MTP لا يتطلب مواد استهلاكية خاصة ، فهذا يوفر لك الكثير من المال! |
| عدم الاتصال بالموجات فوق الصوتية | يطبق Multiwell Plate Sonicator UIP400MTP الموجات فوق الصوتية المكثفة دون إدخال أي شيء في العينة. يمكنك صوتنة لوحات متعددة الآبار والأوعية المغلقة والقوارير. Hielscher يوفر لك أصحاب عينات مخصصة لأي قوارير غير قياسية أو الأوعية. |
| الدقة والتحكم | يتيح لك التحكم الدقيق والبرامج الذكية ضبط المعلمات فوق الصوتية لتناسب احتياجات المعالجة الخاصة بك على النحو الأمثل. يمكنك الحصول على أقصى قدر من كفاءة صوتنة وفعالية لكل تجربة. |
| التحكم في درجة الحرارة | ضبط درجة حرارة محددة لصوتنة الخاص بك. يمكن لصوتنة لوحة UIP400MTP مراقبة درجة حرارة العينة وضبط صوتنة وفقا لذلك. يقوم سائل التبريد المعاد تدويره بتبريد كل بئر في اللوحة للتحكم الدقيق في درجة الحرارة. |
| البروتوكول والتحكم عن بعد | يمكن التحكم في كل تشغيل صوتنة من جهاز كمبيوتر. لا حاجة لتثبيت البرامج. يمكنك استخدام متصفحك القياسي (مثل Chrome أو Firefox أو Edge أو Safari) على أي نظام تشغيل (مثل MacOS أو Windows أو Android أو iOS أو Linux) للتحكم في UIP400MTP ومراقبتها عن بعد. كل تشغيل صوتنة تنتج بروتوكول صوتنة مفصل للتقييم والتوثيق. ملف البروتوكول بتنسيق CSV غير مملوك ، يمكنك فتحه باستخدام البرنامج المفضل لديك ، على سبيل المثال Microsoft Excel أو Apple Numbers أو OpenOffice Calc. |
| قوي وموثوق | تم تصميم UIP400MTP وبناؤه في ألمانيا وفقا لأعلى معايير الجودة ، وهو ليس قويا فحسب ، بل إنه متين بشكل ملحوظ. يفي تصميمه بالمعايير الصناعية ويتحمل بسهولة قسوة الاستخدام اليومي في بيئة معملية متطلبة. يمكنك استخدام UIP400MTP بشكل مستمر على مدار 24 ساعة ، 7 أيام في الأسبوع في عمليات عالية الإنتاجية. |
- كفاءة عالية
- أحدث التقنيات
- موثوقيه & متانه
- تحكم دقيق وقابل للتعديل في العملية
- برنامج ذكي
- الميزات الذكية (على سبيل المثال ، قابلة للبرمجة ، وبروتوكول البيانات ، والتحكم عن بعد)
- سهل وآمن للعمل
- صيانة منخفضة
- التنظيف المكاني (التنظيف المكاني)
التصميم والتصنيع والاستشارات – جودة صنع في ألمانيا
Hielscher الموجات فوق الصوتية معروفة جيدا لأعلى معايير الجودة والتصميم. المتانة والتشغيل السهل تسمح بالتكامل السلس للموجات فوق الصوتية لدينا في المنشآت الصناعية. يتم التعامل بسهولة مع الظروف القاسية والبيئات الصعبة بواسطة الموجات فوق الصوتية Hielscher.
Hielscher Ultrasonics هي شركة حاصلة على شهادة الأيزو وتركز بشكل خاص على الموجات فوق الصوتية عالية الأداء التي تتميز بأحدث التقنيات وسهولة الاستخدام. بطبيعة الحال، الموجات فوق الصوتية Hielscher هي CE المتوافقة وتلبية متطلبات UL، وكالة الفضاء الكندية وبنفايات.
عدم الاتصال صوتي UIP400MTP لإعداد عينة الميكروبيوم في ألواح متعددة الآبار.
الأدب / المراجع
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- InfoGraphic UIP400MTP – 96-well plate Ultrasonicator for High-Throughput Sample Prep – english – Hielscher Ultrasonics
- Jannike L. Krause, Sven-Bastiaan Haange, Stephanie S. Schäpe, Beatrice Engelmann, Ulrike Rolle-Kampczyk, Katarina Fritz-Wallace, Zhipeng Wang, Nico Jehmlich, Dominique Türkowsky, Kristin Schubert, Judith Pöppe, Katrin Bote, Uwe Rösler, Gunda Herberth, Martin von Bergen (2020): The glyphosate formulation Roundup® LB plus influences the global metabolome of pig gut microbiota in vitro. Science of The Total Environment, Volume 745, 2020.
- Tröscher-Mußotter, Johanna; Sáenz, Johan; Grindler, Sandra; Meyer, Jennifer; Kononov, Susanne; Mezger, Beate; Borda, Daniel; Frahm, Jana; Dänicke, Sven; Camarinha-Silva, Amelia; Huber, Korinna; Seifert, Jana (2021): Microbiome Clusters Disclose Physiologic Variances in Dairy Cows Challenged by Calving and Lipopolysaccharides. mSystems 2021.
- Jannike Lea Krause, Beatrice Engelmann, Stephanie Serena Schaepe, Ulrike Rolle-Kampczyk, Nico Jehmlich, Hyun-Dong Chang, Ulla Slanina, Maximillian Hoffman, Jörg Lehmann, Ana Claudia Zenclussen, Gunda Herberth, Martin von Bergen, Sven-Bastiaan Haange (2024): DSS treatment does not affect murine colonic microbiota in absence of thehost. Gut Microbes 2024.
أسئلة يتكرر طرحها عن أبحاث الميكروبيوم
ماذا تفعل Sonication للبكتيريا؟
يعطل Sonication الخلايا البكتيرية باستخدام الموجات الصوتية عالية التردد ، مما يتسبب في التجويف الذي يولد موجات صدمة وقوى ميكانيكية ، مما يؤدي إلى تحلل الخلايا وإطلاق محتويات داخل الخلايا.
ما هي الطرق المستخدمة لدراسة الميكروبيومات؟
تشمل طرق دراسة الميكروبيوم تقنيات تسلسل الحمض النووي مثل تسلسل الجينات 16S rRNA وعلم الميتاجينوميات ، بالإضافة إلى علم النسخ والبروتينات والأيض لتحليل الوظائف والتفاعلات الميكروبية. يتم استخدام أدوات المعلوماتية الحيوية لتفسير البيانات الهائلة التي تم إنشاؤها.
ما هي التقنيات المستخدمة في تحليل الميكروبيوم؟
تشمل التقنيات المستخدمة في تحليل الميكروبيوم تسلسل الجينات 16S rRNA للتنميط التصنيفي ، والتسلسل الميتاجينومي للتحليل الجيني الشامل ، وعلم الميتا ترانسكريبتوميكس لدراسة التعبير الجيني ، والميتابروتيميات لتحليل البروتينات ، والأيض لتحديد المنتجات الأيضية. أدوات المعلوماتية الحيوية ضرورية لمعالجة البيانات وتفسيرها.
ما هي الأيضات والميتاجينوميات والميتابروتيوميات في أبحاث الميكروبيوم؟
في أبحاث الميكروبيوم ، يحلل الأيض الجزيئات الصغيرة والمستقلبات التي تنتجها الميكروبات ، مما يوفر نظرة ثاقبة لأنشطتها الأيضية. يتضمن علم الميتاجينوميات تسلسل الجينومات الجماعية للمجتمعات الميكروبية لفهم تكوينها الجيني وإمكاناتها الوظيفية. يدرس Metaproteomics محتوى البروتين بالكامل في الميكروبيوم ، ويكشف عن التعبير الوظيفي للجينات والأدوار التي تلعبها البروتينات داخل المجتمع الميكروبي.
ما هي المستعمرات البكتيرية في أبحاث الميكروبيوم؟
المستعمرات البكتيرية في أبحاث الميكروبيوم هي مجموعات من البكتيريا تنمو من خلية واحدة أو بضع خلايا على وسط نمو صلب ، وتشكل مجموعات مرئية. تمثل هذه المستعمرات مجموعات نسلية تستخدم لدراسة خصائص وتنوع ووظائف سلالات بكتيرية معينة داخل مجتمع ميكروبي.
Hielscher الفوق صوتيات بتصنيع الخالط بالموجات فوق الصوتية عالية الأداء من المختبر ل الحجم الصناعي.