تكوين ألياف الأميلويد باستخدام UIP400MTP Microplate Sonicator
تتشكل ألياف الأميلويد ، مثل البلورات ، من خلال عملية التنوي والنمو اللاحق. ومع ذلك ، نظرا لحاجز الطاقة الحرة العالي للتنوي ، فإن تكوين ألياف الأميلويد التلقائي يحدث فقط بعد مرحلة تأخر طويلة. برزت الموجات فوق الصوتية كأداة قوية للحث على تنوي الأميلويد ، وبالتالي تسريع تكوين الألياف بشكل كبير. عند دمجها مع قارئ صفيحة دقيقة باستخدام مضان ثيوفلافين T (ThT) ، تتيح الموجات فوق الصوتية الكشف عن ألياف الأميلويد عالية الإنتاجية في عينات متعددة في وقت واحد.
تشكيل ألياف الأميلويد المستحثة بالموجات فوق الصوتية مع UIP400MTP Microplate Sonicator
مع UIP400MTP الصوتي متعدد الآبار ، يمكن تصنيع ألياف الأميلويد من نفس الجودة بكميات كبيرة بسرعة لأغراض البحث. يسمح هذا النهج الفعال بدراسة الأميلويد البروتيني. تسهل هذه التقنية الرجفان النشواني السريع والقابل للتكرار ، كما هو موضح في β2-microglobulin (β2-m) ، وهو بروتين أميلويد مرتبط بالداء النشواني المرتبط بغسيل الكلى.
نهج تجريبي بسيط: الرجفان النشواني المستحث بالموجات فوق الصوتية
للحث على تكوين الألياف ، تم وضع صفيحة دقيقة مكونة من 96 بئرا في وسط جهاز صوتي متعدد الآبار UIP400MTP ، مما يضمن التعرض الموحد بالموجات فوق الصوتية عبر جميع الآبار. كانت الشروط التجريبية على النحو التالي:
- احتوى كل بئر على 0.2 مل من محلول β2-microglobulin (0.3 مجم / مل ، درجة الحموضة 2.5) مكملا ب 5 ميكرومتر ThT.
- تعرضت اللوحة لدورات الموجات فوق الصوتية ، مثل 1 دقيقة بالموجات فوق الصوتية تليها 9 دقائق من التوقف.
- بعد الصوتنة ، تم قياس مضان ThT باستخدام قارئ صفيحة دقيقة.
(راجع سو وآخرون ، 2011)
مقارنة مع التحريض التقليدي
بالمقارنة مع طرق التحريض التقليدية ، قلل الموجات فوق الصوتية بشكل كبير من مرحلة التأخر لتكوين الليف. في ظل ظروف اهتزاز الصفيحة الدقيقة التقليدية ، أظهر 1 فقط من كل 10 آبار زيادة في مضان ThT بعد 20 ساعة. في المقابل ، باستخدام الموجات فوق الصوتية الدورية (15 دقيقة صوتنة متبوعة ب 5 دقائق من الهدوء) ، تم الكشف عن زيادة كبيرة في مضان ThT مباشرة بعد العلاج الأول بالصوتنة.
التسارع السريع لحركية الرجفان
أظهرت النتائج التي تم الحصول عليها من So et al. (2011) أنه يمكن تسريع تكوين الألياف الليفية التلقائية ل β2-microglobulin عند درجة الحموضة 2.5 من عدة ساعات إلى 10-15 دقيقة فقط بالموجات فوق الصوتية.
أكدت صور الفحص المجهري للقوة الذرية (AFM) أن الألياف المتولدة عن طريق الموجات فوق الصوتية لمدة 10 دقائق كل 15 دقيقة لا يمكن تمييزها شكليا عن تلك التي تشكلت باستخدام الموجات فوق الصوتية لمدة دقيقة واحدة كل 10 دقائق. هذا يسلط الضوء على قابلية استنساخ ومتانة رجفان الأميلويد المستحث بالموجات فوق الصوتية.
صور AFM من ألياف الأميلويد التي يتم إنتاجها بواسطة 1 دقيقة بالموجات فوق الصوتية كل 10 دقائق (ط) ، بواسطة صوتنة لمدة 10 دقائق كل 15 دقيقة (ثانيا) ، وعن طريق تفاعل البذر دون الموجات فوق الصوتية (ثالثا). يمثل شريط المقياس الأبيض 1 ميكرومتر.
الدراسة والصور: ©So et al. ، 2011
الرجفان في ظروف الأس الهيدروجيني المحايدة
حتى في ظل ظروف الأس الهيدروجيني المحايدة ، تم تحقيق تكوين الألياف بعد فترة تأخير قدرها 1.5 ساعة ، مما يدل على أن الموجات فوق الصوتية تقلل بشكل كبير من الحاجز النشط أمام التنوي والنمو. هذا يدعم أيضا الفرضية القائلة بأن رجفان الأميلويد هو في المقام الأول رد فعل فيزيائي ، مقيد إلى حد كبير بحاجز طاقة التنوي ، والذي يقلل الموجات فوق الصوتية بشكل فعال.
التأثير على أبحاث الأمراض المرتبطة بالأميلويد
إن التكوين السهل والموثوق به لألياف الأميلويد باستخدام جهاز الصوتنة UIP400MTP microplate له آثار كبيرة على أبحاث مرض الزهايمر (AD) والاضطرابات الأخرى المرتبطة بالأميلويد ، مثل مرض باركنسون ومرض السكري من النوع الثاني والأميلويدوز الجهازي. في AD ، يعد تجميع β الأميلويد (Aβ) سمة مميزة مرضية رئيسية ، ومع ذلك تظل دراسة حركية الرجفان صعبة بسبب مراحل التأخر الطويلة والتباين في الطرق التقليدية. يعمل تكوين الألياف المدفوعة بالموجات فوق الصوتية على تسريع التنوي ، مما يضمن قابلية عالية للتكاثر وتقليل التباين ، وهو أمر بالغ الأهمية لفحص المثبطات المحتملة وفهم الآليات النشوانية المنشأ. علاوة على ذلك ، تتيح قدرة UIP400MTP عالية الإنتاجية إجراء تحقيقات واسعة النطاق في خلل طي البروتين وتجميعه ، مما يسهل اكتشاف العوامل العلاجية التي يمكن أن تعدل تكوين الألياف وربما تخفف من التقدم التنكسي العصبي.
تؤسس هذه الدراسة الموجات فوق الصوتية باستخدام UIP400MTP الصوتي متعدد الآبار كطريقة عالية الكفاءة لتسريع تكوين ألياف الأميلويد. تشمل المزايا الرئيسية لهذا النهج ما يلي:
- انخفاض كبير في وقت التأخير للرجفان.
- التعرض الموحد بالموجات فوق الصوتية عبر جميع الآبار ، مما يتيح تكوين ألياف قابلة للتكرار.
- قدرة فحص عالية الإنتاجية ، مما يجعلها مناسبة للبحث على مستوى الجينوم عن الأميلويد للبروتين.
من خلال دمج الموجات فوق الصوتية مع الكشف عن مضان ThT ، توفر هذه الطريقة منصة سريعة وقابلة للتطوير وموثوقة لدراسة رجفان الأميلويد. نظرا لكفاءته وإمكاناته العالية الإنتاجية ، قد يسهل هذا النهج التخليق السهل لألياف الأميلويد للأبحاث الفيزيائية الحيوية والصيدلانية ، مما يوفر أداة واعدة للدراسات المتعلقة بالأميلويد وفحص الأدوية.
استخراج EM عالي الإنتاجية مع لوحة سونيكاتور 96 بئر UIP400MTP
الأدب / المراجع
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Masatomo So, Hisashi Yagi, Kazumasa Sakurai, Hirotsugu Ogi, Hironobu Naiki, Yuji Goto (2011): Ultrasonication-Dependent Acceleration of Amyloid Fibril Formation. Journal of Molecular Biology, Volume 412, Issue 4, 2011. 568-577.
- Lauren E. Cruchley-Fuge, Martin R. Jones, Ossama Edbali, Gavin R. Lloyd, Ralf J. M. Weber, Andrew D. Southam, Mark R. Viant (2024): Automated extraction of adherent cell lines from 24-well and 96-well plates for multi-omics analysis using the Hielscher UIP400MTP sonicator and Beckman Coulter i7 liquid handling workstation. Metabomeeting 2024, University of Liverpool, 26-28th November 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
أسئلة مكررة
ما هو النواة الأولية للأميلويد؟
التنوي الأولي للأميلويد هو الخطوة الأولية التي تحد من المعدل في تكوين ألياف الأميلويد ، حيث تخضع البروتينات الأحادية لتغييرات توافقية وتتجمع ذاتيا في نواة حرجة. تعمل هذه النواة كقالب لمزيد من التجميع.
كيف يتشكل الليف في الداء النشواني؟
في الداء النشواني ، تتجمع البروتينات غير المطوية عن طريق البلمرة المعتمدة على التنوى. بمجرد تكوين النواة ، تستطيل المونومرات بسرعة إلى ألياف غنية ب β من خلال التنوي الثانوي والنمو النموذجي ، مما يؤدي إلى رواسب الأميلويد.
ما هو تعدد أشكال الأميلويد الليفي؟
يشير تعدد أشكال ألياف الأميلويد إلى الاختلافات الهيكلية في الألياف التي يتكون منها نفس البروتين. تنشأ الاختلافات في مورفولوجيا الألياف ، وترتيب الخيوط الأولية ، والتعبئة الجزيئية بسبب الظروف البيئية أو الطفرات أو مسارات التجميع المختلفة.
ما هو الفرق بين ألياف الأميلويد واللويحات؟
ألياف الأميلويد عبارة عن مجاميع بروتينية خطية غنية ب β صفائح ، في حين أن لويحات الأميلويد عبارة عن رواسب خارج الخلية من الألياف المجمعة ، وغالبا ما يتم خلطها مع الدهون والمعادن والحطام الخلوي ، كما هو موضح في الأمراض التنكسية العصبية مثل مرض الزهايمر.
ما هو الفرق بين ألفا سينوكلين والأميلويد؟
ألفا سينوكلين هو بروتين عصبي يشارك في الوظيفة المشبكية ، ولكن في الحالات المرضية ، فإنه يخطئ ويشكل ألياف تشبه الأميلويد. “اميلويد” هو مصطلح عام لمجاميع البروتين الليفية غير المطوية ، في حين أن ألياف ألفا سينوكلين خاصة بأمراض مثل مرض باركنسون.
ما هو بروتين ليف؟
ألياف البروتين عبارة عن ركام خيطي عالي الترتيب وغني ب β صفائح يتكون من بروتينات غير مطوية أو مكشوفة جزئيا. عادة ما تكون هذه الألياف غير قابلة للذوبان وتنشأ من خلال البلمرة المعتمدة على التنوى. ترتبط بحالات مرضية مختلفة ، بما في ذلك الأميلويدوز والأمراض التنكسية العصبية (على سبيل المثال ، مرض الزهايمر ومرض باركنسون). ومع ذلك ، توجد بعض ألياف البروتين الوظيفية في الأنظمة البيولوجية ، مثل ألياف الكيرلي في البكتيريا وألياف الحرير في العناكب.
Hielscher الفوق صوتيات بتصنيع الخالط بالموجات فوق الصوتية عالية الأداء من المختبر ل الحجم الصناعي.


