Metabolomica facilitată de sonicarea de mare randament
Metabolomica este domeniul de cercetare care folosește tehnici de mare randament pentru a caracteriza și cuantifica molecule mici în diferite biofluide, cum ar fi urina, serul, plasma, fecalele și saliva, dezvăluind semnături metabolice unice. Sonicatorul de mare randament UIP400MTP, conceput pentru plăci cu mai multe godeuri, este un instrument puternic pentru lizarea celulelor din aceste probe, facilitând eliberarea de metaboliți pentru analiza în aval. Această abordare precisă și fiabilă este esențială pentru metabolomică, unde proiectarea precisă a studiului, pregătirea meticuloasă a probelor, configurarea optimizată a platformei, analiza cuprinzătoare a datelor și interpretarea biologică semnificativă sunt esențiale. Metabolomica folosește atât abordări țintite, care se concentrează pe clase specifice de molecule, cum ar fi carbohidrați, lipide și aminoacizi, cât și tehnici nețintite, care oferă o imagine de ansamblu largă a profilurilor metabolice dintr-o probă, dezvăluind complexitatea complicată a semnalizării metabolice.
UIP400MTP este un sonicator fără contact, de mare randament, pentru liza celulară și extracția metabolitelor în plăci cu mai multe godeuri
Pregătirea probelor cu randament ridicat cu sonicatorul de plăci cu 96 de godeuri UIP400MTP
Utilizarea UIP400MTP sonicator fără contact în combinație cu plăci cu 96 de godeuri este o metodă eficientă pentru omogenizarea cu randament ridicat și extracția metabolitelor. Această configurație evită contactul direct cu proba, reducând riscul de contaminare încrucișată în timpul procesării simultane a mai multor probe.
Protocol pas cu pas pentru omogenizare cu sonicator de 96 de godeuri UIP400MTP
- Pregătirea probelor metabolomice
Plasare eșantion: Distribuiți fiecare probă (de exemplu, fecale, țesut intestinal sau conținut luminal) în godeuri individuale ale unei plăci sau microplăci cu 96 de godeuri.
Solvent: Solvenții organici, cum ar fi metanolul, etanolul, acetonitrilul, cloroformul și amestecurile lor (apoase), sunt esențiali pentru extracția metaboliților, ajutând la eliberarea metaboliților intracelulari din matricea celulară. Utilizați 100-300 μL de solvent pe godeu, asigurând suficient volum pentru a scufunda complet proba.
Standarde interne: Opțional, adăugați standarde interne la fiecare puț pentru normalizare în timpul analizei metabolomice din aval. - Configurație medie de cuplare
Nivelul apei: Așezați placa cu 96 de puțuri pe platforma de sonicare umplută cu apă (mediul de cuplare) așa cum este descris în manual. - UIP400MTP Configurarea parametrilor
Setări de alimentare: Reglați amplitudinea ultrasunetelor la 50-80% din puterea maximă pentru o omogenizare eficientă.
Mod puls: Setați ciclul de sonicare la impulsuri alternative (de exemplu, 30 de secunde ON, 30 de secunde OFF) pentru a permite răcirea și a preveni supraîncălzirea probei.
Timp total: 4-10 minute, în funcție de complexitatea și duritatea probei.
Controlul temperaturii: Utilizați un răcitor de laborator pentru a menține apa la 4-8°C în timpul sonicării pentru a proteja metaboliții sensibili la căldură. - Procesul de sonicare
Porniți UIP400MTP pentru ciclurile de sonicare.
Monitorizați procesul prin intermediul interfeței UIP400MTP.
Efectul de cavitație va omogeniza probele și va liza celulele din godeuri, eliberând metaboliți intracelulari în solvent. - PostSonicare
Centrifugare: După sonicare, transferați conținutul plăcii în tuburile de colectare, dacă este necesar. Centrifugați la 4.000-6.000 × g timp de 10 minute pentru a granula resturile insolubile și materialul celular.
Colecția de supranațători: Transferați cu atenție supernatantul din fiecare puț în tuburi sau plăci noi pentru analiză.
Uscare opțională: Uscați supranatanții folosind un concentrator de vid (de exemplu, SpeedVac) dacă este necesară concentrația, apoi reconstituiți într-un volum mic solventul corespunzător.
Profitați de capacitatea de procesare de mare randament a sonicatorului cu plăci cu mai multe godeuri UIP400MTP și facilitați-vă cercetarea și analiza metabolomică!
UIP400MTP sonicator cu randament ridicat pentru cercetarea metabolomică în plăci cu mai multe godeuri, plăci cu 96 de godeuri, tuburi și plăci Petri.
UIP400MTP Sonicator cu plăci cu mai multe godeuri pentru pregătirea probelor de mare randament în cercetarea metabolomică.
Principiul sonicării fără contact cu UIP400MTP
UIP400MTP aplică unde ultrasonice pe godeurile unei plăci cu 96 de godeuri indirect printr-un mediu de cuplare (de exemplu, apă). Aceste unde creează cavitație, care perturbă celulele și eliberează metaboliți fără contact fizic între sonda sonicatoare și probă.
“Vă scriu pentru a vă mulțumi pentru experiența noastră fantastică folosind sonicatorul UIP400MTP pentru liza bacteriană uniformă și consistentă a probelor de microbiom fecal. Împingem limitele pentru tehnologia de liză cu randament ridicat, iar instrumentul dvs. este potrivit pentru această sarcină. Unele dintre cele mai importante aspecte sunt:
- Ușurință în operare – instrumentul este ușor de utilizat, iar personalizarea este simplă folosind opțiunile de meniu
- randament ridicat – excelent pentru manipularea plăcilor, cu 96 de probe simultan
- Sonicarea uniformă a tuturor vaselor – Dispozitivul a fost capabil să furnizeze aceeași cantitate de sonicare tuturor godeurilor, ceea ce a fost crucial pentru aplicația noastră
- Sprijin din partea echipei Hielscher – Suportul a fost excelent, ați fost mereu acolo pentru noi în antrenament, pentru a ne răspunde la întrebări și a rezolva problemele, cu sugestii care ne-au ajutat să ne atingem obiectivul.
Vă mulțumim din nou pentru ajutor și asistență în timp ce am lucrat pentru a optimiza protocoalele noastre.”
Dr. Mark D. Driscoll – Director științific – Intus Biosciences
Sonicatorul cu plăci cu mai multe godeuri facilitează UIP400MTP pregătirea probelor cu randament ridicat, de exemplu în cercetarea și analiza metaboliților.
Sonicator placă cu 96 de puțuri UIP400MTP: Lichidul care transmite ultrasunete înconjoară toate puțurile și oferă sonicare uniformă a fiecărui eșantion
Caracteristici cheie ale UIP400MTP Sonicator cu plăci cu mai multe godeuri
| sonicare cu randament ridicat | Perfect potrivit pentru plăci cu 96 de godeuri și alte plăci cu mai multe godeuri, UIP400MTP permite sonicarea simultană și identică a mai multor probe, scurtând semnificativ durata de pregătire a probelor și crescând randamentul testării numărului mare de probe. |
| Utilizați placa cu mai multe godeuri la alegere | UIP400MTP este conceput pentru a sonica orice plăci standard cu mai multe godeuri, plăci PCR sau plăci de microtitru. Alegeți placa cea mai potrivită pentru experimentele dvs. Deoarece UIP400MTP nu necesită consumabile proprietare, acest lucru vă economisește mulți bani! |
| Ultrasunete fără contact | Sonicatorul cu plăci cu mai multe godeuri aplică UIP400MTP ultrasunete intense fără a introduce nimic în probă. Puteți sonica plăci cu mai multe godeuri, vase închise și flacoane. Hielscher vă furnizează suporturi de mostre personalizate pentru orice flacoane sau vase non-standard. |
| Precizie și control | Controlul de precizie și software-ul inteligent vă permit să setați parametrii cu ultrasunete pentru a se potrivi în mod optim nevoilor dumneavoastră specifice de procesare. Obțineți eficiență și eficacitate maximă de sonicare pentru fiecare experiment. |
| controlul temperaturii | Setați o temperatură specifică pentru sonicare. Sonicatorul plăcii UIP400MTP poate monitoriza temperatura eșantionului și regla sonicarea în consecință. Un lichid de răcire recirculant răcește fiecare godeu din placă pentru un control precis al temperaturii. |
| Protocoale și telecomandă | Fiecare rulare sonicare poate fi controlată de la un computer. Nu este necesară instalarea software-ului. Puteți utiliza browserul standard (de exemplu, Chrome, Firefox, Edge sau Safari) pe orice sistem de operare (de exemplu, MacOS, Windows, Android, iOS sau Linux) pentru a controla și monitoriza UIP400MTP de la distanță. Fiecare rulare sonicare produce un protocol detaliat sonicare pentru evaluare și documentare. Fișierul de protocol este într-un format CSV neproprietar, pe care îl puteți deschide cu programul preferat, de ex. Microsoft Excel, Apple Numbers sau OpenOffice Calc. |
| Robust și fiabil | Proiectat și construit în Germania la cele mai înalte standarde de calitate, UIP400MTP nu este doar puternic, ci și remarcabil de durabil. Designul său îndeplinește standardele industriale și rezistă cu ușurință rigorilor utilizării zilnice într-un mediu de laborator solicitant. Puteți utiliza UIP400MTP continuu 24 de ore, 7 zile pe săptămână în operațiuni cu randament ridicat. |
- eficiență ridicată
- tehnologie de ultimă generație
- fiabilitate & robustețe
- control reglabil și precis al procesului
- Software inteligent
- funcții inteligente (de exemplu, programabile, protocoale de date, telecomandă)
- ușor și sigur de operat
- întreținere redusă
- CIP (curățare pe loc)
Proiectare, fabricație și consultanță – Calitate Made in Germany
Hielscher ultrasonicators sunt bine-cunoscute pentru cele mai înalte standarde de calitate și design. Robustețea și funcționarea ușoară permit integrarea fără probleme a ultrasonicators noastre în instalații industriale. Condiții dure și medii solicitante sunt ușor de manipulat de ultrasonicators Hielscher.
Hielscher Ultrasonics este o companie certificată ISO și pune un accent deosebit pe ultrasonicators de înaltă performanță cu tehnologie de ultimă oră și ușurință în utilizare. Desigur, ultrasonicators Hielscher sunt conforme CE și îndeplinesc cerințele UL, CSA și RoHs.
Non-contact sonicator UIP400MTP pentru prepararea probelor metabolomice în microplăci.
Literatură / Referințe
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator for High-Throughput Sample Preparation – English version – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Plate-Sonicator für die High-Throughput Probenvorbereitung in 96-Well-Platten – deutsch – Hielscher Ultrasonics
- FactSheet UIP400MTP Multi-well Plate Sonicator – Non-Contact Sonicator – Hielscher Ultrasonics
- Dreyer J., Ricci G., van den Berg J., Bhardwaj V., Funk J., Armstrong C., van Batenburg V., Sine C., VanInsberghe M.A., Marsman R., Mandemaker I.K., di Sanzo S., Costantini J., Manzo S.G., Biran A., Burny C., Völker-Albert M., Groth A., Spencer S.L., van Oudenaarden A., Mattiroli F. (2024): Acute multi-level response to defective de novo chromatin assembly in S-phase. Molecular Cell 2024.
- Mochizuki, Chika; Taketomi, Yoshitaka; Irie, Atsushi; Kano, Kuniyuki; Nagasaki, Yuki; Miki, Yoshimi; Ono, Takashi; Nishito, Yasumasa; Nakajima, Takahiro; Tomabechi, Yuri; Hanada, Kazuharu; Shirouzu, Mikako; Watanabe, Takashi; Hata, Kousuke; Izumi, Yoshihiro; Bamba, Takeshi; Chun, Jerold; Kudo, Kai; Kotani, Ai; Murakami, Makoto (2024): Secreted phospholipase PLA2G12A-driven lysophospholipid signaling via lipolytic modification of extracellular vesicles facilitates pathogenic Th17 differentiation. BioRxiv 2024.
- Cosenza-Contreras M, Seredynska A, Vogele D, Pinter N, Brombacher E, Cueto RF, Dinh TJ, Bernhard P, Rogg M, Liu J, Willems P, Stael S, Huesgen PF, Kuehn EW, Kreutz C, Schell C, Schilling O. (2024): TermineR: Extracting information on endogenous proteolytic processing from shotgun proteomics data. Proteomics. 2024.
- De Oliveira A, Cataneli Pereira V, Pinheiro L, Moraes Riboli DF, Benini Martins K, Ribeiro de Souza da Cunha MDL (2016): Antimicrobial Resistance Profile of Planktonic and Biofilm Cells of Staphylococcus aureus and Coagulase-Negative Staphylococci. International Journal of Molecular Sciences 17(9):1423; 2016.
- Martins KB, Ferreira AM, Pereira VC, Pinheiro L, Oliveira A, Cunha MLRS (2019): In vitro Effects of Antimicrobial Agents on Planktonic and Biofilm Forms of Staphylococcus saprophyticus Isolated From Patients With Urinary Tract Infections. Frontiers in Microbiology 2019.
Întrebări frecvente despre cercetarea metabolomică
Ce este microbiomul?
Microbiomul se referă la comunitatea colectivă de microorganisme, inclusiv bacterii, viruși, ciuperci și arhee, precum și materialul lor genetic, care locuiesc într-un anumit mediu, cum ar fi corpul uman. Joacă un rol esențial în sănătatea gazdei prin influențarea metabolismului, a funcției imunitare și a protecției împotriva agenților patogeni, fiind în același timp modelat de factori precum dieta, stilul de viață și mediul.
Ce este metabolomica?
Metabolomica este studiul cuprinzător al metaboliților, care sunt molecule mici produse în timpul proceselor metabolice dintr-un sistem biologic. Implică identificarea, cuantificarea și analiza acestor molecule pentru a înțelege funcțiile celulare, căile metabolice și modul în care răspund la modificările genetice, de mediu sau patologice.
Ce este metabolomul?
Metabolomul este setul complet de molecule mici sau metaboliți, prezenți într-un sistem biologic, cum ar fi o celulă, un țesut sau un organism, la un moment dat. Reflectă activitatea biochimică și starea fiziologică a sistemului, oferind informații despre metabolism și interacțiunile acestuia cu mediul.
Hielscher Ultrasonics produce omogenizatoare cu ultrasunete de înaltă performanță de la Laborator spre dimensiunea industrială.