Lisis ultrasónica utia'al u Western Blotting
- Le western blot jach jump'éel procedimiento analítico utia'al u detección proteínas específicas ti' jump'éel muestra homogeneizado ti' wa'ak'al wa extracto t'aan.
- Utia'al ejecutar jump'éel Western blot wa utia'al P'iis le actividad enzimática, ya'ab ensayos requieren muuk' le materiales (je'ebix, proteínas, ADN, fragmentos subcelulares) atrapados ti' le célula.
- Le sonicación jach jump'éel método fiable yéetel ch'a'abil u manejar yo'osal le disrupción yéetel lisis t'aan controlada.
Disrupción t'aan ultrasónica
Le extracción proteínas jach yéetel células cultivadas u ti'al le yáax paso ya'ab yo'osal biológicas, bioquímicas yéetel analíticas (PAGE, Western blot, ELISA, espectrometría masas, etcétera) wa utia'al u purificación proteínas. Tia'al jump'éel ka'anal rendimiento proteico, le xooko'obo' t'aan yéetel u wa'ak'al k'a'abéet u alterados leti' lisados u bix ken eficiente. Seen wa lela' células vegetales bix u jach animales, u sonicación u ti'al le método mentik le lisado nu'ukul-t'aan bix u ch'a'abil ka rápida.
Ventajas le sonicación
- Séeba'an & Xoknáalo'obo'
- Chéen ch'a'abil operación
- Ka'anal rendimiento proteico
- Reproducible leti' Repetible
- Controlado yéetel precisión
- escalable
Protocolo u inmunoprecipitación utia'al u inmunoblot occidental
U Reactivos
Utia'al u wa u le soluciones yilik, meyaj ja' purificada bey Milli-Q.
- 1 X solución salina tamponada yéetel fosfato (PBS).
- 1 tampón lisis t'aan: 20 mM Tris (pH 7,5), 150 mM NaCl, 1 mM EDTA ti', 1 mM EGTA, 1 ti chúumuk Triton X-100, 2,5 mM pirofosfato sodio, 1 mM β-glicerofosfato, 1 mM Na3VO4, 1 μg leti' ml u leupeptina
Páaybe'en: Agregue 1 mM PMSF inmediatamente bey ma' biilankiltej. - 15 μl proteína A+15 μl proteína G le kuxlaken utia'al u IP, ba'ale' je'el depender ti' le anticuerpo primario yéetel u volumen le muestra. Bey xan u utilizar proteína ti' leti' G agarosa premezclada (je'ebix, proteína u utia'al u reducción u IgG u t'u'ul yéetel proteína G utia'al u reducción le IgG ch'o').
- Tampón muestra 3 X SDS: 187,5 mM Tris-HCl (pH 6,8 u 25 ° C), 6 ti chúumuk yéetel SDS, 30 ti chúumuk glicerol, 150 mM DTT, 0,03 ti chúumuk yéetel azul bromofenol
B. wa u lisados celulares yilik
- Jooch le células. Utia'al u recolectar células ti' condiciones ma' desnaturalizantes, retire le medios yéetel enjuague le celdas juntéene' yéetel PBS síis.
- Retire le PBS yéetel añada 0,5 ml tampón lisis t'aan 1 X síis u Amal placa (10 cm) yéetel incube le placas ti' hielo ichil 5 minutos.
- Raspe le células le placas yéetel transfiéralas ti' le tubos microcentrífuga. Mantener te' hielo.
- Sonicar ka'atéen ichil 10 segundos ti' tampón inmunoprecipitación síis (tampón IP: 50 mM Tris-HCl [pH 7,4], 150 mM NaCl ti', 5 mM EDTA, 0,1 ti chúumuk NP-40 yéetel le mezcla inhibidores ti' le proteasa). En el caso de le sonicación, le VialTweeter wa jump'éel ultrasonido sonda, bey le UP100H o UP200Ht le le asab adecuados.
- Centrifugar le lisados u 15.000 g ichil 10 minutos u 4 ° kuxtal
- Transfiera le sobrenadante ti' jump'éel tubo túumben. (Wa k'a'abéet, le lisado ku páajtal almacenar ti–80 ° C).
- Agregue le anticuerpo primario ti' le sobrenadante. Le sobrenadante yéetel le anticuerpo primario ku incuba ichil 1 h ti' 4 ° C yáanal jump'éel ligera agitación. Ba'axten lo general, anticuerpo primario ku agrega ti' jump'éel cantidad 10 Óoxten asab concentrada u u le ba'ax ku meyaj utia'al u western blot. (Je'el comenzar yéetel 1 μg tumen 100 μL).
- Tu continuación le sobrenadante ku incuba láayli' asab yéetel le mezcla yaan xan ya'abach iguales u proteína U-agarosa (Invitrogen) yéetel proteína G agarosa ti' 1 h asab.
- P'o'ik le gránulos agarosa Óoxten yéetel tampón IP. Tu continuación extraiga le proteínas unidas yéetel le tampón kuuch SDS-PAGE chokojtal le u 95 ° C ichil 5 minutos.
Kuxtal Inmunoprecipitación
- Ch'aik 200 μl lisado t'aan ka añadir le anticuerpo primario. Incubar yéetel jump'éel O'olkij balanceo ichil áak'abe' u 4 ° kuxtal
- Añadir perlas agarosa proteína u wa G (20 μl purín ti' le 50 ti chúumuk perlas). Incubar yéetel juntúul balanceo O'olkij ichil 1-3 horas ti' 4 ° kuxtal
- Microcentrífuga ti' 30 segundos u 4 ° kuxtal P'o'ik le pellet jo'op'éel Óoxten yéetel 500 μl tampón lisis t'aan 1 X. Manténgalo tu hielo ichil le lavados.
- Sut suspender gránulo yéetel tampón muestra 3 X SDS ti' 20 μl. Vórtice, ku microcentrífuga ti' 30 segundos.
- K'íintik le muestra 95-100 ° C ichil 2-5 minutos yéetel microcentrifugar ichil 1 minuto ti' 14.000 X g.
- Cargue le muestra (15-30 μl) ti' le gel SDS-PAGE (12-15 ti chúumuk).
- Analice le muestra tumen Western blot.
Análisis u Western Blot yéetel sonicator UP50H
Ti' le xooko' Kriebisch et ti' le. (2011) ku utilizó le uláak' protocolo utilizando le sonicador bin yano'ob sonda UP50H:
Le proteína total aisló ti' le células MC3T3-E1 tratadas yéetel 1,25 (Jay).2D3 (10−8 M) wa vehículo. Le células lisaron yéetel jump'éel tampón ku contenía 50 mM Tris HCl, pH 8 (Sigma-Aldrich); 150 mM NaCl (Fisher Scientific); 0,1 ti chúumuk dodecil sulfato sodio (SDS) (Fisher Scientific); IGEPAL CA-630 ti' le 1 ti chúumuk (Sigma-Aldrich) yéetel desoxicolato sodio ti' le 0,5 ti chúumuk (Merck). Le lisado t'aan ku sonicó ichil 2 × 10 Guatemala mina'an u yotocho'ob ti' le ciclo 1 yéetel juntúul amplitud 80 yéetel le Procesador ultrasónico UP50H (Hielscher, ma'alo'obtal u ultrasonidos, Teltow, Alemania). Ichil túun, le centrifugó ichil 10 minutos u 14.000 rpm yéetel le sobrenadante ku utilizó utia'al u transferencia occidental. Veinticinco μg proteína ku hirvieron tu tampón muestra yéetel aj nu'uktaj reductor (Invitrogen) yéetel posteriormente ku separaron yo'osal SDS-PAGE utilizando geles poliacrilamida ti' le 4-12 ti chúumuk (Invitrogen) yéetel ku transfirieron ti' jump'éel membrana nitrocelulosa (GE health care). Le membrana bloqueó ti' 1 h yéetel TBS (10 mM u Tris-HCl; pH 7,6; 150 mM NaCl) ku contenía 1 ti chúumuk caseína (Sigma-Aldrich) yéetel 1 ti chúumuk Tris (1 M). Ka' ts'o'ok u bloqueo, le membrana ku incubó yéetel juntúul ligera agitación ti' le áak'aba' yaan 4 ° C yéetel le anticuerpo primario (t'u'ul antihumano CBS 1 leti' 500, desarrollado ti' le laboratorio le Prof. R. Banerjee, Ann Arbor, MI, EE. UU.). Le incubación yéetel juntúul anticuerpo secundario conjugado (Dako) yéetel peroxidasa rábano páapo' (HPR) ku beetajo' ichil 1 h u temperatura ambiente. Le blots ku desarrollaron yo'osal quimioluminiscencia mejorada (Perkin Elmer).
Beetik clic waye' yo'osal xook asab yóok'ol le ti' tu'ux yo'osal le lisis yéetel extracción t'aan tuméen ultrasonidos, wa u le lisado yilik yéetel le recomendaciones yo'osal u ma'alo'obkíinsiko'ob le procesos.
Le uláak' tabla ku ts'aik ti' jump'éel indicación le Buka'aj u ba'al u procesamiento aproximada u k ultrasonidos Buka'aj laboratorio:
Dispositivos recomendados | Volumen lote | Gasto |
---|---|---|
UIP400MTP Sonicador placas 96 pocillos | Placas multipocillo leti' u microtitulación | n.d. |
cupHorn ultrasónico | CupHorn utia'al u viales wa vaso u precipitados | n.d. |
GDmini2 | reactor ultrasónico u microflujo | n.d. |
VialTweeter | 0. 5 u 1.5mL | n.d. |
UP100H | U 1 u 500 ml | U 10 ti' 200 ml leti' min |
UP200Ht, UP200St | U 10 u 1000 ml | Ti' 20 ti' 200 ml leti' min |
UP400St | U 10 ti' 2000 ml | Ti' 20 u 400 ml leti' min |
Tamizadora ultrasónica | n.d. | n.d. |
Xook k! Leti' k'áatiko'ob k!
Tu yo'olal Western Blotting
Le transferencias ku procedimientos analíticos ti' le le ADN, le ARN yéetel le proteínas ku transfieren ti' jump'éel portador utia'al u páajtal u separar.
Le transferencia Southern ku meyajtiko'ob utia'al u detección ADN, transferencia Northern yo'osal le ARN yéetel le transferencia ku Western ti' le proteínas.
Le Western blot xan u denomina inmunotransferencia proteínas tuméen u meyajtiko'ob jump'éel anticuerpo utia'al u detectar específicamente u antígeno. Western Blotting u ti'al juntúul ti' le métodos ku análisis asab importantes detectar proteínas específicas ti' le muestra. Ti' le Western blot, le proteínas ku inmovilizan ti' le membranas utia'al u detectar le yo'osal anticuerpos monoclonales wa policlonales.
Yo'osal electroforesis ti' gel poliacrilamida SDS (SDS-PAGE), le proteínas nativas u p'atikuba'ob tuméen juntúul ba'ax 3-Mulix wa proteínas desnaturalizadas tumen le longitud ti' le polipéptido. Tu continuación le proteínas ku transfieren ti' jump'éel membrana (normalmente nitrocelulosa wa PVDF), tu'ux ku tiñen yéetel anticuerpos específicos utia'al u proteína objetivo. Le paso ku electroforesis tu gel le analte'obo' yaan ti' le análisis Western blot utia'al u resolver le talamilo' le reactividad cruzada ti' le anticuerpos.
Tu continuación le proteínas separadas ku transcriben ti' jump'éel matriz (chuunil laat'a'an ti' jump'éel membrana ti' nitrocelulosa wa PVDF), tu'ux ku tiñen yéetel anticuerpos. Le anticuerpos funcionan bey juntúul sonda yéetel u seleccionan específicamente utia'al u proteína diana. Le análisis le tu'ux ku yaantal yéetel le intensidad reacción específica revela detalles expresión le proteínas objetivo ti' le muestra dada. Western blot je'el u detectar le objetivo proteína ba'ax le jach baja bey 1ng debido a le ka'anal resolución electroforesis ti' gel yéetel le k'a'am especificidad yéetel ka'anal sensibilidad le inmunoensayo. Le método Western blot ku meyajtiko'ob ti' biología molecular, bioquímica, inmunogenética yéetel uláak' sikte investigación molecular.
Uláak' yo'osal relacionadas incluyen análisis transferencia ti'its, le inmunohistoquímica yéetel le inmunocitoquímica, le ku u utilizan anticuerpos utia'al u detectar proteínas te' jach ka células yo'osal inmunotinción, yéetel le ensayo ku inmunoabsorción ligado enzimas (ELISA).
Bibliografía leti' Referencias
- Koch RJ, Barrette AM, Stern AD, et al. Validating Antibodies for Quantitative Western Blot Measurements with Microwestern Array. Sci Rep. 2018;8(1):11329. Published 2018 Jul 27. doi:10.1038/s41598-018-29436-0
- Carsten Kriebitzsch, Lieve Verlinden, Guy Eelen, Natasja M. van Schoor, Karin Swart, Paul Lips, Mark B. Meyer, J Wesley Pike, Steven Boonen, Carsten Carlberg, Victor Vitvitsky, Roger Bouillon, Ruma Banerjee, and Annemieke Verstuyf (2011): 1,25-dihydroxyvitamin D3 influences cellular homocysteine levels in murine pre-osteoblastic MC3T3-E1 cells by direct regulation of cystathionine β-synthase. J Bone Miner Res. 26(12), 2011. 2991–3000.
- Tahrin Mahmood, Ping-Chang Yang (2012): Western Blot: Technique, Theory, and Trouble Shooting. North American Journal of Medical Sciences. 4(9), 2012. 429-434.