Fragmentación ultrasónica u ADN utia'al u secuenciación láak' "semana" generación

Le secuenciación láak' "semana" generación (NGS) k'a'abet le cizallamiento yéetel u le fragmentación confiables ti' le ADN genómico utia'al u secuenciar cadenas ADN genómico yéetel crear bibliotecas genómicas. Le fragmentación controlada ti' le ADN ti' fragmentos ADN jach jump'éel paso tuukulo'obo' wa u le muestra requerido bey ma' secuenciar le ADN yilik. Le ultrasonicación u demostrado u jump'éel láaka eficiente ka confiable utia'al u fragmentación le ADN cierta longitud. Le tsoolil bix u ultrasónicos u fragmentación ADN logran ya'ala'al máaxo'ob máano'ob fragmentación reproducibles. Le ultrasonidos Hielscher ku capaces u producir amplia gama distribuciones genómicas Buka'aj fragmentos ti' ADN, controlables yéetel precisión ti' le parámetros funcionamiento. Dado u le kaambalilo'ob ultrasónicos cizallamiento ADN Hielscher táan disponibles utia'al u viales simples yéetel ya'ab k'oja'ano'ob, bey je'el bix ti' microplacas, wa u muestras yilik u ku ka'a ma'alob eficiente.

Solicitud a'alajil t'aan




Yanak ti' tu yilaje' k Política yojeta'al mixba'al.


Ultrasonic DNA fragmentation is frequently used as sample preparation step in Next Generation Sequencing (NGS)

Análisis electroforéticos DNA genómico u Escherichia coli EDL933 sometidos ultrasonidos 0 - u 15 minutos. L indica le ba'ala' yaan ADN. (Basselet et el., 2008).

Ventajas le fragmentación ultrasónica ti' le ADN

  • ya'ala'al máaxo'ob máano'ob repetibles leti' reproducibles
  • ajustable yéetel precisión tia'al cierta longitud fragmento
  • procesamiento séeba'an
  • ya'ala'al máaxo'ob máano'ob consistentes fragmentación ADN
  • dispositivos utia'al u je'el volumen muestra (je'ebix, ya'ab k'oja'ano'ob viales wa microplacas).
  • ka'anal rendimiento
  • kaambalil yo'osal preciso ti' le temperatura
  • operación simple yéetel ch'a'abil u biilankiltej

Secuenciación láak' "semana" generación: fragmentación ultrasónica ti' le ADN utia'al u wa u bibliotecas yilik

Utia'al u bisa'al ka'ansaj jump'éel secuenciación láak' "semana" generación, u k'a'abéet u le óoxp'éel wook k'a'abeto'ob ti' (1) wa u yilik le biblioteca, (2) secuenciación yéetel (3) análisis datos. Ichil wa u yilik le biblioteca, le ADN ku fragmenta, tu láak' le extremos le fragmento ku reparan (pulen) agregando tin juunal k'oja'ano'obo' adenina yéetel le fragmentos objetivo ku suutikuba'ob ADN naaj tsolokbal. Finalmente, le llamados adaptadores ku unen tumen ligadura, PCR wa tagmentación utia'al u le producto final u ADN le biblioteca béeyak u cuantificado utia'al u secuenciación.
Fragmentación le ADN yo'osal sonicación: Especialmente ka le tecnologías secuenciación xooka' kóom bey Illumina, u ma' táan u béeytal xook fragmentos u ADN asab chowaktako'ob uchik, le soportes ADN k'a'abéet fragmentar u ti' jump'éel jaaj Buka'aj u páajtal kaxta'al u yúuchul ti' kin tuukul confiable yo'osal ultrasonidos.
Le ultrasonicación ku páajtal utilizar u kin tuukul confiable utia'al u fragmentación ADN, ARN yéetel cromatina.

Bix u meyaj le fragmentación ultrasónica ti' le ADN.

Le sonicación, bey xan k'ajo'olta'an bey procesamiento acústico ti' muestras, jach jump'éel método ampliamente utilizado utia'al u fragmentar le ADN. Utia'al u cizallamiento ultrasónico ti' le ADN, le muestras ku exponen u ondas ultrasónicas ti' condiciones controladas. Le principio funcionamiento le fragmentación ultrasónica ti' le ADN ku basa ti' le vibraciones yéetel cavitación generadas tumen le ondas ultrasonido. Le muuk' u cizallamiento ku resultan ti' le cavitación ultrasónica (acústica) rompen le moléculas ADN ka'anal peso molecular. Le ajuste le sonicación bey le intensidad (amplitud, ku bisik), le modo pulsación yéetel le temperatura, permiten jump'éel fragmentación precisa ti' le ADN ti' jump'éel cierta longitud deseada ti' le fragmentos ADN. Ka' jo'op' u ADN tu menudo u reduce u 100 u 600 pb yo'osal ultrasonido, ku páajtal kéen p'áatak fragmentos u ADN asab largos tak 1300 pb ka aplican condiciones ultrasónicas u asab suaves.

Ultrasonic homogenizers are reliable for DNA shearing

Cizallamiento ultrasónico ti' le ADN ichil ChIP – Inmunoprecipitación cromatina
Tu'ux u Jkwchui yáanal CC-BY-SA.03

Kaambalil yo'osal u temperatura utia'al Je'e bix u páajtale' u degradación le ADN

U páajtalil molecular naaj tsolokbal le ADN Jach ma'alob sensible ti' le temperaturas elevadas, yo'olal le kaambalil yo'osal exacto ti' le temperatura ichil le wook wa u le muestra yilik le jump'éel factor crucial tia'al ya'ala'al máaxo'ob máano'ob análisis confiables.
Ts'o'ok je'el u ka'ansaje' táan utilizando le ultrasonidos sonda ti' Hielscher, le VialTweeter wa le UIP400MTP – Le monitoreo ka kanik continuo ti' le temperatura u garantizado óolal ti' Jaajal jump'éel sensor temperatura conectable yéetel u software le dispositivo na'at. Utia'al u mantener le temperatura ichil jump'éel jaaj rango, u establecer jump'éel límite temperatura superior yéetel inferior. Tu consecuencia le ultrasonido ku detendrá jach séeb bix u exceda le límite temperatura yéetel automáticamente continuará sonicando u ken u temperatura te disminuido ti' jump'éel nu'ukulo'ob ∆T.
Le sofisticado software ultrasonidos Hielscher garantiza le mantenimiento fiable ti' le condiciones ideales ti' muestras.

Fragmentación masiva u ADN muestra yéetel le ultrasonido placa multipozo UIP400MTP

Ultrasonic Multi-Sample Preparation Unit UIP400MTP for multi-well plate sonicationLe meyaj ku muestras tu ciencias u kuxtal ts'o'ok u asab ya'abtal, significativamente ti' le ts'ook k'iino'oba'. Lela' u k'áat u ya'al ti' jump'éel meyaj ku jach ka'anal u muestras (je'ebix, 384, 1536 wa 3456 pozos tumen microplaca) k'a'abéet procesar u ichil le preparación yéetel le análisis muestra ti' condiciones consistentemente iguales tia'al ya'ala'al máaxo'ob máano'ob comparables ka válidos. Yéetel le UIP400MTP, Hielscher Ultrasonics táan siguiendo u tendencia le procesamiento masivo ti' muestras. Le UIP400MTP jach jump'éel ultrasonido utia'al wa u muestras meyaj utilizando microplacas. Le UIP400MTP je'el u páajtal u procesar placas yéetel 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 wa 3456 pozos. Dependiendo de le bin yano'ob microplaca, Amal ch'e'eno' je'el xu'ulsa'al volúmenes muestra ichil decenas nanolitros yéetel ya'ab mililitros. Ampliamente utilizado ti' le investigación ciencias u kuxtal, le UIP400MTP ku meyaj jach comúnmente utia'al wa u muestras yilik bey ma' ensayos bey ELISA (ensayo u inmunoabsorción ligado enzimas) wa PCR, Bey ma' análisis proteínas, bey je'el bix ti' wa u cromatina yilik bey ma' CHiP yéetel CHiP-seq, ye'esik uchik u péeksa'al u histonas yéetel uláak' tratamientos analíticos (je'ebix, electroforesis ti' gel ti', espectrometría masas).

Le VialTweeter utia'al u praparación muestras tak 10 viales

Chukbesik le instalación VialTweeter: xooko'obo' u VialTweeter ti' le procesador ultrasónico UP200StLe VialTweeter jach jump'éel ultrasonido laboratorio ampliamente utilizado VialTweeter ba'ax ku cha'antik le sonicación efectiva yéetel tuniche' tak 10 viales simultáneamente. Dado ti' le viales yéetel tubos ensayo (je'ebix, viales Eppendorf, crio viales, tubos centrífuga) ku sonican indirectamente, u evita je'el contaminación cruzada. Bix u ku ts'áajik le ti' jump'éelili' kuchil-intensidad ultrasonido u Amal muestra, tuláakal ya'ala'al máaxo'ob máano'ob sonicación le homogéneos yéetel reproducibles. Le VialTweeter ku tuláakal le noj inteligentes bey k la dispositivos digitales (je'ebix, menú na'at, configuraciones programables, kaambalil yo'osal u temperatura, kaambalil yo'osal remoto, etc.) utia'al garantizar le asab comodidad le usuario.

Sondas multides u yaal utia'al placas microagres

4 probe heads or 4 sonotrodes for simultaneous sonication of 4 samples at the same intensity with the Hielscher 200 watts ultrasonicator models UP200ST and UP200HTDisponibles ti' le homogeneizadores sonda ultrasónica UP200Ht yéetel UP200St, le sondas multidedo yéetel 4 jump'éel 8 yaal le jump'éel opción tuniche' utia'al sonicar ya'ab k'oja'ano'ob muestras in wéet k'iin ti' le meyajo'ob condiciones. Je'ebix, le sonotrodo MTP-24-8-96 jach jump'éel sonda u waxak yaal, ba'ax le beetike' uts utia'al u integración ti' sistemas automatizados wa u eficiente preparación je'elo'oba' u muestras le pozos placas ya'ab k'oja'ano'ob pozos. Le sonotrodo multides le beetike' uts utia'al laboratorios automatizados, tu'ux ku procesan chuunil laat'a'an picores yéetel tubos u ensayo u utilizan jump'éel sonotrodo ultrasónico estándar. Le sondas estándar yéetel ya'ab yaal u páajtal inter - k'ex jáan ti' jump'éel pocos minutos transformando le ultrasonido jump'éel tin juunal sonda ti' jump'éel disruptor ultrasónico u ya'ab k'oja'ano'ob sondas.

Solicitud a'alajil t'aan




Yanak ti' tu yilaje' k Política yojeta'al mixba'al.


Ultrasonidos Hielscher utia'al u fragmentación le ADN

Hielscher Ultrasonics k'u'ubul ya'abkach plataformas ku basadas tu ultrasonido utia'al u fragmentación ADN, ARN yéetel cromatina. Táan a jejeláas plataformas incluyen sondas ultrasónicas (sonotrodos), soluciones sonicación indirecta utia'al u preparación simultánea ti' muestras ti' ya'ab k'oja'ano'ob tubos wa placas ya'ab k'oja'ano'ob k tsa'ayal (je'ebix, placas u 96 k tsa'ayal, placas microtituladores), sonoreactores yéetel cuphorns ultrasónicos. Tuláakal le plataformas utia'al u corte ADN u alimentadas tumen procesadores ultrasónicos u ka'anal rendimiento yéetel ajustados ti' frecuencia, ba'ax ku controlables yéetel precisión yéetel ku ts'abal ya'ala'al máaxo'ob máano'ob reproducibles.

Procesadores ultrasónicos yo'osal je'el meyaj ku Buka'aj muestra

Yéetel le ultrasonidos multi-muestra Hielscher VialTweeter (utia'al tak 10 tubos u ensayo) yéetel UIP400MTP (utia'al microplacas leti' placas multipozo) leti' uchik páajtal xu'ulsiko'ob le k'iin procesamiento muestras debido a le ultrasonicación intensa yéetel controlable yéetel precisión ka' jo'op' u obtiene le distribución yéetel le rendimiento deseados le Buka'aj le fragmento ADN. Le fragmentación ultrasónica ti' le ADN ku beetik u wa u muestras yilik je'el eficiente, confiable yéetel escalable. Le tsoolil bix u páajtal escalar linealmente u juntúul u numerosas muestras yo'osal le ka'anatako'ob ultrasonido controlado constantemente.
Le ultrasonidos sonda yéetel juntúul u cinco yaal le ideales utia'al u wa u números u muestra asab mejen wa u meyajtiko'ob muestra asab mejen. Le ultrasonidos laboratorio Hielscher u disponibles ti' ya'ab tamaños utia'al u k tsa'ayal recomendar ti' le dispositivo beetike' uts utia'al u ka'anatako'ob ka requisitos.

kanik tuukula' exacto

Hielscher ultrasonicators can be remotely controlled via browser control. Sonication parameters can be monitored and adjusted precisely to the process requirements.Le ajustes u sonicación controlables yéetel precisión ku cruciales ts'o'ok u exhaustiva le sonificación je'el u páajtal u destruir le ADN, le ARN yéetel le cromatina, ba'ale' le cizallamiento ultrasónico inadecuado ku ts'aik bey resultado fragmentos ADN yéetel cromatina jach chowaktako'ob. Le ultrasonidos digitales u Hielscher u páajtal configurar uchik bin jump'éel parámetro sonicación preciso. Le configuración sonicación específica xan ku páajtal ooks bey configuración programada utia'al u repetición rápida u yéet procedimiento.
Tuláakal le sonicación ku protocola automáticamente yéetel u almacena bey archivo CSV ti' jump'éel tarjeta SD incorporada. Le je'ela' ku cha'antik jump'éel ju'uno'ob precisa ti' le ensayos realizados yéetel ku cha'antik xíixtik, uchik le ejecuciones sonicación.
Ti' le kaambalil yo'osal remoto ti' le navegador, tuláakal le ultrasonidos digitales ku páajtal operar yéetel monitorear yéetel je'el navegador estándar. Ma' k'a'abet u instalación software adicional, ts'o'ok u jump'éel conexión LAN ku cha'antik jump'éel configuración plug-n-play jach simple.

Le asab facilidad búukinta'al ti' wa u muestras ultrasónicas wa u meyaj

Tuláakal le ultrasonidos Hielscher u diseñados utia'al u ofrecer ultrasonidos u ka'anal rendimiento, ka' jo'op' u in wéet k'iin Mantats' le jach fáciles u biilankiltej ka fáciles u operar. Le ajustes u ma'alob estructurados ti' jump'éel menú jul, le tu u páajtal tsáabaltio'ob áantaj uchik ti' le pantalla táctil u boonil wa u kanik remoto ti' le navegador. Le software na'at yéetel ajustes programables yéetel grabación yo'osal u datos garantiza jump'éel configuración sonicación óptima tia'al ya'ala'al máaxo'ob máano'ob fiables ka reproducibles. Le interfaz menú Cho' yéetel ch'a'abil u biilankiltej p'áatal le ultrasonidos Hielscher ti' dispositivos fáciles ti' biilankiltej yéetel eficientes.
Le uláak' tabla ku ts'aik ti' jump'éel indicación le Buka'aj u ba'al u procesamiento aproximada u k ultrasonidos ti' laboratorio,, ideales utia'al tareas wa u muestras bey le fragmentación ADN yéetel ARN, le lisis t'aan yéetel le extracción proteínas yilik:

Dispositivo u Potencia [W] Bin yano'ob Volumen [mL]
UIP400MTP 400 utia'al u microplacas 6 – 3456 pozos
VialTweeter 200 utia'al tak 10 viales asab posibilidad sujeción 0.5 – 1.5
UP50H 50 Bin yano'ob sonda 0.01 – 250
UP100H 100 Bin yano'ob sonda 0.01 – 500
UP200Ht 200 Bin yano'ob sonda 0.1 – 1000
UP200St 200 Bin yano'ob sonda 0.1 – 1000
UP400St 400 Bin yano'ob sonda 5.0 – 2000
Cuphorn 200 CupHorn, sonoreactor 10 – 200
GDmini2 200 celda flujo libre contaminación

Ti' máax ku yéetel to'on! Leti' k'áatiko'ob k!

Solicitar a wojeltik

Meyaj le uláak' formulario utia'al solicitar a'alajil t'aan adicional yo'osal procesadores ultrasónicos, aplicaciones yéetel tojol. K encantados u discutir u tuukula' yéetel tech ka ofrecer ti' jump'éel ultrasónico yaan u cumpla yéetel u requisitos!









Yanak ti' tu yilaje' k Política yojeta'al mixba'al.


The VialTweeter is a MultiSample Ultraonicator that allows for reliable sample preparation under precisely controlled temperature conditions.

Le unidad preparación ultrasónica u multimuestra VialTweeter Cha' le sonicación simultánea u tak 10 viales. Yéetel le dispositivo sujeción VialPress, ku páajtal presionar tak 4 tubos adicionales tu delantera ti' jump'éel sonicación intensa.


Le sonotrodo MTP-24-8-96 u waxak sondas ultrasónicas utia'al u sonicación pozos placas microtíter.

Le sonotrodo MTP-24-8-96 u waxak sondas ultrasónicas utia'al u sonicación pozos placas microtíter.



Literatura leti' Referencias

Hechos u tojol le su'utalil K'ajóolt

Ba'ax le secuenciación láak' "semana" generación.

Le secuenciación láak' "semana" generación, bey xan le secuenciación láak' "semana" generación (NGS), le secuenciación ka'anal rendimiento wa secuenciación segunda generación, refiere u enfoque le secuenciación paralela masiva, tu'ux yaan xan ya'abach jach Nuuktak (masivas) tu ADN millones fragmentos ku secuencian simultáneamente ti' paralelo tumen meyajta'ale'.
Utia'al u bisa'al ka'ansaj jump'éel secuenciación láak' "semana" generación, u k'a'abéet u le óoxp'éel wook k'a'abeto'ob ti' (1) wa u yilik le biblioteca, (2) secuenciación yéetel (3) análisis datos. Ichil wa u yilik le biblioteca, le hebras ADN k'a'abéet fragmentar u ti' fragmentos ADN cierta longitud. Le sonicación jach juntúul le kaambalilo'ob preferidas utia'al u fragmentar le ADN.
Ichil le tuukula' secuenciación le ADN, le orden le nucleótidos ti' le ADN – k'ajo'olta'an bey secuencia ácido nucleico – u determina. Le secuencia ácidos nucleicos u religioso Kanp'éel bases nucleótidos: adenina, citosina, guanina, timina – Ba'ax código utia'al le.
Le secuenciación láak' "semana" generación táan impulsando le investigación ti' ciencias u kuxtal yéetel ts'aak personalizada, ts'o'ok u secuenciación ADN yéetel ARN ku meyajtiko'ob tu gran medida ti' le investigación genómica, le investigación le k'ak'as k'oja'anil cáncer, le investigación k'aas k'oja'anilo'obo' jela'antak ka ka complejas, le investigación microbiana, le agrogenómica yéetel ya'ab uláak' sikte u investigación.

Secuenciación láak' "semana" generación vs secuenciación Sanger

Ka' jo'op' u yéetel le secuenciación láak' "semana" generación (NGS) leti' páajtal secuenciar jump'éel meyaj ku masivo u muestras genómicas, secuenciación Sanger (xan conocida bey método ku meyajo'ob tsolokbal wa secuenciación yáax generación) chéen ti' le Buka'aj u ba'al u secuenciar números muestra mejen. Le secuenciación Sanger chéen secuencia jump'éel chéen fragmento ADN in la ka' yéetel u páajtal kaxta'al u yúuchul ti' jump'éel chéen k'iin. Debido a u precisión le secuenciación Sanger xan u considera le ma'alo'obtal estándar táak'iin, ba'ax ku meyajtiko'ob utia'al verificar ya'ala'al máaxo'ob máano'ob obtenidos tumen le secuenciación láak' "semana" generación.
Le secuenciación Sanger u chukik longitudes xooka' yan 800 pb (típicamente 500-600 pb yéetel ADN ma' enriquecido). Le longitudes u xooka' asab chowak ti' le secuenciación Sanger muestran ventajas significativas yóok'ol la métodos secuenciación, especialmente ti' términos secuenciación regiones repetitivas ti' le genoma. Juntúul desafío datos secuencia xooka' kóom jach particularmente jump'éel talamil ti' le secuenciación túumben genomas (u novo) yéetel le secuenciación segmentos ti' genoma ma'alob reorganizados, típicamente le u ku cha'antiko'ob u genomas k'ak'as k'oja'anil cáncer wa tu regiones cromosomas ku exhiben variación estructural.. [cp. Morozova yéetel Marra, 2008]


High performance ultrasonics! Hielscher's product range covers the full spectrum from the compact lab ultrasonicator over bench-top units to full-industrial ultrasonic systems.

Hielscher Ultrasonics fabrica homogeneizadores ultrasónicos u ka'anal rendimiento Laboratorio Utia'al Buka'aj industrial.