Fragmentación ultrasónica ADN pa ar secuenciación Nu'bu̲ Xtí generación

Ar secuenciación Nu'bu̲ Xtí generación (NGS) requiere ar cizallamiento ne ar fragmentación confiables ar ADN genómico pa secuenciar cadenas ADN genómico ne da t'ot'e bibliotecas genómicas. Fragmentación controlada ar ADN fragmentos ADN ge 'nar bi thogi esencial nt'ot'e ar muestra requerido 'bu̲ 'be̲tho secuenciar ar ADN. Ar ultrasonicación xi demostrado to 'nar técnica nt'ot'e xi hño ne ya confiable pa ar fragmentación ar ADN cierta longitud. Ya protocolos ultrasónicos fragmentación ADN logran resultados ar fragmentación reproducibles. Ya ultrasonidos Hielscher ya mar tsa̲ ndi producir 'nar nt'ot'e ho 'bui ndunthe gama distribuciones genómicas tamaño fragmentos ar ADN, controlables ko precisión a través de ya parámetros funcionamiento. Dado ke ya sistemas ultrasónicos cizallamiento ADN Hielscher gi 'bu̲hu̲ da 'mui pa viales simples ne múltiples, nja'bu komongu pa microplacas, ar nt'ot'e muestras bí japi altamente nt'ot'e xi hño.

Nu'bu da 'yadi ungumfädi




Pets'i ja ma Nt'eje privacidad.


Ultrasonic DNA fragmentation is frequently used as sample preparation step in Next Generation Sequencing (NGS)

Análisis electroforéticos DNA genómico Escherichia coli EDL933 sometidos ultrasonidos 0 — ar 15 ya t'olo ora. L indica 'rede ADN. (Basselet et jar el., 2008)

Ventajas fragmentación ultrasónica ar ADN

  • resultados repetibles yá reproducibles
  • ajustable ko precisión pa da cierta longitud fragmento
  • procesamiento rápido
  • resultados consistentes fragmentación ADN
  • dispositivos pa 'na volumen muestra (nt'udi, múltiples viales wa microplacas)
  • mar hñets'i rendimiento
  • control preciso ar mpat'i
  • operación simple ne hei ar zu̲di

Secuenciación Nu'bu̲ Xtí generación: fragmentación ultrasónica ADN pa jar nt'ot'e bibliotecas

Pa da t'ot'e 'nar secuenciación Nu'bu̲ Xtí ar generación, ar tsa ga OT'UJE ya hñu pasos hontho (1) mfädi jar biblioteca, (2) secuenciación ne (3) análisis ar datos. Nxoge jar nt'ot'e ar biblioteca, ar ADN bí fragmenta, xu̲ki ya extremos ar fragmento bí reparan (pulen) agregando 'nar sola base adenina ne ya fragmentos objetivo ar convierten jar ADN doble ar cadena. Ar ngäts'i, ya llamados adaptadores da unen ya ligadura, PCR wa tagmentación pa ndi producto final ADN biblioteca ar tsa da cuantificado pa ár secuenciación.
Fragmentación ADN ir nge ya sonicación: Ho̲ntho nu'u̲ nu'bu̲ ya tecnologías ar secuenciación da corta Illumina, ngu nä'ä hingi xi lei fragmentos ADN mäs largos hingi hembi da, ya soportes ADN tsa fragmentar bí ma 'nar makwäni tamaño ke ar tsa̲ da dähä ar bí confiable ir nge ya ultrasonidos.
Ar ultrasonicación ar tsa̲ da utilizar ar bí confiable pa ar fragmentación ar ADN, ar ARN ne ar cromatina.

¿Tema funciona fragmentación ultrasónica ar ADN?

Ar sonicación, 'nehe conocida komongu procesamiento acústico muestras, ge 'nar nt'ot'e ampliamente utilizado pa fragmentar ar ADN. Pa ar cizallamiento ultrasónico ar ADN, ya muestras ar exponen da ondas ultrasónicas jar nkohi controladas. Ar ndui funcionamiento fragmentación ultrasónica ar ADN bí basa ya vibraciones ne cavitación generadas ir nge ya ondas ultrasonido. Ya ndu nzafi ar cizallamiento nä'ä da hneki ar cavitación ultrasónica (acústica) rompen ya moléculas ADN mar hñets'i be̲xu molecular. Ar za ar sonicación, komongu ar intensidad (amplitud, duración), ar modo ar pulsación ne ar mpat'i permiten 'nar fragmentación precisa ar ADN 'nar cierta longitud deseada ar fragmentos ar ADN. Gem'bu̲ ar ADN tso̲kwa menudo ar reduce da 100 ya 600 pb ir nge ya ultrasonido, ar xi uni fragmentos ADN mäs largos asta 1300 pb nu'bu̲ ar aplican nkohi ultrasónicas mäs suaves.

Ultrasonic homogenizers are reliable for DNA shearing

Cizallamiento ultrasónico ADN Nxoge ChIP – Inmunoprecipitación cromatina
Adaptado ar Jkwchui jár CC — BY — SA.03

Control mpat'i pa da mä 'met'o degradación ar ADN

Ar dets'e molecular doble cadena ar ADN ar altamente sensible ja ya temperaturas elevadas, nä'ä control exacto ar mpat'i Nxoge ya pasos nt'ot'e ar muestra ge 'nar factor crucial pa da resultados análisis confiables.
Ya da da ntsuni utilizando ya ultrasonidos sonda ar Hielscher, ar VialTweeter wa ar UIP400MTP – Ar monitoreo ne control continuo ar mpat'i xí garantizado jamädi 'nar sensor mpat'i conectable ne da software ar dispositivo inteligente. Pa da zeti ar mpat'i 'be̲di 'nar makwäni rango, to da t'ot'e 'nar límite mpat'i mäs xi ngu ne ya inferior. Da consecuencia, ar ultrasonido bí detendrá ngut'ä ngut'ä Komo ar exceda nuna ar límite mpat'i ne automáticamente continuará sonicando ar nu'bu̲ ar mpat'i xi disminuido ja 'nar conjunto ∆ T.
Ar sofisticado software ya ultrasonidos Hielscher garantiza t'ot'e fiable ya nkohi ideales ar nt'ot'e ya muestras.

Fragmentación masiva ADN muestra ko ar ultrasonido placa multipozo UIP400MTP

Ultrasonic Multi-Sample Preparation Unit UIP400MTP for multi-well plate sonicationÁr 'bede ya muestras jar ciencias ar nzaki xi hñuts'i significativamente jar ngäts'i ar década. 'Me̲hna ir bo̲ni ke 'nar 'bede mar na hñets'i muestras (nt'udi, 384, 1536 wa 3456 me̲he̲ ya microplaca) tsa procesar ar Nxoge ár mfädi ne ár análisis ar muestra jar nkohi consistentemente iguales pa da resultados comparables ne válidos. Ko ar UIP400MTP, Hielscher Ultrasonics xi de̲ni ár tendencia ar procesamiento masivo muestras. Ar UIP400MTP ge 'nar ultrasonido pa jar nt'ot'e muestras utilizando microplacas. Ar UIP400MTP ar tsa̲ da procesar placas ko ar 6, 12, 24, 48, 96, 384, 1536 wa 3456 me̲he̲. Dependiendo de ar klase ar microplaca, nu'bu̲ pozo to contener volúmenes muestra entre decenas nanolitros ne varios ar mililitros. Ampliamente utilizado jar nthoni ciencias ar nzaki, ar UIP400MTP bí usa xi comúnmente pa jar nt'ot'e muestras 'bu̲ 'be̲tho ensayos komongu ELISA (ensayo ar inmunoabsorción ligado enzimas) wa PCR, 'be̲tho ar análisis proteínas, nja'bu komongu pa jar nt'ot'e ar ar cromatina 'bu̲ 'be̲tho CHiP ne CHiP — seq, identificación nyokwi nthoki histonas ne ma'ra tratamientos analíticos (nt'udi, electroforesis jar gel, espectrometría masas).

VialTweeter pa ar praparación muestras asta 10 viales

Completar ar instalación VialTweeter: he̲'mi VialTweeter ja ar procesador ultrasónico UP200StAr VialTweeter ge 'nar ultrasonido laboratorio ampliamente utilizado VialTweeter da permite ar sonicación efectiva ne cómoda asta 10 viales simultáneamente. Dado ke ya viales ne tubos ensayo (nt'udi, viales ar Eppendorf, crio viales, tubos ar centrífuga) bí sonican indirectamente, bí evita 'na contaminación cruzada. Komo mi entrega xkagentho ar intensidad ar ultrasonido ya muestra, nga̲tho ya resultados sonicación ya homogéneos ne ya reproducibles. Ar VialTweeter ofrece ga̲tho ya 'befi inteligentes komongu HMUNTS'UJE ma 'ra dispositivos digitales (nt'udi, menú inteligente, configuraciones programables, control ar mpat'i, control remoto, etc.) pa garantizar ar dätä comodidad ar usuario.

Sondas multides dedo pa placas microagres

4 probe heads or 4 sonotrodes for simultaneous sonication of 4 samples at the same intensity with the Hielscher 200 watts ultrasonicator models UP200ST and UP200HTDa 'mui da homogeneizadores ar sonda ultrasónica UP200Ht ne UP200St, ya sondas multidedo ko 4 wa 8 dedos ge 'nar opción cómoda pa sonicar múltiples muestras jar xkagentho ar pa ja ya nkohi xi da ehese̲. Ngu, sonotrodo MTP — 24 — 8 — 96 ge 'nar sonda ar hñäto ya dedos, nä'ä ar ideal pa ar integración sistemas automatizados wa ar nt'ot'e xi hño nt'ot'e manual muestras ya me̲he̲ placas múltiples ar me̲he̲. Sonotrodo multides ar ideal pa laboratorios automatizados, ho bí procesan principalmente picores ne tubos ar ensayo da utilizan 'nar sonotrodo ultrasónico estándar. Ya sondas estándar ne varios ar dedos ar xi inter — mpa̲ti rápidamente jar 'ra pocos ya t'olo ora transformando ultrasonido 'nar sola sonda ja 'nar disruptor ultrasónico múltiples ar sondas.

Nu'bu da 'yadi ungumfädi




Pets'i ja ma Nt'eje privacidad.


Ultrasonidos Hielscher pa ar fragmentación ar ADN

Hielscher Ultrasonics ofrece ndunthe plataformas nthe jar ultrasonido pa ar fragmentación ar ADN, ar ARN ne ar cromatina. Gi Bu̲i plataformas incluyen sondas ultrasónicas (sonotrodos), soluciones sonicación indirecta pa jar nt'ot'e simultánea muestras múltiples tubos wa placas múltiples pomos (nt'udi, placas ar 96 pomos, placas microtituladores), sonoreactores ne cuphorns ultrasónicos. Ga̲tho ya plataformas pa ar Ts'ut'ubi ADN gi alimentadas ya procesadores ultrasónicos mar hñets'i rendimiento ne ajustados jar frecuencia, ya controlables ko ya precisión ne ofrecen resultados reproducibles.

Procesadores ultrasónicos pa 'na ya 'bede ne tamaño muestra

Ko ya ultrasonidos multi-muestra Hielscher VialTweeter (pa ga 10 tubos ar ensayo) ne UIP400MTP (da microplacas yá placas multipozo) xähmä hingi hembi da reducir ar pa procesamiento muestras nu'bya ar ultrasonicación intensa ne controlable ko precisión Mente obtiene jar Nthege ne ar rendimiento deseados tamaño fragmento ADN. Fragmentación ultrasónica ar ADN xí ne ar nt'ot'e muestras da nt'ot'e xi hño, confiable ne ar escalable. Ya protocolos ar xi escalar linealmente ar 'na jar numerosas muestras ir nge ar nt'ot'e ultrasonido controlado constantemente.
Ya ultrasonidos sonda ko 'na jar ku̲t'a dedos ya ideales pa jar nt'ot'e 'bede ya muestra mäs t'olo. Ya ultrasonidos laboratorio Hielscher gi 'bu̲hu̲ da 'mui jar varios tamaños pa ndi podamos da mats'i bí dispositivo ideal pa ár nt'ot'e ne ya requisitos.

control proceso exacto

Hielscher ultrasonicators can be remotely controlled via browser control. Sonication parameters can be monitored and adjusted precisely to the process requirements.Ya ajustes ar sonicación controlables ko ya precisión ya cruciales ya da sonificación ar exhaustiva ar tsa̲ da destruir ar ADN, ar ARN ne ar cromatina, pe ar cizallamiento ultrasónico inadecuado xta komongu ar nt'uni fragmentos ADN ne cromatina xki largos. Ya ultrasonidos digitales Hielscher ar xi configurar hingi hembi da nä'ä mä 'nar parámetro ar sonicación preciso. Configuración sonicación específica 'nehe ar tsa̲ da guardar komongu configuración programada pa repetición ngut'a xkagentho ar nt'ot'e.
Nga̲tho ar sonicación bí protocola ar automáticamente ne ar almacena komongu archivo CSV 'na jar tarheta SD incorporada. 'Me̲hna permite 'nar documentación precisa ya ensayos realizados ne permite hnu hingi hembi da ya ejecuciones sonicación.
A través de ar control remoto ar navegador, nga̲tho ya ultrasonidos digitales ar xi operar ne monitorear a través de 'na navegador estándar. Hingi bí requiere ar instalación software adicional, ya da 'nar conexión LAN permite 'nar configuración plug — n — play xi simple.

Ar dätä facilidad njapu'befi jar nt'ot'e muestras ultrasónicas

Ga̲tho ya ultrasonidos Hielscher gi 'bu̲hu̲ diseñados pa ofrecer ultrasonidos mar hñets'i rendimiento, mente da ma xkagentho ar pa nzäm'bu̲ ya na fáciles ar zu̲di ne fáciles ar operar. Ya ajustes gi 'bu̲hu̲ xi hño estructurados ja 'nar menú xí nzi, nä'ä ar tsa̲ da acceder hingi hembi da a través de ar pantalla táctil ya njät'i wa ar control remoto ar navegador. Software inteligente ajustes programables ne grabación automática datos garantiza 'nar configuración sonicación óptima pa da resultados fiables ne reproducibles. Ar interfaz ar menú 'Beni ne hei ar zu̲di bi pa̲ti ya ultrasonidos Hielscher jar dispositivos fáciles ar zu̲di ne eficientes.
Xtí tabla bí xta ar 'nar indicación ya mfeni ya procesamiento aproximada ar HMUNTS'UJE ultrasonidos ar laboratorio, ne ya ideales pa tareas nt'ot'e muestras komongu ar fragmentación ADN ne ARN, ar lisis ar celular ne ar extracción proteínas:

Dispositivo ar Nts'edi [W] Ar klase Volumen [mL]
UIP400MTP 400 pa microplacas 6 – 3456 me̲he̲
VialTweeter 200 pa ga 10 ar viales mäs posibilidad sujeción 0.5 – 1.5
UP50H 50 Ar klase sonda 0.01 – 250
UP100H 100 Ar klase sonda 0.01 – 500
UP200Ht 200 Ar klase sonda 01. – 1000
UP200St 200 Ar klase sonda 01. – 1000
UP400St 400 Ar klase sonda 5.0 – 2000
CupHorn 200 CupHorn, sonoreactor 10 – 200
GDmini2 200 celda flujo dí contaminación

Ja ar contacto ko ngekihe! Yá preguntar ga!

Da 'yadi mäs ungumfädi

Utilice da ku̲hu̲ formulario pa da 'yadi ungumfädi adicional dige ar procesadores ultrasónicos, ar aplicaciones ne ar precio. Estaremos encantados da mä ár proceso ko nu'i ne bí ofrecer 'nar ko ya ultrasónico da cumpla ko yá requisitos!









Pets'i ja ma Nt'eje privacidad.


The VialTweeter is a MultiSample Ultraonicator that allows for reliable sample preparation under precisely controlled temperature conditions.

Ar xe̲ni mfädi ultrasónica multimuestra VialTweeter permite sonicación simultánea asta 10 viales. Ko ar dispositivo sujeción VialPress, ar xi presionar asta 4 tubos Nthuts'i jar xeni delantera pa 'nar sonicación intensa.


Sonotrodo MTP — 24 — 8 — 96 pe̲ts'i hñäto sondas ultrasónicas da sonicación ya me̲he̲ placas microtíter.

Sonotrodo MTP — 24 — 8 — 96 pe̲ts'i hñäto sondas ultrasónicas da sonicación ya me̲he̲ placas microtíter.



Ot'a yá Referencias

Hechos Bale ar penä ga pädi

¿Temu̲ ar secuenciación Nu'bu̲ Xtí generación?

Ar secuenciación Nu'bu̲ Xtí generación, 'nehe ár secuenciación Nu'bu̲ Xtí generación (NGS), secuenciación mar hñets'i rendimiento wa ar secuenciación ñoho ar generación, ar refiere bí enfoque ar secuenciación paralela masiva, ho cantidades na dätä (masivas) ar ADN millones fragmentos ar secuencian simultáneamente jar paralelo ya nt'ot'e.
Pa da t'ot'e 'nar secuenciación Nu'bu̲ Xtí ar generación, ar tsa ga OT'UJE ya hñu pasos hontho (1) mfädi jar biblioteca, (2) secuenciación ne (3) análisis ar datos. Nxoge jar nt'ot'e ar biblioteca, ya hebras ADN tsa fragmentar ar jar fragmentos ADN cierta longitud. Ar sonicación ge 'na ya técnicas preferidas pa fragmentar ar ADN.
Nxoge ar proceso secuenciación ar ADN, ar teni ya nucleótidos ar ADN – conocida komongu secuencia ácido nucleico — bí determina. Secuencia ácidos ar nucleicos bí compone ar goho bases nucleótidos: adenina, citosina, guanina, timina – Temu̲ código pa ar ungumfädi.
Ar secuenciación Nu'bu̲ Xtí ar generación xí impulsando ár nthoni ciencias ar nzaki ne 'ñithi personalizada, ya da secuenciación ya ADN ne ya ARN ar gi japu̲'be̲fi gran da medida jar ár nthoni genómica, ár nthoni ar cáncer, ár nthoni enfermedades raras ne complejas, ár nthoni microbiana, ár agrogenómica ne xingu ya campos nthoni.

Secuenciación Nu'bu̲ Xtí generación vs secuenciación Sanger

Mente da secuenciación Nu'bu̲ Xtí generación (NGS) ko ar tsa̲ ga secuenciar 'nar 'bede masivo ya muestras genómicas, ar secuenciación Sanger ('nehe conocida komongu ya nt'ot'e terminación cadena wa secuenciación ndui generación) ho̲ntho pe̲ts'i mfeni ya secuenciar 'bede ya muestra t'olo. Secuenciación Sanger Honto secuencia 'nar Honto fragmento ADN la tso̲kwa xähmä ne ar tsa̲ da dähä jar Honto 'nar pa. Nu'bya ár precisión ar secuenciación Sanger 'nehe nu'u̲ t'uni tecnología estándar k'axt'i, nä'ä da gi japu̲'be̲fi pa gí hñeti ha ya resultados obtenidos ya secuenciación Nu'bu̲ Xtí ar generación.
Secuenciación Sanger alcanza longitudes da aproximadamente 800 pb (típicamente 500 — 600 pb ko ADN hingi enriquecido). Ya longitudes pa da mäs largas jar secuenciación Sanger muestran ventajas significativas dige ma'ra ya nt'ot'e secuenciación, hontho jar ngäts'i ar secuenciación regiones repetitivas ar genoma. 'Nar desafío ya datos secuencia da corta ar particularmente 'nar hñäki jar secuenciación ya 'ra'yo genomas (ar novo) ne ar secuenciación segmentos ar genoma altamente reorganizados, típicamente mi observan genomas cáncer wa regiones cromosomas da exhiben variación estructural. [cp. Morozova ne Marra, 2008]


High performance ultrasonics! Hielscher's product range covers the full spectrum from the compact lab ultrasonicator over bench-top units to full-industrial ultrasonic systems.

Hielscher Ultrasonics fabrica homogeneizadores ultrasónicos mar hñets'i rendimiento Laboratorio Pa tamaño industrial.